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白癜风患者病变表皮与正常表皮的比较蛋白质组学研究 被引量：1
1
作者 艾力克木·吐尔逊 陈秀兰 +11 位作者 艾尼瓦尔·塔力甫 李娜 王继峰 蔡潭溪 郭晓静 丁翔 谢振声 牛丽丽 张朦朦 Ghulam Abbas 阿吉艾克拜尔·艾萨 杨福全 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2023年第2期334-345,共12页
目的本文通过开展白癜风患者病变表皮与正常表皮的比较蛋白质组学研究,发现和鉴定白癜风患者病变表皮与正常表皮之间的差异表达蛋白,以探讨白癜风患者表皮发生病变的分子机制。方法首先,建立和优化了表皮样品中蛋白质的最佳酶切条件。其... 目的本文通过开展白癜风患者病变表皮与正常表皮的比较蛋白质组学研究,发现和鉴定白癜风患者病变表皮与正常表皮之间的差异表达蛋白,以探讨白癜风患者表皮发生病变的分子机制。方法首先,建立和优化了表皮样品中蛋白质的最佳酶切条件。其次,采用基于串联质谱标签(TMT)标记的定量蛋白质组学技术策略开展了稳定期白癜风患者病变表皮与正常表皮的比较蛋白质组学研究,并筛选了差异表达蛋白。最后通过生物信息学分析工具及数据库(GO、KEGG、STRING、GSEA)对差异蛋白进行功能富集分析。结果优化所得到的最佳酶解条件是由Lys-C(酶∶底物,1∶100)和胰酶(酶∶底物,1∶50)组合而成的顺序酶切。比较蛋白质组学研究共鉴定4496个蛋白质,其中181个蛋白质为白癜风患者病变表皮中的差异表达蛋白。生物信息学分析表明差异表达蛋白主要与代谢、免疫、氧化还原和细胞黏附相关。其中119个上调蛋白主要参与角质化、转录、氧化应激及蛋白酶解等过程。62个下调蛋白主要参与细胞内物质运输、谷胱甘肽代谢和肌动蛋白细丝封端等过程。结论比较蛋白质组学研究揭示了白癜风患者病变表皮与正常表皮之间主要存在角质化、免疫、脂质代谢和氧化还原等方面的功能差异,发现了PRDX1、PRDX2、EEF2、ITGB1、SPTBN2、ANXA1及PFKL等蛋白质为潜在的白癜风患者病变表皮功能失调的关键蛋白质。 展开更多
关键词 白癜风 表皮蛋白组学 TMT标记定量 角质化 氧化应激 脂质代谢
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