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合成己酸乙酯酯化酶产生菌的鉴定及产酶条件优化 被引量:10
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作者 许春艳 孙宝国 +2 位作者 徐友强 范光森 李秀婷 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第5期138-147,共10页
筛选到1株浓香型酒曲来源且己酸乙酯酯化性能较强的红曲霉并进行菌种鉴定。在形态学鉴定的基础上,通过ITS序列和β-微管蛋白基因序列构建系统发育树,初步鉴定为紫色红曲霉,编号为YJX-8。研究菌株YJX-8最佳产酯化酶条件及酯化酶底物特异... 筛选到1株浓香型酒曲来源且己酸乙酯酯化性能较强的红曲霉并进行菌种鉴定。在形态学鉴定的基础上,通过ITS序列和β-微管蛋白基因序列构建系统发育树,初步鉴定为紫色红曲霉,编号为YJX-8。研究菌株YJX-8最佳产酯化酶条件及酯化酶底物特异性,结果表明,其最适液态培养基组分是:蔗糖90 g/L、黄豆饼粉25 g/L、MgSO41 g/L、NaH2PO41 g/L;最适培养条件是:pH 4.5、30℃、180 r/min、6 d;在最优条件下,酯化酶酶活达到(1.177±0.009)U/mL,酶活提高4.56倍。红曲霉酯化酶对己酸具有很强的选择性。 展开更多
关键词 紫色红曲霉 己酸乙酯 酯化酶 底物特异性
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碳水化合物结合结构域研究进展 被引量:9
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作者 李恒 唐双焱 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期1160-1167,共8页
糖类是自然界数量最多的一类有机化合物,生物对其降解利用是最重要的反应之一。碳水化合物酶是具有降解、修饰和生成糖苷键功能的一大类酶。由于高分子糖类可溶性低,其糖苷键难以触及,因此其被酶作用的效率相对较低。碳水化合物结合结... 糖类是自然界数量最多的一类有机化合物,生物对其降解利用是最重要的反应之一。碳水化合物酶是具有降解、修饰和生成糖苷键功能的一大类酶。由于高分子糖类可溶性低,其糖苷键难以触及,因此其被酶作用的效率相对较低。碳水化合物结合结构域能特异性结合多糖底物,对提升糖类底物的酶催化效率起着关键的作用。本文从碳水化合物结合结构域的家族类型、结构类型、结构与功能关系以及与催化结构域的关系几个方面进行了综述,对阐明碳水化合物结合结构域与碳水化合物识别机制,进而将其广泛应用于生物和医疗领域具有重要意义。 展开更多
关键词 碳水化合物结合结构域 碳水化合物酶 多糖 底物特异性
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底物特异性的生物催化与酶设计改造 被引量:8
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作者 姜恬 冯旭东 +1 位作者 李岩 李春 《化工进展》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期606-614,共9页
随着生物产业的发展,生物酶催化发挥着越来越重要的作用。然而,部分酶在应用过程中仍然存在诸多问题,影响了生物催化的进一步发展。本文以酶的底物特异性为切入点,回顾了酶的专一性、高效性和环保性;介绍了酶在药物合成和天然产物改性... 随着生物产业的发展,生物酶催化发挥着越来越重要的作用。然而,部分酶在应用过程中仍然存在诸多问题,影响了生物催化的进一步发展。本文以酶的底物特异性为切入点,回顾了酶的专一性、高效性和环保性;介绍了酶在药物合成和天然产物改性领域的应用以及所遇到的问题;综述了酶的底物特异性改造过程中各种方法的应用,包括化学修饰、非理性和理性设计。化学修饰作为一种直观的修饰方法,通过化学反应对酶分子进行改造;非理性设计是利用易错PCR和DNA Shuffling等手段获得底物特异性提高的突变体;理性设计是基于序列和结构信息对酶分子进行改造。本文从重塑活性口袋提高酶的底物特异性和重塑活性口袋改变酶促反应类型两个方面出发,详述了理性设计改变酶的底物特异性的方法,为酶的特异性改造提供借鉴。 展开更多
关键词 生物催化 酶设计 底物特异性 分子改造
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南果梨中多酚氧化酶的动力学研究 被引量:4
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作者 朱凤妹 辛广 刘长江 《食品科技》 CAS 北大核心 2004年第4期8-10,共3页
研究了南果梨多酚氧化酶的底物专一性和不同底物的米氏常数,结果表明,最适底物为绿原酸。同时研究了不同抑制剂对南果梨多酚氧化酶的抑制效果。
关键词 南果梨 多酚氧化酶 动力学 底物转一性 抑制剂
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Deubiquitination complex platform:A plausible mechanism for regulating the substrate specificity of deubiquitinating enzymes
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作者 Yi-Zheng Fang Li Jiang +2 位作者 Qiaojun He Ji Cao Bo Yang 《Acta Pharmaceutica Sinica B》 SCIE CAS CSCD 2023年第7期2955-2962,共8页
Deubiquitinating enzymes(DUBs) or deubiquitinases facilitate the escape of multiple proteins from ubiquitin-proteasome degradation and are critical for regulating protein expression levels in vivo.Therefore,dissecting... Deubiquitinating enzymes(DUBs) or deubiquitinases facilitate the escape of multiple proteins from ubiquitin-proteasome degradation and are critical for regulating protein expression levels in vivo.Therefore,dissecting the underlying mechanism of DUB recognition is needed to advance the development of drugs related to DUB signaling pathways.To data,extensive studies on the ubiquitin chain specificity of DUBs have been reported,but substrate protein recognition is still not clearly understood.As a breakthrough,the scaffolding role may be significant to substrate protein selectivity.From this perspective,we systematically characterized the scaffolding proteins and complexes contributing to DUB substrate selectivity.Furthermore,we proposed a deubiquitination complex platform(DCP) as a potentially generic mechanism for DUB substrate recognition based on known examples,which might fill the gaps in the understanding of DUB substrate specificity. 展开更多
关键词 Deubiquitinating enzyme(DUB) DEUBIQUITINATION substrate specificity COMPLEX SCAFFOLD Protein partner
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油橄榄类黄酮生物合成相关酶的研究进展 被引量:4
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作者 唐亚琴 梅抗抗 +3 位作者 陈瑶 谢琴鼎 黄乾明 陈华萍 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期2110-2117,共8页
类黄酮是酚类代谢物的一大亚组,其生物合成属于苯丙素代谢途径的分支,它们广泛分布在整个植物界。不仅在植物中有极其重要的生理、生化和生态功能,而且对动物的生物活性及提供营养等方面做出重要贡献。油橄榄叶、果实、根都富含类黄酮,... 类黄酮是酚类代谢物的一大亚组,其生物合成属于苯丙素代谢途径的分支,它们广泛分布在整个植物界。不仅在植物中有极其重要的生理、生化和生态功能,而且对动物的生物活性及提供营养等方面做出重要贡献。油橄榄叶、果实、根都富含类黄酮,具有重要研究价值。本研究综述了油橄榄类黄酮生物合成途径相关酶(CHI,CHS,F3H,DFR,FLS,FNSI,LAR,F3'H,F3',5'H)的底物特异性和功能性区域,分析总结了编码这些酶的基因在不同物种间的序列相似性和在不同组织的表达特异性。这对深入研究植物类黄酮生物合成相关酶的结构和功能,基因的克隆、表达和调控以及对油橄榄类黄酮生物合成途径相关酶的研究具有参考价值。 展开更多
关键词 油橄榄 类黄酮 相关酶 底物特异性 保守位点
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蚯蚓纤溶酶底物特异性
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作者 武金霞 赵晓瑜 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期22-28,共7页
蚯蚓纤溶酶是具有较强溶栓作用的丝氨酸蛋白酶,为研究蚯蚓纤溶酶在溶栓的同时是否对其他血液蛋白有破坏作用,本实验以一些血液功能蛋白为底物,用蚯蚓纤溶酶在体外对其进行水解,采用SDS-PAGE检测水解前后底物成分的变化。结果显示,蚯蚓... 蚯蚓纤溶酶是具有较强溶栓作用的丝氨酸蛋白酶,为研究蚯蚓纤溶酶在溶栓的同时是否对其他血液蛋白有破坏作用,本实验以一些血液功能蛋白为底物,用蚯蚓纤溶酶在体外对其进行水解,采用SDS-PAGE检测水解前后底物成分的变化。结果显示,蚯蚓纤溶酶短时间内能完全水解纤维蛋白和纤维蛋白原,长时间作用下能部分水解牛血清白蛋白和人免疫球蛋白重链,不水解牛血红蛋白、牛血超氧化物歧化酶和牛凝血酶原。表明蚯蚓纤溶酶对血栓成分具有较强的识别和水解能力,而对其他血液蛋白作用微弱,说明蚯蚓纤溶酶作为药物使用时具有较强的溶栓和预防血栓形成的作用,且副作用较小。 展开更多
关键词 蚯蚓纤溶酶 溶栓作用 底物特异性 水解 功能蛋白
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植物体系中甲酯酶的底物专一性的理论研究(英文) 被引量:1
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作者 钱萍 赵楠 +1 位作者 陈峰 郭鸿 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2015年第11期2283-2291,共9页
酶对天然底物的高度专一性是酶的特点之一.然而关于酶是如何对底物具有高度专一性以及识别能力,我们的理解仍然缺乏.本文以植物体系中发现的一组甲酯酶(MESs)对一些底物[包括水杨酸甲酯(Me SA),茉莉酮酸甲酯(Me JA)和吲哚-3-乙酸甲酯(Me... 酶对天然底物的高度专一性是酶的特点之一.然而关于酶是如何对底物具有高度专一性以及识别能力,我们的理解仍然缺乏.本文以植物体系中发现的一组甲酯酶(MESs)对一些底物[包括水杨酸甲酯(Me SA),茉莉酮酸甲酯(Me JA)和吲哚-3-乙酸甲酯(Me IAA)]的催化反应为例,报道了同源建模和理论计算对茉莉酮酸甲酯酶(At MES10)和水杨酸结合蛋白2(SABP2)的研究结果.基于简单的锁-钥匙理论(底物与酶结合时不发生基团的碰撞或严重排斥),以底物对接到酶的活性部位(即底物中—COO的一部分占据可被催化丝氨酸亲核进攻的位置)为原则,可以在空间上为酶对底物的专一性提供解释.模拟结果表明,SABP2可对Me SA有高活性,对Me JA和Me IAA有低或无活性;At MES10可对Me JA有高活性,而对Me SA和Me IAA有低或无活性,这与实验结果相一致.因此,相关酶的结构预测与计算机模拟对了解酶的底物专一性具有重要的意义. 展开更多
关键词 酶催化 底物专一性 计算机模拟 蛋白质结构预测 甲酯酶
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利用机器学习提高M.jannaschii酪氨酰tRNA合成酶底物特异性分子建模预测的准确度 被引量:1
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作者 段秉亚 孙应飞 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1214-1232,共19页
设计结合不同化学结构底物的酶结合袋是一个巨大的挑战.传统的湿实验要筛选成千上万甚至上百万个突变体来寻找对特定配体结合的突变体,此过程需要耗费大量的时间和资源.为了加快筛选过程,我们提出了一种新的工作流程,将分子建模和数据... 设计结合不同化学结构底物的酶结合袋是一个巨大的挑战.传统的湿实验要筛选成千上万甚至上百万个突变体来寻找对特定配体结合的突变体,此过程需要耗费大量的时间和资源.为了加快筛选过程,我们提出了一种新的工作流程,将分子建模和数据驱动的机器学习方法相结合,生成具有高富集率的突变文库,用于高效筛选能识别特定底物的蛋白质突变体.M.jannaschii酪氨酰tRNA合成酶(Mj.TyrRS)能识别特定的非天然氨基酸并催化形成氨酰tRNA,其不同的突变体能够识别不同结构的非天然氨基酸,并且已经有了许多报道和数据的积累,因此我们使用TyrRS作为一个例子来进行此筛选流程的概念验证.基于已知的多个Mj.TyrRS的晶体结构及分子建模的结果,我们发现D158G/P是影响残基158~163位α螺旋蛋白骨架变化的关键突变.我们的模拟结果表明,在含有687个突变体的测试数据中,与随机突变相比,分子建模和打分函数计算排序可以将目标突变体的富集率提高2倍,而使用已知突变体和对应的非天然氨基酸数据训练的机器学习模型进行校准后,筛选富集率可提高11倍.这种分子建模和机器学习相结合的计算和筛选流程非常有助于Mj.TyrRS的底物特异性设计,可以大大减少湿实验的时间和成本.此外,这种新方法在蛋白质计算设计领域具有广泛的应用前景. 展开更多
关键词 酪氨酰tRNA合成酶 遗传密码扩展 酶底物特异性 ROSETTA 分子建模 机器学习
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一种新的ELISA无毒底物TMBS在血清结核菌抗原检测中的应用
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作者 丁惠强 胡忠义 韩海年 《宁夏医学杂志》 CAS 1993年第3期139-142,共4页
通过实验室操作,介绍3,3,5,5,一四甲基联苯胺硫酸盐(TMBS)作为ELISA底物,应用于血清结核抗原的检测;TMBS的主要优点是无致癌性,敏感性高,显色结果终止后稳定。通过实验确定了TMBS在ELISA中的最佳反应条件;经试用于Ⅲ例各种结核病人血清... 通过实验室操作,介绍3,3,5,5,一四甲基联苯胺硫酸盐(TMBS)作为ELISA底物,应用于血清结核抗原的检测;TMBS的主要优点是无致癌性,敏感性高,显色结果终止后稳定。通过实验确定了TMBS在ELISA中的最佳反应条件;经试用于Ⅲ例各种结核病人血清结核抗原检测,结果敏感性是目前最常用的底物邻苯二胺(OPD)的2.3倍,阳性检出率增加10.81%差异显著(P<0.05)。 展开更多
关键词 底物特异性 ELISA 抗原 结核杆菌
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