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2021年云南省红河州手足口病病例标本中分离的2株新型肠道病毒EV-C96 VP1区基因特征分析
1
作者 普伟 赵福琴 +4 位作者 柏桦 姜黎黎 田炳均 伏晓庆 罗春蕊 《中国病毒病杂志》 CAS 2024年第2期124-129,共6页
目的对2021年云南省红河州手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例标本中分离的2株新型肠道病毒EV-C96的基因特征进行分析,为今后对该病毒的防控提供分子流行病学数据。方法收集2021年1—12月红河州手足口病病例的粪便和咽拭... 目的对2021年云南省红河州手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例标本中分离的2株新型肠道病毒EV-C96的基因特征进行分析,为今后对该病毒的防控提供分子流行病学数据。方法收集2021年1—12月红河州手足口病病例的粪便和咽拭子标本,从处理后的标本中提取病毒RNA,采用实时荧光定量反转录聚合酶链反应(real-time quantitative reverse transcription PCR,real-time qRT-PCR)法进行病毒鉴定。对鉴定出的其他肠道病毒进行基因测序定型。用肠道病毒特异性引物扩增VP1区基因,用DNAStar软件中的Seqman程序对病毒基因进行编辑、整理,得到其VP1区序列。按文献下载EV-C96病毒VP1基因代表株参考序列,用Mega 5.2软件进行基因特征分析。结果2021年红河州共报告手足口病病例6017例,发病率为171.73/10万,其中,经real-time qRT-PCR法确诊的429例手足口病病例中,EV-A71感染57例,占13.29%(57/429),CVA16感染137例,占31.93%(137/429),其他肠道病毒感染235例,占54.78%(235/429),用基因测序法从235例其他肠道病毒感染病例样本中检测到2株EV-C96,占0.85%(2/235)。基因特征分析表明这2株EV-C96病毒属C基因型。结论2021年云南省红河州手足口病病原体以其他肠道病毒为主,其中2株为EV-C96,属C基因型。这是云南省首次从手足口病病例中检测到新型肠道病毒EV-C96。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒c组96型 VP1区基因 基因特征分析
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肠道病毒C组96型VP1蛋白线性B细胞表位筛选与鉴定
2
作者 何韵怡 刘阳阳 +1 位作者 胡嘉华 刘洪波 《华夏医学》 CAS 2024年第2期1-9,共9页
目的鉴定肠道病毒C组96型(enterovirus C96,EV-C96)VP1蛋白的线性B细胞表位。方法采用IEDB网站提供的在线分析工具分析、预测EV-C96 VP1蛋白的线性B细胞表位,结合其二级结构、β-转角、抗原性、亲水性等多项参数,筛选出优势候选表位;应... 目的鉴定肠道病毒C组96型(enterovirus C96,EV-C96)VP1蛋白的线性B细胞表位。方法采用IEDB网站提供的在线分析工具分析、预测EV-C96 VP1蛋白的线性B细胞表位,结合其二级结构、β-转角、抗原性、亲水性等多项参数,筛选出优势候选表位;应用间接ELISA法检测候选表位与EV-C96免疫血清的反应性以及与21种其他常见手足口病病原血清的交叉反应性;应用微量中和试验测定表位抗体的中和效价;采用序列比对分析表位的序列保守性;应用结构对齐分析表位的结构特异性。结果通过生物信息学筛选出EVC96 VP1蛋白7个候选表位(P1~P7);ELISA法检测发现P7(氨基酸序列位置为282~304)与EV-C96多克隆抗体有强反应性,与其他常见EV多克隆抗体不发生明显反应;微量中和试验显示,P7抗体的中和效价低于1∶2;序列及结构分析结果显示,P7的氨基酸序列在EV-C96型内具有较高保守性,与其他EV相应位点氨基酸序列的结构有明显差异。结论P7表位为EV-C96特异的非中和性B细胞表位,可作为开发EV-C96检测试剂盒的候选抗原表位。 展开更多
关键词 肠道病毒c组96型 VP1蛋白 线性B细胞表位 手足口病
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肠道病毒D68型和C96型的研究进展
3
作者 刘阳阳 刘洪波 《医学综述》 2019年第8期1546-1550,共5页
肠道病毒(EV)是全球最常见的致病性病毒之一,可以引起手足口病、急性弛缓性麻痹、急性无力脊髓炎等多系统多种急慢性疾病,同时具有种类多、变异快的特点,其中有型别曾在美国、欧洲等世界多个地区引起过大规模暴发性流行。近年来,EVD68和... 肠道病毒(EV)是全球最常见的致病性病毒之一,可以引起手足口病、急性弛缓性麻痹、急性无力脊髓炎等多系统多种急慢性疾病,同时具有种类多、变异快的特点,其中有型别曾在美国、欧洲等世界多个地区引起过大规模暴发性流行。近年来,EVD68和EVC96的检出率在我国逐年升高,其中EVD68曾于2014年在美国大规模流行。虽然目前两者尚未在我国大规模暴发,但随着检出率的不断增长及EV的不断重组进化,其对公众健康具有极大的威胁。因此,未来需加快对EVC96及EVD68等新EV防治诊疗手段的研发。 展开更多
关键词 肠道病毒D68型 EVc96型 基因重组
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