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基于人工染色体的DNA信息存储前沿进展 被引量：1
1
作者 杨洋 樊春海 《合成生物学》 CSCD 2021年第3期305-308,共4页
作为信息存储的替代材料,DNA体现着高信息存储密度和长期稳定等特性。来自天津大学的元英进教授团队最近在酵母菌内完成了从头设计并合成一条人工染色体用于编码两张图片和一段视频数据的研究。这项成果建立了体内组装编码的人工染色体... 作为信息存储的替代材料,DNA体现着高信息存储密度和长期稳定等特性。来自天津大学的元英进教授团队最近在酵母菌内完成了从头设计并合成一条人工染色体用于编码两张图片和一段视频数据的研究。这项成果建立了体内组装编码的人工染色体的数据存储策略,可以实现一次写入、稳定复制和多次读取,从而体现出低成本海量数据分发的巨大优势。 展开更多
关键词 dna存储 人工染色体 合成生物学 编码dna
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基于改进生成式对抗网络的编码DNA分子识别 被引量：1
2
作者 随学杰 王慧锋 颜秉勇 《华东理工大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期241-246,共6页
纳米孔道单分子检测技术通过在纳米孔道中捕获分子穿过时产生的离子流变化信号来研究单个分子的信息。然而,由于纳米孔道对不同分子的捕获率不同,因此采集到的单分子数据集不平衡,进而影响分子识别的准确率。本文基于编码DNA分子的阻断... 纳米孔道单分子检测技术通过在纳米孔道中捕获分子穿过时产生的离子流变化信号来研究单个分子的信息。然而,由于纳米孔道对不同分子的捕获率不同,因此采集到的单分子数据集不平衡,进而影响分子识别的准确率。本文基于编码DNA分子的阻断事件,构建以深度卷积生成式对抗网络(DCGAN)为基本框架的模型,实现少数类样本的扩充,从而达到纳米孔道数据集的平衡处理,并采用QuipuNet对平衡前后的数据集进行训练和识别。结果表明,采用DCGAN平衡数据集后,训练后的QuipuNet对部分"100"编码分子的识别准确率提升了14%,且平均识别准确率均高于其他扩充数据集的方法,验证了采用DCGAN扩充编码DNA分子数据以平衡数据集可有效提高模型训练后对实际信号的识别准确率。 展开更多
关键词 深度卷积生成式对抗网络 QuipuNet 分类 纳米孔道数据分析 编码dna分子
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基于VAE的编码DNA载体阻断事件聚类分析与研究
3
作者 魏梓轩 周家乐 《华东理工大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期411-418,共8页
纳米孔道检测技术是单分子检测领域一个重要的研究方向。对纳米孔道阻断电流信号进行特征提取和转换,是对阻断事件进行分类以确定分析物种类的关键。由于有监督学习只能对已知种类的阻断事件进行预测,难以实现对信号本质特征的区分,因... 纳米孔道检测技术是单分子检测领域一个重要的研究方向。对纳米孔道阻断电流信号进行特征提取和转换,是对阻断事件进行分类以确定分析物种类的关键。由于有监督学习只能对已知种类的阻断事件进行预测,难以实现对信号本质特征的区分,因此本文基于编码DNA载体的阻断事件,利用卷积神经网络的特征提取特性,提出了一种应用于纳米孔道信号的无监督聚类方法。结合深度嵌入聚类和变分自编码器(Variational Autoencoder, VAE),实现了对阻断事件的特征转换和聚类的整体性训练。实验结果表明,该聚类方法能对编码DNA载体阻断事件提供较好的聚类结果,与其他聚类算法相比,最高提升了29%的聚类精度,具有更高的聚类准确度。 展开更多
关键词 变分自编码器 聚类 深度嵌入 纳米孔道数据分析 编码dna载体
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基于基因工程思想的产品族设计及其关键技术研究 被引量：3
4
作者 高磊 万静 陈东宁 《图学学报》 CSCD 北大核心 2012年第1期38-43,共6页
通过分析型材断面的尺寸和形状特征的继承关系及型材模块的结构变异,将基因工程的思想用于产品族的开发设计中,并将"型材特征"看作是产品结构信息的"DNA"。借鉴生物学领域基因工程原理,揭示了"型材特征"... 通过分析型材断面的尺寸和形状特征的继承关系及型材模块的结构变异,将基因工程的思想用于产品族的开发设计中,并将"型材特征"看作是产品结构信息的"DNA"。借鉴生物学领域基因工程原理,揭示了"型材特征"这种信息流在产品树中的传播规律,在此基础上提出了一种基于基因工程思想的产品基因编码与重组方法。通过对产品族和产品基因DNA的概念以及产品族设计DNA的内涵和研究内容的探讨,指出了支持产品基因工程的关键技术,并以门体型材为例,说明产品族基因工程思想的设计效果。 展开更多
关键词 产品族设计 基因编码 dna 门型材 基因工程思想
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