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与猪流行性腹泻病毒M蛋白互作的宿主蛋白的鉴定
被引量:
3
1
作者
王瑞阳
于瑞嵩
+5 位作者
陈冰清
李凤平
谢春芳
司伏生
董世娟
李震
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期1434-1442,共9页
【背景】猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)膜蛋白(M)在病毒粒子的组装、膜融合和病毒复制等方面具有重要的作用,但M蛋白与宿主细胞的互作机制尚不清楚。【目的】利用免疫沉淀技术和液质联用技术筛选细胞内与PEDV...
【背景】猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)膜蛋白(M)在病毒粒子的组装、膜融合和病毒复制等方面具有重要的作用,但M蛋白与宿主细胞的互作机制尚不清楚。【目的】利用免疫沉淀技术和液质联用技术筛选细胞内与PEDVM蛋白相互作用的蛋白,为揭示M蛋白在病毒增殖过程中发挥的功能提供研究基础。【方法】将MOI=0.1的PEDV DR13疫苗株接种于长成单层的Vero细胞,感染36 h后,收集细胞并进行裂解。利用抗M的单克隆抗体沉淀与M相互作用蛋白复合物,通过液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)进行鉴定并利用细胞功能富集分析(Gene ontology,GO)对感染组鉴定到的细胞蛋白进行分析,确定两个细胞内源性蛋白为候选蛋白,进行免疫共沉淀(Co-IP)验证和共定位分析。【结果】基于鉴定蛋白的肽段数的方法分析显示,感染组与对照组相比,鉴定了218个与M蛋白相互作用的细胞内源性蛋白,分别与蛋白质合成、代谢、细胞信号通路转导等密切相关,选择细胞分裂周期蛋白42 (Cell division cycle 42,CDC42)、真核翻译起始因子3亚基L蛋白(eIF3L)为候选蛋白进行Co-IP(Co-immunoprecipitation)验证和共定位分析,结果证实CDC42、eIF3L蛋白分别与M蛋白在细胞内存在相互作用。【结论】鉴定出PEDV M蛋白能够与宿主细胞CDC42和eIF3L蛋白相互作用,并鉴定出其他可能与M蛋白发生相互作用的宿主蛋白60个,为开展PEDV与宿主细胞蛋白相互作用研究提供了重要理论依据。
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关键词
免疫共沉淀
猪流行性腹泻病毒
CDC42
eif
3
l
膜蛋白
蛋白互作
原文传递
新疆细毛羊eIF3l基因的克隆、原核表达及蛋白检测
2
作者
于常江
沈敏
+3 位作者
杨华
杨永林
祁成年
张云生
《畜牧与兽医》
北大核心
2017年第8期16-20,共5页
为了探究新疆细毛羊真核生物翻译起始因子(eukaryotic translation initiation factors,eIFs)基因eIF3l序列和原核表达蛋白特征,采用RTPCR法从新疆细毛羊成纤维细胞中克隆eIF3l基因mRNA的CDS区编码序列,构建其原核表达载体,并进行原核...
为了探究新疆细毛羊真核生物翻译起始因子(eukaryotic translation initiation factors,eIFs)基因eIF3l序列和原核表达蛋白特征,采用RTPCR法从新疆细毛羊成纤维细胞中克隆eIF3l基因mRNA的CDS区编码序列,构建其原核表达载体,并进行原核表达和蛋白检测。结果显示:完整获得eIF3l基因1 695 bp,共编码564个氨基酸残基;37℃,1 mmol/L异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)诱导3.5 h可形成大量包涵体蛋白,其分子量约为69 ku;Western blot鉴定目的蛋白表达正确。结果表明:新疆细毛羊eIF3l基因原核表达成功,为进一步研究其功能和应用提供了科学数据。
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关键词
新疆细毛羊
eif
3
l
基因
载体构建
原核表达
原文传递
题名
与猪流行性腹泻病毒M蛋白互作的宿主蛋白的鉴定
被引量:
3
1
作者
王瑞阳
于瑞嵩
陈冰清
李凤平
谢春芳
司伏生
董世娟
李震
机构
上海海洋大学水产与生命学院
上海市农业科学院畜牧兽医研究所
上海农业遗传育种重点实验室
上海种猪工程技术研究中心
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期1434-1442,共9页
基金
国家自然科学基金(31602060)
上海市农业科学院学科领域建设专项(31602060-2016匹配)
+1 种基金
国家重点研发计划(2016YFD0500101)
上海市科技兴农重点攻关项目(沪农科攻字(2015)第6-1-9号)~~
文摘
【背景】猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)膜蛋白(M)在病毒粒子的组装、膜融合和病毒复制等方面具有重要的作用,但M蛋白与宿主细胞的互作机制尚不清楚。【目的】利用免疫沉淀技术和液质联用技术筛选细胞内与PEDVM蛋白相互作用的蛋白,为揭示M蛋白在病毒增殖过程中发挥的功能提供研究基础。【方法】将MOI=0.1的PEDV DR13疫苗株接种于长成单层的Vero细胞,感染36 h后,收集细胞并进行裂解。利用抗M的单克隆抗体沉淀与M相互作用蛋白复合物,通过液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)进行鉴定并利用细胞功能富集分析(Gene ontology,GO)对感染组鉴定到的细胞蛋白进行分析,确定两个细胞内源性蛋白为候选蛋白,进行免疫共沉淀(Co-IP)验证和共定位分析。【结果】基于鉴定蛋白的肽段数的方法分析显示,感染组与对照组相比,鉴定了218个与M蛋白相互作用的细胞内源性蛋白,分别与蛋白质合成、代谢、细胞信号通路转导等密切相关,选择细胞分裂周期蛋白42 (Cell division cycle 42,CDC42)、真核翻译起始因子3亚基L蛋白(eIF3L)为候选蛋白进行Co-IP(Co-immunoprecipitation)验证和共定位分析,结果证实CDC42、eIF3L蛋白分别与M蛋白在细胞内存在相互作用。【结论】鉴定出PEDV M蛋白能够与宿主细胞CDC42和eIF3L蛋白相互作用,并鉴定出其他可能与M蛋白发生相互作用的宿主蛋白60个,为开展PEDV与宿主细胞蛋白相互作用研究提供了重要理论依据。
关键词
免疫共沉淀
猪流行性腹泻病毒
CDC42
eif
3
l
膜蛋白
蛋白互作
Keywords
Co-IP
PEDV
CDC42
eif
3
l
Membrane protein
Protein-protein interaction
分类号
S852.651 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
新疆细毛羊eIF3l基因的克隆、原核表达及蛋白检测
2
作者
于常江
沈敏
杨华
杨永林
祁成年
张云生
机构
塔里木大学动物科学学院
绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室
出处
《畜牧与兽医》
北大核心
2017年第8期16-20,共5页
基金
国家"863"计划(2013AA102506)
国家自然科学基金项目(30960249)
兵团种质资源创新与功能基因发掘及利用专项(2012BB044)
文摘
为了探究新疆细毛羊真核生物翻译起始因子(eukaryotic translation initiation factors,eIFs)基因eIF3l序列和原核表达蛋白特征,采用RTPCR法从新疆细毛羊成纤维细胞中克隆eIF3l基因mRNA的CDS区编码序列,构建其原核表达载体,并进行原核表达和蛋白检测。结果显示:完整获得eIF3l基因1 695 bp,共编码564个氨基酸残基;37℃,1 mmol/L异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)诱导3.5 h可形成大量包涵体蛋白,其分子量约为69 ku;Western blot鉴定目的蛋白表达正确。结果表明:新疆细毛羊eIF3l基因原核表达成功,为进一步研究其功能和应用提供了科学数据。
关键词
新疆细毛羊
eif
3
l
基因
载体构建
原核表达
Keywords
Xinjiang Fine-woo
l
sheep
eif
3
l
gene
vector construction
prokaryotic expression
分类号
S826 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
与猪流行性腹泻病毒M蛋白互作的宿主蛋白的鉴定
王瑞阳
于瑞嵩
陈冰清
李凤平
谢春芳
司伏生
董世娟
李震
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
3
原文传递
2
新疆细毛羊eIF3l基因的克隆、原核表达及蛋白检测
于常江
沈敏
杨华
杨永林
祁成年
张云生
《畜牧与兽医》
北大核心
2017
0
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