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鸭γ干扰素在体外细胞中抗鸭肠炎病毒作用的研究
被引量:
4
1
作者
李思琪
尹海畅
+3 位作者
王怡平
金建丽
陈洪岩
赵丽丽
《中国兽医科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期1365-1373,共9页
为初步探究鸭γ干扰素(IFNγ)抗病毒作用,本研究从鸭胚成纤维细胞(duck embryo fibroblast,DEF)中扩增出鸭γ干扰素(IFNγ) cDNA。将鸭IFNγ基因分别与真核表达载体PCAGG及原核表达载体p ET-32a连接,获得重组质粒PCAGG-IFNγ及pET...
为初步探究鸭γ干扰素(IFNγ)抗病毒作用,本研究从鸭胚成纤维细胞(duck embryo fibroblast,DEF)中扩增出鸭γ干扰素(IFNγ) cDNA。将鸭IFNγ基因分别与真核表达载体PCAGG及原核表达载体p ET-32a连接,获得重组质粒PCAGG-IFNγ及pET-32a-IFNγ。转染PCAGG-IFNγ于DEF细胞后第24小时,接种鸭肠炎病毒(duck enteritis virus,DEV)。同时将pET-32a-IFNγ在大肠杆菌原核表达系统中进行蛋白表达,并用纯化产物处理DEF细胞,处理后第24小时接种DEV,分别采用Western-blot、TCID50测定方法和荧光定量PCR检测重组蛋白IFNγ对DEV复制的影响,并检测细胞中相关干扰素刺激因子(interferonstimulated genes,ISGs)基因包括抗黏液病毒基因(Myxovirus resistance,Mx)、泛素样2′-5′寡聚腺苷酸合成酶基因(2′-5′oligoadenylatesynthetases-like,OASL)、DEAD框蛋白50基因(DEAD-box protein 50,DDX50)的表达情况。结果发现,无论是真核表达的还是原核表达的重组IFNγ均能抑制DEV的复制,并引起ISGs基因表达的上调。本研究结果为进一步探索鸭IFNγ的抗病毒机制提供了基础数据。
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关键词
鸭γ干扰素
鸭胚成纤维细胞
鸭肠炎病毒
原文传递
基于RNA-Seq筛选新型鸭细小病毒感染鸭胚成纤维细胞的差异表达基因
被引量:
1
2
作者
崔元
李晓轩
+1 位作者
孙继国
袁万哲
《现代畜牧兽医》
2018年第5期1-6,共6页
为筛选鸭细小病毒(DPV)感染鸭胚成纤维(DEF)细胞后的差异表达基因,本研究利用DPV接种DEF细胞作为试验组,对照组加入相同体积的2%DMEM,培养至72 h后提取2组样品的总RNA,利用RNA-Seq技术筛选出DEF细胞感染DPV后的差异表达基因,并对其进行...
为筛选鸭细小病毒(DPV)感染鸭胚成纤维(DEF)细胞后的差异表达基因,本研究利用DPV接种DEF细胞作为试验组,对照组加入相同体积的2%DMEM,培养至72 h后提取2组样品的总RNA,利用RNA-Seq技术筛选出DEF细胞感染DPV后的差异表达基因,并对其进行生物信息学GO功能分类和KEGG分析。结果显示,差异表达水平变化倍数(fold change,FC)在2倍以上的基因共有4 073个,其中上调表达基因1 904个,下调表达2 169个。GO功能分析显示,这些基因主要涉及到炎症反应、免疫反应、蛋白结合、转运活动等功能。KEGG信号通路分析表明,这些差异表达基因参与细胞因子受体相互作用、新陈代谢、TNF、NF-κB、Jak-STAT、Toll样受体等信号通路。应用荧光定量PCR(Real-time FQ-PCR)验证部分差异表达基因的检测结果显示,差异基因的相对表达量与RNA-Seq技术测序结果基本一致,表明了RNA-Seq检测结果的可靠性。本研究为进一步研究DPV的致病作用及宿主抗病机制奠定了基础。
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关键词
鸭细小病毒
鸭胚成纤维细胞
转录组测序
差异表达基因
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职称材料
题名
鸭γ干扰素在体外细胞中抗鸭肠炎病毒作用的研究
被引量:
4
1
作者
李思琪
尹海畅
王怡平
金建丽
陈洪岩
赵丽丽
机构
中国农业科学院、哈尔滨兽医研究所、兽医生物技术国家重点实验室/黑龙江省实验动物与比较医学重点实验室
牡丹江师范学院生命科学与技术学院
出处
《中国兽医科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期1365-1373,共9页
基金
黑龙江省青年科学基金项目(QC2018033)
上海市科委科研计划项目(16140900500)
+3 种基金
黑龙江省自然科学基金重点项目(ZD2016006)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610302016013
1610302017013
1610302018013)
文摘
为初步探究鸭γ干扰素(IFNγ)抗病毒作用,本研究从鸭胚成纤维细胞(duck embryo fibroblast,DEF)中扩增出鸭γ干扰素(IFNγ) cDNA。将鸭IFNγ基因分别与真核表达载体PCAGG及原核表达载体p ET-32a连接,获得重组质粒PCAGG-IFNγ及pET-32a-IFNγ。转染PCAGG-IFNγ于DEF细胞后第24小时,接种鸭肠炎病毒(duck enteritis virus,DEV)。同时将pET-32a-IFNγ在大肠杆菌原核表达系统中进行蛋白表达,并用纯化产物处理DEF细胞,处理后第24小时接种DEV,分别采用Western-blot、TCID50测定方法和荧光定量PCR检测重组蛋白IFNγ对DEV复制的影响,并检测细胞中相关干扰素刺激因子(interferonstimulated genes,ISGs)基因包括抗黏液病毒基因(Myxovirus resistance,Mx)、泛素样2′-5′寡聚腺苷酸合成酶基因(2′-5′oligoadenylatesynthetases-like,OASL)、DEAD框蛋白50基因(DEAD-box protein 50,DDX50)的表达情况。结果发现,无论是真核表达的还是原核表达的重组IFNγ均能抑制DEV的复制,并引起ISGs基因表达的上调。本研究结果为进一步探索鸭IFNγ的抗病毒机制提供了基础数据。
关键词
鸭γ干扰素
鸭胚成纤维细胞
鸭肠炎病毒
Keywords
duck
interferon
gamma
duck
embryo
fibroblast
cells
duck
enteritis
virus
分类号
S852.659.1 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
基于RNA-Seq筛选新型鸭细小病毒感染鸭胚成纤维细胞的差异表达基因
被引量:
1
2
作者
崔元
李晓轩
孙继国
袁万哲
机构
河北农业大学动物医学院
河北省兽医生物技术工程技术研究中心
出处
《现代畜牧兽医》
2018年第5期1-6,共6页
基金
河北省研究生创新资助项目
文摘
为筛选鸭细小病毒(DPV)感染鸭胚成纤维(DEF)细胞后的差异表达基因,本研究利用DPV接种DEF细胞作为试验组,对照组加入相同体积的2%DMEM,培养至72 h后提取2组样品的总RNA,利用RNA-Seq技术筛选出DEF细胞感染DPV后的差异表达基因,并对其进行生物信息学GO功能分类和KEGG分析。结果显示,差异表达水平变化倍数(fold change,FC)在2倍以上的基因共有4 073个,其中上调表达基因1 904个,下调表达2 169个。GO功能分析显示,这些基因主要涉及到炎症反应、免疫反应、蛋白结合、转运活动等功能。KEGG信号通路分析表明,这些差异表达基因参与细胞因子受体相互作用、新陈代谢、TNF、NF-κB、Jak-STAT、Toll样受体等信号通路。应用荧光定量PCR(Real-time FQ-PCR)验证部分差异表达基因的检测结果显示,差异基因的相对表达量与RNA-Seq技术测序结果基本一致,表明了RNA-Seq检测结果的可靠性。本研究为进一步研究DPV的致病作用及宿主抗病机制奠定了基础。
关键词
鸭细小病毒
鸭胚成纤维细胞
转录组测序
差异表达基因
Keywords
DPV
duck
embryo
fibroblast
cells
RNA-Seq
Differentially
expressed
genes
分类号
S852.61 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鸭γ干扰素在体外细胞中抗鸭肠炎病毒作用的研究
李思琪
尹海畅
王怡平
金建丽
陈洪岩
赵丽丽
《中国兽医科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018
4
原文传递
2
基于RNA-Seq筛选新型鸭细小病毒感染鸭胚成纤维细胞的差异表达基因
崔元
李晓轩
孙继国
袁万哲
《现代畜牧兽医》
2018
1
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职称材料
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