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猪Nrf2基因克隆、生物信息学分析及启动子区转录活性分析 被引量:6
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作者 刘宗立 陈涛 +4 位作者 杨丹丹 崔景香 李川皓 曾勇庆 陈伟 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期1328-1339,共12页
旨在了解猪Nrf2基因的结构和功能,研究Nrf2基因的转录调控机制。本研究选取6头90 kg左右的健康大蒲莲猪为试验动物,采用cDNA末端快速克隆技术(RACE)和染色体步移技术获得大蒲莲猪Nrf2基因完整的cDNA序列和启动子区域,利用生物信息学软... 旨在了解猪Nrf2基因的结构和功能,研究Nrf2基因的转录调控机制。本研究选取6头90 kg左右的健康大蒲莲猪为试验动物,采用cDNA末端快速克隆技术(RACE)和染色体步移技术获得大蒲莲猪Nrf2基因完整的cDNA序列和启动子区域,利用生物信息学软件分析Nrf2基因及其启动子区域的生物学特征。结果,Nrf2基因cDNA全长2 358 bp,包括87 bp的5′UTR,495 bp的3′UTR序列,CDS区大小为1 776 bp,编码591个氨基酸。对预测蛋白质序列进行生物信息学分析,蛋白分子量为66.402 7 ku,理论等电点(pI)为4.66,大部分二级结构为α-螺旋。采用染色体步移技术扩增得到5′侧翼序列2 091 bp的片段。Nrf2基因5′侧翼区经预测含有典型的TATA-box,不含CpG岛。构建不同长度启动子片段的pGL3-Basic表达载体,转染293T细胞后经双荧光素酶活性检测,提示在-903^-710 bp区域内可能存在正调控区或增强子,生物信息学预测其中含有多个转录因子结合位点,可能参与Nrf2基因转录调控。本研究成功获得了Nrf2基因完整的cDNA序列和启动子区域,并且发现-903^-710 bp为核心启动子,本研究为猪抗氧化应激的遗传改良提供一定理论基础。 展开更多
关键词 Nrf2基因 基因克隆 启动子 双荧光素酶
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Attenuation of the Activation of NLRP3 Inflammasome in Fibroblast Like Synoviocytes of Rheumatoid Arthritis by Baicalin through Regulating the Let-7i-3p/PI3K/Akt/NF-κB Signaling Axis
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作者 Wei ZHANG Li WANG +4 位作者 Yuxin YANG Rui MA Li WANG Ling HUANG Qiaofeng WAN 《Medicinal Plant》 2024年第2期69-73,76,共6页
[Objectives]To study the effect and mechanism of baicalin on the activation of NLRP3 inflammasome in human fibroblast like synoviocytes of rheumatoid arthritis(HFLS-RA).[Methods]To confirm that baicalin alleviated the... [Objectives]To study the effect and mechanism of baicalin on the activation of NLRP3 inflammasome in human fibroblast like synoviocytes of rheumatoid arthritis(HFLS-RA).[Methods]To confirm that baicalin alleviated the activation of NLRP3 inflammasome in HFLS-RA,the expression of NLRP3 before and after baicalin treatment was observed by immunofluorescence.Western blot was used to detect the protein expression of p-PI3K,p-Akt,NF-κB p65,NLRP3,ASC and caspase-1 after baicalin treatment for 48 h,and the contents of IL-1 and IL-18 in the supernatents were detected by ELISA.In order to explore the mechanism of baicalin alleviating the activation of NLRP3 inflammasome,the corresponding relationship between let-7i-3p and PIK3CA was verified by double luciferin and Westen blot analysis.The expression of let-7i-3p and PI3K before and after baicalin intervention was detected by RT-qPCR.let-7i-3p interference was used to verify whether baicalin mitigated the activation of enhanced NLRP3 inflammasome.[Results]Baicalin(50 and 100 mg/L)significantly reduced the activation of NLRP3 inflammasome,inhibited the protein expressions of p-PI3K,p-Akt,NF-κB p65,NLRP3,ASC and caspase-1,and the secretion of IL-1 and IL-18.let-7i-3p and PIK3CA had a targeted correspondence,and baicalin up-regulated the expression of let-7i-3p and down-regulated the expression of PIK3CA.Baicalin attenuated the activation of NLRP3 inflammasome enhanced by let-7i-3p interference.[Conclusions]Baicalin can up-regulate let-7i-3p expression,inhibit PI3K/Akt/NF-κB signal transduction,and thus reduce the activation of NLRP3 inflammasome in HFLS-RA. 展开更多
关键词 BAICALIN Rheumatoid arthritis Human fibroblast like synoviocytes of rheumatoid arthritis NLRP3 inflammasome miRNA dual-luciferase
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黄芩苷调节let-7i-3p/PI3K/Akt/NF-κB信号轴减轻类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞NLRP3炎性小体活化 被引量:1
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作者 张炜 王莉 +4 位作者 杨雨欣 马锐 王丽 黄菱 万巧凤 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期2313-2319,共7页
目的研究黄芩苷减轻类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞(human fibroblast like synoviocytes of rheumatoid arthritis,HFLS-RA)NLRP3炎性小体活化的作用及机制。方法为证实黄芩苷减轻HFLS-RA中NLRP3炎性小体活化,采用免疫荧光观察黄芩苷处... 目的研究黄芩苷减轻类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞(human fibroblast like synoviocytes of rheumatoid arthritis,HFLS-RA)NLRP3炎性小体活化的作用及机制。方法为证实黄芩苷减轻HFLS-RA中NLRP3炎性小体活化,采用免疫荧光观察黄芩苷处理前后NLRP3的表达;Western blot检测黄芩苷处理48 h后,p-PI3K、p-Akt、NF-κB p65、NLRP3、ASC及caspase-1蛋白的表达;ELISA检测细胞上清中IL-1及IL-18的含量。为探究黄芩苷减轻NLRP3炎性小体活化的机制,采用双荧光素酶及Western blot验证let-7i-3p与PIK3CA的对应关系;RT-qPCR检测黄芩苷干预前后let-7i-3p及PI3K的表达;采用let-7i-3p干扰,验证黄芩苷是否减轻了增强的NLRP3炎性小体的活化。结果50、100 mg·L^(-1)黄芩苷明显减轻了NLRP3炎性小体的活化,抑制p-PI3K、p-Akt、NF-κB p65、NLRP3、ASC、caspase-1蛋白的表达,抑制IL-1、IL-18的分泌。let-7i-3p与PIK3CA存在靶向对应关系,黄芩苷上调了let-7i-3p的表达、下调了PIK3CA的表达;黄芩苷减轻了因let-7i-3p干扰而增强的NLRP3炎性小体的活化。结论黄芩苷经上调let-7i-3p表达、抑制PI3K/Akt/NF-κB信号转导,从而减轻NLRP3炎性小体的活化。 展开更多
关键词 黄芩苷 类风湿关节炎 类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞 NLRP3炎性小体 miRNA 双荧光素酶
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mgr-mir-9 implicates Meloidogyne graminicola infection in rice by targeting the effector MgPDI
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作者 TIAN Zhong-ling ZHOU Jia-yan +1 位作者 ZHENG Jing-wu HAN Shao-jie 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2023年第5期1445-1454,共10页
MicroRNAs (miRNAs),a class of small non-coding RNAs,are crucial endogenous gene regulators in a range of animals,including plant-parasitic nematodes.Meloidogyne graminicola is an obligate sedentary endoparasite of ric... MicroRNAs (miRNAs),a class of small non-coding RNAs,are crucial endogenous gene regulators in a range of animals,including plant-parasitic nematodes.Meloidogyne graminicola is an obligate sedentary endoparasite of rice and causes significant yield losses.A number of studies focused on the roles of M.graminicola effectors during the parasitic process;however,how nematode miRNAs regulate its effectors needs elucidating.In this research,we analyzed a cluster of M.graminicola miRNAs obtained at the second-stage juveniles (J2s) stage that are closely linked to the regulation of M.graminicola effectors.There are 49 767 105 total clean reads obtained from three libraries.A total of 233 known miRNAs and 21 novel miRNAs were identified.Among the known miRNAs,mgr-lin-4,mgr-mir-1,mgr-mir-100,mgrmir-86,mgr-mir-279,mgr-mir-87,mgr-mir-71,mgr-mir-9,mgr-mir-50,mgr-mir-72,and mgr-mir-34 are the most abundant11 miRNAs families.Moreover,the expression levels of selected miRNAs were validated by real-time quantitative PCR.We hypothesized that these miRNAs might regulate the expression of secreted effectors during the J2s stage to facilitate its infection.Consistent with this,we found that mgr-mir-9 targets MgPDI,an important M.graminicola effector mRNA.In addition to that,J2s treated with mgr-mir-9 mimics showed down-regulation of MgPDI expression and reduced reproductive ability,alluding mgr-mir-9 is involved in nematode infection.These results provide novel insight into the regulatory functions of M.graminicola miRNAs during the infection and identify miRNAs and their effector targets as potential key management targets to limit parasite survival during the early stages of infection. 展开更多
关键词 microRNA function MELOIDOGYNE graminicola deep SEQUENCING dual-luciferase REPORTER Assay System proteindisulfideisomerase
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牦牛VEGFA双荧光素酶载体构建及与miR-200b的靶向验证
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作者 谢建鹏 陈平 +1 位作者 王斐 何振富 《寒旱农业科学》 2023年第8期745-749,共5页
为探究微小RNA(miR-200b)与血管内皮生长因子A(VEGFA)基因之间的靶向关系,采用miRanda和Targetscan软件预测牦牛miR-200b与VEGFA可能存在结合位点,构建了VEGFA基因3′UTR区的野生型和突变型双荧光素酶载体。利用与目的miRNA靶种子序列... 为探究微小RNA(miR-200b)与血管内皮生长因子A(VEGFA)基因之间的靶向关系,采用miRanda和Targetscan软件预测牦牛miR-200b与VEGFA可能存在结合位点,构建了VEGFA基因3′UTR区的野生型和突变型双荧光素酶载体。利用与目的miRNA靶种子序列相结合基因的突变序列,构建该靶基因的突变型重组质粒(pGL3-promoter-mut VEGFA),再进行重组质粒和目的miRNA的miRNA mimic的共转染实验。结果表明,预测到的miR-200b与VEGFA基因的3′UTR区存在结合位点。PCR进行扩增和测序之后,VEGFA基因3′UTR区的野生型、突变型载体构建成功。共转染VEGFA野生型载体和miR-200b mimic的双荧光素酶活性极显著低于对照组(P<0.05),VEGFA突变型载体和miR-200b mimic共转染的双荧光素酶活性与对照组无显著差异(P>0.05)。说明VEGFA基因的3′UTR区能与miR-200b结合并抑制双荧光素酶活性,验证了VEGFA是miR-200b的靶基因。 展开更多
关键词 牦牛 载体构建 双荧光素酶 VEGFA基因 miR-200b
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pGL3-Basic-COX-2-promoter报告基因重组质粒的构建及其功能鉴定 被引量:3
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作者 李琦 周利红 +3 位作者 王炎 孙珏 高虹 范忠泽 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2008年第31期3498-3504,共7页
目的:构建COX-2基因启动子荧光素酶报告基因重组质粒pGL3-Basic-COX-2-promoter,并进行功能鉴定.方法:根据已知人的COX-2基因启动子序列设计两端引物,扩增人基因组DNA中的COX-2启动子.载体质粒pGL3-Basic和COX-2启动子分别用限制性内切... 目的:构建COX-2基因启动子荧光素酶报告基因重组质粒pGL3-Basic-COX-2-promoter,并进行功能鉴定.方法:根据已知人的COX-2基因启动子序列设计两端引物,扩增人基因组DNA中的COX-2启动子.载体质粒pGL3-Basic和COX-2启动子分别用限制性内切酶HindⅢ和BglⅡ双酶切,将COX-2基因启动子插入到pGL3-Basic报告载体中.构建的pGL3-Basic-COX-2-promoter重组质粒和内参质粒pRL-SV40瞬时共转染胃癌MKN45细胞,加入100倍细胞数量的Hpylori共培养不同时间后,检测双荧光素酶的活性.结果:成功构建COX-2基因启动子重组质粒pGL3-Basic-COX-2-promoter,质粒测序及酶切结果完全正确.瞬时转染实验显示,COX-2启动子在MKN45细胞中的转录表达随时间的变化而升高,转染后40h的双报告基因活性是转染后8h的3.5倍(P<0.01);加入Hpylori共培养后,同时间点的荧光素酶活性明显升高(P<0.05或0.01),转染后40h的活性是转染后8h的5倍(P<0.01).结论:pGL3-Basic-COX-2-promoter在胃癌MKN45细胞中能被转录激活,加入Hpylori刺激后COX-2活性显著增强,pGL3-Basic-COX-2-promoter可以用来鉴定和检测细胞中COX-2的水平. 展开更多
关键词 环氧合酶2 启动子 质粒 幽门螺杆菌 双荧光素酶
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利用Gal4/VP16-UAS和双荧光素酶报告基因系统检测γ-分泌酶活性 被引量:1
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作者 刘忠华 阮燕 +1 位作者 查芹芹 张岱 《现代生物医学进展》 CAS 2006年第3期1-4,共4页
目的:确立基于Gal4/vp16-UAS和双荧光素酶报告基因系统检测γ-分泌酶切割淀粉样前体蛋白活性的方法。方法:将插入上游激活序列(UAS)和萤火虫荧光素酶报告基因的质粒MH100,嵌合酵母活性转录因子(Gal4)、单纯疱疹病毒蛋白(VP16)和γ-分泌... 目的:确立基于Gal4/vp16-UAS和双荧光素酶报告基因系统检测γ-分泌酶切割淀粉样前体蛋白活性的方法。方法:将插入上游激活序列(UAS)和萤火虫荧光素酶报告基因的质粒MH100,嵌合酵母活性转录因子(Gal4)、单纯疱疹病毒蛋白(VP16)和γ-分泌酶切割位点的质粒C99-GVP,以及海肾荧光素酶质粒pRL-CMV,用脂质体转染法转入稳定表达淀粉样前体蛋白C末端的人神经母细胞瘤细胞(SH-SY5Y),用免疫沉淀Westernblot分析法检测β-淀粉样蛋白(Aβ)的生成,利用Gal4/vp16-UAS和双荧光素酶报告基因系统测定荧光素酶报告基因的表达。结果:免疫沉淀Westernblot分析表明A(的生成在γ-分泌酶激活剂神经节苷脂GM1作用下升高并呈剂量依赖性,同时双荧光素酶法检测γ-分泌酶活性也同步升高。在γ-分泌酶抑制剂作用下Aβ的产生呈剂量依赖性的减少,同时γ-分泌酶活性也同步降低。结论:基于Gal4/vp16-UAS和双荧光素酶报告基因系统检测γ-分泌酶活性的方法有效可靠,是一种敏感、定量的检测方法。 展开更多
关键词 Gal4/vp16-UAS 双荧光素酶 Γ-分泌酶 阿尔茨海默症
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海南黑山羊MBL2基因的转录调控元件的筛选与分析 被引量:2
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作者 王雪梅 翟哲 +9 位作者 陈巧玲 吴艳茹 吴昊天 黄惠娴 刘志勇 李崇瑞 满初日嘎 王凤阳 杜丽 陈思 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1795-1806,共12页
甘露聚糖结合凝集素C(mannose binding lectin C,MBL-C)是C型(Ca^(2+)依赖型)凝集素超家族的成员,其作为一种急性期蛋白,具有抗细菌感染的功能,参与机体的天然免疫反应。为鉴定出结合在MBL2基因启动子区(1009 bp)的重要转录因子,探寻该... 甘露聚糖结合凝集素C(mannose binding lectin C,MBL-C)是C型(Ca^(2+)依赖型)凝集素超家族的成员,其作为一种急性期蛋白,具有抗细菌感染的功能,参与机体的天然免疫反应。为鉴定出结合在MBL2基因启动子区(1009 bp)的重要转录因子,探寻该基因的转录调控机制,本研究选取海南黑山羊MBL2基因的启动子序列1009 bp,采用DNA重组技术克隆6个转录起始位点上游1009 bp的启动子5′端侧翼缺失序列,克隆片段经双酶切后连接至pGL3-Basic载体。重组质粒转染至293T细胞中,结合双荧光素酶活性检测系统筛选MBL2基因的核心启动子区域。通过在线生物信息学软件预测山羊MBL2基因的核心启动子区域的转录因子结合位点,利用点突变技术构建转录因子结合位点缺失的载体,转染293T细胞后结合双荧光素酶活性检测系统分析其转录活性。结果表明,海南黑山羊MBL2基因的核心启动子区域位于转录起始位点上游-304~-45 bp范围内,在线软件分析该区域存在RELA、NF-κB2、MZF1等3种转录因子结合位点。双荧光素酶报告分析结果表明,RELA和NF-κB2的结合位点缺失后均使山羊MBL2基因的转录活性极显著下降(P<0.01)。结果提示,RELA和NF-κB2对山羊MBL2基因的转录活性可能具有重要的正调控作用。该研究为进一步探寻海南黑山羊MBL2基因的功能提供理论依据。 展开更多
关键词 海南黑山羊 MBL2基因 转录调控 双荧光素酶 核心启动子
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Cloning and characterization of an apolipoprotein C2 promoter in the mouse central nervous system 被引量:1
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作者 Zhaoyang Li Bing Du +5 位作者 Shengyang Li Xiangchuan Lv Shenglai Zhou Yang Yu Wei Wang Zhihong Zheng 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2013年第2期156-161,共6页
Apolipoprotein C2 is an important member of the apolipoprotein C family, and is a potent activator of lipoprotein lipase. In the central nervous system, apolipoprotein C2 plays an important role in the catabolism of t... Apolipoprotein C2 is an important member of the apolipoprotein C family, and is a potent activator of lipoprotein lipase. In the central nervous system, apolipoprotein C2 plays an important role in the catabolism of triglyceride-rich lipoproteins. Studies into the exact regulatory mechanism of mouse apolipoprotein C2 expression have not been reported. In this study, seven luciferase expression vectors, which contained potential mouse apolipoprotein C2 gene promoters, were constructed and co-transfected with pRL-TK into HEK293T cells to investigate apolipoprotein C2 promoter activity. Luciferase assays indicated that the apolipoprotein C2 promoter region was mainly located in the +104 bp to +470 bp region. The activity of the different lengths of apolipoprotein C2 promoter region varied. This staggered negative-positive-negative arrangement indicates the complex regulation of apolipoprotein C2 expression and provides important clues for elucidating the regulatory mechanism of apolipoprotein C2 gene transcription. 展开更多
关键词 neural regeneration basic research apolipoprotein C2 PROMOTER dual-luciferase reporter assay transcriptional activity regulatory elements grants-supported paper NEUROREGENERATION
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Impact of Pitx3 gene knockdown on glial cell line-derived neurotrophic factor transcriptional activity in dopaminergic neurons 被引量:1
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作者 Jing Chen Xiao-yu Kang +1 位作者 Chuan-xi Tang Dian-shuai Gao 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2017年第8期1347-1351,共5页
Pitx3 is strongly associated with the phenotype, differentiation, and survival of dopaminergic neurons. The relationship between Pitx3 and glial cell line-derived neurotrophic factor(GDNF) in dopaminergic neurons re... Pitx3 is strongly associated with the phenotype, differentiation, and survival of dopaminergic neurons. The relationship between Pitx3 and glial cell line-derived neurotrophic factor(GDNF) in dopaminergic neurons remains poorly understood. The present investigation sought to construct and screen a lentivirus expression plasmid carrying a rat Pitx3 short hairpin(sh)RNA and to assess the impact of Pitx3 gene knockdown on GDNF transcriptional activity in MES23.5 dopaminergic neurons. Three pairs of interference sequences were designed and separately ligated into GV102 expression vectors. These recombinant plasmids were transfected into MES23.5 cells and western blot assays were performed to detect Pitx3 protein expression. Finally, the most effective Pitx3 sh RNA and a dual-luciferase reporter gene plasmid carrying the GDNF promoter region(GDNF-luciferase) were cotransfected into MES23.5 cells. Sequencing showed that the synthesized sequences were identical to the three Pitx3 interference sequences. Inverted fluorescence microscopy revealed that the lentivirus expression plasmids carrying Pitx3-sh RNA had 40-50% transfection efficiency. Western blot assay confirmed that the corresponding Pitx3 of the third knockdown sequence had the lowest expression level. Dual-luciferase reporter gene results showed that the GDNF transcriptional activity in dopaminergic cells cotransfected with both plasmids was decreased compared with those transfected with GDNF-luciferase alone. Together, the results showed that the designed Pitx3-sh RNA interference sequence decreased Pitx3 protein expression, which decreased GDNF transcriptional activity. 展开更多
关键词 nerve regeneration NEURODEGENERATION Parkinson's disease glial cell line-derived neurotrophic .factor Pitx3 MES23.5 cells shorthairpin RNA gene knockdown PLASMID dual-luciferase reporter gene neural regeneration
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猪E2F3基因3′UTR双荧光素酶报告基因质粒构建及其与miR-10a-5p的靶向验证 被引量:2
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作者 刘鸿艳 郑仰清 +1 位作者 徐晶 张廷荣 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第15期28-32,169,共6页
为了鉴定miR-10a-5p与猪E2F3基因的靶向关系,试验从生物信息miRNA Base数据库查询miR-10a-5p的相关信息,并运用MEGA 6.0软件分析其保守性,通过Target Scan生物信息学网站预测其潜在的靶基因及结合位点,然后PCR扩增E2F3基因3′非编码区(3... 为了鉴定miR-10a-5p与猪E2F3基因的靶向关系,试验从生物信息miRNA Base数据库查询miR-10a-5p的相关信息,并运用MEGA 6.0软件分析其保守性,通过Target Scan生物信息学网站预测其潜在的靶基因及结合位点,然后PCR扩增E2F3基因3′非编码区(3′UTR)片段,构建E2F3的野生型(E2F3-3′UTR-wt)和突变型(E2F3-3′UTR-mut)双荧光素酶报告基因质粒,并分别与miR-10a-5p mimics、mimics NC共转染至293T细胞中,检测双荧光素酶活性变化。结果表明:miR-10a-5p在7个物种间具有高度保守性,成熟序列均为UACCCUGUAGAUCCGAAUUUGU;Target Scan生物信息学网站预测到miR-10a-5p具有包括E2F3基因在内的共241个潜在的靶基因;E2F3基因片段经PCR扩增获得大小约1 288 bp的清晰条带,测序结果与预期一致;转染miR-10a-5p mimics能显著降低猪E2F3基因野生型质粒双荧光素酶活性(P<0.05)。说明猪E2F3基因3′UTR双荧光素酶报告基因质粒构建成功,且其与miR-10a-5p之间存在靶向关系。 展开更多
关键词 E2F3 miR-10a-5p 保守性 双荧光素酶 靶向验证 转染
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绵羊INHBB、SMAD4和FGF18基因的双荧光素酶载体构建及其与miR-370-3p的靶向验证 被引量:2
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作者 李芝丰 储明星 孙伟 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第9期3109-3117,共9页
为研究绵羊输卵管功能相关的oar-miR-370-3p与抑制素亚基βB(inhibin subunit beta B,INHBB)、SMAD家族成员4(SMAD family member 4,SMAD4)和成纤维细胞生长因子18(fibroblast growth factor 18,FGF18)基因之间的靶向关系,本研究对多个... 为研究绵羊输卵管功能相关的oar-miR-370-3p与抑制素亚基βB(inhibin subunit beta B,INHBB)、SMAD家族成员4(SMAD family member 4,SMAD4)和成纤维细胞生长因子18(fibroblast growth factor 18,FGF18)基因之间的靶向关系,本研究对多个物种(绵羊、人、小鼠、大鼠、猕猴、豚鼠和兔)中miR-370-3p的序列进行了比对,利用RNAhybrid程序预测绵羊miR-370-3p与INHBB、SMAD4和FGF18基因的3′UTR可能存在的结合位点,随后分别构建INHBB、SMAD4和FGF18基因3′UTR的野生型和突变型双荧光素酶载体,并将其与miR-370-3p mimics、mimics NC共转染至HEK293T细胞,检测双荧光素酶活性。结果表明,绵羊miR-370-3p序列与其他6个物种不同,但具有一定的保守性。RNAhybrid程序预测到oar-miR-370-3p与INHBB、SMAD4和FGF18基因的3′UTR存在结合位点。PCR扩增结果和测序结果表明,INHBB、SMAD4和FGF18基因3′UTR的野生型和突变型载体构建成功。共转染INHBB、SMAD4和FGF18野生型载体和miR-370-3p mimics的双荧光素酶活性极显著或显著低于相应的对照组(P<0.01;P<0.05);而3种突变型载体和miR-370-3p mimics共转染的双荧光素酶活性均与相应的对照组无显著差异(P>0.05)。表明INHBB、SMAD4和FGF18基因的3′UTR区域均能与miR-370-3p结合并抑制双荧光素酶活性,验证了INHBB、SMAD4和FGF18基因均是miR-370-3p的靶基因,为进一步研究oar-miR-370-3p影响绵羊输卵管功能与绵羊繁殖力的分子机制提供依据。 展开更多
关键词 抑制素亚基βB SMAD家族成员4 成纤维细胞生长因子18 miR-370-3p 双荧光素酶
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中蜂囊状幼虫病毒非编码区对蛋白翻译的影响
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作者 王莹莹 马跃宇 +3 位作者 费东亮 李明 孙莉 马鸣潇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1429-1437,共9页
RNA病毒非编码区对病毒RNA的转译起始、稳定及病毒蛋白表达等方面均起着重要作用,为研究中蜂囊状幼虫病毒(Chinese sacbrood virus,CSBV)非编码区(Untranslated region,UTR)是否对蛋白翻译存在作用,将CSBV 5’UTR和3’UTR分别插入报告... RNA病毒非编码区对病毒RNA的转译起始、稳定及病毒蛋白表达等方面均起着重要作用,为研究中蜂囊状幼虫病毒(Chinese sacbrood virus,CSBV)非编码区(Untranslated region,UTR)是否对蛋白翻译存在作用,将CSBV 5’UTR和3’UTR分别插入报告基因绿色荧光蛋白(Enhanced green fluorescent protein,EGFP)5’端,通过观察绿色荧光强度研究CSBV非编码区对蛋白翻译的影响。此外,利用双荧光素酶检测试剂盒检测5’UTR和3’UTR对荧光素酶活性的影响。结果表明:CSBV 5’UTR和3’UTR能够有效抑制绿色荧光蛋白EGFP表达,其中3’UTR抑制绿色荧光蛋白表达作用更强;经双荧光素酶报告系统检测,质粒pGLl-3’UTR和pGL3-5’UTR中报告基因相对活性分别为对照质粒pGL3-control的0.39和0.69,差异极其显著(P<0.001)。由此可见,CSBV 5’UTR和3’UTR对其蛋白翻译存在抑制作用,且3’UTR作用更加明显。通过本研究,为深入认识CSBV 5’UTR和3’UTR在病毒复制和病毒蛋白翻译中的功能提供了帮助,也有助于对CSBV分子致病机制的研究。 展开更多
关键词 中蜂囊状幼虫病病毒 非编码区 双荧光素酶 抑制
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膝关节骨关节炎中miR-1271的表达及其与ERG的相关性分析
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作者 俞东升 董涛 +1 位作者 夏洪超 徐建 《局解手术学杂志》 2022年第3期231-234,共4页
目的探讨miR-1271在膝关节骨关节炎中的表达情况及其与E26转录因子相关基因(ERG)的相关性。方法选取我院60例膝关节骨关节炎患者作为OA组,另选取60例外伤导致的单纯膝关节半月板损伤患者(非OA组)作为对照。采用qRT-PCR检测膝关节滑液中m... 目的探讨miR-1271在膝关节骨关节炎中的表达情况及其与E26转录因子相关基因(ERG)的相关性。方法选取我院60例膝关节骨关节炎患者作为OA组,另选取60例外伤导致的单纯膝关节半月板损伤患者(非OA组)作为对照。采用qRT-PCR检测膝关节滑液中miR-1271与ERG的表达水平;采用双荧光素酶报告基因实验检测miR-1271与ERG的靶向结合关系;miR-1271与ERG的相关性采用Spearman分析。结果qRT-PCR检测结果显示,与非OA组相比,OA组miR-1271在膝关节骨关节炎中显著高表达(P<0.001),而ERG在膝关节骨关节炎中显著低表达(P<0.001)。OA组关节滑液中miR-1271与ERG的表达呈负相关(r=-0.746,P=0.013),非OA组关节滑液中miR-1271与ERG的表达也呈负相关(r=-0.723,P=0.024)。双荧光素酶报告基因实验结果显示,与共转染NC mimic和PGLO-ERG WT细胞相比,共转染miR-1271 mimic和PGLO-ERG WT细胞的荧光强度显著降低(P<0.001);而共转染NC mimic和PGLO-ERG MUT细胞与共转染miR-1271 mimic和PGLO-ERG MUT细胞的荧光强度比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论miR-1271在膝关节骨关节炎患者中显著高表达,而ERG在膝关节骨关节炎患者中显著低表达,且miR-1271可靶向ERG进行负性调控,对膝关节骨关节炎的发生发展起重要作用。 展开更多
关键词 膝关节骨关节炎 miR-1271 E26转录因子相关基因 双荧光素酶
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转录因子Ets-2调控小鼠成釉细胞MMP-20基因表达的研究 被引量:1
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作者 孙霞 王青山 +5 位作者 韩婷婷 李东亮 孙学玲 孙岩 纪虹利 高玉光 《口腔医学研究》 CAS CSCD 2013年第1期1-4,8,共5页
目的:通过研究Ets-2转录因子对调控小鼠成釉细胞金属基质蛋白酶-20(matrix metalloproteinase-20,MMP-20)基因表达的调控作用,进一步明确Ets-2在釉质发育中的作用。方法:应用免疫组化方法观察出生后5d小鼠切牙成釉细胞中Ets-2的表达;在... 目的:通过研究Ets-2转录因子对调控小鼠成釉细胞金属基质蛋白酶-20(matrix metalloproteinase-20,MMP-20)基因表达的调控作用,进一步明确Ets-2在釉质发育中的作用。方法:应用免疫组化方法观察出生后5d小鼠切牙成釉细胞中Ets-2的表达;在小鼠成釉细胞中分别转染200ng pcDNA3.1/myc-HisA-Ets-2和Ets-2siRNA后,利用实时定量RT-PCR法检测MMP20基因表达的不同变化;用双荧光素酶报告基因检测系统分析Ets-2对MMP-20启动子突变后转录活性的影响。结果:免疫组化显示Ets-2在成釉细胞中呈阳性表达。实时定量RT-PCR研究发现Ets-2过表达后,MMP-20表达水平显著增加;当Ets-2基因沉默后,MMP-20表达水平则显著下降。双荧光素酶报告基因检测系统检测显示,转染pcDNA3.1/myc-HisA-Ets-2的实验组与对照组相比,MMP-20启动子的转录活性升高;对启动子Ets潜在结合部位进行定点突变后,MMP-20启动子的转录活性显著下降,Ets-2丧失上调MMP-20启动子转录活性的作用。结论:小鼠成釉细胞核中Ets-2可通过MMP-20启动子上Ets潜在结合位点,上调MMP-20基因表达水平。 展开更多
关键词 转录因子Ets-2 基质金属蛋白酶-20 免疫组化 RT-PCR 双荧光素酶报告基因检测
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CYP3A4基因启动子受AFB1调控位点的鉴定
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作者 张岩 徐丹丹 +2 位作者 范启明 陈雯 王庆 《热带医学杂志》 CAS 2015年第5期576-579,586,共5页
目的构建不同长度人CYP3A4基因启动子荧光素酶报告质粒并予鉴定,检测L02细胞中各荧光素酶报告质粒相对荧光素酶活性,并分析AFB1处理对其影响,找出AFB1调控人CYP3A4基因可能的启动子区域。方法采用PCR技术扩增不同长度人CYP3A4基因启动... 目的构建不同长度人CYP3A4基因启动子荧光素酶报告质粒并予鉴定,检测L02细胞中各荧光素酶报告质粒相对荧光素酶活性,并分析AFB1处理对其影响,找出AFB1调控人CYP3A4基因可能的启动子区域。方法采用PCR技术扩增不同长度人CYP3A4基因启动子片段,将其插入荧光素酶报告质粒p GL3-basic中荧光素酶编码序列之前,构建含不同长度CYP3A4启动子的报告质粒p GL3-basic-CYP3A4-1~7,将报告质粒转染L02细胞,检测其荧光素酶活性来表示CYP3A4对应启动子片段的转录活性。检测各报告质粒在AFB1处理下与DMSO对照相比荧光素酶活性上升的比例,找出AFB1上调CYP3A4启动子转录活性的作用区域。结果报告质粒测序结果证实,上述荧光素酶报告质粒均构建成功。将报告质粒转染L02细胞,AFB1和DMSO处理后检测结果表明p GL3-basic-CYP3A4-1~6和p GL3-basic-CYP3A4-7相对荧光素酶活性受AFB1上升比率差异有统计学意义(P〈0.05),p GL3-basic-CYP3A4-1至p GL3-basic-CYP3A4-6这6个报告质粒相对荧光素酶活性受AFB1上升比率差异无统计学意义(P〉0.05)。结论成功构建了人CYP3A4基因不同长度启动子片段的荧光素酶报告质粒,并初步确定AFB1可以通过调控CYP3A4启动子-200~0 nt的结合位点来上调CYP3A4的转录活性。 展开更多
关键词 黄曲霉毒素B1 CYP3A4 启动子 双荧光报告
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关岭牛MyoD1与MSTN基因相互表达调控
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作者 田念念 李雄 +3 位作者 黄勇 石鹏飞 孙金魁 许厚强 《生物技术》 CAS 2021年第5期417-424,共8页
[目的]旨在验证牛MyoD1与MSTN在表达调控上的相互作用。[方法]首先,以构建的p EGFP-N3-MyoD1和p EGFP-N3-MSTN过表达载体,分别在两组关岭牛原代成肌细胞中过表达MyoD1和MSTN,细胞转染24 h后,qRT-PCR检测并分析各处理组细胞中MyoD1和MST... [目的]旨在验证牛MyoD1与MSTN在表达调控上的相互作用。[方法]首先,以构建的p EGFP-N3-MyoD1和p EGFP-N3-MSTN过表达载体,分别在两组关岭牛原代成肌细胞中过表达MyoD1和MSTN,细胞转染24 h后,qRT-PCR检测并分析各处理组细胞中MyoD1和MSTN相比表达情况。其次,以海肾荧光载体pRL-TK为内参质粒,在转染p GL-3-MSTN-pro质粒的关岭牛原代成肌细胞中过表达MyoD1,在转染p GL-3-MyoD1-pro质粒的关岭牛原代成肌细胞中过表达MSTN,共转染36 h后,双荧光素酶试剂盒检测分析各组细胞中相对荧光素酶活性变化。[结果]过表达MyoD1组细胞中MyoD1相对表达量相比对照组上调至8 283.987±2 337.534(P=0.004),MSTN的相对表达量上调至7.849±1.089 (P=0.000 4);而MSTN过表达组细胞中MSTN相对表达量相比对照组上调至121 131.802±12 474.046(P=0.004),MyoD1基因的相对表达量下调至0.103±0.016(P=0.000 1)。进一步试验中,过表达MyoD1组细胞中相对荧光素酶活性变化相比对照组从1.131±0.051上调至3.030±0.212(P=0.0001);而过表达MSTN组细胞中相对荧光素酶活性变化相比对照组从1.797±0.136下调至0.543±0.092(P=0.000 2)。[结论]MyoD1的过量表达(P=0.004),会导致MSTN表达显著上调(P=0.000 4);而MSTN的过量表达(P=0.004),可负向调节MyoD1表达(P=0.000 1)。此外MyoD1的过表达会增强MSTN启动子活性(P=0.000 1);而MSTN的过表达会降低MyoD1启动子活性(P=0.000 2)。综上,MyoD1可正向调控MSTN表达,而MSTN也对MyoD1表达起负反馈调节作用。 展开更多
关键词 关岭牛 MyoD1 MSTN 过表达 双荧光素酶 启动子
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A reporter gene system for screening inhibitors of Wnt signaling pathway
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作者 Xing-Yao LI Yuan-Yuan WANG +2 位作者 Chun-Mao YUAN Xiao-Jiang HAO Yan LI 《Natural Products and Bioprospecting》 CAS 2013年第1期24-28,共5页
Abnormal activation of canonical Wnt signaling has been associated with various types of cancer.Inhibitory reagents targeting the Wnt signaling have great potential to inhibit the growth of relevant tumors.Here we gen... Abnormal activation of canonical Wnt signaling has been associated with various types of cancer.Inhibitory reagents targeting the Wnt signaling have great potential to inhibit the growth of relevant tumors.Here we generated a cell-based screening strategy for identification of antagonists of the Wnt/β-catenin signaling pathway.Stable expression wnt3a was generated in HEK293 cell line,which harbors dual-luciferase reporters.The Wnt signaling in the stably transfected cell line was proved to be very sensitive to(-)-epigallocatechin-3-gallate(EGCG)and lithium chloride(LiCl)treatment,respectively.Natural compounds were screened and a couple of novel inhibitory modulators of the Wnt signaling pathway were obtained. 展开更多
关键词 Wnt signaling natural compounds dual-luciferase reporter TUMOR
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牛MyoG基因启动子的克隆及功能的初步分析 被引量:25
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作者 王秋华 曹允考 +4 位作者 李树峰 佟慧丽 兴孝友 李光鹏 严云勤 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期37-43,共7页
本研究旨在比较日本和牛MyoG基因的不同长度片段启动子的活性强弱并初步探讨其中的机制。根据GenBank已公布的牛MyoG基因的启动子序列,设计特异性PCR引物扩增日本和牛MyoG基因的一系列启动子缺失序列,构建重组克隆载体pMD18-T-MyoGpro,... 本研究旨在比较日本和牛MyoG基因的不同长度片段启动子的活性强弱并初步探讨其中的机制。根据GenBank已公布的牛MyoG基因的启动子序列,设计特异性PCR引物扩增日本和牛MyoG基因的一系列启动子缺失序列,构建重组克隆载体pMD18-T-MyoGpro,对阳性克隆进行限制性酶切鉴定、测序及生物信息学分析,进而构建一系列启动子缺失片段的pGL3-MyoGpro双荧光素酶表达载体,转染牛肌源干细胞(MDSCs)和牛胎儿成纤维细胞,并进行双报告基因活性检测。结果表明,日本和牛MyoG基因的166~2 125bp启动子都能不同程度的启动双荧光素酶报告基因在牛肌源干细胞中的表达,且具有肌肉特异性。通过生物信息学分析得知日本和牛MyoG启动子序列中有1个TATA盒,15个E-box,并可能含有MyoD、MEF2、MEF3、MTBF、TEF1、PRDF、Sp1、多个SRF、ERE、GRE及多个Oct-1等转录因子调控结合位点,本试验通过比较不同长度启动子片段的活性并结合对上述转录因子的分析,认为这些转录因子可能对启动子活性起着重要的调控作用。对牛MyoG基因启动子的克隆与功能和序列分析为进一步研究MyoG基因的表达调控奠定了基础。 展开更多
关键词 MYOG基因 启动子序列 转染 双报告检测 肌肉特异性 生物信息学分析
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基于雌激素受体调节Nrf2-ARE通路的黄芩中抗氧化成分的筛选 被引量:12
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作者 刘媛媛 刘陶 +4 位作者 吴玉梅 张晗 赵鑫 刘志东 李楠 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期822-827,共6页
目的建立基于Nrf2-ARE通路的报告基因筛选模型,筛选黄芩中基于雌激素受体发挥抗氧化作用的活性成分。方法 ARE荧光素酶报告质粒p GL4. 37和海肾荧光素酶报告质粒pRL-TK共同转染293T细胞。将黄芩中汉黄芩素、黄芩素、黄芩苷等3个主要活... 目的建立基于Nrf2-ARE通路的报告基因筛选模型,筛选黄芩中基于雌激素受体发挥抗氧化作用的活性成分。方法 ARE荧光素酶报告质粒p GL4. 37和海肾荧光素酶报告质粒pRL-TK共同转染293T细胞。将黄芩中汉黄芩素、黄芩素、黄芩苷等3个主要活性成分和(或)雌激素受体(ER)特异性抑制剂加入Nrf2-ARE双荧光素酶报告基因系统,检测其是否通过ER影响Nrf2-ARE通路,发挥抗氧化作用。将筛选出的成分和(或) ER抑制剂、Nrf2-ARE通路抑制剂加入Ha Ca T细胞中,验证是否通过ER影响Nrf2-ARE通路发挥抗氧化作用。结果黄芩苷(100μmol·L^(-1))可明显激活293T细胞中的Nrf2-ARE通路,诱导表达倍数为空白组的(1. 56±0. 01)倍(P <0. 01)。预给予ER抑制剂后,诱导表达倍数下降至(1. 02±0. 23)倍,抗氧化作用消失。分别预给予ER抑制剂、Nrf2-ARE通路抑制剂后,黄芩苷干预UVB损伤的Ha Ca T细胞中的ROS值明显上升,SOD值明显下降。结论黄芩苷可以通过ER影响Nrf2-ARE通路,发挥抗氧化作用。 展开更多
关键词 黄芩 抗氧化 Nrf2-ARE通路 植物雌激素受体 双荧光素酶报告基因系统 黄芩苷
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