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乙型肝炎病毒基因型分布及耐药突变位点分析
1
作者
王卫杰
张效本
+1 位作者
刘保弟
卢大雷
《实验室检测》
2024年第7期153-156,共4页
目的探讨开封地区乙型肝炎病毒(HBV)基因型分布,基因耐药突变位点分布情况。方法选取开封地区2018年1月至2020年12月期间收集200例乙型肝炎表面抗原(HBsAg)阳性患者,采用基因测序技术检测患者基因型,对检测结果进行统计分析。并对患者...
目的探讨开封地区乙型肝炎病毒(HBV)基因型分布,基因耐药突变位点分布情况。方法选取开封地区2018年1月至2020年12月期间收集200例乙型肝炎表面抗原(HBsAg)阳性患者,采用基因测序技术检测患者基因型,对检测结果进行统计分析。并对患者血清中HBV-DNA进行核苷类似物(NAs)耐药基因位点分析。结果开封地区200例乙型肝炎表面抗原(HBsAg)阳性患者基因型C型179例,占比97.8%,B型4例,占比2.2%,未检测出B+C型及其他型;200例患者测序结果中26例检测出NAs基因耐药突变位点,基因C型患者耐药突变位点检出率高于基因B型患者。结论开封地区乙型肝炎表面抗原阳性患者HBV基因型以C型为主,B型较少,未检测到其它基因型;基因C型患者NAs耐药位点检出率高于B型。NAs耐药突变位点中共检出9种不同耐药突变位点组合模式,以单位点突变为主。
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关键词
乙型肝炎表面抗原阳性
基因型
耐药突变位点
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职称材料
昆明地区1452例低病毒载量慢乙肝患者耐药突变相关位点的分析
被引量:
1
2
作者
余婷婷
王红英
+3 位作者
张润武
白经
普冬
李冬玲
《昆明医科大学学报》
CAS
2022年第9期43-47,共5页
目的对昆明地区低病毒载量乙肝患者进行基因分型及耐药突变位点的分析研究,为低载量乙肝患者临床抗病毒治疗难易程度的判定及抗病毒精准医疗个体化方案的制定提供依据。方法选取1452例低病毒载量(HBV DNA《2.0x10^(3) IU/mL)慢性乙型肝...
目的对昆明地区低病毒载量乙肝患者进行基因分型及耐药突变位点的分析研究,为低载量乙肝患者临床抗病毒治疗难易程度的判定及抗病毒精准医疗个体化方案的制定提供依据。方法选取1452例低病毒载量(HBV DNA《2.0x10^(3) IU/mL)慢性乙型肝炎患者,进行乙肝分型和耐药基因位点检测。结果昆明地区乙肝低载量人群中HBeAg阴性者占比较高(59.5%),男性患者占比(70.6%)高于女性,年龄分布以30~60岁为主(72.7%),基因分型以C基因型占比最高(61.8%)。1452例昆明地区低载量乙肝患者中共有37例患者检出耐药突变位点,其中拉米夫定与恩曲他滨耐药率一致(1.6%),替比夫定耐药率为1.2%,阿德福韦耐药率0.9%,恩替卡韦耐药率0.2%,替诺福韦未检出耐药突变位点。除耐药突变位点外,还检出其他突变位点112例,其中S256G、S213T、N/H238T/D、Q215H检出率最高,检出率最低的突变位点为A194T。结论昆明地区乙肝基因型以C型为主,提示该地区的HBV基因型分布状况有独立特征。昆明地区低病毒载量乙肝患者恩替卡韦的耐药率最低,未发现TDF耐药,但存在替诺福韦酯药物敏感性下降。检出的其他突变位点是否与耐药性相关,仍存在一定的争议,但其检出率也存在一定的占比。
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关键词
HBV
低载量
分型
耐药
突变位点
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职称材料
开封市慢性乙型肝炎患者耐药现状及常见核苷(酸)类治疗药物耐药基因突变位点研究
3
作者
赫琰
周玉霞
+1 位作者
于五辈
徐庆杰
《华南预防医学》
2022年第6期660-664,共5页
目的探究慢性乙肝(CHB)患者耐药现状及常见核苷(酸)类治疗药物耐药基因突变位点。方法以2020年1月1日至2021年9月30日开封市传染病医院及河南大学淮河医院的CHB患者为研究对象,回顾性收集病例资料并对患者进行常见核苷(酸)类治疗药物耐...
目的探究慢性乙肝(CHB)患者耐药现状及常见核苷(酸)类治疗药物耐药基因突变位点。方法以2020年1月1日至2021年9月30日开封市传染病医院及河南大学淮河医院的CHB患者为研究对象,回顾性收集病例资料并对患者进行常见核苷(酸)类治疗药物耐药基因突变位点检测,采用描述性分析方法对结果进行分析。结果本研究共纳入2141例CHB患者,其中男1635例,女506例,年龄20~42岁,平均(31.5±10.5)岁,HBV DNA载量(4.88±1.54)×10^(7)U/mL。30~42岁CHB患者耐药率显著高于20~29岁者(P<0.01)。CHB患者对拉米夫定耐药性较高,对替诺福韦酯、阿德福韦酯敏感性较高。2141例CHB患者检出HBV耐药基因突变788例,占36.81%。M204I、M204V、M250I+M250L是HBV耐药突变位点前3位,分别占22.08%、13.20%、9.64%。B基因型患者为主(占62.20%)。C基因型与B+C混合型患者突变率明显高于B基因型患者,B基因型患者多基因位点突变率明显高于C基因型与B+C混合型患者(P<0.01)。单一药物治疗组与多种药物序贯治疗组耐药基因突变率差异无统计学意义(P>0.05)。停药组耐药基因突变率高于非停药组(P<0.01)。结论长期常见核苷(酸)类药物治疗多出现耐药,可导致多种形式的HBV聚合酶变性,是HBV感染治疗的主要阻碍。临床检测耐药突变位点有利于治疗方案制定,指导治疗药物选择与长期防治。
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关键词
慢性乙肝
耐药
核苷(酸)类治疗药物
耐药基因突变位点
原文传递
结核分枝杆菌基因组变异及其耐药调查
被引量:
7
4
作者
徐国超
王延乾
+4 位作者
朱明武
李冰
朱晓燕
田鹏飞
郭珊
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2019年第8期940-942,958,共4页
目的调查结核分枝杆菌基因组变异及耐药情况,分析其耐药机制,以指导临床治疗。方法收集511例结核病患者痰液标本,进行结核分枝杆菌检查及鉴定。采用比例法进行药物敏感性试验;采用PCR扩增gyrA、katG、rpoB、rpsL基因,分析基因变异情况...
目的调查结核分枝杆菌基因组变异及耐药情况,分析其耐药机制,以指导临床治疗。方法收集511例结核病患者痰液标本,进行结核分枝杆菌检查及鉴定。采用比例法进行药物敏感性试验;采用PCR扩增gyrA、katG、rpoB、rpsL基因,分析基因变异情况。结果共分离144株结核分枝杆菌,其对氧氟沙星、异烟肼、利福平、链霉素的耐药率分别为60.42%、52.78%、43.75%、36.81%。其中对氧氟沙星、异烟肼、利福平、链霉素低耐和高耐药率分别为36.11%和24.31%、33.33%和19.44%、13.19%和30.56%、4.86%和31.94%,药物低耐率与高耐率之间差异无统计学意义(P>0.05)。72株发生gyrA基因变异,基因突变率为82.76%。其中Asp→Gly在94位点突变39株(44.83%),Ala→Val在90位点突变21株(24.14%),Asp→Ala在94位点突变12株(13.79%)。另15株(17.24%)未发生基因变异。53株发生katG基因变异,基因突变率为69.74%。其中Ser→Thr在315位点突变43株(56.58%),Gly→Ser在299位点突变8株(10.53%),Ser→Gly在315位点突变2株(2.63%)。另23株(30.26%)未发生变异。49株发生rpoB基因变异,基因突变率为77.78%。其中Ser→Leu在521位点突变34株(53.97%),His→Leu在526位点突变13株(20.63%),Leu→Pro在533位点突变2株(3.17%)。另14株(22.22%)未发生变异。41株发生rpsL基因变异,基因突变率为77.36%。其中Lys→Arg在43位点突变37株(69.81%),Lys→Arg在88位点突变4株(7.55%)。另12株(22.64%)未发生变异。结论 gyrA、katG、rpoB、rpsL基因变异可能是导致结核分枝杆菌耐药性逐年增高的主要原因,应给予重视。
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关键词
结核分枝杆菌
基因组变异
耐药
变异位点
原文传递
凉山州某县未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的耐药情况分析
被引量:
1
5
作者
刘梅
朱芮
+6 位作者
吴涛
俄尔阿沙木
袁天茹
宋绍芳
刘玲
梁洪远
曹汴川
《中国感染与化疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期19-24,共6页
目的分析凉山州某县未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的传播性耐药(TDR)情况,为了解当地HIV-1耐药株的传播及抗反转录病毒治疗(ART)方案的制定提供理论依据和技术支撑。方法以来源于2022年1—8月在凉山州某县未接受ART的HIV-1感染者为研...
目的分析凉山州某县未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的传播性耐药(TDR)情况,为了解当地HIV-1耐药株的传播及抗反转录病毒治疗(ART)方案的制定提供理论依据和技术支撑。方法以来源于2022年1—8月在凉山州某县未接受ART的HIV-1感染者为研究对象,采集其血液样本并分离血浆和血细胞,血浆样本用于HIV-1 RNA定量检测和HIV-1 RNA基因型耐药检测,血细胞样本用于HIV-1 DNA定量检测和HIV-1 DNA基因型耐药检测。结果135例研究对象中,男性75例(55.6%),女性60例(44.4%),中位年龄37.5岁,彝族占比最大(96.3%)。性途径传播为HIV-1主要传播方式(83.0%)。发生TDR的有11例,发生率为8.1%。诊断HIV-1感染距耐药检测时间的中位数为11 d。HIV-1 RNA以10001~100000拷贝/mL占比较多(43.7%)。HIV-1 DNA以101~1000拷贝/106 cells占比较多(55.6%)。HIV-1亚型中,以B+C亚型重组占比最高(51.9%),其次为CRF07_BC重组型(43.0%)。135例研究对象中,有23例(17.0%)出现耐药突变位点,与非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)有关的耐药突变位点有16例(11.9%),K103N是主要的耐药突变位点,依非韦伦和奈韦拉平是主要的耐药药物;与整合酶抑制剂(INSTI)有关的耐药突变位点有6例(4.4%),E157Q是主要的耐药突变位点,埃替拉韦和拉替拉韦是主要的耐药药物;有1例(0.7%)同时出现NNRTI和INSTI耐药突变位点。经过单因素和多因素logistic回归分析,相较于年龄>30岁,年龄≤30岁发生TDR风险更高。结论凉山州某县未接受ART的HIV-1感染者的耐药情况不容忽视,相较于年龄>30岁,年龄≤30岁发生TDR风险更高,建议HIV-1感染者在接受ART前均进行HIV-1耐药检测。
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关键词
耐药突变位点
传播性耐药
人类免疫缺陷病毒
抗反转录病毒治疗
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职称材料
题名
乙型肝炎病毒基因型分布及耐药突变位点分析
1
作者
王卫杰
张效本
刘保弟
卢大雷
机构
开封市医学科学研究所检验科
开封市中医院检验科
出处
《实验室检测》
2024年第7期153-156,共4页
基金
开封市科技攻关项目(1803024)
文摘
目的探讨开封地区乙型肝炎病毒(HBV)基因型分布,基因耐药突变位点分布情况。方法选取开封地区2018年1月至2020年12月期间收集200例乙型肝炎表面抗原(HBsAg)阳性患者,采用基因测序技术检测患者基因型,对检测结果进行统计分析。并对患者血清中HBV-DNA进行核苷类似物(NAs)耐药基因位点分析。结果开封地区200例乙型肝炎表面抗原(HBsAg)阳性患者基因型C型179例,占比97.8%,B型4例,占比2.2%,未检测出B+C型及其他型;200例患者测序结果中26例检测出NAs基因耐药突变位点,基因C型患者耐药突变位点检出率高于基因B型患者。结论开封地区乙型肝炎表面抗原阳性患者HBV基因型以C型为主,B型较少,未检测到其它基因型;基因C型患者NAs耐药位点检出率高于B型。NAs耐药突变位点中共检出9种不同耐药突变位点组合模式,以单位点突变为主。
关键词
乙型肝炎表面抗原阳性
基因型
耐药突变位点
Keywords
hepatitis
B
surface
antigen
positive
genotype
drug resistance
mutation
sites
分类号
R512.62 [医药卫生—内科学]
下载PDF
职称材料
题名
昆明地区1452例低病毒载量慢乙肝患者耐药突变相关位点的分析
被引量:
1
2
作者
余婷婷
王红英
张润武
白经
普冬
李冬玲
机构
昆明市第三人民医院/云南省传染性疾病临床医学中心
出处
《昆明医科大学学报》
CAS
2022年第9期43-47,共5页
基金
云南省应用基础研究计划基金资助项目(2017FD186)
昆明市卫生健康委卫生科研基金资助项目(2021-11-01-0010)。
文摘
目的对昆明地区低病毒载量乙肝患者进行基因分型及耐药突变位点的分析研究,为低载量乙肝患者临床抗病毒治疗难易程度的判定及抗病毒精准医疗个体化方案的制定提供依据。方法选取1452例低病毒载量(HBV DNA《2.0x10^(3) IU/mL)慢性乙型肝炎患者,进行乙肝分型和耐药基因位点检测。结果昆明地区乙肝低载量人群中HBeAg阴性者占比较高(59.5%),男性患者占比(70.6%)高于女性,年龄分布以30~60岁为主(72.7%),基因分型以C基因型占比最高(61.8%)。1452例昆明地区低载量乙肝患者中共有37例患者检出耐药突变位点,其中拉米夫定与恩曲他滨耐药率一致(1.6%),替比夫定耐药率为1.2%,阿德福韦耐药率0.9%,恩替卡韦耐药率0.2%,替诺福韦未检出耐药突变位点。除耐药突变位点外,还检出其他突变位点112例,其中S256G、S213T、N/H238T/D、Q215H检出率最高,检出率最低的突变位点为A194T。结论昆明地区乙肝基因型以C型为主,提示该地区的HBV基因型分布状况有独立特征。昆明地区低病毒载量乙肝患者恩替卡韦的耐药率最低,未发现TDF耐药,但存在替诺福韦酯药物敏感性下降。检出的其他突变位点是否与耐药性相关,仍存在一定的争议,但其检出率也存在一定的占比。
关键词
HBV
低载量
分型
耐药
突变位点
Keywords
HBV
Low
viral
load
Genotype
drug resistance
mutation
sites
分类号
R512.62 [医药卫生—内科学]
下载PDF
职称材料
题名
开封市慢性乙型肝炎患者耐药现状及常见核苷(酸)类治疗药物耐药基因突变位点研究
3
作者
赫琰
周玉霞
于五辈
徐庆杰
机构
开封市传染病医院
河南大学淮河医院
出处
《华南预防医学》
2022年第6期660-664,共5页
文摘
目的探究慢性乙肝(CHB)患者耐药现状及常见核苷(酸)类治疗药物耐药基因突变位点。方法以2020年1月1日至2021年9月30日开封市传染病医院及河南大学淮河医院的CHB患者为研究对象,回顾性收集病例资料并对患者进行常见核苷(酸)类治疗药物耐药基因突变位点检测,采用描述性分析方法对结果进行分析。结果本研究共纳入2141例CHB患者,其中男1635例,女506例,年龄20~42岁,平均(31.5±10.5)岁,HBV DNA载量(4.88±1.54)×10^(7)U/mL。30~42岁CHB患者耐药率显著高于20~29岁者(P<0.01)。CHB患者对拉米夫定耐药性较高,对替诺福韦酯、阿德福韦酯敏感性较高。2141例CHB患者检出HBV耐药基因突变788例,占36.81%。M204I、M204V、M250I+M250L是HBV耐药突变位点前3位,分别占22.08%、13.20%、9.64%。B基因型患者为主(占62.20%)。C基因型与B+C混合型患者突变率明显高于B基因型患者,B基因型患者多基因位点突变率明显高于C基因型与B+C混合型患者(P<0.01)。单一药物治疗组与多种药物序贯治疗组耐药基因突变率差异无统计学意义(P>0.05)。停药组耐药基因突变率高于非停药组(P<0.01)。结论长期常见核苷(酸)类药物治疗多出现耐药,可导致多种形式的HBV聚合酶变性,是HBV感染治疗的主要阻碍。临床检测耐药突变位点有利于治疗方案制定,指导治疗药物选择与长期防治。
关键词
慢性乙肝
耐药
核苷(酸)类治疗药物
耐药基因突变位点
Keywords
Chronic
hepatitis
B
drug resistance
Nucleoside(acid)
drug
s
Gene
mutation
sites
of
drug resistance
分类号
R512.62 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
结核分枝杆菌基因组变异及其耐药调查
被引量:
7
4
作者
徐国超
王延乾
朱明武
李冰
朱晓燕
田鹏飞
郭珊
机构
新乡市中心医院
新乡医学院第一附属医院
航空工业新乡航空工业(集团)有限公司医院
出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2019年第8期940-942,958,共4页
文摘
目的调查结核分枝杆菌基因组变异及耐药情况,分析其耐药机制,以指导临床治疗。方法收集511例结核病患者痰液标本,进行结核分枝杆菌检查及鉴定。采用比例法进行药物敏感性试验;采用PCR扩增gyrA、katG、rpoB、rpsL基因,分析基因变异情况。结果共分离144株结核分枝杆菌,其对氧氟沙星、异烟肼、利福平、链霉素的耐药率分别为60.42%、52.78%、43.75%、36.81%。其中对氧氟沙星、异烟肼、利福平、链霉素低耐和高耐药率分别为36.11%和24.31%、33.33%和19.44%、13.19%和30.56%、4.86%和31.94%,药物低耐率与高耐率之间差异无统计学意义(P>0.05)。72株发生gyrA基因变异,基因突变率为82.76%。其中Asp→Gly在94位点突变39株(44.83%),Ala→Val在90位点突变21株(24.14%),Asp→Ala在94位点突变12株(13.79%)。另15株(17.24%)未发生基因变异。53株发生katG基因变异,基因突变率为69.74%。其中Ser→Thr在315位点突变43株(56.58%),Gly→Ser在299位点突变8株(10.53%),Ser→Gly在315位点突变2株(2.63%)。另23株(30.26%)未发生变异。49株发生rpoB基因变异,基因突变率为77.78%。其中Ser→Leu在521位点突变34株(53.97%),His→Leu在526位点突变13株(20.63%),Leu→Pro在533位点突变2株(3.17%)。另14株(22.22%)未发生变异。41株发生rpsL基因变异,基因突变率为77.36%。其中Lys→Arg在43位点突变37株(69.81%),Lys→Arg在88位点突变4株(7.55%)。另12株(22.64%)未发生变异。结论 gyrA、katG、rpoB、rpsL基因变异可能是导致结核分枝杆菌耐药性逐年增高的主要原因,应给予重视。
关键词
结核分枝杆菌
基因组变异
耐药
变异位点
Keywords
Mycobacterium
tuberculosis
genomic
variation
drug resistance
mutation
site
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
R52 [医药卫生—临床医学]
原文传递
题名
凉山州某县未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的耐药情况分析
被引量:
1
5
作者
刘梅
朱芮
吴涛
俄尔阿沙木
袁天茹
宋绍芳
刘玲
梁洪远
曹汴川
机构
越西县第一人民医院抗病毒治疗中心
首都医科大学附属北京地坛医院艾滋病临床中心
西南医科大学附属医院感染病科
出处
《中国感染与化疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期19-24,共6页
基金
中国性病艾滋病防治协会·妇幼泰格关爱及预防母婴传播基金(PMTCT202207)。
文摘
目的分析凉山州某县未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的传播性耐药(TDR)情况,为了解当地HIV-1耐药株的传播及抗反转录病毒治疗(ART)方案的制定提供理论依据和技术支撑。方法以来源于2022年1—8月在凉山州某县未接受ART的HIV-1感染者为研究对象,采集其血液样本并分离血浆和血细胞,血浆样本用于HIV-1 RNA定量检测和HIV-1 RNA基因型耐药检测,血细胞样本用于HIV-1 DNA定量检测和HIV-1 DNA基因型耐药检测。结果135例研究对象中,男性75例(55.6%),女性60例(44.4%),中位年龄37.5岁,彝族占比最大(96.3%)。性途径传播为HIV-1主要传播方式(83.0%)。发生TDR的有11例,发生率为8.1%。诊断HIV-1感染距耐药检测时间的中位数为11 d。HIV-1 RNA以10001~100000拷贝/mL占比较多(43.7%)。HIV-1 DNA以101~1000拷贝/106 cells占比较多(55.6%)。HIV-1亚型中,以B+C亚型重组占比最高(51.9%),其次为CRF07_BC重组型(43.0%)。135例研究对象中,有23例(17.0%)出现耐药突变位点,与非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)有关的耐药突变位点有16例(11.9%),K103N是主要的耐药突变位点,依非韦伦和奈韦拉平是主要的耐药药物;与整合酶抑制剂(INSTI)有关的耐药突变位点有6例(4.4%),E157Q是主要的耐药突变位点,埃替拉韦和拉替拉韦是主要的耐药药物;有1例(0.7%)同时出现NNRTI和INSTI耐药突变位点。经过单因素和多因素logistic回归分析,相较于年龄>30岁,年龄≤30岁发生TDR风险更高。结论凉山州某县未接受ART的HIV-1感染者的耐药情况不容忽视,相较于年龄>30岁,年龄≤30岁发生TDR风险更高,建议HIV-1感染者在接受ART前均进行HIV-1耐药检测。
关键词
耐药突变位点
传播性耐药
人类免疫缺陷病毒
抗反转录病毒治疗
Keywords
drug resistance
mutation
site
transmitted
drug resistance
HIV
antiretroviral
therapy
分类号
R512.91 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
乙型肝炎病毒基因型分布及耐药突变位点分析
王卫杰
张效本
刘保弟
卢大雷
《实验室检测》
2024
0
下载PDF
职称材料
2
昆明地区1452例低病毒载量慢乙肝患者耐药突变相关位点的分析
余婷婷
王红英
张润武
白经
普冬
李冬玲
《昆明医科大学学报》
CAS
2022
1
下载PDF
职称材料
3
开封市慢性乙型肝炎患者耐药现状及常见核苷(酸)类治疗药物耐药基因突变位点研究
赫琰
周玉霞
于五辈
徐庆杰
《华南预防医学》
2022
0
原文传递
4
结核分枝杆菌基因组变异及其耐药调查
徐国超
王延乾
朱明武
李冰
朱晓燕
田鹏飞
郭珊
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2019
7
原文传递
5
凉山州某县未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的耐药情况分析
刘梅
朱芮
吴涛
俄尔阿沙木
袁天茹
宋绍芳
刘玲
梁洪远
曹汴川
《中国感染与化疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
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