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前列腺癌差异性下调lncRNA的数据挖掘及表达分析
1
作者
万佳慧
王孝锦
+2 位作者
王秀丽
姜世君
崔荣军
《牡丹江医学院学报》
2019年第2期33-36,共4页
目的筛选前列腺癌中差异性下调的lnc RNA。方法从TCGA数据库获取前列腺癌和癌旁组织的基因表达数据;利用R语言中Edge R程序包筛选前列腺癌中表达下调的lnc RNA;分析排名最靠前的lnc RNA在前列腺癌不同种族、年龄、Gleason评分的临床样...
目的筛选前列腺癌中差异性下调的lnc RNA。方法从TCGA数据库获取前列腺癌和癌旁组织的基因表达数据;利用R语言中Edge R程序包筛选前列腺癌中表达下调的lnc RNA;分析排名最靠前的lnc RNA在前列腺癌不同种族、年龄、Gleason评分的临床样本中的差异表达; Graph Pad Prism绘制ROC曲线; KEGG分析获取相关信号转导通路。结果筛选出前列腺癌组织中显著下调的lnc RNA166种,其中EMX2OS排名最靠前; EMX2OS能够区分前列腺癌组织与癌旁组织;不同种族、不同Gleason评分、不同年龄前列腺癌组织EMX2OS的表达与癌旁组织相比显著降低(P<0.01); Gleason评分为7与Gleason评分为9的前列腺癌组织相比,EMX2OS的表达显著降低(P<0.05); EMX2OS的相关基因主要富集于c GMP-PKG、血管平滑肌收缩、钙离子等与肿瘤的发生发展密切相关的信号转导途径。结论筛选出前列腺癌组织显著低表达的lnc RNA EMX2OS,有望成为前列腺癌的诊断标志。
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关键词
下调
lncrna
EMX2OS
差异表达
前列腺癌
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职称材料
题名
前列腺癌差异性下调lncRNA的数据挖掘及表达分析
1
作者
万佳慧
王孝锦
王秀丽
姜世君
崔荣军
机构
牡丹江医学院生物化学与分子生物学教研室
齐齐哈尔市第七医院检验科
大庆医学高等专科学校检验教研室
出处
《牡丹江医学院学报》
2019年第2期33-36,共4页
基金
牡丹江医学院研究生创新科研项目(2017YJSCX-04MY)
文摘
目的筛选前列腺癌中差异性下调的lnc RNA。方法从TCGA数据库获取前列腺癌和癌旁组织的基因表达数据;利用R语言中Edge R程序包筛选前列腺癌中表达下调的lnc RNA;分析排名最靠前的lnc RNA在前列腺癌不同种族、年龄、Gleason评分的临床样本中的差异表达; Graph Pad Prism绘制ROC曲线; KEGG分析获取相关信号转导通路。结果筛选出前列腺癌组织中显著下调的lnc RNA166种,其中EMX2OS排名最靠前; EMX2OS能够区分前列腺癌组织与癌旁组织;不同种族、不同Gleason评分、不同年龄前列腺癌组织EMX2OS的表达与癌旁组织相比显著降低(P<0.01); Gleason评分为7与Gleason评分为9的前列腺癌组织相比,EMX2OS的表达显著降低(P<0.05); EMX2OS的相关基因主要富集于c GMP-PKG、血管平滑肌收缩、钙离子等与肿瘤的发生发展密切相关的信号转导途径。结论筛选出前列腺癌组织显著低表达的lnc RNA EMX2OS,有望成为前列腺癌的诊断标志。
关键词
下调
lncrna
EMX2OS
差异表达
前列腺癌
Keywords
down
-
regulated
lncrna
EMX2OS
gene
expression
Prostate
adenocarcinoma
分类号
R34 [医药卫生—基础医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
前列腺癌差异性下调lncRNA的数据挖掘及表达分析
万佳慧
王孝锦
王秀丽
姜世君
崔荣军
《牡丹江医学院学报》
2019
0
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