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PCR-DGGE技术分析不同包装条件下鱼肉表面优势菌的菌群变化
被引量:
8
1
作者
涂宗财
马达
+3 位作者
王辉
石燕
沙小梅
黄小琴
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014年第20期143-147,共5页
采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-deformation gradient gel electrophoresis analysis,PCR-DGGE)技术研究3种包装(空气、真空、气调)结合钴60辐照技术对鱼肉表面优势菌菌群的影响,分别选择6种辐照剂量(...
采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-deformation gradient gel electrophoresis analysis,PCR-DGGE)技术研究3种包装(空气、真空、气调)结合钴60辐照技术对鱼肉表面优势菌菌群的影响,分别选择6种辐照剂量(0、2、4、6、8、10 kGy)照射4℃贮藏18 d后的鱼肉表面优势腐败菌群进行研究。方法:采集第18天不同包装不同剂量的草鱼肉样品,洗脱鱼肉表面菌;提取DNA,扩增16S rDNA的V3可变区,用PCRDGGE技术鉴定优势菌,割胶回收测序。结果表明:不同包装鱼肉表面优势菌群数量和种类不同,在样品中共同的优势腐败菌为假单胞菌,在空气包装中优势腐败菌是假单胞菌、乳酸菌和沙雷菌,沙雷菌在辐照剂量高于8 kGy时被抑制。在真空包装中优势腐败菌是假单胞菌、沙雷菌、热死环丝菌和耶尔森菌,沙雷菌辐照剂量高于6 kGy时被抑制,而耶尔森菌在2 kGy以上即被抑制,热死环丝菌在6、8 kGy辐照条件下才出现,其具有很高的辐照抗性。在气调包装中优势腐败菌是假单胞菌和乳酸菌,但乳酸菌仅在气调包装2 kGy辐照和气调包装8 kGy两种辐照包装条件下是优势腐败菌。结果表明,PCR-DGGE技术可以很好地鉴别鱼肉表面优势腐败菌。
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关键词
草鱼
聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳
微生物
优势菌群
气调包装
辐照
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职称材料
祁连山老虎沟12号冰川退缩对细菌优势种群影响的初步研究
被引量:
5
2
作者
张淑红
侯书贵
+3 位作者
秦翔
杜文涛
孙维君
闫沛迎
《冰川冻土》
CSCD
北大核心
2013年第3期751-760,共10页
随着全球冰川正在越来越多的地区融化,冰川微生物资源很可能会由于冰川退缩而未被人类所发现就已受到生存的威胁而濒危.以祁连山老虎沟12号冰川消融区和末端雪样及末端土样为研究对象,采用培养方法、分子鉴定,研究冰川雪样优势菌群在冰...
随着全球冰川正在越来越多的地区融化,冰川微生物资源很可能会由于冰川退缩而未被人类所发现就已受到生存的威胁而濒危.以祁连山老虎沟12号冰川消融区和末端雪样及末端土样为研究对象,采用培养方法、分子鉴定,研究冰川雪样优势菌群在冰川末端土样的分布状况及生理生化指标变化情况,分析冰川细菌优势菌群在冰川退缩后适应非雪环境的能力.结果表明:冰川末端雪样优势菌为1BW1和1BW2所代表的Pedobacter,该属在冰川消融区雪样和冰川末端土样中未分离到;冰川消融区雪样优势菌为2BW所代表的Acinetobacter,该属在冰川末端雪样中的数量较少,在冰川末端土样中的数量更少.不同采样位点16SrRNA序列相似性高的菌株其生理生化特征比相同采样位点的大.因此,冰川冰退缩可能会引发冰川雪样中的优势种群不能适应新环境而灭绝.应加强冰川细菌资源利用和保护的研究基础.
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关键词
老虎沟12号冰川
退缩
细菌优势种群
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职称材料
题名
PCR-DGGE技术分析不同包装条件下鱼肉表面优势菌的菌群变化
被引量:
8
1
作者
涂宗财
马达
王辉
石燕
沙小梅
黄小琴
机构
南昌大学食品科学与技术国家重点实验室
江西师范大学功能有机小分子教育部重点实验室
出处
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014年第20期143-147,共5页
基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2012CB126314)
江西省重大科技创新研究项目(20124ACB00600)
文摘
采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-deformation gradient gel electrophoresis analysis,PCR-DGGE)技术研究3种包装(空气、真空、气调)结合钴60辐照技术对鱼肉表面优势菌菌群的影响,分别选择6种辐照剂量(0、2、4、6、8、10 kGy)照射4℃贮藏18 d后的鱼肉表面优势腐败菌群进行研究。方法:采集第18天不同包装不同剂量的草鱼肉样品,洗脱鱼肉表面菌;提取DNA,扩增16S rDNA的V3可变区,用PCRDGGE技术鉴定优势菌,割胶回收测序。结果表明:不同包装鱼肉表面优势菌群数量和种类不同,在样品中共同的优势腐败菌为假单胞菌,在空气包装中优势腐败菌是假单胞菌、乳酸菌和沙雷菌,沙雷菌在辐照剂量高于8 kGy时被抑制。在真空包装中优势腐败菌是假单胞菌、沙雷菌、热死环丝菌和耶尔森菌,沙雷菌辐照剂量高于6 kGy时被抑制,而耶尔森菌在2 kGy以上即被抑制,热死环丝菌在6、8 kGy辐照条件下才出现,其具有很高的辐照抗性。在气调包装中优势腐败菌是假单胞菌和乳酸菌,但乳酸菌仅在气调包装2 kGy辐照和气调包装8 kGy两种辐照包装条件下是优势腐败菌。结果表明,PCR-DGGE技术可以很好地鉴别鱼肉表面优势腐败菌。
关键词
草鱼
聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳
微生物
优势菌群
气调包装
辐照
Keywords
grass
carp
polymerase
chain
reaction-deformation
gradient
gel
electrophoresis
analysis(PCR-DGGE)
microorganisms
dominant
bacterial
population
modified
atmosphere
package
irradiation
分类号
O658.9 [理学—分析化学]
TS254.7 [理学—化学]
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职称材料
题名
祁连山老虎沟12号冰川退缩对细菌优势种群影响的初步研究
被引量:
5
2
作者
张淑红
侯书贵
秦翔
杜文涛
孙维君
闫沛迎
机构
商丘师范学院生命科学学院
南京大学地理与海洋学院
中国科学院寒区旱区环境与工程研究所冰冻圈科学国家重点实验室
山东师范大学人口.资源与环境学院
出处
《冰川冻土》
CSCD
北大核心
2013年第3期751-760,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31100369
41201067
+2 种基金
41071046
41171052)
冰冻圈科学国家重点实验室自主项目(SKLCS-ZZ-2012-01-05)资助
文摘
随着全球冰川正在越来越多的地区融化,冰川微生物资源很可能会由于冰川退缩而未被人类所发现就已受到生存的威胁而濒危.以祁连山老虎沟12号冰川消融区和末端雪样及末端土样为研究对象,采用培养方法、分子鉴定,研究冰川雪样优势菌群在冰川末端土样的分布状况及生理生化指标变化情况,分析冰川细菌优势菌群在冰川退缩后适应非雪环境的能力.结果表明:冰川末端雪样优势菌为1BW1和1BW2所代表的Pedobacter,该属在冰川消融区雪样和冰川末端土样中未分离到;冰川消融区雪样优势菌为2BW所代表的Acinetobacter,该属在冰川末端雪样中的数量较少,在冰川末端土样中的数量更少.不同采样位点16SrRNA序列相似性高的菌株其生理生化特征比相同采样位点的大.因此,冰川冰退缩可能会引发冰川雪样中的优势种群不能适应新环境而灭绝.应加强冰川细菌资源利用和保护的研究基础.
关键词
老虎沟12号冰川
退缩
细菌优势种群
Keywords
Laohugou
Glacier
No.12
retreat
dominant
bacterial
population
分类号
Q938.15 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
PCR-DGGE技术分析不同包装条件下鱼肉表面优势菌的菌群变化
涂宗财
马达
王辉
石燕
沙小梅
黄小琴
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014
8
下载PDF
职称材料
2
祁连山老虎沟12号冰川退缩对细菌优势种群影响的初步研究
张淑红
侯书贵
秦翔
杜文涛
孙维君
闫沛迎
《冰川冻土》
CSCD
北大核心
2013
5
下载PDF
职称材料
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