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蛋白质二级结构预测的结构表达方法研究
1
作者
吕庆章
牛静
+1 位作者
李小娟
王珂芳
《河南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期87-90,共4页
蛋白质二级结构预测时,描述窗口内氨基酸残基序列的各种物理化学和分子结构参数的数量非常大,而且不能很好地直接体现氨基酸的连接顺序,这样就造成二级结构预测工作既费时效果又低下,因此,对这些数据预处理是非常必要的.研究发现,这些...
蛋白质二级结构预测时,描述窗口内氨基酸残基序列的各种物理化学和分子结构参数的数量非常大,而且不能很好地直接体现氨基酸的连接顺序,这样就造成二级结构预测工作既费时效果又低下,因此,对这些数据预处理是非常必要的.研究发现,这些初始数据对应的变换矩阵的本征值谱与氨基酸残基序列情况无关,只与氨基酸的类别、数量性质有关,而其本征函数数据能够直接反映氨基酸残基的序列情况,利用有显著大小的本征值对应的本征函数作为描述参数,在进行蛋白质二级结构预测时,不但能够显著减少描述参数的个数,而且它体现了氨基酸顺序的变化,这将有效提高蛋白质二级结构预测研究效果.
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关键词
描述参数
氨基酸残基序列
蛋白质二级结构预测
平移窗口
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职称材料
题名
蛋白质二级结构预测的结构表达方法研究
1
作者
吕庆章
牛静
李小娟
王珂芳
机构
河南师范大学化学与环境科学学院
出处
《河南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期87-90,共4页
基金
河南省杰出青年科学基金(064100002600)
河南省高校青年骨干教师资助计划
文摘
蛋白质二级结构预测时,描述窗口内氨基酸残基序列的各种物理化学和分子结构参数的数量非常大,而且不能很好地直接体现氨基酸的连接顺序,这样就造成二级结构预测工作既费时效果又低下,因此,对这些数据预处理是非常必要的.研究发现,这些初始数据对应的变换矩阵的本征值谱与氨基酸残基序列情况无关,只与氨基酸的类别、数量性质有关,而其本征函数数据能够直接反映氨基酸残基的序列情况,利用有显著大小的本征值对应的本征函数作为描述参数,在进行蛋白质二级结构预测时,不但能够显著减少描述参数的个数,而且它体现了氨基酸顺序的变化,这将有效提高蛋白质二级结构预测研究效果.
关键词
描述参数
氨基酸残基序列
蛋白质二级结构预测
平移窗口
Keywords
describeing
parameter
amino
acid′s
sequence
protein′s
secondary
structure
prediction
slide
window
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蛋白质二级结构预测的结构表达方法研究
吕庆章
牛静
李小娟
王珂芳
《河南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2009
0
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职称材料
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