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大豆紫色酸性磷酸酶GmPAP14克隆与生物信息学分析
被引量：
9
1
作者
孔佑宾
宁英达
+3 位作者
刘渊
李喜焕
常文锁
张彩英
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期7-11,24,共6页
采用RT-PCR技术克隆大豆紫色酸性磷酸酶(Purple acid phosphatase,PAP)基因,并对基因及其编码蛋白进行生物信息学分析,为植物磷高效转基因育种及分子机制解析提供候选基因。结果表明:从低磷处理14d的‘中黄15’cDNA中克隆获得一条开放...
采用RT-PCR技术克隆大豆紫色酸性磷酸酶(Purple acid phosphatase,PAP)基因,并对基因及其编码蛋白进行生物信息学分析,为植物磷高效转基因育种及分子机制解析提供候选基因。结果表明:从低磷处理14d的‘中黄15’cDNA中克隆获得一条开放阅读框1 395bp的基因,经保守域分析发现该基因属于紫色酸性磷酸酶类,命名为GmPAP14(GenBank No.JN967626)。对基因编码蛋白进行生物信息学分析发现,GmPAP14编码1条含有464个氨基酸残基的多肽链,分子量约53.1kD,理论等电点6.14,且含有紫色酸性磷酸酶所特有的5个保守基序和7个金属离子结合位点。进一步分析发现GmPAP14具有跨膜结构与信号肽,定位于质膜或分泌到胞外。经系统发育树分析显示GmPAP14与苜蓿MtPAP1及大豆GmPAP1具有同源性,预测可能与植物磷素高效吸收利用有关。
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关键词
低磷胁迫
大豆
紫色酸性磷酸酶(PAP)基因
生物信息学
下载PDF
职称材料
题名
大豆紫色酸性磷酸酶GmPAP14克隆与生物信息学分析
被引量：
9
1
作者
孔佑宾
宁英达
刘渊
李喜焕
常文锁
张彩英
机构
教育部华北作物种质资源研究与利用重点实验室河北农业大学
迁安市农业畜牧水产局
出处
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期7-11,24,共6页
基金
国家转基因重大专项资助项目(2009ZX08004-004B)
国家自然科学基金项目(31071441)
+1 种基金
河北省自然科学基金项目(C2010000749)
河北省教育厅科学研究项目(2009)
文摘
采用RT-PCR技术克隆大豆紫色酸性磷酸酶(Purple acid phosphatase,PAP)基因,并对基因及其编码蛋白进行生物信息学分析,为植物磷高效转基因育种及分子机制解析提供候选基因。结果表明:从低磷处理14d的‘中黄15’cDNA中克隆获得一条开放阅读框1 395bp的基因,经保守域分析发现该基因属于紫色酸性磷酸酶类,命名为GmPAP14(GenBank No.JN967626)。对基因编码蛋白进行生物信息学分析发现,GmPAP14编码1条含有464个氨基酸残基的多肽链,分子量约53.1kD,理论等电点6.14,且含有紫色酸性磷酸酶所特有的5个保守基序和7个金属离子结合位点。进一步分析发现GmPAP14具有跨膜结构与信号肽,定位于质膜或分泌到胞外。经系统发育树分析显示GmPAP14与苜蓿MtPAP1及大豆GmPAP1具有同源性,预测可能与植物磷素高效吸收利用有关。
关键词
低磷胁迫
大豆
紫色酸性磷酸酶(PAP)基因
生物信息学
Keywords
deprived
phosphorus
soybean
purple
acid
phosphatase
gene
bioinformatics
analysis
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大豆紫色酸性磷酸酶GmPAP14克隆与生物信息学分析
孔佑宾
宁英达
刘渊
李喜焕
常文锁
张彩英
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
9
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