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基于肺癌患者8个抑癌基因启动子CpG岛甲基化构建人工神经网络筛查模型 被引量:4
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作者 亢春彦 张秀芝 +3 位作者 王丹丹 高凤兰 王风翔 陈洁 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2020年第21期1718-1724,共7页
目的分析外周血P16、死亡相关蛋白激酶(death-associated protein kinase,DAPK)、RAS相关区域家族1A(RAS association domain family protein 1A,RASSF1A)、脆性组氨酸三联体(fragile histidine traid,FHIT)、肠腺瘤性息肉病基因(adenom... 目的分析外周血P16、死亡相关蛋白激酶(death-associated protein kinase,DAPK)、RAS相关区域家族1A(RAS association domain family protein 1A,RASSF1A)、脆性组氨酸三联体(fragile histidine traid,FHIT)、肠腺瘤性息肉病基因(adenomatous polyposis coii,APC)、人类O6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶(human O6 methylguanine DNA methyltransfer ase,MGMT)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)及周期素依赖性激酶10(cyclin-dependent kinase 10,CDK10)基因启动子区CpG岛甲基化水平,探讨基于上述8个抑癌基因构建人工神经网络(artificial neural network,ANN)模型在肺癌筛查中的意义。方法选取2015-03-31-2018-11-30河南省胸科医院和郑州大学第二附属医院呼吸内科与胸外科原发性肺癌患者84例,同时选取2个医院体检健康者84例为对照组。采用实时荧光定量甲基化特异PCR(real-timefluorescent quantitative methylation-specific PCR,qMSP)法检测基因启动子区CpG岛甲基化水平。建立ANN筛查模型,Fisher判别分析模型,数据分组与ANN模型分组相同采用ROC曲线评估模型预测效果。结果小细胞肺癌组FHIT(P=0.357)、CDK10(P=0.199)、P16(P=0.275)、MGMT(P=0.887)、RASSF1A(P=0.137)、APC(P=0.248)、EGFR(P=0.083)、DAPK(P=0.993);非小细胞肺癌组FHIT(P=0.248)、CDK10(P=0.301)、P16(P=0.587)、MGMT(P=0.638)、RASSF1A(P=0.169)、APC(P=0.136)、EGFR(P=0.426)、DAPK(P=0.861)基因启动子甲基化水平高于对照组,均P<0.001。二元logistic回归分析显示年龄(OR=0.697,95%CI:0.235~2.065,P=0.315)、吸烟(OR=2.049,95%CI:1.367~3.071,P=0.031)、性别(OR=1.100,95%CI:0.568~2.131,P=0.623)、肿瘤家族史(OR=1.283,95%CI:0.759~2.168,P=0.435)、FHIT甲基化(OR=2.878,95%CI:1.921~4.313,P=0.016)、CDK10甲基化(OR=1.680,95%CI:1.241~2.273,P=0.005)、P16甲基化(OR=1.784,95%CI:1.335~2.385,P=0.010)、MGMT甲基化(OR=1.780,95%CI:1.356~2.336,P=0.013)、RASSF1A甲基化(OR=2.539,95%CI:1.427~4.517,P=0.028)、APC甲基化(OR=2.478,95%CI:1.513~4.059,P=0.001)� 展开更多
关键词 DNA基因甲基化 死亡相关蛋白激酶 人类O6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶 肺癌 人工神经网络模型
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5-杂氮-2'-脱氧胞苷抑制人喉癌裸鼠移植瘤的机制探讨 被引量:3
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作者 张松 孔维佳 +2 位作者 郭长凯 王彦君 韩月臣 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2005年第21期1212-1215,共4页
目的:探讨5-杂氮-2′-脱氧胞苷对Hep-2人喉癌裸鼠移植瘤生长的影响,寻找喉癌治疗的新靶点。方法:建立喉癌裸鼠移植瘤模型,用5-杂氮-2′-脱氧胞苷处理裸鼠,观察移植瘤的生长情况并绘制其生长曲线。用RT-PCR和免疫组织化学技术检测死亡相... 目的:探讨5-杂氮-2′-脱氧胞苷对Hep-2人喉癌裸鼠移植瘤生长的影响,寻找喉癌治疗的新靶点。方法:建立喉癌裸鼠移植瘤模型,用5-杂氮-2′-脱氧胞苷处理裸鼠,观察移植瘤的生长情况并绘制其生长曲线。用RT-PCR和免疫组织化学技术检测死亡相关蛋白激酶(Death-associatedproteinkinaseDAPK)基因mRNA及蛋白表达的变化。结果:5-杂氮-2′-脱氧胞苷对人喉癌裸鼠移植瘤处理后用药组和对照组之间裸鼠的体重无明显差异(t=0.011,P>0.05),而移植瘤的体积用药组较对照组明显减小,统计学差异有显著性(t=10.11,P<0.01)。在喉癌移植瘤组织中,对照组DAPK均不表达,而用药组出现表达。结论:5-杂氮-2′-脱氧胞苷在体内能使因甲基化而失活的抑癌基因再转录,诱导其表达,进而抑制喉癌移植瘤的生长。 展开更多
关键词 HEP-2细胞系 5-杂氮-2′-脱氧胞苷 裸鼠模型 死亡相关蛋白激酶
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死亡相关蛋白激酶1、KLF4、6-氧-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶甲基化状态检测及与宫颈癌人乳头瘤病毒16感染的关系 被引量:5
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作者 倪茗 刘婷婷 +4 位作者 汪俊 邹学红 周红玉 王燕 余桂梅 《实用临床医药杂志》 CAS 2022年第8期117-121,共5页
目的检测宫颈癌组织死亡相关蛋白激酶1(DAPK1)、KLF4、6-氧-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)启动子区域甲基化状态,初步探讨其甲基化状态与宫颈癌人乳头瘤病毒16(HPV16)感染的关系。方法选取宫颈癌患者103例为宫颈癌组,另选取同期年龄... 目的检测宫颈癌组织死亡相关蛋白激酶1(DAPK1)、KLF4、6-氧-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)启动子区域甲基化状态,初步探讨其甲基化状态与宫颈癌人乳头瘤病毒16(HPV16)感染的关系。方法选取宫颈癌患者103例为宫颈癌组,另选取同期年龄相匹配的慢性子宫颈炎患者110例为对照组。检测2组宫颈脱落组织DAPK1、KLF4、MGMT基因甲基化状态。通过人乳头瘤病毒检测HPV16感染情况,分析宫颈癌组织DAPK1、KLF4、MGMT基因甲基化与HPV16感染相关性。结果与对照组相比,宫颈癌组患者HPV16感染阳性率升高,差异有统计学意义(P<0.05);与对照组相比,宫颈癌组DAPK1、KLF4、MGMT基因异常甲基化率升高,差异有统计学意义(P<0.05)。分化程度低、TNM分期Ⅲ~Ⅳ期、有淋巴结转移及有远处转移患者宫颈癌组织DAPK1、KLF4、MGMT甲基化率高于分化程度高、中及TNM分期Ⅰ~Ⅱ、无淋巴结转移、无远处转移患者,差异有统计学意义(P<0.05)。与HPV16感染阴性相比,HPV16感染阳性患者中APK1、KLF4、MGMT甲基化比例升高,差异有统计学意义(P<0.05)。HPV16感染情况与APK1、KLF4、MGMT甲基化相关(r=0.454,0.497,0.307,P<0.05)。结论HPV16感染可能与APK1、KLF4、MGMT甲基化有关,HPV16感染可能通过影响APK1、RAR-β、MGMT基因甲基化促进宫颈癌的发展。 展开更多
关键词 宫颈癌 人乳头瘤病毒感染 死亡相关蛋白激酶1 6氧-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶 甲基化
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DAPK2抑癌基因与机体免疫和肿瘤发生的相关性综述 被引量:1
4
作者 刘晨睿 吴勇军 +3 位作者 李智 张钰华 王丹慧 吴娟 《世界复合医学》 2020年第12期192-195,共4页
DAPK2基因与肿瘤发生相关性研究是肿瘤治疗研究热点,从基因层面对肿瘤进行控制对于攻克肿瘤难题具有重要的意义。目前国内外对于DAPK2和肿瘤相关性的研究还处在以实验验证为主的阶段,深入精确的理论模型还没有完全建立。该文从DAPK2结... DAPK2基因与肿瘤发生相关性研究是肿瘤治疗研究热点,从基因层面对肿瘤进行控制对于攻克肿瘤难题具有重要的意义。目前国内外对于DAPK2和肿瘤相关性的研究还处在以实验验证为主的阶段,深入精确的理论模型还没有完全建立。该文从DAPK2结构与功能入手,展开讨论DAPK2基因表达与肿瘤发生的相关性以及DAPK2基因表达与胶质瘤细胞增殖、侵袭的相关性。通过采用多种实验手段(Transwell实验、RNA干扰实验、划痕愈合实验、克隆形成实验、MTT实验、流式细胞术等),证明DAPK2基因与机体免疫和肿瘤发生存在关联。 展开更多
关键词 死亡相关蛋白激酶2 DAPK2 甲基化 肿瘤治疗 肿瘤诊断
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水杨酸钠诱导大鼠耳蜗中DAPK1表达改变 被引量:1
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作者 翟思佳 黄巧 +2 位作者 廖行伟 刘宇超 尹时华 《中华耳科学杂志》 CSCD 北大核心 2020年第3期552-558,共7页
目的探讨死亡相关蛋白激酶1(death associated protein kinase 1,DAPK1)是否参与水杨酸钠损伤听觉系统的过程。方法将听性脑干反应(ABR)反应阈小于40dB和畸变产物耳声发射(DPOAE)筛查通过的40只SD大鼠随机分为2组:对照组(control组)和... 目的探讨死亡相关蛋白激酶1(death associated protein kinase 1,DAPK1)是否参与水杨酸钠损伤听觉系统的过程。方法将听性脑干反应(ABR)反应阈小于40dB和畸变产物耳声发射(DPOAE)筛查通过的40只SD大鼠随机分为2组:对照组(control组)和水杨酸钠组(SS组)。SS组腹腔注射350mg/kg/d水杨酸钠,对照组腹腔注射等量生理盐水。造模结束后通过ABR、DPOAE等电生理方法确认听觉损害程度;通过HE染色及免疫组化等形态学方法检测耳蜗的病理生理变化和DAPK1蛋白表达分布情况;应用实时荧光定量PCR对各组大鼠耳蜗组织中DAPK1 mRNA转录表达情况进行检测。结果SS组DAPK1 m RNA和蛋白表达水平较对照组表达均减少,差异具有统计学意义,且改变主要集中于耳蜗螺旋神经节(SNG)区域。结论水杨酸钠使大鼠耳蜗尤其SNG中DAPK1的表达下调,DAPK1参与水杨酸钠损伤听觉系统的过程。 展开更多
关键词 水杨酸钠 耳蜗 死亡相关蛋白激酶1 炎性调节
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