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蝮亚科蛇线粒体细胞色素b基因序列分析及其系统发育 被引量:59
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作者 周继亮 张亚平 +3 位作者 黄美华 陈永久 陈小青 姚耿东 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第4期361-366,共6页
对中国产蝮亚科 (Crotalinae)亚洲蝮属 (Gloydius) 6种蛇 (其中短尾蝮取自两个不同地区 ) [短尾蝮Gloydiusbrevicaudus (Stejneger) ,黑眉蝮Gloydiussaxatilis (Emelianov) ,蛇岛蝮Gloydiusshedaoensis (Zhao) ,雪山蝮Gloydiusstrauchii... 对中国产蝮亚科 (Crotalinae)亚洲蝮属 (Gloydius) 6种蛇 (其中短尾蝮取自两个不同地区 ) [短尾蝮Gloydiusbrevicaudus (Stejneger) ,黑眉蝮Gloydiussaxatilis (Emelianov) ,蛇岛蝮Gloydiusshedaoensis (Zhao) ,雪山蝮Gloydiusstrauchii (Bedriaga) ,高原蝮Gloydiusstrauchiimonticola (Werner) ,乌苏里蝮Gloydiusussurriensis(Emelianov) ]与竹叶青属竹叶青蛇TrimeresurusstejnegeriSchmidt共 7种蛇 8个个体测定了 789bp或 744bp线粒体细胞色素b基因序列 ,用MEGA1 0 2软件分析了其碱基组成及变异情况 ,以游蛇科链蛇属半棱鳞链蛇Din odonsemicarinatus序列为外群 ,用PAUP4 0b2软件构建最简约分子系统树。结果显示 ,竹叶青蛇在全部受试物种中处于原始地位 ,分布于东北地区的蛇岛蝮、乌苏里蝮、黑眉蝮与浙江和陕西产的短尾蝮所组成的分枝与横断山区的高原蝮、雪山蝮聚集形成的分枝组成姐妹群 ,支持分布于中国境内的亚洲蝮属蛇种的两个起源及分化地的假说 ,同时探讨了蝮蛇的分类地位问题。 展开更多
关键词 蝮亚科 细胞色素b基因 序列分子 分子系统树 蛇类 系统发育
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基于mtDNA Cytb的六种果实蝇的分子鉴定(双翅目:实蝇科) 被引量:56
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作者 朱振华 叶辉 张智英 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期386-390,共5页
本研究首次对果实蝇属的桔小实蝇Bactroceradorsalis、瓜实蝇B.cucurbitae、南瓜实蝇B.tau、番石榴实蝇B.correcta、具条实蝇B.scutellata、黑漆实蝇B.scutellaris等6种实蝇mtDNACytb基因进行了测序。对这6种实蝇72个个体mtDNACytb基因... 本研究首次对果实蝇属的桔小实蝇Bactroceradorsalis、瓜实蝇B.cucurbitae、南瓜实蝇B.tau、番石榴实蝇B.correcta、具条实蝇B.scutellata、黑漆实蝇B.scutellaris等6种实蝇mtDNACytb基因进行了测序。对这6种实蝇72个个体mtDNACytb基因中段420bp的碱基序列进行分析,得到38种单倍型,发现了116个变异位点,其中30个位点较为稳定。对这6种实蝇与其各自鉴别位点的对应关系研究表明,mtDNACytb基因可以作为这6种实蝇种类鉴别的分子标记。 展开更多
关键词 双翅目 实蝇科 果实蝇属 线粒体DNA 细胞色素b基因 分子鉴定
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白腹锦鸡和红腹锦鸡的遗传分化 被引量:39
3
作者 向余劲攻 杨岚 张亚平 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期225-228,共4页
白腹锦鸡Chrysolophusamherstiae(Leadbeater)和红腹锦鸡Chrysolophuspictus(L.)是两个种还是两个亚种尚有争议。测定了白腹锦鸡C.amherstiae两个个体部分细胞色素b基因序列 ,得到完全相同的861bp的序列。与红腹锦鸡C.pictus的同源序列... 白腹锦鸡Chrysolophusamherstiae(Leadbeater)和红腹锦鸡Chrysolophuspictus(L.)是两个种还是两个亚种尚有争议。测定了白腹锦鸡C.amherstiae两个个体部分细胞色素b基因序列 ,得到完全相同的861bp的序列。与红腹锦鸡C.pictus的同源序列相比 ,在21个位点上出现变异 ,应用木村资生的双参数法算出两者的遗传距离为2.5 %。根据鸡形目细胞色素b基因核苷酸替换的速率约为每百万年0 5 %~0 7 % ,推断出两种锦鸡的分化时间至少为1 7百万年。从而在分子水平上支持白腹锦鸡(C.amherstiae)和红腹锦鸡(C.pictus)是两个独立种。 展开更多
关键词 白腹锦鸡 红腹锦鸡 细胞色素b基因 遗传分化
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多重实时荧光PCR检测牛、山羊和绵羊源性成分 被引量:43
4
作者 曾少灵 秦智锋 +9 位作者 阮周曦 花群义 卢体康 吕建强 陈书琨 曹琛福 张彩虹 孙洁 陈兵 吴绍精 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期139-146,共8页
根据牛、山羊和绵羊线粒体细胞色素b基因序列,设计特异性引物和以不同荧光素标记的Taqman探针。通过对PCR反应体系和反应条件的优化筛选,建立能同时鉴别牛、山羊和绵羊源性成分的多重实时荧光PCR方法。采用本文方法与国标GB/T20190-200... 根据牛、山羊和绵羊线粒体细胞色素b基因序列,设计特异性引物和以不同荧光素标记的Taqman探针。通过对PCR反应体系和反应条件的优化筛选,建立能同时鉴别牛、山羊和绵羊源性成分的多重实时荧光PCR方法。采用本文方法与国标GB/T20190-2006方法分别对17种不同源性动物DNA和200份不同来源样品DNA进行牛羊源性成分检测,数据显示两者检测结果符合率达100%,特异性相当。与国标方法相比,本试验方法不需电泳、酶切和测序,即可在一个PCR反应中同时鉴别检测牛、山羊和绵羊3种源性成分,检测效率提高近3倍;灵敏度更高,比国标方法灵敏10倍;适用性更广,除了饲料,还适用于肉品、奶品、生皮和动物油脂等动物产品的牛羊源性成分检测。 展开更多
关键词 细胞色素b基因 多重实时荧光PCR 山羊和绵羊源性成分
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刺鲃基于线粒体细胞色素b基因的生物地理学过程 被引量:27
5
作者 唐琼英 杨秀平 刘焕章 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期352-356,共5页
以中华倒刺Spinibarbussinensis为外类群 ,研究了不同地理种群刺Spinibarbuscaldwelli细胞色素b基因序列 (114 0bp)变异 ,以探讨其生物地理学过程。结果表明 :长江下游水系与珠江水系种群的变异值为 1 2 %— 2 3% ,与闽江水系的为 ... 以中华倒刺Spinibarbussinensis为外类群 ,研究了不同地理种群刺Spinibarbuscaldwelli细胞色素b基因序列 (114 0bp)变异 ,以探讨其生物地理学过程。结果表明 :长江下游水系与珠江水系种群的变异值为 1 2 %— 2 3% ,与闽江水系的为 2 7%— 3 7% ,与九龙江水系的为 3 1%— 4 2 % ,这些值都远远低于它们与中华倒刺的变异值(13 2 %— 14 6 % )。遗传变异值表明了刺的生物地理学过程 ,首先是东南沿海的水系同内地的水系发生隔离 ,然后珠江水系同长江水系隔离 ,这些变化均发生在第四纪。 展开更多
关键词 刺鲤 细胞色素b 生物地理学过程 鲤形目 线粒体
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不同地域小稻蝗mtDNA部分序列及其相互关系 被引量:30
6
作者 任竹梅 马恩波 郭亚平 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期51-57,共7页
测定了 9个不同地理区域的小稻蝗Oxyaintricata (St l)共 33个个体的线粒体DNA (mtDNA)细胞色素b基因部分序列 ,比较其同源性 ,计算核苷酸组成 ,并用瘤锥蝗科的曲尾似橄蝗Pseudomorphacrishollisi和斑腿蝗科的芋蝗Gesonulapuncti frons... 测定了 9个不同地理区域的小稻蝗Oxyaintricata (St l)共 33个个体的线粒体DNA (mtDNA)细胞色素b基因部分序列 ,比较其同源性 ,计算核苷酸组成 ,并用瘤锥蝗科的曲尾似橄蝗Pseudomorphacrishollisi和斑腿蝗科的芋蝗Gesonulapuncti frons作外群构建NJ分子系统树。在获得的小稻蝗 432bp的序列中 ,A +T约占 70 3 % ,其中 30个核苷酸位点存在变异 (约占所测核苷酸的 6 9% ) ,有 5个位点引起了氨基酸的变异。就每个氨基酸密码子来看 ,第 3位点的A +T含量较高 ,达90 4%。由NJ树显示 ,小稻蝗mtDNA细胞色素b序列不同单倍型之间有一定的分歧 ,形成不同的簇类关系 ,其分枝与地理分布没有直接的对应关系 ,但总体上看 ,这种簇类关系基本上呈平行分布 ,没有明显的地域性差别。 展开更多
关键词 小稻蝗 MTDNA 细胞色素b基因 遗传关系
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基于线粒体cyt b基因标记探讨凤鲚3群体遗传结构和进化特征 被引量:34
7
作者 程起群 马春艳 +3 位作者 庄平 沙珍霞 陆星 缪炯 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期1-7,共7页
为阐明凤鲚不同地理群体的遗传结构和进化关系,采用凤鲚长江(21尾)、闽江(22尾)和珠江(22尾)群体的线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)的细胞色素b(cytb)基因片段序列进行分析。共获得3群体cyt b基因片断607 bp的一致序列... 为阐明凤鲚不同地理群体的遗传结构和进化关系,采用凤鲚长江(21尾)、闽江(22尾)和珠江(22尾)群体的线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)的细胞色素b(cytb)基因片段序列进行分析。共获得3群体cyt b基因片断607 bp的一致序列。序列有102个变异位点,总变异率为16.8%,其中68个为简约位点。各单倍型的变异全部是转换或颠换,无插入和缺失。(A+T)含量为57.6%,大于(G+C)的含量42.4%。核苷酸多态性以闽江群体最高,其它两群体较低。自然选择检验显示3群体内部在分子水平上存在自然选择作用。在所获得的65个序列中,共检测到34种单倍型。群体内的遗传距离为0.3%~1.2%之间,群体间遗传距离在0.8%~10.8%之间。长江群体与珠江群体之间的遗传距离较大为10.8%,长江群体与闽江群体间的遗传距离为10.6%,而珠江和闽江群体之间的遗传距离最小为0.8%。AMOVA分析显示,群体间遗传变异占总变异的90.25%,群体内的遗传变异占总变异的9.75%,提示群体间变异是总变异的主要来源。研究结果提示长江群体和闽江以及珠江群体间的分化可能已达亚种水平。 展开更多
关键词 凤鲚 细胞色素b基因 遗传多样性 遗传分化
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两种鲿科鱼类在长江和珠江流域Cytb基因序列变异性分析 被引量:21
8
作者 杨金权 刘焕章 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期253-257,共5页
采用PCR技术获得了长江和珠江流域的两种科鱼类 1 1 37bpCytb基因的片段 ,进行了序列测定 ,并用Mega软件进行了序列分析。研究发现两种科鱼类的全序列从第十位碱基起有一个三联体密码子的缺失 ,推测为鲇形目鱼类Cytb序列所特有特征... 采用PCR技术获得了长江和珠江流域的两种科鱼类 1 1 37bpCytb基因的片段 ,进行了序列测定 ,并用Mega软件进行了序列分析。研究发现两种科鱼类的全序列从第十位碱基起有一个三联体密码子的缺失 ,推测为鲇形目鱼类Cytb序列所特有特征。黄颡鱼和大鳍种群间的序列差异分别为 0 .4 %和 1 .6 % ,介于一般淡水鱼类mtDNA种内序列的变异范围 ,而高于洄游鱼类序列变异。黄颡鱼属和属Cytb基因序列间的差异为 1 7.6 %— 1 8.0 % ,大大高于种间的序列差异率 ,也从分子水平上证实了二者属级分类单元的有效性。依据分子进化速率推测 ,长江和珠江两水系间大鳍的分歧时间为距今 2 7万年左右的更新世中晚期 ,黄颡鱼的分歧时间在距今 7万年左右的更新世末期。推测造成二者有着不同分歧时间的可能原因是 :大鳍属暖水性鱼类 ,在第四纪冰川期间 ,由于全球性气候变冷 ,大鳍退至长江以南 ,并在各水系间产生隔离 ,各自独立分化至今。而黄颡鱼具有很强的适应性 。 展开更多
关键词 MTDNA CYTb基因 遗传分化 基因序列 变异性 鲿科鱼类
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Cytb分子标记技术在物种鉴定中的应用 被引量:30
9
作者 辛翠娜 彭建军 +1 位作者 王莹 王利利 《野生动物》 2009年第4期217-221,共5页
细胞色素b(Cytochrome b,Cytb)基因作为一种线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)分子标记,其结构和功能是mtDNA的13个蛋白质编码基因中了解得最清楚的基因。它的进化速度适中,一个较小的基因片段就包含着从种内到种间、属间乃至科间的... 细胞色素b(Cytochrome b,Cytb)基因作为一种线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)分子标记,其结构和功能是mtDNA的13个蛋白质编码基因中了解得最清楚的基因。它的进化速度适中,一个较小的基因片段就包含着从种内到种间、属间乃至科间的进化遗传信息,被认为是解决分类及系统进化问题可信的分子标记之一,目前,在很多领域已经得到了广泛的应用。本文将简要介绍Cytb基因及其研究方法,重点总结和归纳Cytb分子标记在物种鉴定中的应用现状并对其应用中的问题及发展趋势做一阐述。 展开更多
关键词 CYTb基因 分子标记 物种鉴定 应用现状 发展趋势
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闽浙地区香鱼线粒体Cytb基因和D-loop区序列多态性分析 被引量:29
10
作者 李娜 陈少波 +2 位作者 谢起浪 吕建新 管敏鑫 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期919-925,共7页
对浙江瑞安、福建宁德、福建东张水库3个地理群体共31例香鱼(Plecoglossus altivelis)的线粒体细胞色素b(Cyt b)基因和线粒体D-loop区序列进行了PCR扩增、序列测定、核苷酸组成和多态性分析。Cytb基因中,A、T、C和G4种核苷酸的比例分别... 对浙江瑞安、福建宁德、福建东张水库3个地理群体共31例香鱼(Plecoglossus altivelis)的线粒体细胞色素b(Cyt b)基因和线粒体D-loop区序列进行了PCR扩增、序列测定、核苷酸组成和多态性分析。Cytb基因中,A、T、C和G4种核苷酸的比例分别为19.72%、29.71%、32.25%和18.32%,A+T含量为49.43%,G+C含量为50.57%。D-loop区序列中,A、T、C和G4种核苷酸的比例分别为29.99%、29.29%、23.80%和16.92%,A+T含量为59.28%,G+C含量为40.72%。在长度为1141bp的Cytb基因序列中,仅存在1个变异位点,核苷酸多样性指数(π值)为0.00028,31个样本中仅出现两种单倍型;857 bp 长的D-loop区序列中,仅存在5个变异位点,核苷酸多样性指数(π值)为0.00199,仅出现5种单倍型。这表明闽浙地区香鱼的遗传多样性水平很低,应当加大对香鱼的保护力度。 展开更多
关键词 香鱼 细胞色素b基因 D—loop区 多态性 单倍型
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从细胞色素b基因序列变异分析中国鲇形目鱼类的系统发育 被引量:27
11
作者 彭作刚 张耀光 +1 位作者 何舜平 陈宜瑜 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第2期145-154,共10页
采用PCR技术获得中国鲇形目鱼类 1 1科 2 4属 2 7个代表种类细胞色素b基因 1 1 3 8bp全序列 ,比较分析了来自北美洲、非洲的部分鲇形目鱼类同一基因序列 ,并选取脂鲤目、鲤形目和鲱形目鱼类作外类群 ,采用Bayesian方法和最大简约法 (MP... 采用PCR技术获得中国鲇形目鱼类 1 1科 2 4属 2 7个代表种类细胞色素b基因 1 1 3 8bp全序列 ,比较分析了来自北美洲、非洲的部分鲇形目鱼类同一基因序列 ,并选取脂鲤目、鲤形目和鲱形目鱼类作外类群 ,采用Bayesian方法和最大简约法 (MP)构建分子系统树。结果表明 :(1 )鲇形目鱼类细胞色素b基因序列中 ,与脂鲤目、鲤形目以及鲱形目鱼类相比存在 3bp的缺失 ;(2 )鲇形目鱼类各科代表种类形成一单系群 ;(3 )两种建树方法均支持科、粒鲇科和钝头科形成一单系群 ;而胡子鲇科、刀鲇科、海鲇科、科、长臀科、科、鲇科、棘脂科、科形成一大的单系群 ;但鳗鲇科的系统位置两种建树方法没有取得一致结果 ;而其中长臀科与北美的科形成姐妹群 ,胡子鲇、科、鲇科。 展开更多
关键词 中国 鲇形目 细胞色素b基因 系统发育 bayesian方法
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从细胞色素b基因全序列探讨大额牛的分子系统发生 被引量:21
12
作者 李世平 常洪 +3 位作者 马国龙 陈宏宇 冀德君 耿荣庆 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期65-70,共6页
大额牛是一种半野生半家养的珍稀牛种,有关其起源和系统地位一直存在争议。通过PCR扩增、测序等步骤共获得了11头大额牛细胞色素b(Cytb)基因全序列(1140bp)。应用分析软件,对大额牛11条Cytb序列进行了分析,并结合GenBank中牛属动物6个... 大额牛是一种半野生半家养的珍稀牛种,有关其起源和系统地位一直存在争议。通过PCR扩增、测序等步骤共获得了11头大额牛细胞色素b(Cytb)基因全序列(1140bp)。应用分析软件,对大额牛11条Cytb序列进行了分析,并结合GenBank中牛属动物6个近缘种的同源序列,以亚洲水牛(Bubalus bubalis)为外群,分别采用邻接法(NJ)和最大简约法(MP)构建了牛属动物分子系统发育树。序列分析结果表明,11条大额牛Cytb序列1140位点中,共发现95个变异位点(占分析位点总数的8.33%),定义了6种单倍型,表明大额牛群体的Cytb基因遗传多态性比较丰富。构建的NJ和MP分子系统树均显示,大额牛研究群体明显分为3支,第1支与普通牛(Bos taurus)相聚,第2支与瘤牛(Bos indicus)相聚,第3支与印度野牛(Bos gaurus)相聚。系统发育分析表明,大额牛很可能是印度野牛的家养型或驯化种,我国大额牛群体可能曾受到其他牛种血缘的入侵。 展开更多
关键词 大额牛 细胞色素b基因 起源 分子系统发生
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以mtDNA细胞色素b基因探讨斑翅山鹑的分类地位 被引量:16
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作者 文陇英 张立勋 刘发 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期69-75,共7页
以线粒体DNA细胞色素b (mtDNACytb)基因作为分子标记 ,提取鸡形目雉科 10个属 18个样本的DNA ,PCR扩增自动测序 ,获得序列长度 82 8bp。将山鹑属中的斑翅山鹑 (Perdixdauuricae)与其近缘属排序对比 ,分别以角叫鸭 (Anhimacornuta)和海龟... 以线粒体DNA细胞色素b (mtDNACytb)基因作为分子标记 ,提取鸡形目雉科 10个属 18个样本的DNA ,PCR扩增自动测序 ,获得序列长度 82 8bp。将山鹑属中的斑翅山鹑 (Perdixdauuricae)与其近缘属排序对比 ,分别以角叫鸭 (Anhimacornuta)和海龟 (Kachugadhongoka)为外群 ,用邻接法、最大简约法和最小进化法构建分子系统发生树。邻接法构建的系统树显示斑翅山鹑与雉聚类 ,核苷酸序列差异值斑翅山鹑与环颈雉为 15 2 % ,与石鸡为 16 1%。分析认为在雉科中斑翅山鹑与雉类更接近 ,而与真正的鹑亲缘关系较远。同时以mtDNA分析鸟类系统发生时海龟更适合作为外群。以角叫鸭为外群加入西方松鸡 (Tetraourogallus)时 ,则斑翅山鹑的分类地位不能确定 ,这可能与鸡形目的适应辐射有关。 展开更多
关键词 雉类 斑翅山鹑 线粒体DNA细胞色素b基因 系统发生 分类
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6个中国猪地方品种和3个瑞典猪DNA分子系统发育相关关系(英文) 被引量:13
14
作者 蒋思文 Elisabetta Giuffra +1 位作者 Leif Andersson 熊远著 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第12期1120-1128,共9页
线粒体DNA遗传多样性用于评价 6个中国地方猪种和 3个瑞典家猪系统发育关系。采用PCR和序列分析方法得到了来自 9个品种 1 40头猪的线粒体中控制区 4 4 0bp和细胞色素b基因 798bp核苷酸序列。系统发育分析结果表明 :6个中国地方猪种起... 线粒体DNA遗传多样性用于评价 6个中国地方猪种和 3个瑞典家猪系统发育关系。采用PCR和序列分析方法得到了来自 9个品种 1 40头猪的线粒体中控制区 4 4 0bp和细胞色素b基因 798bp核苷酸序列。系统发育分析结果表明 :6个中国地方猪种起源于亚洲野猪。中国地方猪种和欧洲野猪的线粒体DNA核苷酸序列变异发生在 4 1 30 0 0~8750 0 0年以前 ,而亚洲野猪的变异仅发生在 70 0 0~ 1 560 0 0年以前。由于 2 0 0 0年以前或1 8世纪初中国猪种导入欧洲家猪 。 展开更多
关键词 线粒体DNA 控制区 细胞色素b基因 系统发育分析 中国 地方品种 瑞典家猪
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剑尾鱼线粒体细胞色素b基因的序列分析 被引量:12
15
作者 叶星 白俊杰 +2 位作者 劳海华 简清 吴淑勤 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 2002年第3期131-134,共4页
目的 克隆和测定剑尾鱼 (Xiphophorushelleri)线粒体细胞色素b基因 (cytb)的全序列。方法 提取剑尾鱼肝脏的总DNA。设计合成特异引物进行PCR扩增。扩增产物经琼脂糖电泳检测、纯化后克隆到pGEM Teasyvectorsystem中的T载体上 ,筛选转... 目的 克隆和测定剑尾鱼 (Xiphophorushelleri)线粒体细胞色素b基因 (cytb)的全序列。方法 提取剑尾鱼肝脏的总DNA。设计合成特异引物进行PCR扩增。扩增产物经琼脂糖电泳检测、纯化后克隆到pGEM Teasyvectorsystem中的T载体上 ,筛选转化子 ,提取质粒 ,酶切鉴定。挑取重组质粒pGEM T xhcytb 11进行序列测定。结果 获得了剑尾鱼线粒体cytb基因的全序列 ,共 114 0bp。结论 用BLAST与GenBank中的线粒体DNA序列进行比较 ,显示剑尾鱼与其他鱼类的cytb基因具有较高的同源性 ;根据剑尾鱼与其他 13种鱼的cytb基因序列同源性所建立的进化树 。 展开更多
关键词 剑尾鱼 线粒体 细胞色素b基因 序列分析
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Molecular phylogeny and biogeography of the highly specialized grade schizothoracine fishes (Teleostei:Cyprinidae) inferred from cytochrome b sequences 被引量:21
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作者 HE DeKui CHEN YiFeng 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2007年第6期777-788,共12页
We recovered the phylogenetic relationships among 23 species and subspecies of the highly special-ized grade schizothoracine fishes distributing at 36 geographical sites in the Tibetan Plateau and its surrounding regi... We recovered the phylogenetic relationships among 23 species and subspecies of the highly special-ized grade schizothoracine fishes distributing at 36 geographical sites in the Tibetan Plateau and its surrounding regions by analyzing sequences of cytochrome b genes. Furthermore, we estimated the possible divergent times among lineages based on a historical geological isolation event in the Tibetan Plateau. The molecular data revealed that the highly specialized grade schizothoracine fishes were not a monophyletic group, but were the same as genera Gymnocypris and Schizogypsis. Our results indi-cated that the molecular phylogenetic relationships apparently reflected their geographical and historical associations with drainages, namely species from the same and adjacent drainages clustered together and had close relationships. The divergence times of different lineages were well consistent with the rapid uplift phases of the Tibetan Plateau in the late Cenozoic, suggesting that the origin and evolution of schizothoracine fishes were strongly influenced by environment changes resulting from the upheaval of the Tibetan Plateau. 展开更多
关键词 特化等级裂腹鱼类 细胞色素b序列 分子系统发生 生物地理学 鲤科
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从细胞色素b基因序列探讨普氏野马与蒙古马的遗传多态性 被引量:17
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作者 安丽萍 李正先 +3 位作者 于景文 成述儒 王川 罗玉柱 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 2006年第5期10-13,共4页
测定了14匹普氏野马(6匹A系和8匹B系)和18匹蒙古马的细胞色素b基因全序列1 140 bp.分析了普氏野马和蒙古马之间的遗传多态性.从GenBank获得10个韩国Cheju马和2个日本家马细胞色素b全序列,以驴的序列作根,用最大简约化法绘制出45个序列... 测定了14匹普氏野马(6匹A系和8匹B系)和18匹蒙古马的细胞色素b基因全序列1 140 bp.分析了普氏野马和蒙古马之间的遗传多态性.从GenBank获得10个韩国Cheju马和2个日本家马细胞色素b全序列,以驴的序列作根,用最大简约化法绘制出45个序列的系统发育树.研究认为:普氏野马与蒙古马遗传关系较近;蒙古马具有多个起源或经过多次驯化;蒙古马、日本家马和韩国Cheju马具有共同的祖先. 展开更多
关键词 普氏野马 细胞色素b基因 遗传多态性
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从细胞色素b基因序列探讨笛鲷属的分子系统发生关系 被引量:16
18
作者 朱世华 杨迎春 +4 位作者 沈锡权 邹记兴 郑文娟 余红卫 黄勃 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第3期514-521,共8页
测定了9种中国南海的笛鲷属鱼类的细胞色素b基因的部分序列,结合来自GenBank中1种分布于菲律宾和9种分布于美国大西洋的笛鲷属鱼类的相应同源序列,用邻接法和最大简约法构建分子系统树。结果显示:红鳍笛鲷(Lutjanuserythropterus)与红笛... 测定了9种中国南海的笛鲷属鱼类的细胞色素b基因的部分序列,结合来自GenBank中1种分布于菲律宾和9种分布于美国大西洋的笛鲷属鱼类的相应同源序列,用邻接法和最大简约法构建分子系统树。结果显示:红鳍笛鲷(Lutjanuserythropterus)与红笛鲷(L.sanguineus)之间的同源序列碱基差异百分率只有0.32%,支持二者是同种异名的观点;中国南海的笛鲷属鱼类间的平均碱基差异要高于美国大西洋笛鲷属鱼类。在MP和NJ树中,美国大西洋笛鲷表现为亲缘关系较近,来源于中国南海的笛鲷鱼类相对集中在树的基部,分歧较大。这与所研究的笛鲷地理分布和地理隔离基本相一致,同时也说明中国南海笛鲷分化较早并且分歧较大。 展开更多
关键词 笛鲷属 线粒体DNA 细胞色素b基因 分子系统发生
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细胞色素b基因序列与7种石首鱼类的系统进化 被引量:15
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作者 田兰香 梁冰 +2 位作者 张树义 赵盛龙 王日昕 《台湾海峡》 CAS CSCD 2004年第4期436-443,共8页
通过比较一段381bp细胞色素b基因序列,分析了石首鱼科7种石首鱼的系统发育关系.该序列有51个单变异多态位点、128个简约信息多态位点,对应的氨基酸序列有41个氨基酸变异位点.根据Kimura2参数构建的邻接树(NJtree)和最大简约树(MPtree)... 通过比较一段381bp细胞色素b基因序列,分析了石首鱼科7种石首鱼的系统发育关系.该序列有51个单变异多态位点、128个简约信息多态位点,对应的氨基酸序列有41个氨基酸变异位点.根据Kimura2参数构建的邻接树(NJtree)和最大简约树(MPtree)都显示同样的结果:7种石首鱼类构成一个单系群.皮氏叫姑鱼位于单系群的基部,且与其他石首鱼分离时间很早;大黄鱼和棘头梅童鱼亲缘关系最近,并与钩牙皇石首鱼和波纹短须石首鱼构成姐妹群.黄姑鱼和鱼也接近树的基部. 展开更多
关键词 鱼类 多态位点 大黄鱼 亲缘关系 变异 系统进化 黄姑鱼 细胞色素b基因 系统发育关系 序列
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中华鳖(Pelodiscus sinensis)5个不同地理种群细胞色素b基因序列变异及种群遗传结构分析 被引量:17
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作者 张永正 张海琪 +3 位作者 何中央 徐晓林 李智强 杜建明 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期234-239,共6页
利用线粒体细胞色素b基因序列对中华鳖5个不同地理种群(太湖群体、日本群体、江西群体、台湾群体和乌鳖群体)的种群遗传结构进行分析。以特异引物进行PCR扩增,获得了408bp的基因片断序列。序列分析结果表明,在31个中华鳖个体中,共检测... 利用线粒体细胞色素b基因序列对中华鳖5个不同地理种群(太湖群体、日本群体、江西群体、台湾群体和乌鳖群体)的种群遗传结构进行分析。以特异引物进行PCR扩增,获得了408bp的基因片断序列。序列分析结果表明,在31个中华鳖个体中,共检测到17个变异位点,获得8种单倍型。日本群体的2种单倍型在其他4个群体中都未检测到,为该群体所特有,日本种群与其他4个群体的遗传距离最远。除日本群体缺乏主体单倍型外,其他4个群体共同拥有主体单倍型Hap.1,江西群体、台湾群体和乌鳖群体的单倍型类型都和其他群体共同享有,没有其特异的单倍型。MP法和NJ法构建的系统发生树显示日本群体的两种单倍型以很高的置信度聚成一支,这与其地理分布存在一定的相关性,其序列上的差异,可以成为种群鉴别的分子标记;另外4个群体的6种单倍型聚合成一大支,但同一个地理区域的群体并未聚成一类,未按照地理位置形成明显的地理格局。 展开更多
关键词 中华鳖 线粒体DNA 细胞色素b基因 序列分析 种群遗传结构
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