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蝗总科部分种类Cytb基因序列及系统进化研究 被引量:48
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作者 任竹梅 马恩波 郭亚平 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第4期314-321,共8页
蝗总科 8个科 10个种的线粒体DNA细胞色素b (Cytb)基因部分序列被测定分析 ,比较同源性 ,计算核苷酸使用频率并构建NJ分子系统树。在获得的 4 32bp的序列中 ,A +T约占 70 4 % ,其中 177个核苷酸位点存在变异(约占 4 1 0 % ) ,DNA一级... 蝗总科 8个科 10个种的线粒体DNA细胞色素b (Cytb)基因部分序列被测定分析 ,比较同源性 ,计算核苷酸使用频率并构建NJ分子系统树。在获得的 4 32bp的序列中 ,A +T约占 70 4 % ,其中 177个核苷酸位点存在变异(约占 4 1 0 % ) ,DNA一级序列数据显示 ,该 8科蝗虫间DNA序列变异丰富。用日本蚱作外群构建的NJ树表明 :瘤锥蝗科较为原始 ,而癞蝗科与槌角蝗科关系较近 ,为比较进化的类群 ,蝗总科 8科的起源关系为 :瘤锥蝗科→斑翅蝗科和锥头蝗科→斑腿蝗科→剑角蝗科→网翅蝗科→槌角蝗科和癞蝗科 ,上述研究结果与传统形态分类学结论不完全一致 。 展开更多
关键词 蝗总科 基因序列 MTDNA cytb基因 系统进化
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金钱白花蛇及其伪品的Cyt b基因片段序列分析和PCR鉴别研究 被引量:56
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作者 王义权 周开亚 +1 位作者 徐珞珊 徐国钧 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第12期941-947,共7页
对金钱白花蛇及其伪、混品药材和原动物的Cytb基因片段的序列分析发现,该基因片段在金钱白花蛇及其伪品间的差异远远大于金钱白花蛇种内个体间的差异,是理想的用于鉴别金钱白花蛇及其伪混品的分子遗传标记。在对Cytb基因片段... 对金钱白花蛇及其伪、混品药材和原动物的Cytb基因片段的序列分析发现,该基因片段在金钱白花蛇及其伪品间的差异远远大于金钱白花蛇种内个体间的差异,是理想的用于鉴别金钱白花蛇及其伪混品的分子遗传标记。在对Cytb基因片段序列分析的基础上,设计了金钱白花蛇PCR鉴别的一对高度特异性引物BuL1和BuH1。结果表明,该对引物在对金钱白花蛇的PCR鉴别中,用60℃~65℃的复性温度,可以100%检出金钱白花蛇,误检率和漏检率为0,并能在混合的药材粉末中检测出被检样品中是否含有金钱白花蛇组份。本研究还表明PCR鉴别将有可能成为中成药复方组分鉴别的一种新手段。 展开更多
关键词 cytb基因 DNA序列 金钱白花蛇 中药鉴别
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通过Cyt b基因同源序列比较评估厦门文昌鱼的分类学地位 被引量:34
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作者 王义权 许群山 +1 位作者 彭宣宪 周涵韬 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第2期202-208,共7页
白氏文昌鱼Branchiostomabelcheri (Gray)在我国和日本沿海均有分布 ,由于南、北方文昌鱼形态学上有一定差异 ,且二者间存在一些过渡类型 ,其分类地位问题仍有待进一步澄清。本文测定了厦门欧厝海域产的文昌鱼mtDNACytb基因序列 ,并与... 白氏文昌鱼Branchiostomabelcheri (Gray)在我国和日本沿海均有分布 ,由于南、北方文昌鱼形态学上有一定差异 ,且二者间存在一些过渡类型 ,其分类地位问题仍有待进一步澄清。本文测定了厦门欧厝海域产的文昌鱼mtDNACytb基因序列 ,并与日本产的文昌鱼以及另外产于大西洋的两种文昌鱼Cytb基因序列比较。分子系统学分析结果表明 :厦门欧厝海域产的文昌鱼与日本产的文昌鱼平均遗传距离为 2 1 12 % ,达到了种间分化的水平 ;经过对已有文献和文昌鱼地理分布的综合分析 ,作者建议将原来的白氏文昌鱼青岛亚种B belcheritsingtauense提升为种 ,南、北方所产文昌鱼分别作为两个独立的种存在 ,即南方的B belcheri (Gray)和北方的B 展开更多
关键词 cytb基因 同源序列 厦门 文昌鱼 DNA序列 分子系统学 分类地位
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基于线粒体Cytb基因全序列的松江鲈群体遗传结构分析 被引量:38
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作者 高天翔 毕潇潇 +1 位作者 赵林林 李创举 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期199-207,共9页
对松江鲈(Trachidermus fasciatus Heckel)中国沿海7个群体和日本有明海群体的线粒体Cytb基因全序列进行了测定、分析。结果显示:47个个体共检测到31个单倍型,8个群体均呈现出较高的单倍型多样性(0.60—1.00)和较低的核苷酸多样性(0.000... 对松江鲈(Trachidermus fasciatus Heckel)中国沿海7个群体和日本有明海群体的线粒体Cytb基因全序列进行了测定、分析。结果显示:47个个体共检测到31个单倍型,8个群体均呈现出较高的单倍型多样性(0.60—1.00)和较低的核苷酸多样性(0.0005—0.0041)的特点。AMOVA分析结果及单倍型邻接关系树和单倍型网络关系图均显示松江鲈分为中国和日本两个世系,而中国世系的7个群体未呈现出明显的地理遗传结构。基于核苷酸Kimura双参数替代模型计算得出的中国和日本两个世系的净遗传距离,再参照其他硬骨鱼类线粒体Cytb基因2%/Ma(百万年)的分歧速率,推测松江鲈中日两个世系间分化时间约为41万年前。对中国世系进行群体历史动态分析,中性检验结果均为负值且显著,核苷酸不配对分布呈单峰型,表明松江鲈中国世系曾发生过群体扩张,其扩张时间大约为12万年前。 展开更多
关键词 松江鲈 cytb基因 全序列 遗传结构 群体扩张
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两种鲿科鱼类在长江和珠江流域Cytb基因序列变异性分析 被引量:21
5
作者 杨金权 刘焕章 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期253-257,共5页
采用PCR技术获得了长江和珠江流域的两种科鱼类 1 1 37bpCytb基因的片段 ,进行了序列测定 ,并用Mega软件进行了序列分析。研究发现两种科鱼类的全序列从第十位碱基起有一个三联体密码子的缺失 ,推测为鲇形目鱼类Cytb序列所特有特征... 采用PCR技术获得了长江和珠江流域的两种科鱼类 1 1 37bpCytb基因的片段 ,进行了序列测定 ,并用Mega软件进行了序列分析。研究发现两种科鱼类的全序列从第十位碱基起有一个三联体密码子的缺失 ,推测为鲇形目鱼类Cytb序列所特有特征。黄颡鱼和大鳍种群间的序列差异分别为 0 .4 %和 1 .6 % ,介于一般淡水鱼类mtDNA种内序列的变异范围 ,而高于洄游鱼类序列变异。黄颡鱼属和属Cytb基因序列间的差异为 1 7.6 %— 1 8.0 % ,大大高于种间的序列差异率 ,也从分子水平上证实了二者属级分类单元的有效性。依据分子进化速率推测 ,长江和珠江两水系间大鳍的分歧时间为距今 2 7万年左右的更新世中晚期 ,黄颡鱼的分歧时间在距今 7万年左右的更新世末期。推测造成二者有着不同分歧时间的可能原因是 :大鳍属暖水性鱼类 ,在第四纪冰川期间 ,由于全球性气候变冷 ,大鳍退至长江以南 ,并在各水系间产生隔离 ,各自独立分化至今。而黄颡鱼具有很强的适应性 。 展开更多
关键词 MTDNA cytb基因 遗传分化 基因序列 变异性 鲿科鱼类
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仿刺参cytb和β-actin基因表达稳定性比较 被引量:29
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作者 杨爱馥 周遵春 +6 位作者 董颖 姜北 汪笑宇 陈仲 关晓燕 王摆 孙大鹏 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 2010年第1期79-84,共6页
基因表达分析需要采用内参基因来校正目的基因的表达量。采用半定量RT-PCR的方法分析了cytb和β-actin基因在仿刺参(Apostichopus japonicus)未受精卵、受精卵、多细胞期、囊胚期、原肠期、小耳状幼体、中耳状幼体、大耳状幼体、樽型幼... 基因表达分析需要采用内参基因来校正目的基因的表达量。采用半定量RT-PCR的方法分析了cytb和β-actin基因在仿刺参(Apostichopus japonicus)未受精卵、受精卵、多细胞期、囊胚期、原肠期、小耳状幼体、中耳状幼体、大耳状幼体、樽型幼体、五触手幼体、稚参11个发育阶段和幼参的体壁、体腔细胞、肠道和呼吸树中的表达情况。结果表明:cytb在不同发育阶段和不同组织中稳定表达;β-actin基因在稚参之前不同发育阶段中表达水平有显著差异,在幼参的体壁、肠道和呼吸树中稳定表达。此外,cytb在lipopolysaccgarides(LPS)刺激前后的原肠胚、小耳状幼体、中耳状幼体、大耳状幼体、樽型幼体、稚参和幼参四种组织中表达量无显著差异;β-actin基因在LPS刺激前后的幼参体腔细胞、肠道和呼吸树中表达量无显著差异。本研究为仿刺参功能基因表达分析中,cytb与β-actin基因作为内参基因的可行性提供了依据。 展开更多
关键词 仿刺参 cytb基因 Β-ACTIN基因 LPS刺激 内参基因
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Cytb分子标记技术在物种鉴定中的应用 被引量:30
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作者 辛翠娜 彭建军 +1 位作者 王莹 王利利 《野生动物》 2009年第4期217-221,共5页
细胞色素b(Cytochrome b,Cytb)基因作为一种线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)分子标记,其结构和功能是mtDNA的13个蛋白质编码基因中了解得最清楚的基因。它的进化速度适中,一个较小的基因片段就包含着从种内到种间、属间乃至科间的... 细胞色素b(Cytochrome b,Cytb)基因作为一种线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)分子标记,其结构和功能是mtDNA的13个蛋白质编码基因中了解得最清楚的基因。它的进化速度适中,一个较小的基因片段就包含着从种内到种间、属间乃至科间的进化遗传信息,被认为是解决分类及系统进化问题可信的分子标记之一,目前,在很多领域已经得到了广泛的应用。本文将简要介绍Cytb基因及其研究方法,重点总结和归纳Cytb分子标记在物种鉴定中的应用现状并对其应用中的问题及发展趋势做一阐述。 展开更多
关键词 cytb基因 分子标记 物种鉴定 应用现状 发展趋势
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青海湖及其相邻水系特有裸鲤属鱼类的分子系统发育 被引量:23
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作者 赵凯 李俊兵 +3 位作者 杨公社 段子渊 何舜平 陈宜瑜 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第13期1348-1355,共8页
对来自青海湖、黄河和柴达木水系特有的青海湖裸鲤、花斑裸鲤和斜口裸鲤149个个体的Cyt b基因全序列进行了测定和分析. 一致的系统进化树显示, 以上3个物种并未形成3个独立的单系群; 而是分为3个谱系: 谱系A包括青海湖裸鲤、斜口裸鲤和... 对来自青海湖、黄河和柴达木水系特有的青海湖裸鲤、花斑裸鲤和斜口裸鲤149个个体的Cyt b基因全序列进行了测定和分析. 一致的系统进化树显示, 以上3个物种并未形成3个独立的单系群; 而是分为3个谱系: 谱系A包括青海湖裸鲤、斜口裸鲤和黄河花斑裸鲤的一部分; 谱系B由黄河花斑裸鲤的另一部分组成; 谱系C则由来自柴达木盆地格尔木河的花斑裸鲤形成单系群. AMOVA分析显示, 大部分的遗传变异来自于谱系间(93.12%), 提出该地区裸鲤属鱼类存在3个多样化谱系. 青海湖裸鲤与其甘子河亚种在Cyt b水平没有形成分化, 不支持青海湖裸鲤为多型种, 也不支持斜口裸鲤作为独立的种或作为花斑裸鲤的一个亚种. 黄河花斑裸鲤有2个谱系来源, 群体内的遗传分化表明, 黄河上游峡谷对裸鲤的基因交流有一定的限制. 黄河花斑裸鲤的另一谱系(谱系B)很可能是黄河在最近一次溯源过程中, 融合了当地的土著裂腹鱼类而在遗传上留下了族源印迹. 柴达木盆地花斑裸鲤形成单系群(谱系C), 与黄河花斑裸鲤间高于0.98的Fst值表明基因交流在它们之间长期被阻断, 暗示生态隔离可能已经使柴达木裸鲤独立进化成相当于不同的种. 形态分类的鳃耙数与群体遗传变异间没有显著的相关性. 种群的遗传多样性普遍较低(π = 0.00096~0.00485), 柴达木裸鲤很可能在历史上遭受过严重的'瓶颈效应', 提议当前应对柴达木的裸鲤给予优先保护. 展开更多
关键词 分子系统发育 鱼类 鲤属 水系 青海湖裸鲤 柴达木盆地 相邻 cytb基因 群体遗传变异 基因交流 系统进化树 遗传多样性 格尔木河 遗传分化 黄河上游 形态分类 瓶颈效应 优先保护 谱系 花斑 全序列 单系 多样化 相关性 显示
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几种游蛇的Cyt b基因片段序列分析及其演化关系(英文) 被引量:14
9
作者 王义权 周开亚 +2 位作者 徐珞珊 杨光 徐国钧 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 1999年第3期332-338,共7页
分别从蛇类药材和冷冻保存的新鲜蛇类肌肉标本中提取DNA,经PCR扩增出12种蛇共25个样品的Cytb基因片段,并用银染测序的方法对DNA序列进行了分析。在此基础上用MEGA软件重建的系统发生树表明,研究的11种游蛇科蛇类可以分为3组:第一组... 分别从蛇类药材和冷冻保存的新鲜蛇类肌肉标本中提取DNA,经PCR扩增出12种蛇共25个样品的Cytb基因片段,并用银染测序的方法对DNA序列进行了分析。在此基础上用MEGA软件重建的系统发生树表明,研究的11种游蛇科蛇类可以分为3组:第一组为赤链蛇和水赤链游蛇,第二组为马梢蛇和灰鼠蛇,第三组为锦蛇属的蛇,它们与第二组较近。锦蛇属是一高度分化的属,该组至少可分为两类,一类包括百花锦蛇和黑眉锦蛇;另一类包括玉斑锦蛇、棕黑锦蛇、红点锦蛇、王锦蛇和双斑锦蛇。后一类还可进一步分为3个亚组,玉斑锦蛇和棕黑锦蛇为第一亚组,红点锦蛇单独为第二亚组,王锦蛇和双斑锦蛇为第三亚组。本研究结果还表明,多年保存的陈旧药材标本可以用DNA序列分析的方法对其进行分子系统演化关系的研究。 展开更多
关键词 cytb基因 DNA片段 游蛇 序列分析 进化
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三大不同品种马mtDNA Cytb基因PCR-RFLP分析 被引量:16
10
作者 李金莲 石有斐 +1 位作者 布仁其其格 芒来 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期933-938,共6页
用BamHⅠ、TaqⅠ、HaeⅢ、RsaⅠ和HincⅡ5种限制性内切酶通过PCR-RFLP技术检测了包括引入品种、培育品种和地方品种的6个类型(纯血马、三河马、乌珠穆沁马、锡尼河马、乌审马和矮马)共256匹马的mtDNACytb基因部分序列多态性。用8%非变... 用BamHⅠ、TaqⅠ、HaeⅢ、RsaⅠ和HincⅡ5种限制性内切酶通过PCR-RFLP技术检测了包括引入品种、培育品种和地方品种的6个类型(纯血马、三河马、乌珠穆沁马、锡尼河马、乌审马和矮马)共256匹马的mtDNACytb基因部分序列多态性。用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将酶切产物分离,并用银染法显色。结果BamHⅠ和TaqⅠ表现出多态,5种酶共检测到7种态型,归纳为3种单倍型,以单倍型Ⅰ和Ⅲ为主体单倍型,但通过一个特殊的酶型BamHⅠ-B分析推测所研究的马可能起源于一个母系祖先。 展开更多
关键词 限制性内切酶 PCR-RFLP 马mtDNA cytb基因 多态性
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草莓灰霉病菌对嘧菌酯的抗性检测及抗性菌株的生物学特性研究 被引量:15
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作者 张佳 张璨 +2 位作者 芦帆 蔡乐 张国珍 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期124-130,共7页
由灰葡萄孢(Botrytis cinerea Pers.)引起的草莓灰霉病是严重危害草莓的病害之一。为了解草莓灰霉病菌对杀菌剂嘧菌酯的抗性情况,本研究针对2012年从国内10省市采集和分离的134株草莓灰霉病菌菌株,利用特异性引物BcAR-F/BcAR-R扩增其cyt... 由灰葡萄孢(Botrytis cinerea Pers.)引起的草莓灰霉病是严重危害草莓的病害之一。为了解草莓灰霉病菌对杀菌剂嘧菌酯的抗性情况,本研究针对2012年从国内10省市采集和分离的134株草莓灰霉病菌菌株,利用特异性引物BcAR-F/BcAR-R扩增其cytb基因的部分序列,进行了嘧菌酯抗性的分子检测;对检测出的抗性菌株在嘧菌酯浓度分别为22.4、112和224μg·mL^(-1)的含药培养基上进行抗性验证;此外,还比较了抗性菌株与敏感菌株主要生物学性状的差异。结果表明,有54个菌株对嘧菌酯表现抗性,均属于中等抗性水平,占检测总数的40.3%,分布于北京市、湖北、江苏、河北、辽宁和四川各省;对15个抗性菌株cytb基因的序列分析表明,其第143位发生突变,由甘氨酸变为丙氨酸;对随机选取的4株抗性菌株和2株敏感菌株的适合度测定结果发现,抗性菌株和敏感菌株在最适生长温度、菌落生长速度、孢子萌发率方面没有表现出规律性差异,但抗性菌株的产孢量和致病力均显著低于敏感菌株。 展开更多
关键词 草莓 灰葡萄孢 嘧菌酯 抗药性 cytb基因
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基于线粒体细胞色素氧化酶b(cytb)全基因序列分析我国部分地区兔痒螨的遗传变异特征 被引量:15
12
作者 赵习彬 王保健 +3 位作者 简克灵 杨光友 赖为民 古小彬 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期714-721,共8页
为探讨兔痒螨是否会受兔品种、温度带和地域来源的不同而出现遗传变异,采用PCR技术首次对我国6个省份共68个獭兔来源(陕西、河北、河南和湖北)和肉兔来源(山东和四川)痒螨虫株的线粒体细胞色素氧化酶b(cytb)基因全序列进行扩增,经测序... 为探讨兔痒螨是否会受兔品种、温度带和地域来源的不同而出现遗传变异,采用PCR技术首次对我国6个省份共68个獭兔来源(陕西、河北、河南和湖北)和肉兔来源(山东和四川)痒螨虫株的线粒体细胞色素氧化酶b(cytb)基因全序列进行扩增,经测序后分析遗传变异情况。68条兔痒螨cytb全序列均为1 100bp,共有96个(8.7%)变异位点和46个单倍型;我国整体种群的单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.959 2和0.012 0,具有较高的遗传多样性;我国兔痒螨整体种群的中性检验结果为负值(Tajima’s D=-0.444 01,Fu’s Fs=-1.454 25),且呈现多峰的错配分布曲线现象,暗示我国兔痒螨可能经历过突增长过程;我国所有种群间存在一定的遗传分化(Fst=0.262 2)、基因流水平较低(Nm=0.7);分子方差(AMOVA)分析表明遗传分化主要发生在种群内;单倍型网络图和NJ树显示我国兔痒螨的聚类与兔品种、温度带和地理来源无关。结果表明,我国6个地区的兔痒螨虫株呈现较高的遗传多样性,具有一定的遗传分化,但未形成以兔品种、温度带和地理分布为格局的遗传结构。 展开更多
关键词 中国 兔痒螨 cytb基因 遗传变异
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刀鲚和凤鲚的分子鉴定及其在仔鱼种类鉴定中的应用 被引量:16
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作者 何文平 程飞 +3 位作者 黎雨轩 柳明 李钟杰 谢松光 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期565-571,共7页
使用mtDNA Cyt b基因序列作为分子标记,基于400 bp左右的序列分析长颌鲚、短颌鲚及凤鲚成鱼的遗传关系。结果显示长颌鲚和短颌鲚间的遗传距离在0—0.5%之间;凤鲚与长颌鲚、短颌鲚的遗传距离分别在7.9%—8.9%和7.7%—8.6%之间。用Kimura... 使用mtDNA Cyt b基因序列作为分子标记,基于400 bp左右的序列分析长颌鲚、短颌鲚及凤鲚成鱼的遗传关系。结果显示长颌鲚和短颌鲚间的遗传距离在0—0.5%之间;凤鲚与长颌鲚、短颌鲚的遗传距离分别在7.9%—8.9%和7.7%—8.6%之间。用Kimura双参数模型构建的NJ分子系统树显示,长颌鲚和短颌鲚不能形成彼此独立的分支,而是混合聚在一起形成一个分支;凤鲚则形成另一个分支。对长江口沿岸区域的鲚属仔鱼Cyt b基因片段序列分析发现,仔鱼个体之间的遗传距离为0—0.7%,仔鱼与长颌鲚、短颌鲚的遗传距离在0.1%—0.5%之间,而与凤鲚的遗传距离为8.3%—8.8%。在Kimura双参数模型构建的NJ分子系统树中,仔鱼与长颌鲚、短颌鲚聚为一类,而与凤鲚分开,表明分析的仔鱼样品不包括凤鲚个体。由于长江口一般没有短颌鲚分布,这些仔鱼应该都是长颌鲚。 展开更多
关键词 长江口 刀鲚 凤鲚 仔鱼 种类鉴定 cytb基因
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基于粪便DNA的青海雪豹种群遗传结构初步研究 被引量:15
14
作者 张于光 何丽 +2 位作者 朵海瑞 李迪强 金崑 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期310-315,共6页
雪豹是国际关注的全球濒危物种,由于独特的生活习性,其确切分布区、种群数量和遗传结构信息非常有限,基于粪便DNA分析技术的发展为该物种的研究提供了新的手段。在青海省都兰县宗加乡、诺木红乡和治多县索加乡收集到106份疑似雪豹粪... 雪豹是国际关注的全球濒危物种,由于独特的生活习性,其确切分布区、种群数量和遗传结构信息非常有限,基于粪便DNA分析技术的发展为该物种的研究提供了新的手段。在青海省都兰县宗加乡、诺木红乡和治多县索加乡收集到106份疑似雪豹粪便样品,成功地扩增了78份粪便样品的mtDNA Cyt b基因片段,并进行测序。经过GenBank数据库的Blastn比对,确定了21份为雪豹粪便,其中宗加乡11份、诺木红乡5份、索加乡5份。经过Clustal W和DNASP软件比对分析,在21份雪豹粪便DNA中,共检测出7个多态性位点,分为4个单倍型,单倍型多态性(h)为0.384,核苷酸多态性(π)为0.35%。三个样地之间的遗传距离为0.002~0.005,核苷酸差异为0.200—1.273。结果表明了3个取样区均有雪豹存在,且存在较丰富的遗传多态性,样地间也存在一定的遗传差异。 展开更多
关键词 雪豹 生物多样性 遗传结构 cytb基因
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基于线粒体基因Cytb和COI的蝗科中五亚科分子系统发育关系分析(直翅目:蝗总科)(英文) 被引量:12
15
作者 王乃馨 封霞 +2 位作者 蒋国芳 方宁 轩文娟 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1187-1195,共9页
本研究基于Cytb基因和COI基因的部分序列来推断17种蝗虫之间的系统发育关系。这17种蝗虫均采自国内,代表了蝗科(Acrididae)5个亚科:黑蝗亚科(Melanoplinae)、斑腿蝗亚科(Catantopinae)、刺胸蝗亚科(Cyrtacanthacridinae)、斑翅蝗亚科(Oe... 本研究基于Cytb基因和COI基因的部分序列来推断17种蝗虫之间的系统发育关系。这17种蝗虫均采自国内,代表了蝗科(Acrididae)5个亚科:黑蝗亚科(Melanoplinae)、斑腿蝗亚科(Catantopinae)、刺胸蝗亚科(Cyrtacanthacridinae)、斑翅蝗亚科(Oedipodinae)和大足蝗亚科(Gomphocerinae)。采用联合序列方法进行分析,结果显示:Cytb和COI联合序列长度为1998bp,其中A和T总含量为72.13%,G和C总含量为27.87%。联合序列共包含了889个保守位点,1109个变异位点,在这些变异位点中有838个简约信息位点。系统发生树采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)和最大似然法(ML)进行构建。使用蜢总科的变色乌蜢Erianthus versicolor和Erianthus sp.两个种作为外群。结果表明:大足蝗亚科和斑腿蝗亚科的单系性没有得到支持。斑翅蝗亚科内部各种聚成一个大支,在本研究中该亚科的单系性得到支持,与前人的研究结论相同。大足蝗亚科、斑腿蝗亚科、刺胸蝗亚科和黑蝗亚科这4科关系非常近,可以考虑将其合并为一个亚科。同时,我们发现基于Cytb和COI基因联合序列推断蝗科内各亚科间的系统发生关系并不十分可靠。 展开更多
关键词 直翅目 蝗科 线粒体DNA cytb基因 COI基因 系统发育
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多重位点特异性PCR快速检测牛肉中常见掺假动物源性成分 被引量:13
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作者 李盈诺 王艳双 +5 位作者 苑广信 孙丽媛 艾金霞 冯源 李明成 张丽华 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2019年第24期82-87,共6页
目的:基于动物线粒体cytb基因的多态性位点,建立一种特异性多重PCR体系检测牛肉、猪肉和鸡肉的方法。方法:提取肉类的基因组DNA,利用不同物种mtDNA cytb基因序列的SNP位点的差异,设计特异性引物。进行多重PCR扩增,利用扩增产物片段大小... 目的:基于动物线粒体cytb基因的多态性位点,建立一种特异性多重PCR体系检测牛肉、猪肉和鸡肉的方法。方法:提取肉类的基因组DNA,利用不同物种mtDNA cytb基因序列的SNP位点的差异,设计特异性引物。进行多重PCR扩增,利用扩增产物片段大小不同,检测牛肉中常见的掺假动物源性成分。通过灵敏性试验,确定最低检测量。结果:实验设计的引物特异性良好,在同一反应体系中,在同一退火温度52℃条件下,牛肉DNA扩增后产生149 bp的特异性条带,猪肉DNA扩增片段为261 bp,鸡肉DNA扩增片段为554 bp,未发生非特异性扩增。且检测的最低浓度达到100 pg/μL,具有高度的灵敏性和适用性。结论:根据动物线粒体cytb基因的差异性位点,开发的多重PCR体系,可一次性地同时检测牛肉、猪肉和鸡肉,可快速、灵敏、高通量地分析食品中掺假动物成分的来源。 展开更多
关键词 mtDNA cytb基因 SNP位点 牛肉 多重PCR 肉类掺假 动物源性成分
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基于Cytb基因的动物检材种属鉴定在非传统领域的部分运用 被引量:12
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作者 王健胜 高雅琴 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期37-43,共7页
传统意义上的种属鉴定主要用于法医学研究方面,然而随着科技的进步及社会发展的需要,种属鉴定在其他领域也有广泛的应用。主要以线粒体Cytb基因为切入点,简要介绍了线粒体DNA及Cytb基因的结构和特点,总结和归纳了基于Cytb基因进行种属... 传统意义上的种属鉴定主要用于法医学研究方面,然而随着科技的进步及社会发展的需要,种属鉴定在其他领域也有广泛的应用。主要以线粒体Cytb基因为切入点,简要介绍了线粒体DNA及Cytb基因的结构和特点,总结和归纳了基于Cytb基因进行种属鉴定的相关技术方法在打击动物走私、濒危物种保护、食品及动物产品或制品等的检验检疫方面的运用情况,并对存在的问题及发展趋势做一阐述。 展开更多
关键词 cytb基因 动物检材 种属鉴定 非传统领域
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Phylogenetic Relationships and Status Quo of Colonies for Gayal Based on Analysis of Cytochrome b Gene Partial Sequences 被引量:13
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作者 马国龙 常洪 +5 位作者 李世平 陈宏宇 冀德君 耿荣庆 常春芳 李永红 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第5期413-419,共7页
Thirty-three mutations and four different haplotypes were found when cytochrome b(Cytb) gene partial sequences of 12 gayals were analyzed. Together with sequences of Bos indicus, Bos taurus, Bos grunniens, and Bos g... Thirty-three mutations and four different haplotypes were found when cytochrome b(Cytb) gene partial sequences of 12 gayals were analyzed. Together with sequences of Bos indicus, Bos taurus, Bos grunniens, and Bos gaurus with Bubalus bubalis as the out group, the partial sequences of Cytb gene of gayals were aligned and base composition and nucleotide variation of Cytb gene were analyzed. The phylogenetic trees were constructed by the NJ method and the MP method respectively, both supporting almost the same topology. Gayal is an independent species of Bos from Bos indicus, Bos taurus, and Bos gaurus. The results also indicate that a great proportion of gayal bloodline was invaded by other species, and the protection of gayal is facing a formidable situation. 展开更多
关键词 GAYAL cytochrome b gene phylogenetic relationship status quo of colony
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COI及cytb基因对河鲀鱼鱼种鉴定的适用性研究 被引量:11
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作者 李楠 王佳慧 +5 位作者 韩春卉 张宏元 赵熙 张靖 李凤琴 江涛 《中国食品卫生杂志》 北大核心 2018年第1期6-11,共6页
目的建立河鲀鱼DNA条形码鉴定方法,探讨细胞色素氧化酶亚基I(COI)及细胞色素b(cytb)基因对我国常见东方鲀属、兔头鲀属河鲀鱼鱼种鉴定的适用性。方法野捕河鲀鱼经形态学鉴定后,钓取COI及cytb基因序列并测序。从Gen Bank下载已有河鲀鱼... 目的建立河鲀鱼DNA条形码鉴定方法,探讨细胞色素氧化酶亚基I(COI)及细胞色素b(cytb)基因对我国常见东方鲀属、兔头鲀属河鲀鱼鱼种鉴定的适用性。方法野捕河鲀鱼经形态学鉴定后,钓取COI及cytb基因序列并测序。从Gen Bank下载已有河鲀鱼参考序列,分别构建COI及cytb基因分子进化树,确定样品种属并与形态学鉴定比对。应用所建方法对中毒样品进行河鲀成分鉴定。结果 COI和cytb基因分子进化树将57份样品聚类到东方鲀属和兔头鲀属的9个鱼种,除棕斑兔头鲀和暗鳍兔头鲀(COI进化树)、暗纹东方鲀和晕环东方鲀(cytb进化树)外,2种条形码均能对其余鱼种进行有效区分。中毒样品经鉴定均含有月兔头鲀。结论所建立的DNA条形码方法可有效鉴定河鲀鱼鱼种,弥补形态学鉴定的缺陷。 展开更多
关键词 河鲀鱼 COI基因 cytb基因 DNA条形码 鱼种 鉴定 食品安全
原文传递
牛线粒体CYTB基因的序列分析及进化关系 被引量:8
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作者 黄秉周 徐公瑾 +2 位作者 李相烈 李宁 金海国 《延边大学农学学报》 2004年第3期153-157,共5页
对CYTB基因全长1140 bp序列进行分析的结果表明,10个品种的20条CYTB碱基序列中共发现10种单倍型,黄牛中单倍型较少.共检测到98个变异位点,未发现插入和缺失,牦牛和黄牛除了异亮氨酸以外有着相同的密码子偏好.将核酸序列转换成氨基酸序列... 对CYTB基因全长1140 bp序列进行分析的结果表明,10个品种的20条CYTB碱基序列中共发现10种单倍型,黄牛中单倍型较少.共检测到98个变异位点,未发现插入和缺失,牦牛和黄牛除了异亮氨酸以外有着相同的密码子偏好.将核酸序列转换成氨基酸序列后,黄牛表现的遗传差异更小,18个个体分享5种氨基酸序列单倍型,共有6个氨基酸突变位点,8个突变氨基酸. 展开更多
关键词 线粒体 cytb基因 序列分析 进化关系
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