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两种野生动物蛔虫线粒体cox1基因序列差异性研究 被引量：5
1
作者 邱启官 李庆 许英蕾 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2018年第8期42-45,共4页
分离到湖南长沙生态动物园白狮和猎豹的两种野生动物蛔虫样本,对这两种蛔虫线粒体DNA(rDNA)中细胞色素I(cox1)序列进行扩增测序,并与Gen Bank中收录的猫弓首蛔虫、狸猫弓首蛔虫、犬弓首蛔虫、狮弓蛔虫和猪蛔虫cox1序列进行比较。结果显... 分离到湖南长沙生态动物园白狮和猎豹的两种野生动物蛔虫样本,对这两种蛔虫线粒体DNA(rDNA)中细胞色素I(cox1)序列进行扩增测序,并与Gen Bank中收录的猫弓首蛔虫、狸猫弓首蛔虫、犬弓首蛔虫、狮弓蛔虫和猪蛔虫cox1序列进行比较。结果显示:来自长沙生态动物园的白狮和猎豹蛔虫cox1序列长度均为415 bp;与Gen Bank收录JF780951. 1(狮弓蛔虫)序列用Blast软件比较,发现极少数的碱基置换、颠换、缺失及无差异。利用DNAStar 5. 0的MegAlign软件差异性分析显示,白狮蛔虫(WL1、WL2)基因序列和猎豹蛔虫(CH1、CH2)基因序列与JF780951. 1(狮弓蛔虫)序列的平均差异分别为4. 05%和2. 5%。而样品序列与其他序列相比差异均在10. 1%以上。因此,这2种动物4个蛔虫样品种内差异小,种间差异大,同是狮弓蛔虫。 展开更多
关键词 白狮 猎豹 蛔虫 cox1序列 差异
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兰州市流浪犬蠕虫感染情况调查及复孔绦虫分子生物学鉴定
2
作者 委磊 李斌 +3 位作者 张勇 叶得河 李梅 马永华 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2023年第5期173-180,共8页
为了解兰州市流浪犬蠕虫感染情况及复孔绦虫的遗传变异情况,本实验采集兰州市四个区(城关区、七里河区、安宁区、西固区)541份犬只粪便样本和5株犬复孔绦虫,使用粪检法调查蠕虫感染情况并利用线粒体cox1序列对兰州市犬复孔绦虫进行分子... 为了解兰州市流浪犬蠕虫感染情况及复孔绦虫的遗传变异情况,本实验采集兰州市四个区(城关区、七里河区、安宁区、西固区)541份犬只粪便样本和5株犬复孔绦虫,使用粪检法调查蠕虫感染情况并利用线粒体cox1序列对兰州市犬复孔绦虫进行分子鉴定。结果显示,兰州市流浪犬蠕虫感染率为25.69%(139/541),优势虫种为蛔虫和复孔绦虫,其感染率依次为17.37%(94/541)、5.17%(28/541)。将本次测得的犬复孔绦虫cox1序列与GenBank中收录的中国西南地区和日本的犬复孔绦虫cox1序列进行比对分析,发现兰州市与中国西南地区、日本的样本序列差异分别为4%、5%,同时构建遗传关系树发现三者具有高度同源性,但可能由于地域不同导致气候海拔等因素的变化,致使兰州市犬复孔绦虫的部分cox1碱基发生变异。 展开更多
关键词 蠕虫 感染情况 犬复孔绦虫 分子鉴定 cox1序列
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基于cox1序列的中国6个花鲈野生群体遗传多样性 被引量：2
3
作者 范嗣刚 黄皓 +4 位作者 王鹏飞 闫路路 赵超 张博 邱丽华 《广东海洋大学学报》 CAS 北大核心 2022年第3期11-17,共7页
【目的】利用细胞色素C氧化酶1基因(cox1)序列片段研究中国6个花鲈(Lateolabrax maculatus)野生群体的遗传多样性和遗传结构。【方法】用PCR方法获得花鲈个体的cox1序列,测序后,用MEGA X、DnaSP 6.12和Arlequin 3.01等软件进行数据分析... 【目的】利用细胞色素C氧化酶1基因(cox1)序列片段研究中国6个花鲈(Lateolabrax maculatus)野生群体的遗传多样性和遗传结构。【方法】用PCR方法获得花鲈个体的cox1序列,测序后,用MEGA X、DnaSP 6.12和Arlequin 3.01等软件进行数据分析。【结果与结论】在6个花鲈群体229个样品共检测到48个多态性位点和50个单倍型。单倍型多样性为0.799~0.888,核苷酸多样性为0.0016~0.0027。6个花鲈群体遗传分化指数(Fst)为-0.0081~0.1767。分子方差分析显示,遗传分化90.98%来自群体内,9.02%来自群体间。邻接系统进化树显示6个花鲈群体分为两大支。单倍型邻接树和单倍型网络关系图结果表明,未检测到有地理谱系结构的单倍型。中性检验显示,花鲈群体可能经历过种群扩张。 展开更多
关键词 花鲈 cox1序列 遗传多样性 遗传结构
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孔雀嗉囊毛细线虫的分子鉴定 被引量：3
4
作者 王荣琼 刘永张 +2 位作者 邹丰才 杨建发 彭洁 《养殖与饲料》 2015年第9期8-10,共3页
通过分子生物学方法对来自昆明市圆通山动物园孔雀消化道中收集的线虫进行鉴定。结果显示,该线虫与Gen Bank发表的澳大利亚袋鼠毛细线虫COX1序列的相似性为77.3%,证明该线虫为毛细科毛细属的毛细线虫。COX1序列分析表明序列差异较明显,... 通过分子生物学方法对来自昆明市圆通山动物园孔雀消化道中收集的线虫进行鉴定。结果显示,该线虫与Gen Bank发表的澳大利亚袋鼠毛细线虫COX1序列的相似性为77.3%,证明该线虫为毛细科毛细属的毛细线虫。COX1序列分析表明序列差异较明显,说明孔雀毛细线虫不同于澳大利亚袋鼠毛细线虫,它们存在着遗传背景的差异。 展开更多
关键词 孔雀 毛细线虫 cox1序列 分子鉴定
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犬体内类圆线虫的分子鉴定 被引量：2
5
作者 曾敏浩 阳任花 +4 位作者 郭鑫宇 刘慧婷 柏慧 常巧呈 王春仁 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第17期98-100,共3页
为了鉴定来自斗牛犬体内的类圆线虫种类,试验提取了虫体的总DNA,对核糖体内转录间隔区（ITS）和线粒体细胞色素C氧化酶第Ⅰ亚基（cox1）部分序列进行扩增、克隆、同源性分析及构建系统进化树。结果表明：rDNA ITS序列全长为580 bp,其中I... 为了鉴定来自斗牛犬体内的类圆线虫种类,试验提取了虫体的总DNA,对核糖体内转录间隔区（ITS）和线粒体细胞色素C氧化酶第Ⅰ亚基（cox1）部分序列进行扩增、克隆、同源性分析及构建系统进化树。结果表明：rDNA ITS序列全长为580 bp,其中ITS1序列长度为216 bp;得到的cox1序列长度为961 bp;ITS1和cox1序列均与粪类圆线虫同源性最高,分别为99.5%和99.8%;基于ITS1和cox1序列与Gen Bank中相关线虫进行遗传进化分析,类圆属线虫处在一个大的进化分支上,亲缘关系最近。说明采自病犬体内的线虫为粪类圆线虫。 展开更多
关键词 犬 粪类圆线虫 分子生物学鉴定 遗传进化 ITS序列 cox1序列
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