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神威·太湖之光平台上宇宙N体模拟中FMM的并行优化
1
作者
韩承磊
梁建国
+3 位作者
傅游
叶雨曦
花嵘
李倩倩
《山东科技大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2024年第3期105-113,共9页
宇宙学模拟是典型的N体问题,是高性能计算中具有代表性和挑战性的问题之一。本研究在神威·太湖之光平台上对天文N体模拟软件PhotoNs-2中的计算主体——快速多极子方法(fast multipole method,FMM)进行移植和性能优化。针对目前研...
宇宙学模拟是典型的N体问题,是高性能计算中具有代表性和挑战性的问题之一。本研究在神威·太湖之光平台上对天文N体模拟软件PhotoNs-2中的计算主体——快速多极子方法(fast multipole method,FMM)进行移植和性能优化。针对目前研究中存在的计算效率不高、通信开销大问题,结合神威·太湖之光SW26010处理器架构特点,通过数据重整、超越函数计算重构、设计双缓冲和消息传递接口通信时合并发送树进行优化。相较于优化前,优化后的PhotoNs-2在3个不同算例规模下均取得约24倍的加速效果。提出的优化方案可以为其他高性能应用在神威·太湖之光平台上的移植与优化提供参考。
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关键词
神威·太湖之光平台
并行优化
数据重整
快速多极子方法
宇宙
n
体
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题名
神威·太湖之光平台上宇宙N体模拟中FMM的并行优化
1
作者
韩承磊
梁建国
傅游
叶雨曦
花嵘
李倩倩
机构
山东科技大学计算机科学与工程学院
曲阜师范大学计算机学院
出处
《山东科技大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2024年第3期105-113,共9页
基金
山东省自然科学基金项目(ZR2022MF274,ZR2021LZH004,ZR2023LZH009)。
文摘
宇宙学模拟是典型的N体问题,是高性能计算中具有代表性和挑战性的问题之一。本研究在神威·太湖之光平台上对天文N体模拟软件PhotoNs-2中的计算主体——快速多极子方法(fast multipole method,FMM)进行移植和性能优化。针对目前研究中存在的计算效率不高、通信开销大问题,结合神威·太湖之光SW26010处理器架构特点,通过数据重整、超越函数计算重构、设计双缓冲和消息传递接口通信时合并发送树进行优化。相较于优化前,优化后的PhotoNs-2在3个不同算例规模下均取得约24倍的加速效果。提出的优化方案可以为其他高性能应用在神威·太湖之光平台上的移植与优化提供参考。
关键词
神威·太湖之光平台
并行优化
数据重整
快速多极子方法
宇宙
n
体
Keywords
Su
n
way
TaihuLight
platform
parallel
optimizatio
n
data
reorga
n
izatio
n
FMM
cosmic
n
-
body
分类号
TP311 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
神威·太湖之光平台上宇宙N体模拟中FMM的并行优化
韩承磊
梁建国
傅游
叶雨曦
花嵘
李倩倩
《山东科技大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2024
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