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一种基于寡核苷酸微阵列芯片的多重可扩增探针杂交技术
被引量：
3
1
作者
刘和平
王宏
+3 位作者
陆祖宏
刘小平
夏昆
夏家辉
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2004年第2期119-124,共6页
多重可扩增探针杂交技术 (multiplexamplifiableprobehybridization ,MAPH)是近年来发展起来的一种用于基因组中DNA拷贝数检测的新技术。并发展了一种基于寡核苷酸微阵列芯片的MAPH技术。该方法根据所检测的DNA序列 ,制备若干具有通用...
多重可扩增探针杂交技术 (multiplexamplifiableprobehybridization ,MAPH)是近年来发展起来的一种用于基因组中DNA拷贝数检测的新技术。并发展了一种基于寡核苷酸微阵列芯片的MAPH技术。该方法根据所检测的DNA序列 ,制备若干具有通用引物的PCR产物作为可扩增探针组 ,与固定在尼龙膜上待测的基因组DNA杂交。用磁珠回收特异性杂交的探针 ,经生物素标记的通用引物扩增后 ,与相应的寡核苷酸微阵列芯片杂交。该特异性的寡核苷酸微阵列芯片包括 10个抗肌营养不良基因的外显子探针和阴性、阳性探针。杂交清冼后 ,链霉亲和素 Cy3染色用芯片扫描仪得到杂交的荧光图像。分析荧光信号的强度差异给出特定基因片段拷贝数的变化。该方法用微阵列技术代替MAPH中的电泳检测技术 ,可大幅度增加检测的通量。选择了一个正常男性、一个正常女性和一个肌营养不良症患者的基因组DNA来进行验证。结果表明 。
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关键词
基因拷贝数变化
MAPH
DMD/BMD
链霉亲和素-Cy3
多重PCR
寡核苷酸微阵列芯片
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职称材料
饲粮蛋白水平对荣昌猪脂肪细胞和肌纤维发育及相关基因表达的影响
被引量：
7
2
作者
章杰
刘一辉
+1 位作者
何航
罗宗刚
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期2115-2124,共10页
旨在探讨饲粮蛋白水平对育肥期荣昌猪屠宰性能、细胞大小、基因表达和线粒体DNA拷贝数的影响。选取24头体重相近的荣昌猪,在育肥阶段随机分为2组,即低蛋白组(10.50%)和高蛋白组(16.50%),每组3个重复,每个重复4头猪。试验结束后,屠宰,测...
旨在探讨饲粮蛋白水平对育肥期荣昌猪屠宰性能、细胞大小、基因表达和线粒体DNA拷贝数的影响。选取24头体重相近的荣昌猪,在育肥阶段随机分为2组,即低蛋白组(10.50%)和高蛋白组(16.50%),每组3个重复,每个重复4头猪。试验结束后,屠宰,测定生产性能、屠宰性能、脂肪细胞体积和肌纤维横截面面积。使用qRT-PCR法定量分析mRNA相对表达水平和线粒体DNA拷贝数。结果显示:1)高蛋白组胴体重、脂肪率、背膘厚和脂肪细胞体积显著高于低蛋白组(P<0.05),瘦肉率、眼肌面积和肌纤维横截面面积在2组间无显著差异(P>0.05);2)与低蛋白组相比,高蛋白组脂质降解基因ADIPOR1、ADIPOR2和LPL的表达量显著降低(P<0.05),脂质生成基因FABP5、FTO和UCP2的表达量极显著升高(P<0.01),基因SCD的表达量变化不显著(P>0.05),肌肉生长基因MYOG、MYOZ1、MYOD1和IGF1的表达量显著升高(P<0.05),抑制肌肉生长基因MSTN的表达量变化不显著(P>0.05);3)与低蛋白组相比,高蛋白组脂肪细胞和肌纤维线粒体DNA拷贝数显著升高(P<0.05)。结果提示,饲粮蛋白可从分子和表型水平来影响育肥期荣昌猪的生长发育,高蛋白饲粮可增强其脂肪沉积。
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关键词
饲粮蛋白水平
荣昌猪
脂肪细胞
肌纤维
基因表达
拷贝数变化
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职称材料
ADAM3A基因拷贝数差异与先天性膈疝相关性分析
3
作者
熊瑛
叶伟萍
古航
《临床儿科杂志》
CSCD
北大核心
2017年第9期655-657,共3页
目的通过对先天性膈疝胎儿多基因位点的检测,评价基因拷贝数变化与胎儿先天性膈疝之间的关系。方法采用Affymetrix Cytoscan 750 k平台微阵列分析11例先天性膈疝新生儿的多基因位点(其中1例为双胎,其异卵双胞胎兄弟被诊断为胎儿肠扩张)...
目的通过对先天性膈疝胎儿多基因位点的检测,评价基因拷贝数变化与胎儿先天性膈疝之间的关系。方法采用Affymetrix Cytoscan 750 k平台微阵列分析11例先天性膈疝新生儿的多基因位点(其中1例为双胎,其异卵双胞胎兄弟被诊断为胎儿肠扩张)。结果在1例先天性膈疝新生儿中发现一个纯合子缺失,8 p11.22 arr[hg19],并最终证实为解聚素和金属蛋白酶(ADAM)3A基因的1~15外显子发生纯合缺失。结论 ADAM3A拷贝数的改变可能是先天性膈疝的发病原因。
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关键词
微阵列芯片
先天性膈疝
ADAM3A基因
拷贝数改变
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职称材料
题名
一种基于寡核苷酸微阵列芯片的多重可扩增探针杂交技术
被引量：
3
1
作者
刘和平
王宏
陆祖宏
刘小平
夏昆
夏家辉
机构
分子与生物分子电子学教育部重点实验室
医学遗传学国家重点实验室
出处
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2004年第2期119-124,共6页
基金
国家自然科学基金"创新群体科学基金"项目(编号60121101)
国家重大基础研究项目(编号 :973 1 3 0 106)
国家重大基础研究项目(编号:2001CB510 30 2 )资助~~
文摘
多重可扩增探针杂交技术 (multiplexamplifiableprobehybridization ,MAPH)是近年来发展起来的一种用于基因组中DNA拷贝数检测的新技术。并发展了一种基于寡核苷酸微阵列芯片的MAPH技术。该方法根据所检测的DNA序列 ,制备若干具有通用引物的PCR产物作为可扩增探针组 ,与固定在尼龙膜上待测的基因组DNA杂交。用磁珠回收特异性杂交的探针 ,经生物素标记的通用引物扩增后 ,与相应的寡核苷酸微阵列芯片杂交。该特异性的寡核苷酸微阵列芯片包括 10个抗肌营养不良基因的外显子探针和阴性、阳性探针。杂交清冼后 ,链霉亲和素 Cy3染色用芯片扫描仪得到杂交的荧光图像。分析荧光信号的强度差异给出特定基因片段拷贝数的变化。该方法用微阵列技术代替MAPH中的电泳检测技术 ,可大幅度增加检测的通量。选择了一个正常男性、一个正常女性和一个肌营养不良症患者的基因组DNA来进行验证。结果表明 。
关键词
基因拷贝数变化
MAPH
DMD/BMD
链霉亲和素-Cy3
多重PCR
寡核苷酸微阵列芯片
Keywords
copy
number
changes
MAPH
DMD/BMD
streptavidin-Cy3
multiplex
PCR
oligonucleotide
arrays
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
饲粮蛋白水平对荣昌猪脂肪细胞和肌纤维发育及相关基因表达的影响
被引量：
7
2
作者
章杰
刘一辉
何航
罗宗刚
机构
西南大学动物科学学院
四川省畜牧总站
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期2115-2124,共10页
基金
中央高校基本科研业务费专项资金(XDJK2015C125)
文摘
旨在探讨饲粮蛋白水平对育肥期荣昌猪屠宰性能、细胞大小、基因表达和线粒体DNA拷贝数的影响。选取24头体重相近的荣昌猪,在育肥阶段随机分为2组,即低蛋白组(10.50%)和高蛋白组(16.50%),每组3个重复,每个重复4头猪。试验结束后,屠宰,测定生产性能、屠宰性能、脂肪细胞体积和肌纤维横截面面积。使用qRT-PCR法定量分析mRNA相对表达水平和线粒体DNA拷贝数。结果显示:1)高蛋白组胴体重、脂肪率、背膘厚和脂肪细胞体积显著高于低蛋白组(P<0.05),瘦肉率、眼肌面积和肌纤维横截面面积在2组间无显著差异(P>0.05);2)与低蛋白组相比,高蛋白组脂质降解基因ADIPOR1、ADIPOR2和LPL的表达量显著降低(P<0.05),脂质生成基因FABP5、FTO和UCP2的表达量极显著升高(P<0.01),基因SCD的表达量变化不显著(P>0.05),肌肉生长基因MYOG、MYOZ1、MYOD1和IGF1的表达量显著升高(P<0.05),抑制肌肉生长基因MSTN的表达量变化不显著(P>0.05);3)与低蛋白组相比,高蛋白组脂肪细胞和肌纤维线粒体DNA拷贝数显著升高(P<0.05)。结果提示,饲粮蛋白可从分子和表型水平来影响育肥期荣昌猪的生长发育,高蛋白饲粮可增强其脂肪沉积。
关键词
饲粮蛋白水平
荣昌猪
脂肪细胞
肌纤维
基因表达
拷贝数变化
Keywords
dietary
protein
level
Rong
chang
pig
adipocyte
myofiber
gene
expression
copy
number
chang
e
分类号
S828.5 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
ADAM3A基因拷贝数差异与先天性膈疝相关性分析
3
作者
熊瑛
叶伟萍
古航
机构
上海交通大学医学院附属新华医院
上海长海医院
出处
《临床儿科杂志》
CSCD
北大核心
2017年第9期655-657,共3页
基金
上海交通大学医学院附属新华医院集团基金(No.12XJ2003)
文摘
目的通过对先天性膈疝胎儿多基因位点的检测,评价基因拷贝数变化与胎儿先天性膈疝之间的关系。方法采用Affymetrix Cytoscan 750 k平台微阵列分析11例先天性膈疝新生儿的多基因位点(其中1例为双胎,其异卵双胞胎兄弟被诊断为胎儿肠扩张)。结果在1例先天性膈疝新生儿中发现一个纯合子缺失,8 p11.22 arr[hg19],并最终证实为解聚素和金属蛋白酶(ADAM)3A基因的1~15外显子发生纯合缺失。结论 ADAM3A拷贝数的改变可能是先天性膈疝的发病原因。
关键词
微阵列芯片
先天性膈疝
ADAM3A基因
拷贝数改变
Keywords
microarray
chip
congenital
diaphragmatic
hernia
ADAM3A
gene
copy
number
chang
e
分类号
R722.1 [医药卫生—儿科]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种基于寡核苷酸微阵列芯片的多重可扩增探针杂交技术
刘和平
王宏
陆祖宏
刘小平
夏昆
夏家辉
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2004
3
下载PDF
职称材料
2
饲粮蛋白水平对荣昌猪脂肪细胞和肌纤维发育及相关基因表达的影响
章杰
刘一辉
何航
罗宗刚
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
7
下载PDF
职称材料
3
ADAM3A基因拷贝数差异与先天性膈疝相关性分析
熊瑛
叶伟萍
古航
《临床儿科杂志》
CSCD
北大核心
2017
0
下载PDF
职称材料
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