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高通量测序检测米线中的食源性致病菌
被引量:
9
1
作者
吴怡
刘露露
+4 位作者
吴永民
代诗琼
商颖
曹建新
韩鹏
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期347-352,共6页
为了解米线中食源性致病菌的污染情况,分析其细菌多样性随时间变化趋势,研究从原料到餐桌中各个环节米线样品中食源性致病菌的变化。采用高通量测序对10个米线样本中细菌16S rDNA区域进行测序分析,测序结果一共注释到5个门、11个纲、19...
为了解米线中食源性致病菌的污染情况,分析其细菌多样性随时间变化趋势,研究从原料到餐桌中各个环节米线样品中食源性致病菌的变化。采用高通量测序对10个米线样本中细菌16S rDNA区域进行测序分析,测序结果一共注释到5个门、11个纲、19个目、24个科和29个属的微生物信息。分析表明,在所有样品中,变形菌门均占据50%以上相对丰度,其次为厚壁菌门,沙门菌属和芽孢杆菌属在各样品中均有发现。同时在原料样品和米线样品中还检出了葡萄球菌属、埃希氏杆菌属和李斯特菌属。利用传统培养法对10个样品进行检测,发现蜡样芽孢杆菌、沙门菌在各样品中均有检出,在原料和产品样品中也确实存在金黄色葡萄球菌、大肠杆菌O157:H7和单核细胞性李斯特菌,证明米线确实存在一定的食用风险。研究分析了不同阶段的米线样品中菌群的动态变化,为控制米线微生物污染,消除潜在的食用风险提供理论依据。
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关键词
米线
高通量测序
16S
rDNA
传统培养
食源性致病菌
安全风险
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职称材料
实时荧光PCR法、胶体金法和培养法检测甲鱼中霍乱弧菌
被引量:
3
2
作者
颜淑妩
李哲婷
邓婵
《实用预防医学》
CAS
2012年第6期925-927,共3页
目的优化水产品甲鱼中霍乱弧菌的检测程序,提高甲鱼中霍乱弧菌检出率。方法用实时荧光PCR、常规细菌培养、胶体金法同时对甲鱼中霍乱弧菌进行检测,并用实时荧光PCR法检测标本中霍乱弧菌ctx基因。结果共检测185份甲鱼样品,其中实时荧光PC...
目的优化水产品甲鱼中霍乱弧菌的检测程序,提高甲鱼中霍乱弧菌检出率。方法用实时荧光PCR、常规细菌培养、胶体金法同时对甲鱼中霍乱弧菌进行检测,并用实时荧光PCR法检测标本中霍乱弧菌ctx基因。结果共检测185份甲鱼样品,其中实时荧光PCR法检出28份霍乱弧菌核酸阳性,阳性率为15.14%;6份ctx基因核酸阳性,阳性率21.43%(6/28)。常规细菌培养法分离出2株菌株,一株为O139群霍乱弧菌,一株为小川型霍乱弧菌,用实时荧光PCR检测这两株纯培养菌株或原始标本,霍乱弧菌ctx基因均为阴性;胶体金法未检出阳性标本。结论对于水产品标本,可先用实时荧光PCR法筛检霍乱弧菌,阳性标本再进行传统细菌分离培养,以提高霍乱弧菌菌株的检出率;同时阳性标本进行霍乱弧菌ctx基因核酸检测,如也为阳性,需提高警惕,加强流行病学上的预防控制措施,及时防范霍乱疫情的发生。
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关键词
霍乱弧菌
ctx基因
实时荧光PCR
常规细菌培养
胶体金法
原文传递
肠出血性大肠杆菌O157:H7四种检测方法的比较
被引量:
1
3
作者
钟逸雯
罗可天
宋妙芳
《中国卫生检验杂志》
北大核心
2013年第14期2932-2933,共2页
目的评估这几种检验方法在检验食品中EHEC O157:H7的特异性、敏感性。方法用平板分离培养法、酶联免疫法(ELISA)、胶体金法、荧光PCR法同时对肠出血性大肠杆菌O157:H7进行检测。结果平板分离培养法和荧光PCR法的特异性最好,高浓度时三...
目的评估这几种检验方法在检验食品中EHEC O157:H7的特异性、敏感性。方法用平板分离培养法、酶联免疫法(ELISA)、胶体金法、荧光PCR法同时对肠出血性大肠杆菌O157:H7进行检测。结果平板分离培养法和荧光PCR法的特异性最好,高浓度时三种检测方法的敏感性接近100%,ELISA法敏感性最低86%。结论显色平板分离培养法具有最好的检测特异性和灵敏度,但检测时间较长;ELISA法灵敏度低,但快速,费用不高,无需仪器,适合基层实验室;胶体金法检测灵敏度高,有假阳性,费用高;荧光PCR法检测敏感性与特异性均较高。
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关键词
霍乱弧菌
实时荧光PCR法
常规细菌培养
胶体金法
原文传递
题名
高通量测序检测米线中的食源性致病菌
被引量:
9
1
作者
吴怡
刘露露
吴永民
代诗琼
商颖
曹建新
韩鹏
机构
昆明理工大学食品科学与工程学院
出处
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期347-352,共6页
基金
云南食源性致病菌溯源技术及其风险评价的研究课题(2018BC006)。
文摘
为了解米线中食源性致病菌的污染情况,分析其细菌多样性随时间变化趋势,研究从原料到餐桌中各个环节米线样品中食源性致病菌的变化。采用高通量测序对10个米线样本中细菌16S rDNA区域进行测序分析,测序结果一共注释到5个门、11个纲、19个目、24个科和29个属的微生物信息。分析表明,在所有样品中,变形菌门均占据50%以上相对丰度,其次为厚壁菌门,沙门菌属和芽孢杆菌属在各样品中均有发现。同时在原料样品和米线样品中还检出了葡萄球菌属、埃希氏杆菌属和李斯特菌属。利用传统培养法对10个样品进行检测,发现蜡样芽孢杆菌、沙门菌在各样品中均有检出,在原料和产品样品中也确实存在金黄色葡萄球菌、大肠杆菌O157:H7和单核细胞性李斯特菌,证明米线确实存在一定的食用风险。研究分析了不同阶段的米线样品中菌群的动态变化,为控制米线微生物污染,消除潜在的食用风险提供理论依据。
关键词
米线
高通量测序
16S
rDNA
传统培养
食源性致病菌
安全风险
Keywords
rice
noodles
high-throughput
sequencing
16S
rDNA
conventional
bacterial culture
foodborne
pathogenic
bacteri
a
safety
risk
分类号
TS207.4 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
实时荧光PCR法、胶体金法和培养法检测甲鱼中霍乱弧菌
被引量:
3
2
作者
颜淑妩
李哲婷
邓婵
机构
湖南省衡阳市疾病预防控制中心
出处
《实用预防医学》
CAS
2012年第6期925-927,共3页
文摘
目的优化水产品甲鱼中霍乱弧菌的检测程序,提高甲鱼中霍乱弧菌检出率。方法用实时荧光PCR、常规细菌培养、胶体金法同时对甲鱼中霍乱弧菌进行检测,并用实时荧光PCR法检测标本中霍乱弧菌ctx基因。结果共检测185份甲鱼样品,其中实时荧光PCR法检出28份霍乱弧菌核酸阳性,阳性率为15.14%;6份ctx基因核酸阳性,阳性率21.43%(6/28)。常规细菌培养法分离出2株菌株,一株为O139群霍乱弧菌,一株为小川型霍乱弧菌,用实时荧光PCR检测这两株纯培养菌株或原始标本,霍乱弧菌ctx基因均为阴性;胶体金法未检出阳性标本。结论对于水产品标本,可先用实时荧光PCR法筛检霍乱弧菌,阳性标本再进行传统细菌分离培养,以提高霍乱弧菌菌株的检出率;同时阳性标本进行霍乱弧菌ctx基因核酸检测,如也为阳性,需提高警惕,加强流行病学上的预防控制措施,及时防范霍乱疫情的发生。
关键词
霍乱弧菌
ctx基因
实时荧光PCR
常规细菌培养
胶体金法
Keywords
Vibrio
cholerae
ctx
gene
Real
time
polymerase
chain
reaction
conventional
bacterial culture
Colloidal
gold
immunochromatographic
assay
分类号
R378.3 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
肠出血性大肠杆菌O157:H7四种检测方法的比较
被引量:
1
3
作者
钟逸雯
罗可天
宋妙芳
机构
广州市越秀区疾病预防控制中心
出处
《中国卫生检验杂志》
北大核心
2013年第14期2932-2933,共2页
文摘
目的评估这几种检验方法在检验食品中EHEC O157:H7的特异性、敏感性。方法用平板分离培养法、酶联免疫法(ELISA)、胶体金法、荧光PCR法同时对肠出血性大肠杆菌O157:H7进行检测。结果平板分离培养法和荧光PCR法的特异性最好,高浓度时三种检测方法的敏感性接近100%,ELISA法敏感性最低86%。结论显色平板分离培养法具有最好的检测特异性和灵敏度,但检测时间较长;ELISA法灵敏度低,但快速,费用不高,无需仪器,适合基层实验室;胶体金法检测灵敏度高,有假阳性,费用高;荧光PCR法检测敏感性与特异性均较高。
关键词
霍乱弧菌
实时荧光PCR法
常规细菌培养
胶体金法
Keywords
Vibrio
cholerae
Real
-time
PCR
method
conventional
bacterial culture
Colloidal
gold
method
分类号
Q-331 [生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高通量测序检测米线中的食源性致病菌
吴怡
刘露露
吴永民
代诗琼
商颖
曹建新
韩鹏
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2022
9
下载PDF
职称材料
2
实时荧光PCR法、胶体金法和培养法检测甲鱼中霍乱弧菌
颜淑妩
李哲婷
邓婵
《实用预防医学》
CAS
2012
3
原文传递
3
肠出血性大肠杆菌O157:H7四种检测方法的比较
钟逸雯
罗可天
宋妙芳
《中国卫生检验杂志》
北大核心
2013
1
原文传递
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