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大肠杆菌与酵母菌基因特定序列信息参量的研究 被引量:8
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作者 陈颖丽 李前忠 马克健 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期676-684,共9页
提出核酸序列的矩阵表示形式,按位点定义了有生物学意义的信息参数M1(l)、M2(l)和M3(l)。着重研究了不同表达水平的大肠杆菌(Escherichiacoli,E.coli)的SD序列(Shine -Dalgarnoregion,SD)以及大肠杆菌(E.coli)和酵母菌(Yeast)基因起始... 提出核酸序列的矩阵表示形式,按位点定义了有生物学意义的信息参数M1(l)、M2(l)和M3(l)。着重研究了不同表达水平的大肠杆菌(Escherichiacoli,E.coli)的SD序列(Shine -Dalgarnoregion,SD)以及大肠杆菌(E.coli)和酵母菌(Yeast)基因起始、终止密码子邻近区域核酸序列的碱基关联性与保守性。并求出相应矩阵的本征值 ,给出了信息参量与基因表达水平的关系。发现信息参量体现了原核生物和真核生物翻译起始区域的显著差异 。 展开更多
关键词 SD区域 矩阵表示 信息参数 基因表达水平 保守位点 大肠杆菌 酶母菌 核酸序列
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油橄榄类黄酮生物合成相关酶的研究进展 被引量:4
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作者 唐亚琴 梅抗抗 +3 位作者 陈瑶 谢琴鼎 黄乾明 陈华萍 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期2110-2117,共8页
类黄酮是酚类代谢物的一大亚组,其生物合成属于苯丙素代谢途径的分支,它们广泛分布在整个植物界。不仅在植物中有极其重要的生理、生化和生态功能,而且对动物的生物活性及提供营养等方面做出重要贡献。油橄榄叶、果实、根都富含类黄酮,... 类黄酮是酚类代谢物的一大亚组,其生物合成属于苯丙素代谢途径的分支,它们广泛分布在整个植物界。不仅在植物中有极其重要的生理、生化和生态功能,而且对动物的生物活性及提供营养等方面做出重要贡献。油橄榄叶、果实、根都富含类黄酮,具有重要研究价值。本研究综述了油橄榄类黄酮生物合成途径相关酶(CHI,CHS,F3H,DFR,FLS,FNSI,LAR,F3'H,F3',5'H)的底物特异性和功能性区域,分析总结了编码这些酶的基因在不同物种间的序列相似性和在不同组织的表达特异性。这对深入研究植物类黄酮生物合成相关酶的结构和功能,基因的克隆、表达和调控以及对油橄榄类黄酮生物合成途径相关酶的研究具有参考价值。 展开更多
关键词 油橄榄 类黄酮 相关酶 底物特异性 保守位点
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核酸序列的保守位点及双螺旋结构的局部偏差 被引量:3
3
作者 胜利 罗辽复 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1991年第2期234-247,共14页
统计分析了12类核酸序列在起始密码子邻近,终止密码子邻近以及内含子两端的保守区,得到了保守区随序列类别变化的经验规律,鉴于这些保守位点对基因表达的调控可能具有重要作用,本文利用Tung-Harvey模型,计算了核酸双螺旋结构的局部偏差... 统计分析了12类核酸序列在起始密码子邻近,终止密码子邻近以及内含子两端的保守区,得到了保守区随序列类别变化的经验规律,鉴于这些保守位点对基因表达的调控可能具有重要作用,本文利用Tung-Harvey模型,计算了核酸双螺旋结构的局部偏差,企图发现局部偏差相对较大的位点与保守位点之间的关系。 展开更多
关键词 核酸 保守位点 双螺旋结构 序列
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胰高血糖素样肽-1受体胞外区域突变体复合物的动力学研究 被引量:2
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作者 曹洪玉 金晓军 +4 位作者 郭委 余雅娴 史龙飞 唐乾 郑学仿 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2018年第5期1026-1033,共8页
采用分子动力学模拟方法研究了胰高血糖素样肽-1(GLP-1)与GLP-1受体(GLP-1R)胞外区域的相互作用.结果表明,配体的结合导致受体的构象发生改变,Loop2区域的氨基酸Pro90和Trp91以及C末端的Glu128向配体移动.根据保守位点突变受体(P73A,V81... 采用分子动力学模拟方法研究了胰高血糖素样肽-1(GLP-1)与GLP-1受体(GLP-1R)胞外区域的相互作用.结果表明,配体的结合导致受体的构象发生改变,Loop2区域的氨基酸Pro90和Trp91以及C末端的Glu128向配体移动.根据保守位点突变受体(P73A,V81L,Y88A,P90A和W91A)后所得多肽模拟数据,发现Loop2区域在突变体中的结构和柔性均发生了明显变化,Trp91和Tyr88的突变将导致配体亲和力丧失.研究结果证明,P73A突变型受体和野生型受体分别与配体相互作用后,二者数值差别不大,因此Pro73不是关键残基;V81L突变体则会导致配体亲和力的丧失.该结果为GLP-1药物设计提供了重要理论依据. 展开更多
关键词 胰高血糖素样肽-1 保守位点 分子动力学模拟 突变体
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Antibody-Like Phosphorylation Sites. Theme for Studies of Cancer, Aging and Evolution
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作者 Jaroslav Kubrycht Karel Sigler 《Computational Molecular Bioscience》 2022年第1期58-83,共26页
Sequence similarities were found between protein and DNA sequences encoding certain part of conserved variable immunoglobulin domains (i.e. conserved IgV) and phosphorylation sites. Hypermutation motifs were then indi... Sequence similarities were found between protein and DNA sequences encoding certain part of conserved variable immunoglobulin domains (i.e. conserved IgV) and phosphorylation sites. Hypermutation motifs were then indicated in the majority of the corresponding non-IgV nucleotide sequences. According to database confirmations or double prediction of phosphorylation sites, 80% of the selected human and mouse IgV-related phosphorylation sites or their highly probable candidates exhibited substrate relationship to ataxia-telangiectasia-mutated kinase known as ATM. In accordance with literature data, inactivation of ATM by mutations can participate in the mechanisms of carcinogenesis, neurodegeneration and possibly also in aging. In agreement with this relationship, some of the selected IgV-/ATM-related segments formed molecules specifically involved in carcinogenesis. The selected IgV-related sequence segments were also similar to certain segments of higher plants containing immunoglobulin-like repeats and related regions. Bioinformatic analysis of some selected plant sequences then indicated the presence of catalytic domains composing serine/threonine/tyrosine receptor/receptor-like kinases, which are considered important structures for evolution of very early and part of later Ig-domain-related immunity. The analyzed conserved domain similarities also suggested certain interesting structural and phylogenic relationships, which need to be further investigated. This review in fact briefly summarizes the findings on the subject from the last twenty years. 展开更多
关键词 Ataxia-Telangiectasia-Mutated Kinase (ATM) CARCINOGENESIS Complementarity Determining Region 1 (CDR1 Hypervariable Region 1) conserved Domain(s) Deep Evolution EVOLUTION HYPERMUTATION Kinase(s) Phosphorylation site(s) Plant Immunity Variable Immunoglobulin Domain(s) (IgV)
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转移RNA结构基因共有序列的统计分析
6
作者 达来 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1993年第2期196-203,共8页
本文以大肠杆菌、地钱叶绿体和鸡线粒体基因组中:RNA结构基因的全部拷贝数为分析总体,统计出了碱基分布。在大肠杆菌中证实了Pu52-Py62半不变核苷酸对,排除了A21的共有性,确认了24个共有核苷酸,其中半数核苷酸参加三级氢键的形成作用;... 本文以大肠杆菌、地钱叶绿体和鸡线粒体基因组中:RNA结构基因的全部拷贝数为分析总体,统计出了碱基分布。在大肠杆菌中证实了Pu52-Py62半不变核苷酸对,排除了A21的共有性,确认了24个共有核苷酸,其中半数核苷酸参加三级氢键的形成作用;螺旋区碱基标准配对率平均为95%;在非标准配对中以GU为主而且集中在两个连续双螺旋的缺口处,又发现在第10、27、49位G居多现象,其意义有待阐明。大肠杆菌tRNA序列与地钱叶绿体tRNA序列极为相似,鸡线粒体tRNA由于缺乏典型的D环和TψC环而与大肠杆菌tRNA序列差别较大。本文还计算了大肠杆菌tRNA基因拷贝数与密码子利用率之间相关系数(r=0.976),并讨论了影响细胞内tRNA含量的基因剂量效应,位置效应诸问题。 展开更多
关键词 共有位点 统计相关 转移核糖酸
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嗜热酸性Ⅲ型普鲁兰多糖水解酶TK-PUL保守基序中关键氨基酸残基对其催化性质的影响 被引量:1
7
作者 曾静 何础阔 +3 位作者 郭建军 侯安伟 聂俊辉 袁林 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第22期113-120,共8页
对嗜热酸性Ⅲ型普鲁兰水解酶TK-PUL保守基序中非保守氨基酸残基进行定点突变,通过比较TK-PUL与突变体的酶学性质,确定保守基序中关键氨基酸残基对其催化性质的影响。TK-PUL保守基序Ⅱ中I500W位点变化不影响其最适反应pH值、pH值稳定性... 对嗜热酸性Ⅲ型普鲁兰水解酶TK-PUL保守基序中非保守氨基酸残基进行定点突变,通过比较TK-PUL与突变体的酶学性质,确定保守基序中关键氨基酸残基对其催化性质的影响。TK-PUL保守基序Ⅱ中I500W位点变化不影响其最适反应pH值、pH值稳定性、最适反应温度、热稳定性,但使其α-淀粉酶活性和普鲁兰酶活性均明显降低。动力学常数测定结果显示,突变体I500W以麦芽三糖为底物的k_(cat)/K_(m)值基本不变,以异潘糖为底物的k_(cat)/K_(m)值约为TK-PUL的64.78%。结果表明,TK-PUL保守基序II中第500位氨基酸残基Ile对其水解糖苷键的偏好性起到重要作用。TK-PUL中I500W位点变化不影响其α-1,4-糖苷键水解活性,但使其α-1,6-糖苷键水解活性明显降低。本研究有助于深入理解TK-PUL的双功能催化机制,也可为TK-PUL的分子改造提供理论依据和设计思路。 展开更多
关键词 Ⅲ型普鲁兰多糖水解酶 保守基序 定点突变 催化活性 同源模建
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水利工程建设现场监理人员配置标准及验证 被引量:27
8
作者 聂相田 郜军艳 《水电能源科学》 北大核心 2012年第8期112-115,共4页
随着水利工程建设监理制度的建立和发展,规范水利工程建设监理行业、提高项目管理水平、优化资源组合,制订一套科学合理的水利工程建设现场监理人员配置管理标准迫在眉睫。在识别影响要素的基础上,区分施工阶段及专业项目测算监理服务... 随着水利工程建设监理制度的建立和发展,规范水利工程建设监理行业、提高项目管理水平、优化资源组合,制订一套科学合理的水利工程建设现场监理人员配置管理标准迫在眉睫。在识别影响要素的基础上,区分施工阶段及专业项目测算监理服务工作量,并通过实地调研、数据统计分析及假设检验等方法,提出一套具有普遍适用性和可操作性的监理人员配置办法。 展开更多
关键词 水利工程 现场监理人员 工作量 配置标准
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生物信息方法分析灰霉菌衰退相关病毒蛋白的功能
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作者 王巍杰 郭成志 《河北理工大学学报(自然科学版)》 CAS 2010年第3期121-123,共3页
利用Blast在GenBank数据库对BcDRV病毒相关基因进行简单定位和同源性检索分析,并对BcDRV病毒编码蛋白的结构进行分析和预测,同时在蛋白数据库中检索该蛋白所属家族蛋白线粒体病毒的RNA聚合酶信息,利用所得的结果以多序列比对的方式确立... 利用Blast在GenBank数据库对BcDRV病毒相关基因进行简单定位和同源性检索分析,并对BcDRV病毒编码蛋白的结构进行分析和预测,同时在蛋白数据库中检索该蛋白所属家族蛋白线粒体病毒的RNA聚合酶信息,利用所得的结果以多序列比对的方式确立蛋白家族的进化关系,建立进化树,并使用Interpro数据库详细的分析蛋白功能。 展开更多
关键词 生物信 同源 进化树 保守位点
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豫西旱坡地长期定位保护性耕作研究——Ⅰ.连年免耕和深松覆盖对冬小麦生育及产量的影响 被引量:24
10
作者 王育红 蔡典雄 +5 位作者 姚宇卿 王小彬 吕军杰 李俊红 丁志强 张洁 《干旱地区农业研究》 CSCD 北大核心 2009年第5期47-51,共5页
利用长期定位试验方法(1999-2006年),在豫西旱区坡耕地上进行了不同保护耕作冬小麦生育及产量效应研究。结果表明:深松覆盖和免耕覆盖随着实施年限增加,均有增产效果。深松覆盖稳产、增产效果好于免耕覆盖。与传统耕作比,深松覆... 利用长期定位试验方法(1999-2006年),在豫西旱区坡耕地上进行了不同保护耕作冬小麦生育及产量效应研究。结果表明:深松覆盖和免耕覆盖随着实施年限增加,均有增产效果。深松覆盖稳产、增产效果好于免耕覆盖。与传统耕作比,深松覆盖增产幅度为4.88%~20.90%,平均增产8.77%。免耕覆盖在实施初表现出显著减产,但免耕覆盖在生育期内干旱及夏休闲干旱年份能显著提高小麦产量,平均增产3.70%。免耕覆盖和深松覆盖下冬小麦前期生长发育迟缓,株高降低、主茎叶龄、单株分蘖、次生根数和叶面积减少,根重和生物量减轻;拔节后,冬小麦生长发育快,各项指标(除单株分蘖)逐渐赶上并超过传统耕作。从灌浆特性分析,免耕覆盖和深松覆盖能提高最大灌浆速率,延缓后期灌浆速率下降,延长灌浆时间,进而提高小麦的千粒重。 展开更多
关键词 保护性耕作 长期定位试验 旱区坡耕地 产量
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“互联网+智慧水利”在水利施工现场管理中的应用探讨 被引量:12
11
作者 胥照 《江苏水利》 2018年第2期30-32,共3页
互联网+"是把互联网的创新成果与经济社会各领域深度融合,推动技术进步、效率提升和组织变革,提升实体经济的创新力和生产力,形成更广泛的以互联网为基础和创新要素的经济社会发展新形态。当前"互联网+"已经成为世界经... 互联网+"是把互联网的创新成果与经济社会各领域深度融合,推动技术进步、效率提升和组织变革,提升实体经济的创新力和生产力,形成更广泛的以互联网为基础和创新要素的经济社会发展新形态。当前"互联网+"已经成为世界经济和社会发展的大趋势。"智慧水利"就是将互联网与水利相融合,实现水利信息的共享。主要分析"互联网+智慧水利"对水利施工现场管理的影响,提出相应的解决方案,实现"互联网+智慧水利"在水利施工现场管理中跨越式发展。 展开更多
关键词 互联网+ 智慧水利 水利施工 现场管理
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水利工程施工管理现状和改善策略 被引量:11
12
作者 俞东兴 《价值工程》 2019年第33期32-34,共3页
水利工程建设的重要环节之一即是施工管理,直接影响着水利工程的顺利进行以及工程质量。本文分析了目前我国水利工程施工现状,分析我国水利工程施工过程中存在的问题,并提出了相应的改善对策,提出建立现代化的水利工程施工管理体系,优... 水利工程建设的重要环节之一即是施工管理,直接影响着水利工程的顺利进行以及工程质量。本文分析了目前我国水利工程施工现状,分析我国水利工程施工过程中存在的问题,并提出了相应的改善对策,提出建立现代化的水利工程施工管理体系,优化工程施工的材料管理,规范施工现场管理,建立健全完善的水利工程质量监督体系,加强水利工程的安全管理,对提升我国水利工程质量提供了参考意见。 展开更多
关键词 水利工程 施工管理 现场管理 材料管理 人员管理
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良渚文化遗址水利工程的考证与研究 被引量:9
13
作者 邱志荣 张卫东 茹静文 《浙江水利水电学院学报》 2016年第3期1-9,共9页
良渚文化遗址的探寻始于20世纪30年代,是目前发现的现存我国上古时期时间最早、规模最大、技术含量最高的水利围垦灌溉工程遗址之一.文物部门确认良渚古坝为水利工程是对中国古代水利史研究的重大贡献.经实地考证和阅读有关文献资料,运... 良渚文化遗址的探寻始于20世纪30年代,是目前发现的现存我国上古时期时间最早、规模最大、技术含量最高的水利围垦灌溉工程遗址之一.文物部门确认良渚古坝为水利工程是对中国古代水利史研究的重大贡献.经实地考证和阅读有关文献资料,运用考古、地质、测绘的成果,以钱塘江两岸上古水利史发展的角度,结合历史地理、气象、农业、人类等学科对良渚遗址塘坝工程的规模、功能、性质等进行较全面系统的分析和研究,发现遗址中的山地(上坝)—山麓(下坝)—平原(城墙与城河等)水利工程的建设与发展遵循了自然演变和人类适应与改造自然的规律,坝充分显示了良渚古代文明的发达程度,也说明水利工程在社会文明发展中占有重要地位. 展开更多
关键词 良渚 水利工程 古坝遗址 水利史研究
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水利水电工程建筑施工现场安全问题及管理策略 被引量:8
14
作者 李孙强 《中小企业管理与科技》 2019年第29期33-34,共2页
在科学技术水平快速提升的大背景下,我国水利水电工程施工技术水平和施工质量得到了很大提升。在实际建设过程中,地势、地形复杂项目开工建设规模在不断扩大,这在很大程度上增加了作业难度。在水利水电工程施工现场,相关技术人员需要注... 在科学技术水平快速提升的大背景下,我国水利水电工程施工技术水平和施工质量得到了很大提升。在实际建设过程中,地势、地形复杂项目开工建设规模在不断扩大,这在很大程度上增加了作业难度。在水利水电工程施工现场,相关技术人员需要注重工程项目施工质量,应用新技术和新方法,以此为基础确保水利水电工程施工的安全性。论文主要研究了水利水电工程建筑施工现场的安全问题及管理策略。 展开更多
关键词 水利水电工程 施工现场 安全问题 安全管理
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中国古城防洪的成功范例——成都 被引量:7
15
作者 吴庆洲 《南方建筑》 2008年第6期9-13,共5页
本文论述成都古城在城市防洪和城市水利上的有效措施,包括城市选址、凿金堂峡、建都江堰以及建设城市水系等,也分析了成都城水患的原因和管理的重要性。认为成都古城是中国古城防洪的成功范例。
关键词 城市防洪 城市水利 选址 都江堰 城市水系 管理
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水利工程建设中的浆砌石护坡施工技术分析 被引量:7
16
作者 苏双福 《江西建材》 2021年第9期240-241,共2页
文中主要立足于水利工程建设现状,对浆砌石护坡施工技术应用问题进行了研究与分析。
关键词 水利工程 现场施工 浆砌石护坡施工技术
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基于“互联网+智慧水利”的水利工程施工现场管理分析 被引量:5
17
作者 白成伟 尹艳丽 《科技创新与应用》 2023年第11期193-196,共4页
该文结合榆林市榆阳区的基本情况,展开实例工程施工现场管理的相关研究。在实际的水利工程建设中,选择“互联网+智慧水利”的水利工程,对具体施工现场管理进行研究,确保实际工作中,水利工程的施工效果得到保证,促使水利工程的建设质量... 该文结合榆林市榆阳区的基本情况,展开实例工程施工现场管理的相关研究。在实际的水利工程建设中,选择“互联网+智慧水利”的水利工程,对具体施工现场管理进行研究,确保实际工作中,水利工程的施工效果得到保证,促使水利工程的建设质量得到保证,进而提升水利工程的服务能力,使得水利工程能够满足人们生活所需,促使人们生活品质实现合理的提升。同时,发挥现场管理的功能和作用,促使水利工程的建设质量得到合理的提升。 展开更多
关键词 互联网 智慧水利 水利工程 施工现场管理 智慧管理平台
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水泊渡水库面板堆石坝现场碾压试验及分析 被引量:5
18
作者 何愈明 陈霓 龙宜伟 《贵州水力发电》 2004年第2期82-85,共4页
为确保水泊渡水库面板堆石的填筑质量,施工前进行了7种填筑材的现场碾压试验,证实坝体分区及筑坝材料级配曲线的设计是合适的。同时,通过现场碾压试验确定的大坝填筑碾压设备及与之相匹配的碾压参数,亦能够满足大坝填筑的质量要求。
关键词 水泊渡水库 面板堆石坝 碾压试验 筑坝材料
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水利水电工程施工现场环境保护初探 被引量:6
19
作者 聂红峡 《湖北水利水电职业技术学院学报》 2008年第1期22-25,共4页
水利水电工程是以防洪、发电、灌溉、供水等为目标的兴利除害的综合性工程,具有显著的社会效益和经济效益,但在施工过程中对施工区域原有的自然环境和生态平衡产生一定的影响,应引起高度重视,牢固树立人与自然和谐的生态工程理念,严格... 水利水电工程是以防洪、发电、灌溉、供水等为目标的兴利除害的综合性工程,具有显著的社会效益和经济效益,但在施工过程中对施工区域原有的自然环境和生态平衡产生一定的影响,应引起高度重视,牢固树立人与自然和谐的生态工程理念,严格遵守自然经济规律,切实加强工程施工期间的环境管理,减少环境污染和生态破坏,实现人与自然的和谐共处。 展开更多
关键词 水利工程 施工 现场 环境保护
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水利工程水库坝址选择的工程地质勘察分析 被引量:6
20
作者 赵俐 《工程建设与设计》 2019年第22期129-130,共2页
近年来,我国社会经济、科技等方面发展水平的快速提升,水利工程建设水平也在不断提高。坝址的选择作为当前水利工程建设的重要组成部分,能有效提升水库坝址选择的工程地质勘察分析水平,对保证当前水利工程建设整体水平和发展质量表现出... 近年来,我国社会经济、科技等方面发展水平的快速提升,水利工程建设水平也在不断提高。坝址的选择作为当前水利工程建设的重要组成部分,能有效提升水库坝址选择的工程地质勘察分析水平,对保证当前水利工程建设整体水平和发展质量表现出了极为重要的现实意义。论文分析水利工程水库坝址选择的工程地质勘察分析面临的问题,并提出相应的优化策略,以供参考。 展开更多
关键词 水利工程 水库坝址选择 工程地质勘察 分析研究
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