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李杰教授治疗结直肠癌肺转移数据挖掘及网络药理学研究
被引量:
6
1
作者
许博文
吴静远
+3 位作者
李杰
张潇潇
曹璐畅
王贺平
《辽宁中医药大学学报》
CAS
2021年第6期65-72,共8页
目的通过数据挖掘探究李杰教授治疗结直肠癌肺转移组方规律和有效方剂,并以网络药理学分析分子生物学机制。方法收集2009年1月—2019年12月李杰教授治疗结直肠癌肺转移有效处方,结合中医病机特征,筛选挖掘新方,进行网络药理学分析。采...
目的通过数据挖掘探究李杰教授治疗结直肠癌肺转移组方规律和有效方剂,并以网络药理学分析分子生物学机制。方法收集2009年1月—2019年12月李杰教授治疗结直肠癌肺转移有效处方,结合中医病机特征,筛选挖掘新方,进行网络药理学分析。采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选新方化合物,经DrugBank收集药物靶标,从GeneCards、OMIM、DrugBank、CTD数据库获取疾病靶标,经抽取网络获取候选基因。借助Cytoscape 3.8.0构建"中药-化合物-靶点-疾病"网络,在STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并筛选核心网络模块。利用Metascape对候选基因行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书通路(KEGG)分析,并构建"通路-基因"网络,以筛选关键靶基因。结果挖掘新方7首,对典型的1首新方行网络药理学分析,共得到活性成分43个,候选基因35个,GO功能589个和KEGG通路55条。结论通过数据挖掘,李杰教授治疗结直肠癌肺转移的用药以益气健脾、清肺抗癌为主,挖掘新方为生薏苡仁、芦根、桃仁、杏仁、川贝母和百合,有效成分为Glabridin、Licochalcone B、Glycyrol、Stigmasterol,关键基因为PTGS2、PGR、GSK3β、RXRA等,富集分析显示新方主要涉及癌症途径、细胞凋亡、细胞周期、VEGF、NF-κB和PI3K-Akt通路,还直接参与大肠癌、小细胞肺癌途径。本研究为总结名医临床经验及挖掘分子生物学机制提供一定思路,也为中医经验转化现代医学成果提供借鉴。
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关键词
结直肠癌肺转移
数据挖掘
网络药理学
组方用药规律
分子生物学机制
转化研究
李杰
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职称材料
题名
李杰教授治疗结直肠癌肺转移数据挖掘及网络药理学研究
被引量:
6
1
作者
许博文
吴静远
李杰
张潇潇
曹璐畅
王贺平
机构
中国中医科学院广安门医院
北京中医药大学
出处
《辽宁中医药大学学报》
CAS
2021年第6期65-72,共8页
基金
国家自然科学基金(81273946,81473463,81774289)
北京市科技计划重大基金(D161100005116004)
+1 种基金
北京市科技新星交叉项目(Z171100001117128)
中国中医科学院院级自主选题项目(ZZ11-028)。
文摘
目的通过数据挖掘探究李杰教授治疗结直肠癌肺转移组方规律和有效方剂,并以网络药理学分析分子生物学机制。方法收集2009年1月—2019年12月李杰教授治疗结直肠癌肺转移有效处方,结合中医病机特征,筛选挖掘新方,进行网络药理学分析。采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选新方化合物,经DrugBank收集药物靶标,从GeneCards、OMIM、DrugBank、CTD数据库获取疾病靶标,经抽取网络获取候选基因。借助Cytoscape 3.8.0构建"中药-化合物-靶点-疾病"网络,在STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并筛选核心网络模块。利用Metascape对候选基因行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书通路(KEGG)分析,并构建"通路-基因"网络,以筛选关键靶基因。结果挖掘新方7首,对典型的1首新方行网络药理学分析,共得到活性成分43个,候选基因35个,GO功能589个和KEGG通路55条。结论通过数据挖掘,李杰教授治疗结直肠癌肺转移的用药以益气健脾、清肺抗癌为主,挖掘新方为生薏苡仁、芦根、桃仁、杏仁、川贝母和百合,有效成分为Glabridin、Licochalcone B、Glycyrol、Stigmasterol,关键基因为PTGS2、PGR、GSK3β、RXRA等,富集分析显示新方主要涉及癌症途径、细胞凋亡、细胞周期、VEGF、NF-κB和PI3K-Akt通路,还直接参与大肠癌、小细胞肺癌途径。本研究为总结名医临床经验及挖掘分子生物学机制提供一定思路,也为中医经验转化现代医学成果提供借鉴。
关键词
结直肠癌肺转移
数据挖掘
网络药理学
组方用药规律
分子生物学机制
转化研究
李杰
Keywords
colorectal cancer
lung
metastasis
data
mining
network
pharmacology
prescription
regularity
molecular
biological
mechanisms
translational
research
LI
Jie
分类号
R735.35 [医药卫生—肿瘤]
R735.37 [医药卫生—临床医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
李杰教授治疗结直肠癌肺转移数据挖掘及网络药理学研究
许博文
吴静远
李杰
张潇潇
曹璐畅
王贺平
《辽宁中医药大学学报》
CAS
2021
6
下载PDF
职称材料
已选择
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引用分析
参考文献
引证文献
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