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基于转录组测序探讨湿热蕴结证结直肠腺瘤癌变的生物学基础及参白解毒方作用机制
1
作者
陶玉泉
程海波
+5 位作者
范旻旻
余成涛
李柳
张烨
倪明欣
沈梦
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第19期48-54,共7页
目的:探讨结直肠腺瘤湿热蕴结证的生物学基础及临床有效方药参白解毒方可能的抗肿瘤作用机制。方法:临床获取2019年2月至2020年12月江苏省中医院招募的符合纳入标准的结直肠腺瘤湿热蕴结证患者8例、非湿热蕴结证者11例和结直肠癌患者10...
目的:探讨结直肠腺瘤湿热蕴结证的生物学基础及临床有效方药参白解毒方可能的抗肿瘤作用机制。方法:临床获取2019年2月至2020年12月江苏省中医院招募的符合纳入标准的结直肠腺瘤湿热蕴结证患者8例、非湿热蕴结证者11例和结直肠癌患者10例,对3组患者组织进行转录组测序,筛选证候间及疾病间差异表达基因,并对证候和疾病间差异基因取交集,进一步筛选在非湿热蕴结证、湿热蕴结证和结直肠癌患者中依次递增或依次递减的差异基因,进行功能富集分析和信号通路富集分析。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)检测参白解毒方对上述关键差异基因表达的影响。结果:湿热蕴结证和非湿热蕴结证对比,筛选出差异表达基因共384个,其中表达上调基因203个,表达下调基因181个;结直肠癌与湿热蕴结证结直肠腺瘤比较,筛选出差异表达基因共2965个,其中表达上调基因2460个,表达下调基因505个;将2组差异基因取交集,并筛选同向变化的差异基因共58个;基因本体功能主要富集在UDP-半乳糖:β-N-乙酰葡萄糖胺β-1,3-半乳糖基转移酶活性、N-乙酰乳糖胺β-1,3-N-乙酰葡糖胺转移酶活性和聚N-乙酰乳糖胺生物合成过程;京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路主要富集在鞘糖脂生物合成-珠蛋白和等珠蛋白系列、鞘糖脂生物合成-乳酸和新乳酸系列和白细胞介素(IL)-17信号通路。参白解毒方可明显抑制FOSB和B3GALT5等参与富集的关键基因的表达(P<0.05),且具有浓度依赖性。结论:糖脂代谢可能是结直肠腺瘤湿热蕴结证的生物学基础,参白解毒方可能通过下调FOSB和B3GALT5的表达抑制结直肠癌的发生。
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关键词
参白解毒方
结直肠腺瘤癌变
湿热蕴结证
转录组测序
证侯生物学基础
原文传递
基于LC-MS结合网络药理学探讨参白解毒方抗结直肠腺瘤癌变成分及作用机制
2
作者
刘丽
闫秋莹
+6 位作者
范晓萱
范旻旻
李柳
陶李蕙苹
常澍晨
程海波
孙东东
《南京中医药大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期771-784,共14页
目的解析治疗结直肠腺瘤(CRA)的临床验方参白解毒方(SBJDD)化学成分并探究其防治CRA癌变的潜在机制。方法建立超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS)检测方法,分析SBJDD水煎液及口服该方大鼠的血浆样品中化学成分;基于网络...
目的解析治疗结直肠腺瘤(CRA)的临床验方参白解毒方(SBJDD)化学成分并探究其防治CRA癌变的潜在机制。方法建立超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS)检测方法,分析SBJDD水煎液及口服该方大鼠的血浆样品中化学成分;基于网络药理学方法筛选SBJDD在CRA癌变不同阶段的潜在活性成分,探究其抗CRA癌变作用机制;开展体外实验验证SBJDD抗CRC作用机制。结果在SBJDD水煎液和大鼠口服该方后的血浆样品中分别鉴定出152和41种化学成分。网络药理学结果表明,在结直肠上皮炎症(CREI)阶段,SBJDD中潜在活性成分Epiberberine和Kushenol H等可能通过作用于PIK3CA、MAPK3和PIK3CB等靶点,影响PI3K-AKT和Ras等信号通路,调控与蛋白质磷酸化和信号转导等相关的生物过程;在CRA阶段,该方中活性成分3,7-Dihydroxycoumarin、Palmatine和Kushenol A等可能通过靶向AKT和EGFR等靶点,影响HIF-1、Rap1等信号通路,调控细胞凋亡和细胞增殖等生物过程;在CRA癌变阶段,3,7-Dihydroxycoumarin等潜在活性成分可能通过作用于TP53等靶点,影响PI3K-AKT和甲状腺激素等信号通路,调控RNA聚合酶Ⅱ启动子转录和细胞凋亡等生物过程;在CRC阶段,p-Coumaric acid等潜在活性成分通过作用于PRKCB等靶点,影响EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性和PI3K-AKT等信号通路,调控细胞凋亡和信号转导等生物过程。体外研究表明,SBJDD显著抑制HT29细胞增殖,并抑制EG-FR和PKC蛋白的表达。结论SBJDD中化学成分主要由生物碱、有机酸和黄酮类成分组成,方中成分在CRA癌变的不同阶段中与不同的靶点结合,调节相关的信号通路,产生治疗效果。
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关键词
参白解毒方
结直肠腺瘤癌变
UPLC-Q-TOF-MS
网络药理学
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职称材料
题名
基于转录组测序探讨湿热蕴结证结直肠腺瘤癌变的生物学基础及参白解毒方作用机制
1
作者
陶玉泉
程海波
范旻旻
余成涛
李柳
张烨
倪明欣
沈梦
机构
南京中医药大学第一临床医学院
南京中医药大学附属医院
出处
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第19期48-54,共7页
基金
国家重点研发计划项目(2017YFC1700602)
国家中医药管理局中医药创新团队及人才支持计划项目(ZYYCXTD-C-202208)
+4 种基金
国家中医药管理局高水平中医药重点学科建设项目(国中医药人教函[2023]85号)
江苏高校优势学科建设工程项目(PAPD)
江苏高校“青蓝工程”项目(苏教师函[2023]27号)
江苏省高等学校基础学科(自然科学)研究面上项目(22KJB310003)
江苏省中医药科技发展计划项目(MS2022001)。
文摘
目的:探讨结直肠腺瘤湿热蕴结证的生物学基础及临床有效方药参白解毒方可能的抗肿瘤作用机制。方法:临床获取2019年2月至2020年12月江苏省中医院招募的符合纳入标准的结直肠腺瘤湿热蕴结证患者8例、非湿热蕴结证者11例和结直肠癌患者10例,对3组患者组织进行转录组测序,筛选证候间及疾病间差异表达基因,并对证候和疾病间差异基因取交集,进一步筛选在非湿热蕴结证、湿热蕴结证和结直肠癌患者中依次递增或依次递减的差异基因,进行功能富集分析和信号通路富集分析。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)检测参白解毒方对上述关键差异基因表达的影响。结果:湿热蕴结证和非湿热蕴结证对比,筛选出差异表达基因共384个,其中表达上调基因203个,表达下调基因181个;结直肠癌与湿热蕴结证结直肠腺瘤比较,筛选出差异表达基因共2965个,其中表达上调基因2460个,表达下调基因505个;将2组差异基因取交集,并筛选同向变化的差异基因共58个;基因本体功能主要富集在UDP-半乳糖:β-N-乙酰葡萄糖胺β-1,3-半乳糖基转移酶活性、N-乙酰乳糖胺β-1,3-N-乙酰葡糖胺转移酶活性和聚N-乙酰乳糖胺生物合成过程;京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路主要富集在鞘糖脂生物合成-珠蛋白和等珠蛋白系列、鞘糖脂生物合成-乳酸和新乳酸系列和白细胞介素(IL)-17信号通路。参白解毒方可明显抑制FOSB和B3GALT5等参与富集的关键基因的表达(P<0.05),且具有浓度依赖性。结论:糖脂代谢可能是结直肠腺瘤湿热蕴结证的生物学基础,参白解毒方可能通过下调FOSB和B3GALT5的表达抑制结直肠癌的发生。
关键词
参白解毒方
结直肠腺瘤癌变
湿热蕴结证
转录组测序
证侯生物学基础
Keywords
Shenbai
Jiedu
prescription
colorectal
adenoma
carcinogenesis
damp-heat
accumulation
syndrome
transcriptome
sequencing
biological
foundation
of
syndrome
分类号
R2-0 [医药卫生—中医学]
R22
R242
R285.5
R574
原文传递
题名
基于LC-MS结合网络药理学探讨参白解毒方抗结直肠腺瘤癌变成分及作用机制
2
作者
刘丽
闫秋莹
范晓萱
范旻旻
李柳
陶李蕙苹
常澍晨
程海波
孙东东
机构
江苏省中医药防治肿瘤协同创新中心
南京中医药大学第一临床医学院
南京中医药大学附属医院
出处
《南京中医药大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期771-784,共14页
基金
国家自然科学基金面上项目(82074318,82374287)
国家自然科学基金重点项目(81930117)
+2 种基金
江苏省科技计划项目(BK20230452)
江苏省中医药科技发展计划项目(ZD202201)
江苏省研究生科研创新计划(KYCX23_2203)。
文摘
目的解析治疗结直肠腺瘤(CRA)的临床验方参白解毒方(SBJDD)化学成分并探究其防治CRA癌变的潜在机制。方法建立超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS)检测方法,分析SBJDD水煎液及口服该方大鼠的血浆样品中化学成分;基于网络药理学方法筛选SBJDD在CRA癌变不同阶段的潜在活性成分,探究其抗CRA癌变作用机制;开展体外实验验证SBJDD抗CRC作用机制。结果在SBJDD水煎液和大鼠口服该方后的血浆样品中分别鉴定出152和41种化学成分。网络药理学结果表明,在结直肠上皮炎症(CREI)阶段,SBJDD中潜在活性成分Epiberberine和Kushenol H等可能通过作用于PIK3CA、MAPK3和PIK3CB等靶点,影响PI3K-AKT和Ras等信号通路,调控与蛋白质磷酸化和信号转导等相关的生物过程;在CRA阶段,该方中活性成分3,7-Dihydroxycoumarin、Palmatine和Kushenol A等可能通过靶向AKT和EGFR等靶点,影响HIF-1、Rap1等信号通路,调控细胞凋亡和细胞增殖等生物过程;在CRA癌变阶段,3,7-Dihydroxycoumarin等潜在活性成分可能通过作用于TP53等靶点,影响PI3K-AKT和甲状腺激素等信号通路,调控RNA聚合酶Ⅱ启动子转录和细胞凋亡等生物过程;在CRC阶段,p-Coumaric acid等潜在活性成分通过作用于PRKCB等靶点,影响EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性和PI3K-AKT等信号通路,调控细胞凋亡和信号转导等生物过程。体外研究表明,SBJDD显著抑制HT29细胞增殖,并抑制EG-FR和PKC蛋白的表达。结论SBJDD中化学成分主要由生物碱、有机酸和黄酮类成分组成,方中成分在CRA癌变的不同阶段中与不同的靶点结合,调节相关的信号通路,产生治疗效果。
关键词
参白解毒方
结直肠腺瘤癌变
UPLC-Q-TOF-MS
网络药理学
Keywords
Shenbai
Jiedu
Decoction
colorectal
adenoma
carcinogenesis
UPLC-Q-TOF-MS
network
pharmacology
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组测序探讨湿热蕴结证结直肠腺瘤癌变的生物学基础及参白解毒方作用机制
陶玉泉
程海波
范旻旻
余成涛
李柳
张烨
倪明欣
沈梦
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
原文传递
2
基于LC-MS结合网络药理学探讨参白解毒方抗结直肠腺瘤癌变成分及作用机制
刘丽
闫秋莹
范晓萱
范旻旻
李柳
陶李蕙苹
常澍晨
程海波
孙东东
《南京中医药大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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