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一种基于清晰域的自动聚焦算法 被引量：4
1
作者 何帆 王少志 +3 位作者 徐晓文 张琴 陈阔 赵志强 《光电子．激光》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第1期25-34,共10页
为了解决自动聚焦系统搜索效率较低问题,本文 提出了一种基于清晰域的自动聚焦算 法。该算法创新性的提出了清晰域的概念,自动聚焦系统中寻找最清晰图片的问题转化为寻 找清晰区域的问题。同时为了解决实际聚焦过程中所遇到的次峰干扰问... 为了解决自动聚焦系统搜索效率较低问题,本文 提出了一种基于清晰域的自动聚焦算 法。该算法创新性的提出了清晰域的概念,自动聚焦系统中寻找最清晰图片的问题转化为寻 找清晰区域的问题。同时为了解决实际聚焦过程中所遇到的次峰干扰问题,提出了高通滤波 的方法,对抗次峰干扰。本文设计了两组实验,通过对比应用本文算法前后的搜索效率表现 判断所提出算法的可行性,实验一验证高通滤波对于抵消次峰干扰的可行性,实验二验证清 晰域的自动聚焦算法对提升搜索效率的可行性。实验一的结果证明了高通滤波对非失真情况 下的次峰干扰有一定抑制的效果,实验二的结果表明在对经过高通滤波后的图像应用清晰域 ,能够提升8%-18%的搜索效率。 展开更多
关键词 自动聚焦系统 高通滤波 清晰域
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脂代谢相关基因ABHD5抑制肾癌细胞体外迁移及侵袭
2
作者 李泽宇 柳豪 +4 位作者 黄垣堤 沈开铖 王伟 游金杉 支轶 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期701-706,共6页
目的:探讨透明细胞肾细胞癌(clear cell renal cell cancinoma,ccRcc)细胞体外迁移及侵袭过程中与α/β自水解酶结构域5(α/β-hydrolase domain-containing 5,ABHD5)的关系。方法:采用TCGA数据库分析人ccRcc组织及正常肾组织中ABHD5的... 目的:探讨透明细胞肾细胞癌(clear cell renal cell cancinoma,ccRcc)细胞体外迁移及侵袭过程中与α/β自水解酶结构域5(α/β-hydrolase domain-containing 5,ABHD5)的关系。方法:采用TCGA数据库分析人ccRcc组织及正常肾组织中ABHD5的表达情况。采用ABHD5过表达慢病毒转染人肾透明细胞癌细胞株786-O及Caki-1后,运用real-time PCR及Western blot技术检测ABHD5表达改变情况。采用Transwell实验、划痕实验检测此基因对细胞体外迁移及侵袭能力的影响。结果:TCGA数据库显示ccRcc组织中ABHD5表达较正常肾脏组织显著下降(P=0.000),且其下降程度在复发转移肿瘤中进一步增加(P=0.007),与患者生存呈显著负相关(P<0.001)。Transwell实验、划痕实验显示过表达ABHD5显著抑制肾癌细胞体外迁移及侵袭能力(P<0.05)。过表达ABHD5通过影响Sting信号进而影响肾癌细胞体外迁移及侵袭。结论:脂代谢相关基因ABHD5抑制ccRcc癌细胞体外迁移及侵袭能力。 展开更多
关键词 透明细胞肾细胞癌 脂代谢 α/β-水解酶结构域5 迁移 侵袭
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基于数据挖掘分析ZC3H13在透明细胞肾细胞癌中的表达及预后意义 被引量：2
3
作者 孙琰 方久远 李惠翔 《河南医学研究》 CAS 2021年第4期577-582,共6页
目的分析ZC3H13在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的表达及预后意义。方法利用Ualcan和GEPIA数据库分析并验证ZC3H13 mRNA在ccRCC中的表达及其与临床病理指标和生存期的关系,对ZC3H13基因进行共表达分析及相关性分析。利用人类蛋白质图谱(HPA... 目的分析ZC3H13在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的表达及预后意义。方法利用Ualcan和GEPIA数据库分析并验证ZC3H13 mRNA在ccRCC中的表达及其与临床病理指标和生存期的关系,对ZC3H13基因进行共表达分析及相关性分析。利用人类蛋白质图谱(HPA)数据库中的细胞系及免疫组化结果分析ZC3H13蛋白在ccRCC中的定位及表达情况。利用STRING在线分析以ZC3H13为中心相关蛋白之间的相互作用。结果Ualcan数据库结果显示,在ccRCC、乳头状肾细胞癌(PRCC)、嫌色细胞肾细胞癌(CRCC)中,ZC3H13 mRNA表达水平均下调(P<0.05)。GEPIA数据库结果显示,相比于正常肾组织,ZC3H13 mRNA在ccRCC、PRCC、CRCC这3种亚型肾细胞癌中表达水平均下调(P<0.05)。Ualcan数据库结果显示:Ⅰ期ccRCC患者ZC3H13 mRNA表达水平高于Ⅲ期者(P<0.05);与ccA型比较,ccB型ccRCC患者的ZC3H13 mRNA表达水平较低(P<0.05);ccRCC患者的组织学分级与ZC3H13 mRNA的表达水平有关,相比于低组织学分级患者,具有高组织学分级的患者ZC3H13 mRNA的表达水平更低(P<0.05)。在GEPIA数据库中,随着ccRCC肿瘤分期的升高,ZC3H13 mRNA的表达量逐渐下降(P<0.05)。Ualcan数据库挖掘性分析发现,在ccRCC中,与ZC3H13 mRNA高表达组比较,ZC3H13 mRNA低表达组生存期较短(P<0.05)。GEPIA验证性分析发现,在ccRCC中,与ZC3H13 mRNA高表达组比较,ZC3H13 mRNA低表达组的总生存期和无瘤生存期下降(P<0.05)。HPA数据库结果显示,在A-431肿瘤细胞系中,ZC3H13主要定位于核膜和肌动蛋白丝。利用免疫组化抗体分析显示,ZC3H13蛋白主要表现为细胞核着色,部分胞质轻微着色。ZC3H13与VHL、PBRM1、mTOR、HIF-1α等ccRCC多种关键基因呈正相关(P<0.05)。STRING在线分析显示,ZC3H13与WTAP、POLR2B、KIAA1429等基因共同参与RNA修饰与代谢、RNA甲基化等生物学过程。结论ZC3H13在ccRCC中低表达,与肿瘤恶性生物学行为和不良预后相关。ZC3H13与VHL、PBRM1、mTOR、HIF-1α等c 展开更多
关键词 透明细胞肾细胞癌 ZC3H13 数据库
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基于生物信息学数据分析ELTD1在肾透明细胞癌组织中的表达、甲基化水平及其临床意义 被引量：1
4
作者 黄逸婷 王珂 方晨 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1115-1124,共10页
目的:探讨表皮生长因子蛛毒素受体7穿膜结构域蛋白1(ELTD1)在肾透明细胞癌(ccRCC)组织中的表达、甲基化水平及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法:通过公共数据库分析ccRCC组织中ELTD1表达和甲基化的差异水平,探讨ELTD1表达水平... 目的:探讨表皮生长因子蛛毒素受体7穿膜结构域蛋白1(ELTD1)在肾透明细胞癌(ccRCC)组织中的表达、甲基化水平及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法:通过公共数据库分析ccRCC组织中ELTD1表达和甲基化的差异水平,探讨ELTD1表达水平与患者临床病理特征和预后的相关性。通过TIMER2.0数据库评估ccRCC免疫细胞浸润,筛选ELTD1相关免疫检查点基因,进行GO功能和KEGG通路富集分析,通过基因共表达分析、筛选与ELTD1相关的基因。结果:与癌旁组织比较,ELTD1在ccRCC组织中呈高表达(P<0.05)。TCGA-KIRC队列中,ELTD1的甲基化水平与其表达呈负相关(R=-0.37,P<0.01)。ELTD1转录表达在ccRCC患者年龄、T分期、M分期、临床分期及病理分级组间存在显著差异(均P<0.01),且高表达ELTD1与较长的OS和PFS密切相关(HR=0.55、0.63,均P<0.01),ELTD1高表达是ccRCC的独立保护因素。ELTD1表达与B细胞、CD4^(+)T细胞、CD8^(+)T细胞、巨噬细胞和嗜中性粒细胞的免疫浸润呈显著负相关(R=-0.16、-0.27、-0.25、-0.31、-0.27,均P<0.01)。GO功能和KEGG通路富集分析结果显示,血管生成及肿瘤相关信号通路在ELTD1高表达表型中显著富集(均P<0.01)。ELTD1共表达基因的生存分析提示,其肿瘤抑制作用与共表达网络有关。结论:ELTD1在ccRCC组织中高表达和低甲基化是患者预后良好的指标,且与免疫浸润相关。 展开更多
关键词 肾透明细胞癌 表皮生长因子蛛毒素受体7穿膜结构域蛋白1 甲基化 免疫浸润 预后标志物
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EPAS-1基因甲基化水平及蛋白表达与肾透明细胞癌临床特征的相关性
5
作者 陈海滨 赵建军 +1 位作者 程小龙 谭超 《疑难病杂志》 CAS 2021年第11期1085-1089,共5页
目的分析内皮PAS区域蛋白1(EPAS-1)基因甲基化及蛋白表达水平与肾透明细胞癌临床特征及预后的关系。方法选取2014年2月—2015年8月河北工程大学附属医院泌尿外二科诊治肾透明细胞癌患者86例的癌组织作为肾透明细胞癌组,癌旁正常组织作... 目的分析内皮PAS区域蛋白1(EPAS-1)基因甲基化及蛋白表达水平与肾透明细胞癌临床特征及预后的关系。方法选取2014年2月—2015年8月河北工程大学附属医院泌尿外二科诊治肾透明细胞癌患者86例的癌组织作为肾透明细胞癌组,癌旁正常组织作为癌旁对照组。亚硫酸氢钠处理基因组DNA后采用直接测序法检测组织EPAS-1基因甲基化水平,采用免疫组织化学法检测组织EPAS-1蛋白表达水平;分析肾透明细胞癌患者癌组织EPAS-1甲基化水平及蛋白表达与临床病理特征的关系;多因素Cox回归分析影响肾透明细胞癌预后的因素。结果肾透明细胞癌组EPAS-1基因甲基化率为62.79%(54/86),高于癌旁对照组的16.28%(14/86),差异有统计学意义(χ^(2)/P=38.914/0.000);肾透明细胞癌组EPAS-1蛋白表达阳性率23.26%(20/86),低于癌旁对照组的65.12%(56/86),差异有统计学意义(χ^(2)/P=30.553/0.000)。肿瘤≥4.0 cm、转移(Fuhrman)分级高级别肾透明细胞癌患者癌组织EPAS-1甲基化率高于肿瘤<4.0 cm、Fuhrman分级低级别患者(χ^(2)/P=10.261/0.001,9.097/0.003);蛋白表达阳性率低于肿瘤<4.0 cm、Fuhrman分级低级别患者(χ^(2)/P=10.402/0.001,4.160/0.041)。EPAS-1基因甲基化肾透明细胞癌患者5年生存率低于EPAS-1基因非甲基化患者(51.85%vs.78.13%,χ^(2)=5.865,P=0.015);EPAS-1蛋白阳性表达肾透明细胞癌患者5年生存率高于EPAS-1蛋白阴性表达(85.00%vs.54.55%,χ^(2)=6.020,P=0.014)。EPAS-1基因甲基化是影响肾透明细胞癌患者死亡的独立危险因素[OR(95%CI)=2.093(1.574~2.784)],EPAS-1蛋白阳性表达是其保护因素[OR(95%CI)=0.677(0.469~0.978)]。结论EPAS-1基因启动子高甲基化及蛋白低表达可能与肾透明细胞癌的发生、发展及预后有关。 展开更多
关键词 肾透明细胞癌 内皮PAS区域蛋白1 甲基化 预后
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