文摘目的:研究胃癌组织环状RNA(circular RNAs,circRNAs)表达的变化,以及circRNAs-miRNAs-mRNAs的竞争性内源RNA网络调控的机制。方法:从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中选出GSE78092、GPL19978(GSE83521和GSE89143)、GSE100170和STAD(未上传)共5个数据集,分析其差异表达circRNAs,并利用Starbase、TargetScan等数据库进行生物信息学分析。结果:从胃癌组织与癌旁组织共获得734个差异表达的circ-RNAs,根据P<0.05、差异表达倍数>1.5倍筛选得到17个circRNAs。用Starbase数据库分析circRNAs和miRNAs的互作关系,共发现354个靶miRNAs,并利用GEO数据库(GSE23739)验证筛选得到46个miRNAs,利用TargetScan数据库分析其靶向的mRNAs。京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析和基因本体论(gene ontology,GO)分析表明靶基因主要在转录调控、RNA代谢过程、细胞内信号级联和蛋白质定位等方面促进或者抑制胃癌的发生发展。结论:差异分析表达的17个circRNAs形成circRNAs-miRNAs-mRNAs的竞争性内源RNA网络,可通过调控转录和RNA代谢等过程调节胃癌的发生发展。
