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正常人血液白细胞染色质制备及组份分析
1
作者
温博贵
钟叔平
《江西医学院学报》
1989年第1期17-20,97,共5页
本文报道了由人白细胞制备核及染色质的方法。分析了染色质中的 DNA、RNA、组蛋白(HP)及非组蛋白(NHP)相对含量。由本法制备的染色质 NHP/DNA、HP/DNA及 RNA/DNA 之比为2.1;2.4及0.13.紫外吸收光谱表明:A_(max)为260nm,A(260)/A_(280)=...
本文报道了由人白细胞制备核及染色质的方法。分析了染色质中的 DNA、RNA、组蛋白(HP)及非组蛋白(NHP)相对含量。由本法制备的染色质 NHP/DNA、HP/DNA及 RNA/DNA 之比为2.1;2.4及0.13.紫外吸收光谱表明:A_(max)为260nm,A(260)/A_(280)=1.5。经SDS-PAGE 分析显示出20条蛋白带。
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关键词
血液白细胞染色质
制备方法
组份分析
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职称材料
三维基因组染色质构象捕获及其衍生技术
被引量:
6
2
作者
田昊
杨梓健
+1 位作者
徐兴文
刘良玉
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第10期2040-2050,共11页
线性染色质经过多重折叠凝缩到真核生物的细胞核中,染色质的三维构象直接决定了真核生物的基因表达,因此染色质可以在局部或远程空间上发生互作调控基因转录。折叠成环状构象的染色质可以借助染色质构象捕获(Chromosome conformation ca...
线性染色质经过多重折叠凝缩到真核生物的细胞核中,染色质的三维构象直接决定了真核生物的基因表达,因此染色质可以在局部或远程空间上发生互作调控基因转录。折叠成环状构象的染色质可以借助染色质构象捕获(Chromosome conformation capture,3C)技术来研究,基于3C技术扩展的4C/5C/Hi-C从单个位点延伸到全基因组捕捉三维构象,在此基础上,染色质构象核心技术可以与免疫共沉淀、核酸分子杂交、单细胞、基因组测序等技术偶联而产生新的衍生技术和应用,这极大地推动了染色质构象技术在基因时空特异性表达调控上的研究。文中将以3C和Hi-C等三维基因组核心技术为基础,重点介绍染色质构象捕获及其衍生技术的原理和前沿应用。
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关键词
染色质构象捕获
三维基因组
高通量染色质构象捕获技术
染色质免疫共沉淀
配对末端标记测序技术分析染色质相互作用
原文传递
染色体多态性与男性生殖异常关系探讨
被引量:
6
3
作者
章鸯
宫剑
+1 位作者
邢超
陈雪娇
《中国妇幼保健》
CAS
2017年第5期1016-1018,共3页
目的研究染色体多态性与男性生殖异常的关系。方法对2009年1月-2016年1月在该院门诊就诊的2 482例男性遗传咨询者行外周血染色体核型分析和精子染色质结构分析。结果在2 482例男性遗传咨询者中检出染色体多态性核型54例,占2.18%。根据...
目的研究染色体多态性与男性生殖异常的关系。方法对2009年1月-2016年1月在该院门诊就诊的2 482例男性遗传咨询者行外周血染色体核型分析和精子染色质结构分析。结果在2 482例男性遗传咨询者中检出染色体多态性核型54例,占2.18%。根据多态性变异分4种类型:1D/G组随体增加6例,占多态性的11.11%;2次缢痕增加(包括1、9、16号染色体)8例,占多态性的14.81%;3 9号染色体臂间倒位9例,占多态性的16.67%;4Y染色体多态性31例,占多态性的57.41%。1 424例不育男性遗传咨询者中检出染色体多态性核型48例,占3.37%;在456例无精症男性遗传咨询者中检出染色体多态性核型8例,占1.62%;在1 526例男性少精弱精遗传咨询者中检出染色体多态性核型32例,占2.10%。Y染色体多态性组男性DNA碎片率和精子畸形率明显高于正常对照组,其双链DNA率、精子密度和精子活率明显低于正常对照组,差异具有统计学意义(P<0.05),常染色体多态性组与正常对照组无差异。结论染色体多态性可以导致男性生殖异常,对有不育病史的男性应进行外周血染色体检查和染色质结构分析。
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关键词
染色体多态性
男性生殖异常
外周血染色体核型分析
精子染色质结构分析
原文传递
转录因子Sp1在人内皮细胞高表达脂多糖相关因子1基因转录中的作用
被引量:
4
4
作者
梁自文
吴惠玲
+4 位作者
罗敏
杨宗城
陈建
陈渝
罗勤
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第21期2249-2251,共3页
目的明确转录因子Sp1在人内皮细胞高表达脂多糖相关因子1(endothelial-overexpressed lipopolysiccha-ride-associated factor 1,EOLA1)基因转录调控中的作用。方法定点突变EOLA1基因核心启动子-734~-666序列中推断的Sp1结合位点,观察...
目的明确转录因子Sp1在人内皮细胞高表达脂多糖相关因子1(endothelial-overexpressed lipopolysiccha-ride-associated factor 1,EOLA1)基因转录调控中的作用。方法定点突变EOLA1基因核心启动子-734~-666序列中推断的Sp1结合位点,观察启动子活性变化;进行凝胶电泳迁移和染色质免疫共沉淀验证Sp1转录因子与启动子区顺式作用元件发生相互作用。结果突变Sp1结合位点后,核心启动子的活性(0.12±0.01)较野生启动子(2.51±0.98)显著下降(P<0.05),EMSA和染色质免疫共沉淀验证了SP1与启动子区顺式作用元件相互作用。结论转录因子Sp1调控了EOLA1基因的基础转录。
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关键词
EOLA1
SP1
启动子
凝胶电泳迁移
染色质共沉淀
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职称材料
植物三维染色质构型研究进展
被引量:
2
5
作者
董芊里
王金宾
+1 位作者
李晓宠
宫磊
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期73-86,共14页
染色质在细胞核内的缠绕、折叠及其在细胞核内的空间排布是真核生物染色质构型的主要特征。在经典DNA探针荧光原位杂交显微观察的基础上,基于新一代测序技术的Hi-C及ChIA-PET染色质构型捕获技术已经被广泛应用于动物及植物细胞核染色质...
染色质在细胞核内的缠绕、折叠及其在细胞核内的空间排布是真核生物染色质构型的主要特征。在经典DNA探针荧光原位杂交显微观察的基础上,基于新一代测序技术的Hi-C及ChIA-PET染色质构型捕获技术已经被广泛应用于动物及植物细胞核染色质构型的研究中,并以新的角度定义了包括:染色体(质)域(chromosome territory)、A/B染色质区室(compartment A/B)、拓扑偶联结构域(topological associated domains,TADs)、染色质环(chromatin loops)等在内的多个更为精细的染色质构型。利用以上两种主流技术,越来越多的植物物种染色质构型特征被鉴定、分析和比较。本文系统分析和总结了近年来以植物细胞为模型的细胞核染色构型领域取得的重要成果,包括各级染色质构型特征的组成、建立机制和主要影响因素等。在此基础上,分析了目前研究植物染色质构型技术的瓶颈和突破性的技术进展,并对后续研究主要关注的问题和研究内容进行了展望,以期为相关领域的研究提供更多的理论参考和依据。
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关键词
染色质构型
高通量染色质构象捕获测序
末端配对标签测序
染色质区室
拓扑偶联结构域
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职称材料
精子DNA完整性对男性生育力的补充预测价值
6
作者
陈宇捷
宋兵
+1 位作者
贺小进
曹云霞
《中华临床医师杂志(电子版)》
CAS
2019年第7期489-492,共4页
目的探究精子DNA完整性检测相对传统的精液常规在男性生育力评价中的辅助预估价值.方法采集收集2017年4月至10月共1076例不育男性精液标本,男性患者来源于安徽医科大学第一附属医院妇产科,每份标本分成2份,分别行精液常规及精子DNA完整...
目的探究精子DNA完整性检测相对传统的精液常规在男性生育力评价中的辅助预估价值.方法采集收集2017年4月至10月共1076例不育男性精液标本,男性患者来源于安徽医科大学第一附属医院妇产科,每份标本分成2份,分别行精液常规及精子DNA完整性检测,根据精子DNA碎片指数(DFI)分为精子DNA完整性良好组(DFI≥30%)、完整性一般组(15%<DFI<30%)及完整性差组(DFI≤15%).根据患者年龄分为21~30岁、31~40岁及≥41岁;按照精子浓度分为浓度正常(≥15×10^6/ml)及少精症(<15×10^6/ml),按照精子前向活动率分为正常(≥32%)及弱精子症(<32%),采用χ^2检验分析不同精子DNA完整性组之间的年龄、浓度和前向活动率的差异,采用Pearson相关分析分析患者年龄、精子浓度及前向活动率分别与精子DFI的相关性.结果不同精子DNA完整性组间,精子浓度正常与少精症水平差异具有统计学意义(χ^2=96.82,P<0.001)、活力正常与弱精子症水平差异均具有统计学意义(χ^2=2.06,P<0.001).年龄与DFI成正相关(r=0.154,P<0.001),精子浓度及前向活动率与DFI成负相关(r=-0.231,P<0.001;r=-0.564,P<0.001).结论精子DFI与精子浓度及活动率呈负相关,与年龄呈正相关,精子DNA完整性检测一定程度上可以弥补精液常规参数分析在评价男性生育能力上的不足,具有重要参考价值.
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关键词
精子
DNA
男性
生育力
精液常规
精子染色质结构分析
原文传递
题名
正常人血液白细胞染色质制备及组份分析
1
作者
温博贵
钟叔平
机构
江西医学院生物化学教研室
江西中医学院附属中医院
出处
《江西医学院学报》
1989年第1期17-20,97,共5页
文摘
本文报道了由人白细胞制备核及染色质的方法。分析了染色质中的 DNA、RNA、组蛋白(HP)及非组蛋白(NHP)相对含量。由本法制备的染色质 NHP/DNA、HP/DNA及 RNA/DNA 之比为2.1;2.4及0.13.紫外吸收光谱表明:A_(max)为260nm,A(260)/A_(280)=1.5。经SDS-PAGE 分析显示出20条蛋白带。
关键词
血液白细胞染色质
制备方法
组份分析
Keywords
chromatin
/
analysis
DNA/
analysis
Histones/
analysis
chromosomal proteins
nonhistone/
analysis
RNA/
analysis
histocytochemistry/methods
leukocytes
human
分类号
R977.8 [医药卫生—药品]
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职称材料
题名
三维基因组染色质构象捕获及其衍生技术
被引量:
6
2
作者
田昊
杨梓健
徐兴文
刘良玉
机构
首都师范大学生命科学学院植物基因资源与低碳环境生物技术北京市重点实验室
出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第10期2040-2050,共11页
基金
国家自然科学基金(Nos.31571258,31800244)资助
文摘
线性染色质经过多重折叠凝缩到真核生物的细胞核中,染色质的三维构象直接决定了真核生物的基因表达,因此染色质可以在局部或远程空间上发生互作调控基因转录。折叠成环状构象的染色质可以借助染色质构象捕获(Chromosome conformation capture,3C)技术来研究,基于3C技术扩展的4C/5C/Hi-C从单个位点延伸到全基因组捕捉三维构象,在此基础上,染色质构象核心技术可以与免疫共沉淀、核酸分子杂交、单细胞、基因组测序等技术偶联而产生新的衍生技术和应用,这极大地推动了染色质构象技术在基因时空特异性表达调控上的研究。文中将以3C和Hi-C等三维基因组核心技术为基础,重点介绍染色质构象捕获及其衍生技术的原理和前沿应用。
关键词
染色质构象捕获
三维基因组
高通量染色质构象捕获技术
染色质免疫共沉淀
配对末端标记测序技术分析染色质相互作用
Keywords
chromosome conformation capture
three-dimension genome
high-throughput
chromatin
conformation capture
chromatin
immunoprecipitation
chromatin
interaction
analysis
by paired-end tag sequencing
分类号
Q343.2 [生物学—遗传学]
原文传递
题名
染色体多态性与男性生殖异常关系探讨
被引量:
6
3
作者
章鸯
宫剑
邢超
陈雪娇
机构
台州医院中心实验室
温州医科大学附属第二医院育英儿童医院检验科
出处
《中国妇幼保健》
CAS
2017年第5期1016-1018,共3页
文摘
目的研究染色体多态性与男性生殖异常的关系。方法对2009年1月-2016年1月在该院门诊就诊的2 482例男性遗传咨询者行外周血染色体核型分析和精子染色质结构分析。结果在2 482例男性遗传咨询者中检出染色体多态性核型54例,占2.18%。根据多态性变异分4种类型:1D/G组随体增加6例,占多态性的11.11%;2次缢痕增加(包括1、9、16号染色体)8例,占多态性的14.81%;3 9号染色体臂间倒位9例,占多态性的16.67%;4Y染色体多态性31例,占多态性的57.41%。1 424例不育男性遗传咨询者中检出染色体多态性核型48例,占3.37%;在456例无精症男性遗传咨询者中检出染色体多态性核型8例,占1.62%;在1 526例男性少精弱精遗传咨询者中检出染色体多态性核型32例,占2.10%。Y染色体多态性组男性DNA碎片率和精子畸形率明显高于正常对照组,其双链DNA率、精子密度和精子活率明显低于正常对照组,差异具有统计学意义(P<0.05),常染色体多态性组与正常对照组无差异。结论染色体多态性可以导致男性生殖异常,对有不育病史的男性应进行外周血染色体检查和染色质结构分析。
关键词
染色体多态性
男性生殖异常
外周血染色体核型分析
精子染色质结构分析
Keywords
Chromosomal polymorphism
Male reproductive abnormality
Peripheral blood chromosomal karyotype
analysis
Sperm
chromatin
structure
analysis
分类号
R711.6 [医药卫生—妇产科学]
原文传递
题名
转录因子Sp1在人内皮细胞高表达脂多糖相关因子1基因转录中的作用
被引量:
4
4
作者
梁自文
吴惠玲
罗敏
杨宗城
陈建
陈渝
罗勤
机构
第三军医大学西南医院内分泌科
第三军医大学西南医院全军烧伤研究所
出处
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第21期2249-2251,共3页
基金
国家自然科学基金(30670838)~~
文摘
目的明确转录因子Sp1在人内皮细胞高表达脂多糖相关因子1(endothelial-overexpressed lipopolysiccha-ride-associated factor 1,EOLA1)基因转录调控中的作用。方法定点突变EOLA1基因核心启动子-734~-666序列中推断的Sp1结合位点,观察启动子活性变化;进行凝胶电泳迁移和染色质免疫共沉淀验证Sp1转录因子与启动子区顺式作用元件发生相互作用。结果突变Sp1结合位点后,核心启动子的活性(0.12±0.01)较野生启动子(2.51±0.98)显著下降(P<0.05),EMSA和染色质免疫共沉淀验证了SP1与启动子区顺式作用元件相互作用。结论转录因子Sp1调控了EOLA1基因的基础转录。
关键词
EOLA1
SP1
启动子
凝胶电泳迁移
染色质共沉淀
Keywords
endothelial-overexpressed lipopolysaccharide-associated factor 1
stimulating protein 1
promoter
electrophoretic mobility shift assay
chromatin
immunoprecipitation
analysis
分类号
R394-33 [医药卫生—医学遗传学]
R394.3 [医药卫生—基础医学]
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职称材料
题名
植物三维染色质构型研究进展
被引量:
2
5
作者
董芊里
王金宾
李晓宠
宫磊
机构
东北师范大学生命科学学院分子表观遗传学教育部重点实验室
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期73-86,共14页
基金
国家重点研发计划项目(编号:2016YFD0101004)
国家自然科学基金项目(编号:31670220)
2015“长白山学者计划”特聘教授专项资助~~
文摘
染色质在细胞核内的缠绕、折叠及其在细胞核内的空间排布是真核生物染色质构型的主要特征。在经典DNA探针荧光原位杂交显微观察的基础上,基于新一代测序技术的Hi-C及ChIA-PET染色质构型捕获技术已经被广泛应用于动物及植物细胞核染色质构型的研究中,并以新的角度定义了包括:染色体(质)域(chromosome territory)、A/B染色质区室(compartment A/B)、拓扑偶联结构域(topological associated domains,TADs)、染色质环(chromatin loops)等在内的多个更为精细的染色质构型。利用以上两种主流技术,越来越多的植物物种染色质构型特征被鉴定、分析和比较。本文系统分析和总结了近年来以植物细胞为模型的细胞核染色构型领域取得的重要成果,包括各级染色质构型特征的组成、建立机制和主要影响因素等。在此基础上,分析了目前研究植物染色质构型技术的瓶颈和突破性的技术进展,并对后续研究主要关注的问题和研究内容进行了展望,以期为相关领域的研究提供更多的理论参考和依据。
关键词
染色质构型
高通量染色质构象捕获测序
末端配对标签测序
染色质区室
拓扑偶联结构域
Keywords
chromatin
architecture
high-throughput chromosome conformation capture(Hi-C)
chromatin
interaction
analysis
by paired-end tag sequencing(ChIA-PET)
compartment A/B
topological associated domains(TAD)
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
精子DNA完整性对男性生育力的补充预测价值
6
作者
陈宇捷
宋兵
贺小进
曹云霞
机构
安徽医科大学第一附属医院妇产科国家卫生健康委配子及生殖道异常研究重点实验室出生人口健康教育部重点实验室生殖健康与遗传安徽省重点实验室安徽省生命资源保存与人工器官工程技术研究中心(安徽医科大学)
出处
《中华临床医师杂志(电子版)》
CAS
2019年第7期489-492,共4页
基金
国家自然基金培育基金(2015KJ04)
生殖与遗传安徽省重点实验室开放基金(9021407201)
文摘
目的探究精子DNA完整性检测相对传统的精液常规在男性生育力评价中的辅助预估价值.方法采集收集2017年4月至10月共1076例不育男性精液标本,男性患者来源于安徽医科大学第一附属医院妇产科,每份标本分成2份,分别行精液常规及精子DNA完整性检测,根据精子DNA碎片指数(DFI)分为精子DNA完整性良好组(DFI≥30%)、完整性一般组(15%<DFI<30%)及完整性差组(DFI≤15%).根据患者年龄分为21~30岁、31~40岁及≥41岁;按照精子浓度分为浓度正常(≥15×10^6/ml)及少精症(<15×10^6/ml),按照精子前向活动率分为正常(≥32%)及弱精子症(<32%),采用χ^2检验分析不同精子DNA完整性组之间的年龄、浓度和前向活动率的差异,采用Pearson相关分析分析患者年龄、精子浓度及前向活动率分别与精子DFI的相关性.结果不同精子DNA完整性组间,精子浓度正常与少精症水平差异具有统计学意义(χ^2=96.82,P<0.001)、活力正常与弱精子症水平差异均具有统计学意义(χ^2=2.06,P<0.001).年龄与DFI成正相关(r=0.154,P<0.001),精子浓度及前向活动率与DFI成负相关(r=-0.231,P<0.001;r=-0.564,P<0.001).结论精子DFI与精子浓度及活动率呈负相关,与年龄呈正相关,精子DNA完整性检测一定程度上可以弥补精液常规参数分析在评价男性生育能力上的不足,具有重要参考价值.
关键词
精子
DNA
男性
生育力
精液常规
精子染色质结构分析
Keywords
Sperm
DNA
Male
Fertility
Semen
analysis
Sperm
chromatin
structure
analysis
分类号
R69 [医药卫生—泌尿科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
正常人血液白细胞染色质制备及组份分析
温博贵
钟叔平
《江西医学院学报》
1989
0
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职称材料
2
三维基因组染色质构象捕获及其衍生技术
田昊
杨梓健
徐兴文
刘良玉
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
6
原文传递
3
染色体多态性与男性生殖异常关系探讨
章鸯
宫剑
邢超
陈雪娇
《中国妇幼保健》
CAS
2017
6
原文传递
4
转录因子Sp1在人内皮细胞高表达脂多糖相关因子1基因转录中的作用
梁自文
吴惠玲
罗敏
杨宗城
陈建
陈渝
罗勤
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
4
下载PDF
职称材料
5
植物三维染色质构型研究进展
董芊里
王金宾
李晓宠
宫磊
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
下载PDF
职称材料
6
精子DNA完整性对男性生育力的补充预测价值
陈宇捷
宋兵
贺小进
曹云霞
《中华临床医师杂志(电子版)》
CAS
2019
0
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