命名实体是电子病历中相关医学知识的主要载体,因此,临床命名实体识别(Clinical Named Entity Recognition,CNER)也就成为了临床文本分析处理的基础性任务之一.由于文本结构和语言等方面的特殊性,面向中文电子病历(Electronic Medical R...命名实体是电子病历中相关医学知识的主要载体,因此,临床命名实体识别(Clinical Named Entity Recognition,CNER)也就成为了临床文本分析处理的基础性任务之一.由于文本结构和语言等方面的特殊性,面向中文电子病历(Electronic Medical Records,EMRs)的临床命名实体识别依然存在着巨大的挑战.本文提出了一种基于多头自注意力神经网络的中文临床命名实体识别方法.该方法使用了一种新颖的融合领域词典的字符级特征表示方法,并在BiLSTM-CRF模型的基础上,结合多头自注意力机制来准确地捕获字符间潜在的依赖权重、语境和语义关联等多方面的特征,从而有效地提升了中文临床命名实体的识别能力.实验结果表明本文方法超过现有的其他方法获得了较优的识别性能.展开更多
智慧医疗技术的发展让我们不满足仅使用传统方法做医学研究.针对中文电子病历实体识别问题,设计了一种基于卷积神经网络结合条件随机场(convolutional neural network-conditional random field,CNN-CRF)的实体识别算法框架.为得到高质...智慧医疗技术的发展让我们不满足仅使用传统方法做医学研究.针对中文电子病历实体识别问题,设计了一种基于卷积神经网络结合条件随机场(convolutional neural network-conditional random field,CNN-CRF)的实体识别算法框架.为得到高质量的词向量,将标注实体加入词典进行分词,并将已标注和未标注文本作为语料,用word2vec工具对已分词文本进行无监督学习;为避免扩张卷积层数增加导致过拟合,采用迭代扩张卷积处理输入向量,并使用dropout随机丢弃一些连接;运用条件随机场对网络的分类结果进行修正.把该方法在中文电子病历上进行对比试验,从病历中提取出身体部位,疾病,症状,检查及治疗5类实体.实验结果表明,该方法能有效地辨别病历中的实体,其识别的准确率、召回率和f1值分别为90.01%,90.62%,90.31%,准确率和速率比传统方法都有一定提高.展开更多
基金湖南省自然科学基金资助项目(2018JJ2534)网络犯罪侦查湖南省普通高校重点实验室开放基金资助项目(2020WLFZZC003)+3 种基金国家重点研发计划资助项目(2016YFC0901705)湖南省重大科技专项(2017SK1040)Natural Science Foundation of Hunan Province(2018JJ2534)高新技术产业科技创新引领计划(2020GK2029)
文摘命名实体是电子病历中相关医学知识的主要载体,因此,临床命名实体识别(Clinical Named Entity Recognition,CNER)也就成为了临床文本分析处理的基础性任务之一.由于文本结构和语言等方面的特殊性,面向中文电子病历(Electronic Medical Records,EMRs)的临床命名实体识别依然存在着巨大的挑战.本文提出了一种基于多头自注意力神经网络的中文临床命名实体识别方法.该方法使用了一种新颖的融合领域词典的字符级特征表示方法,并在BiLSTM-CRF模型的基础上,结合多头自注意力机制来准确地捕获字符间潜在的依赖权重、语境和语义关联等多方面的特征,从而有效地提升了中文临床命名实体的识别能力.实验结果表明本文方法超过现有的其他方法获得了较优的识别性能.
文摘智慧医疗技术的发展让我们不满足仅使用传统方法做医学研究.针对中文电子病历实体识别问题,设计了一种基于卷积神经网络结合条件随机场(convolutional neural network-conditional random field,CNN-CRF)的实体识别算法框架.为得到高质量的词向量,将标注实体加入词典进行分词,并将已标注和未标注文本作为语料,用word2vec工具对已分词文本进行无监督学习;为避免扩张卷积层数增加导致过拟合,采用迭代扩张卷积处理输入向量,并使用dropout随机丢弃一些连接;运用条件随机场对网络的分类结果进行修正.把该方法在中文电子病历上进行对比试验,从病历中提取出身体部位,疾病,症状,检查及治疗5类实体.实验结果表明,该方法能有效地辨别病历中的实体,其识别的准确率、召回率和f1值分别为90.01%,90.62%,90.31%,准确率和速率比传统方法都有一定提高.
文摘中文电子病历实体包含大量的医学领域词汇并具有明显的嵌套特征。嵌套实体识别时往往存在目标实体定位不完整、不准确的问题。针对这一问题,提出了一种基于机器阅读理解的中文电子病历嵌套命名实体识别模型MRC-PBM(machine reading comprehension-position information biaffine and MLP)。该模型将命名实体识别(named entity recognition,NER)转化为机器阅读理解任务,将中文电子病历文本和预定义的查询语句串联作为输入,使用基于医学的预训练模型MC_BERT获取词向量,然后通过双向长短期记忆网络模型(BiLSTM)和多粒度扩张卷积模型分别获取双向的特征信息以及单词之间的信息,得到相应的特征向量,最后使用Hybrid-PBM预测器进行实体预测。在嵌套和平面NER数据集上进行实验。实验表明,该模型在糖尿病语料和公开医学数据集上优于其他主流神经网络模型,F1值比基线模型提高了1.21%~5.80%。
