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题名新疆野扁桃TP-M13-SSR引物的多态性分析
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作者
刘梦雯
曾斌
王波
王建友
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机构
新疆农业大学林学与园艺学院
新疆农业大学果树学新疆特色果树研究中心
中国林业科学院新疆林业科学分院
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出处
《北方园艺》
CAS
北大核心
2018年第2期46-51,共6页
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基金
国家自然科学基金资助项目(31660557)
新疆维吾尔自治区科技计划资助项目(201130102-1-5)
新疆维吾尔自治区园艺学重点学科资助项目(2016-10758-3)
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文摘
以来自5个居群的96份新疆野扁桃叶片为试材,采用TP-M13-SSR技术和毛细管荧光电泳检测的方法,分析新疆野扁桃TP-M13-SSR引物的多态性,以期为该珍稀植物的保育工作提供参考依据。结果表明:新疆野扁桃TP-M13-SSR引物库中包含23 627条序列,共有5类重复类型,以二核苷酸类型数量最多,五、六核苷酸数量极少。将12对核心引物与96份样品一同扩增后,等位基因数(No.of allele)均为2个,有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、固定指数(F)、香农指数(I)、特异等位基因(Na)、多态性信息含量指数(PIC)、标记指数(MI)、Nei′s多样性指数、遗传相似性系数(Gst)、基因流(Nm)的范围分别为:3.531 0~9.000 0、0~0.666 7、0.72~0.89、0.25~1.00、1.48~2.44、8~18、0.669 0~0.879 0、5.35~15.82、0.219 5~0.430 8、0.002 0~0.042 6、34.756 0~252.196 4。这12对引物中,引物PT-9的多态性最好,引物PT-1多态性最差。
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关键词
新疆野扁桃
TP-M13-ssr引物
毛细管荧光电泳检测
ssr位点特征
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Keywords
Prunus tenella Batsch.
TP-M13-ssr primer
capillary electrophoresis with fluorescent- labeled primer
characteristics of ssr loci
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分类号
S662.103.6
[农业科学—果树学]
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