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芸薹属AC基因组MTP1基因的生物信息学分析
被引量：
5
1
作者
李施蒙
《广东农业科学》
CAS
2018年第9期21-27,共7页
以拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtMTP1基因序列为参考,利用白菜(Brassica rapa)、甘蓝(Brassica oleracea)、甘蓝型油菜(Brassica napus)全基因组数据对MTP1基因进行全基因组水平鉴定,通过Blastn比对和保守结构域分析,在芸薹属AC基因...
以拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtMTP1基因序列为参考,利用白菜(Brassica rapa)、甘蓝(Brassica oleracea)、甘蓝型油菜(Brassica napus)全基因组数据对MTP1基因进行全基因组水平鉴定,通过Blastn比对和保守结构域分析,在芸薹属AC基因组中共鉴定到8个MTP1基因,其中白菜1个、甘蓝3个、甘蓝型油菜4个(A亚基因组3个、C亚基因组1个)。生物信息学分析结果表明,在蛋白质理化性质、二级结构、跨膜结构域、磷酸化位点等方面,3个物种中的MTP1基因间各有差异,并使用甘蓝型油菜转录组数据比较分析4个BnMTP1基因在不同组织部位的表达模式。
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关键词
甘蓝型油菜
MTP1基因
重金属耐受蛋白
锌
CDF家族
生物信息学
下载PDF
职称材料
题名
芸薹属AC基因组MTP1基因的生物信息学分析
被引量：
5
1
作者
李施蒙
机构
西藏自治区农牧科学院农业研究所
出处
《广东农业科学》
CAS
2018年第9期21-27,共7页
基金
西藏自治区农牧科学院农业研究所青年基金(2017NKS-QNJJ)
文摘
以拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtMTP1基因序列为参考,利用白菜(Brassica rapa)、甘蓝(Brassica oleracea)、甘蓝型油菜(Brassica napus)全基因组数据对MTP1基因进行全基因组水平鉴定,通过Blastn比对和保守结构域分析,在芸薹属AC基因组中共鉴定到8个MTP1基因,其中白菜1个、甘蓝3个、甘蓝型油菜4个(A亚基因组3个、C亚基因组1个)。生物信息学分析结果表明,在蛋白质理化性质、二级结构、跨膜结构域、磷酸化位点等方面,3个物种中的MTP1基因间各有差异,并使用甘蓝型油菜转录组数据比较分析4个BnMTP1基因在不同组织部位的表达模式。
关键词
甘蓝型油菜
MTP1基因
重金属耐受蛋白
锌
CDF家族
生物信息学
Keywords
Brassica
napus
L.
MTP1
gene
metal
tolerance
protein
Zn
cation
diffuse
facilitator
proteins
family
bioinformatics
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
芸薹属AC基因组MTP1基因的生物信息学分析
李施蒙
《广东农业科学》
CAS
2018
5
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职称材料
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参考文献
引证文献
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