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燕麦隐性核不育cSSR标记的开发及其验证
被引量：
4
1
作者
张丽君
刘龙龙
+2 位作者
畅志坚
郭彬
崔林
《草业学报》
CSCD
北大核心
2015年第7期146-154,共9页
构建燕麦隐性核不育转录组数据库,开发cSSR标记,丰富燕麦分子标记数据库,并对隐性核不育相关cSSR标记进行验证,为充分利用燕麦种质资源及深入研究隐性核不育奠定基础。对燕麦雄性不育近等基因系CAMS1进行转录组测序,利用软件对得到的ES...
构建燕麦隐性核不育转录组数据库,开发cSSR标记,丰富燕麦分子标记数据库,并对隐性核不育相关cSSR标记进行验证,为充分利用燕麦种质资源及深入研究隐性核不育奠定基础。对燕麦雄性不育近等基因系CAMS1进行转录组测序,利用软件对得到的EST序列进行SSR位点查找和分析,开发cSSR引物。并用CAMS1×品燕2号F2代群体对所开发的雄性不育相关的cSSR引物进行验证。通过转录组测序获得的EST序列中6409条存在SSR位点,736条序列中有2个及2个以上SSR位点;在所有SSR位点中三核苷酸、二核苷酸重复序列最多,分别为4340(56.66%)和1768(24.30%)个。三核苷酸重复中,CCG/CGG(26.68%)、AGG/CTT(21.29%)、AGC/CTG(18.48%)出现的频率较多,二核苷酸重复中,以AG/CT(60.63%)和AC/GT(26.24%)出现的频率较高;根据开发的cSSR设计了13344对cSSR引物,选择与雄性不育相关且能设计引物的21条序列合成45对SSR引物。PCR检测表明,32对引物(71%)有扩增产物,其中11对cSSR引物在亲本间的扩增产物具有多态性,7对引物在可育和不育性状池间存在差异。本研究对燕麦雄性不育近等基因系CAMS1进行了转录组测序,根据得到的EST序列开发了13344对cSSR引物,并利用CAMS1×品燕2号F2代群体进行有效性检测,32对引物有扩增产物,7个标记可用于燕麦雄性不育材料的分子检测。
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关键词
燕麦
cssr
SSR标记
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职称材料
复杂系统建模的ε机理论方法及应用研究
被引量：
5
2
作者
张淑清
李盼
+2 位作者
师荣艳
翟欣沛
姜兴广
《仪器仪表学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014年第8期1758-1765,共8页
提出一种ε机理论发现复杂系统中隐含模式的新思路。该方法能在对系统内部结构无法知晓的情况下,不需要假设而根据系统自身的特性建模。先对时间序列进行符号化处理,生成符号序列。再采取因果态分割重构法重构ε机,重构后能够显示出原...
提出一种ε机理论发现复杂系统中隐含模式的新思路。该方法能在对系统内部结构无法知晓的情况下,不需要假设而根据系统自身的特性建模。先对时间序列进行符号化处理,生成符号序列。再采取因果态分割重构法重构ε机,重构后能够显示出原始序列中的隐含信息。通过对工程中配电网系统故障选线的多组实验证明,4个评判指标:熵率、统计复杂度、状态数和相对熵率能够一致地显示出各条线路的隐含信息,在几个关键影响因素改变的情况下均能有效地区分故障线路和非故障线路。从而验证了ε机理论在复杂系统建模中的优越性,为复杂系统建模提供了一种有效途径,也为配电网故障选线提供了一种新的方法。
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关键词
复杂系统建模
ε机重构
符号化
因果态分割重构
故障选线
casual
STATE
SPLITTING
RECONSTRUCTION
(
cssr
)
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职称材料
脆蛇转录组序列的分析和系统发育定位(英文)
3
作者
祝静静
黎万顺
+5 位作者
高虹
徐通
鲍秋颖
郑永祥
周德敏
夏钢
《华东师范大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期102-112,共11页
脆蛇是一种类似于蛇但是又具有蜥蜴的特征的爬行动物,这些矛盾的特性与脆蛇的系统发育分类学有密切的关系.脆蛇在传统中药中也有很多治疗作用.基于这些方面,本研究利用高通量测序方法对脆蛇胃肠道的转录组序列进行检测,组装和注释.最终...
脆蛇是一种类似于蛇但是又具有蜥蜴的特征的爬行动物,这些矛盾的特性与脆蛇的系统发育分类学有密切的关系.脆蛇在传统中药中也有很多治疗作用.基于这些方面,本研究利用高通量测序方法对脆蛇胃肠道的转录组序列进行检测,组装和注释.最终获得4.6 Gbp高质量的数据,组装获得58 959个单一的基因,其中35 708(60.56%)个单一基因与数据库的基因相匹配.为了确定脆蛇与蛇和蜥蜴的同源进化关系,对同源基因家族和系统进化树进行了分析,结果显示脆蛇的转录组序列更接近于蛇而不是蜥蜴.除此之外还鉴定了10 613 cSSR标签,其中1 644个标签根据严格的标准能够用至少一个引物获得.本研究第一次揭示了脆蛇胃肠道的转录组序列,确定其在系统发育学上的定位.这些序列和标签为脆蛇的研究提供了重要的资源.
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关键词
脆蛇
Ophisaurus
harti
系统发育
转录组
cssr
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职称材料
呼叫建立成功率简析
被引量：
2
4
作者
贾海蓉
武奕峰
张立毅
《科技情报开发与经济》
2007年第4期237-238,共2页
简述了呼叫建立成功率的计算公式和影响呼叫建立成功率的因素,对GSM网络中呼叫建立成功率低的小区进行了分类分析。
关键词
呼叫建立成功率
网络运行
话务量
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职称材料
基于HMM的私有协议自主学习方法
被引量：
1
5
作者
付光远
刘津霖
李海龙
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2017年第12期3779-3783,共5页
针对近年来工控网络中私有协议的广泛应用,给安全研究带来许多挑战,提出基于隐马尔可夫模型的私有协议自主学习方法,仅通过流量数据得到私有协议报文结构的有限状态机模型。并且针对Baum-Welch算法需要先验知识的缺点,基于因果态分割重...
针对近年来工控网络中私有协议的广泛应用,给安全研究带来许多挑战,提出基于隐马尔可夫模型的私有协议自主学习方法,仅通过流量数据得到私有协议报文结构的有限状态机模型。并且针对Baum-Welch算法需要先验知识的缺点,基于因果态分割重建算法的思想,设计出求解私有协议报文结构ε机模型的CAPP算法,避免了局部最优和由于缺乏先验知识所产生的参数选择问题;通过公有协议FTP、Modbus TCP以及私有协议WDB RPC对方法的有效性进行了实验验证。最后讨论了下一步的研究方向。
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关键词
私有协议
隐马尔可夫模型
ε机
因果态分割重建
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职称材料
从小麦EST序列中开发新的SSR引物
被引量：
66
6
作者
陈军方
任正隆
+1 位作者
高丽锋
贾继增
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第2期154-158,共5页
小麦EST数量的迅速增加为开发新的SSR标记提供了宝贵的数据资源 ,本实验从国际小麦族EST协作网 (ITEC)上公布的 10 380条EST序列中检索到 4 4 4条含有SSR的序列 ,检出率为 4 1%。其中含二核苷酸重复单元和三核苷酸重复单元的SSR ESTs...
小麦EST数量的迅速增加为开发新的SSR标记提供了宝贵的数据资源 ,本实验从国际小麦族EST协作网 (ITEC)上公布的 10 380条EST序列中检索到 4 4 4条含有SSR的序列 ,检出率为 4 1%。其中含二核苷酸重复单元和三核苷酸重复单元的SSR ESTs分别为 34条 (7 7% )和 347条 (78 0 % )。利用这些SSR ESTs序列共设计 135对cSSR引物 ,其中 82对在小麦上有扩增产物 ,占所设计引物总数的 6 0 8%。利用小麦缺体 四体 ,32对cSSR引物被定位到小麦除 2D、4B和 4D外的 18条染色体上。
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关键词
EST
SSR-ESTs
cssr
引物
小麦
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职称材料
哺乳动物肽聚糖识别蛋白抗菌作用及其机制的研究进展
被引量：
2
7
作者
郭睿
王银
《吉林农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期236-240,共5页
哺乳动物肽聚糖识别蛋白(PGRPs)是一类可识别肽聚糖的免疫激活分子,具有抗菌活性。它的抗菌机制与其他抗菌肽明显不同。最新研究发现,哺乳动物PGRPs通过与肽聚糖结合,激活在细菌中识别胞浆外错误折叠蛋白质分子的CssR-CssS或CpxA-CpxR...
哺乳动物肽聚糖识别蛋白(PGRPs)是一类可识别肽聚糖的免疫激活分子,具有抗菌活性。它的抗菌机制与其他抗菌肽明显不同。最新研究发现,哺乳动物PGRPs通过与肽聚糖结合,激活在细菌中识别胞浆外错误折叠蛋白质分子的CssR-CssS或CpxA-CpxR双部件系统,最终导至细菌死亡。文中总结了肽聚糖识别蛋白的抗菌作用及其机制的相关研究进展。
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关键词
肽聚糖识别蛋白
杀菌
cssr
-CssS
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职称材料
扫描GMTI系统运动目标精确定位方法
被引量：
2
8
作者
胡瑞贤
王彤
保铮
《系统工程与电子技术》
EI
CSCD
北大核心
2013年第8期1607-1614,共8页
运动目标定位性能会受到通道一致性和基线误差等系统非理想因素的影响。介绍了误差等效基线的概念来描述以上误差,并在此基础上提出了一种新的扫描地面运动目标检测(ground moving target indication,GMTI)系统的运动目标定位方法。该...
运动目标定位性能会受到通道一致性和基线误差等系统非理想因素的影响。介绍了误差等效基线的概念来描述以上误差,并在此基础上提出了一种新的扫描地面运动目标检测(ground moving target indication,GMTI)系统的运动目标定位方法。该方法的主要步骤包括测量不同误差等效基线对应的杂波抑制锐化比,确定最优误差等效基线及运动目标定位。此方法的关键步骤是通过令杂波抑制比最大化来估计最优误差等效基线,这确保了估计的最优误差等效基线与数据真实误差特性相吻合。因而,其定位性能明显优于采用名义基线的定位结果。实测数据处理结果验证了方法的性能。
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关键词
扫描GMTI
目标定位
杂波抑制锐化比
误差等效基线
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职称材料
题名
燕麦隐性核不育cSSR标记的开发及其验证
被引量：
4
1
作者
张丽君
刘龙龙
畅志坚
郭彬
崔林
机构
山西省农业科学院农作物品种资源研究所
山西省农业科学院作物研究所
山西省晋中市寿阳县乡镇农产品质量安全监管站
出处
《草业学报》
CSCD
北大核心
2015年第7期146-154,共9页
基金
山西省农科院博士基金项目(YBSJJ209)
山西省自然基金项目(2014011030-1)
+1 种基金
山西省国际合作项目(2014081032-1)
国家燕麦荞麦产业技术体系(CARS-08-A-1)项目资助
文摘
构建燕麦隐性核不育转录组数据库,开发cSSR标记,丰富燕麦分子标记数据库,并对隐性核不育相关cSSR标记进行验证,为充分利用燕麦种质资源及深入研究隐性核不育奠定基础。对燕麦雄性不育近等基因系CAMS1进行转录组测序,利用软件对得到的EST序列进行SSR位点查找和分析,开发cSSR引物。并用CAMS1×品燕2号F2代群体对所开发的雄性不育相关的cSSR引物进行验证。通过转录组测序获得的EST序列中6409条存在SSR位点,736条序列中有2个及2个以上SSR位点;在所有SSR位点中三核苷酸、二核苷酸重复序列最多,分别为4340(56.66%)和1768(24.30%)个。三核苷酸重复中,CCG/CGG(26.68%)、AGG/CTT(21.29%)、AGC/CTG(18.48%)出现的频率较多,二核苷酸重复中,以AG/CT(60.63%)和AC/GT(26.24%)出现的频率较高;根据开发的cSSR设计了13344对cSSR引物,选择与雄性不育相关且能设计引物的21条序列合成45对SSR引物。PCR检测表明,32对引物(71%)有扩增产物,其中11对cSSR引物在亲本间的扩增产物具有多态性,7对引物在可育和不育性状池间存在差异。本研究对燕麦雄性不育近等基因系CAMS1进行了转录组测序,根据得到的EST序列开发了13344对cSSR引物,并利用CAMS1×品燕2号F2代群体进行有效性检测,32对引物有扩增产物,7个标记可用于燕麦雄性不育材料的分子检测。
关键词
燕麦
cssr
SSR标记
Keywords
oat （Arena sativa ）
cssr
SSR
分类号
S512.6 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
复杂系统建模的ε机理论方法及应用研究
被引量：
5
2
作者
张淑清
李盼
师荣艳
翟欣沛
姜兴广
机构
燕山大学电气工程学院河北省测试计量技术及仪器重点实验室
出处
《仪器仪表学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014年第8期1758-1765,共8页
基金
国家自然科学基金(61077071)
河北省自然科学基金(F20110203207)
河北省高等科学技术研究重点项目(ZD2014100)资助项目
文摘
提出一种ε机理论发现复杂系统中隐含模式的新思路。该方法能在对系统内部结构无法知晓的情况下,不需要假设而根据系统自身的特性建模。先对时间序列进行符号化处理,生成符号序列。再采取因果态分割重构法重构ε机,重构后能够显示出原始序列中的隐含信息。通过对工程中配电网系统故障选线的多组实验证明,4个评判指标:熵率、统计复杂度、状态数和相对熵率能够一致地显示出各条线路的隐含信息,在几个关键影响因素改变的情况下均能有效地区分故障线路和非故障线路。从而验证了ε机理论在复杂系统建模中的优越性,为复杂系统建模提供了一种有效途径,也为配电网故障选线提供了一种新的方法。
关键词
复杂系统建模
ε机重构
符号化
因果态分割重构
故障选线
casual
STATE
SPLITTING
RECONSTRUCTION
(
cssr
)
Keywords
complex system modeling
ε-machine reconstruction
symbolization
fault line selection
分类号
TM711 [电气工程—电力系统及自动化]
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职称材料
题名
脆蛇转录组序列的分析和系统发育定位(英文)
3
作者
祝静静
黎万顺
高虹
徐通
鲍秋颖
郑永祥
周德敏
夏钢
机构
华东师范大学科学与技术跨学科高等研究院
华大基因
北京大学医学部天然药物及仿生药物国家重点实验
出处
《华东师范大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期102-112,共11页
基金
上海市浦江人才计划(08PJ1404100)
中国国家重点基础研究计划973项目(2010CB12300)
文摘
脆蛇是一种类似于蛇但是又具有蜥蜴的特征的爬行动物,这些矛盾的特性与脆蛇的系统发育分类学有密切的关系.脆蛇在传统中药中也有很多治疗作用.基于这些方面,本研究利用高通量测序方法对脆蛇胃肠道的转录组序列进行检测,组装和注释.最终获得4.6 Gbp高质量的数据,组装获得58 959个单一的基因,其中35 708(60.56%)个单一基因与数据库的基因相匹配.为了确定脆蛇与蛇和蜥蜴的同源进化关系,对同源基因家族和系统进化树进行了分析,结果显示脆蛇的转录组序列更接近于蛇而不是蜥蜴.除此之外还鉴定了10 613 cSSR标签,其中1 644个标签根据严格的标准能够用至少一个引物获得.本研究第一次揭示了脆蛇胃肠道的转录组序列,确定其在系统发育学上的定位.这些序列和标签为脆蛇的研究提供了重要的资源.
关键词
脆蛇
Ophisaurus
harti
系统发育
转录组
cssr
Keywords
glass lizard
Ophisaurus harti
phylogenetic evolution
transcriptome
cssr
分类号
Q111 [生物学—普通生物学]
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职称材料
题名
呼叫建立成功率简析
被引量：
2
4
作者
贾海蓉
武奕峰
张立毅
机构
太原理工大学
出处
《科技情报开发与经济》
2007年第4期237-238,共2页
文摘
简述了呼叫建立成功率的计算公式和影响呼叫建立成功率的因素,对GSM网络中呼叫建立成功率低的小区进行了分类分析。
关键词
呼叫建立成功率
网络运行
话务量
Keywords
cssr
network operation
elephone traffic
分类号
TN929.5 [电子电信—通信与信息系统]
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职称材料
题名
基于HMM的私有协议自主学习方法
被引量：
1
5
作者
付光远
刘津霖
李海龙
机构
火箭军工程大学信息工程系
出处
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2017年第12期3779-3783,共5页
基金
国家自然科学基金青年基金资助项目(61403397)
陕西省自然科学基础研究计划资助项目(2015JM6313)
文摘
针对近年来工控网络中私有协议的广泛应用,给安全研究带来许多挑战,提出基于隐马尔可夫模型的私有协议自主学习方法,仅通过流量数据得到私有协议报文结构的有限状态机模型。并且针对Baum-Welch算法需要先验知识的缺点,基于因果态分割重建算法的思想,设计出求解私有协议报文结构ε机模型的CAPP算法,避免了局部最优和由于缺乏先验知识所产生的参数选择问题;通过公有协议FTP、Modbus TCP以及私有协议WDB RPC对方法的有效性进行了实验验证。最后讨论了下一步的研究方向。
关键词
私有协议
隐马尔可夫模型
ε机
因果态分割重建
Keywords
private protocol
HMM
ε-machine
cssr
分类号
TP393 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
从小麦EST序列中开发新的SSR引物
被引量：
66
6
作者
陈军方
任正隆
高丽锋
贾继增
机构
中国农业科学院作物品种资源研究所
四川农业大学农学院遗传育种系
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第2期154-158,共5页
基金
国家 8 63项目"小麦新型分子标记开发及抗病
优质
高产新品种培育"(2 0 0 1AA2 110 3 1)
文摘
小麦EST数量的迅速增加为开发新的SSR标记提供了宝贵的数据资源 ,本实验从国际小麦族EST协作网 (ITEC)上公布的 10 380条EST序列中检索到 4 4 4条含有SSR的序列 ,检出率为 4 1%。其中含二核苷酸重复单元和三核苷酸重复单元的SSR ESTs分别为 34条 (7 7% )和 347条 (78 0 % )。利用这些SSR ESTs序列共设计 135对cSSR引物 ,其中 82对在小麦上有扩增产物 ,占所设计引物总数的 6 0 8%。利用小麦缺体 四体 ,32对cSSR引物被定位到小麦除 2D、4B和 4D外的 18条染色体上。
关键词
EST
SSR-ESTs
cssr
引物
小麦
Keywords
EST
SSR-ESTs
cssr
primers
Wheat
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
哺乳动物肽聚糖识别蛋白抗菌作用及其机制的研究进展
被引量：
2
7
作者
郭睿
王银
机构
扬州大学兽医学院
出处
《吉林农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期236-240,共5页
基金
教育部博士点基金项目(02318962023532)
文摘
哺乳动物肽聚糖识别蛋白(PGRPs)是一类可识别肽聚糖的免疫激活分子,具有抗菌活性。它的抗菌机制与其他抗菌肽明显不同。最新研究发现,哺乳动物PGRPs通过与肽聚糖结合,激活在细菌中识别胞浆外错误折叠蛋白质分子的CssR-CssS或CpxA-CpxR双部件系统,最终导至细菌死亡。文中总结了肽聚糖识别蛋白的抗菌作用及其机制的相关研究进展。
关键词
肽聚糖识别蛋白
杀菌
cssr
-CssS
Keywords
PGRPs
antibacterium
cssr
-CssS
分类号
S852.6 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
扫描GMTI系统运动目标精确定位方法
被引量：
2
8
作者
胡瑞贤
王彤
保铮
机构
西安电子科技大学雷达信号处理国防科技重点实验室
出处
《系统工程与电子技术》
EI
CSCD
北大核心
2013年第8期1607-1614,共8页
基金
国家自然科学基金青年科学基金(61101241
41001282)资助课题
文摘
运动目标定位性能会受到通道一致性和基线误差等系统非理想因素的影响。介绍了误差等效基线的概念来描述以上误差,并在此基础上提出了一种新的扫描地面运动目标检测(ground moving target indication,GMTI)系统的运动目标定位方法。该方法的主要步骤包括测量不同误差等效基线对应的杂波抑制锐化比,确定最优误差等效基线及运动目标定位。此方法的关键步骤是通过令杂波抑制比最大化来估计最优误差等效基线,这确保了估计的最优误差等效基线与数据真实误差特性相吻合。因而,其定位性能明显优于采用名义基线的定位结果。实测数据处理结果验证了方法的性能。
关键词
扫描GMTI
目标定位
杂波抑制锐化比
误差等效基线
Keywords
scan ground moving target indication （SCAN-GMTI）
moving target location
clutter suppres-sion sharpness ratio （
cssr
）
error equivalent baseline （EEB）
分类号
TN958 [电子电信—信号与信息处理]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
燕麦隐性核不育cSSR标记的开发及其验证
张丽君
刘龙龙
畅志坚
郭彬
崔林
《草业学报》
CSCD
北大核心
2015
4
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职称材料
2
复杂系统建模的ε机理论方法及应用研究
张淑清
李盼
师荣艳
翟欣沛
姜兴广
《仪器仪表学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014
5
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职称材料
3
脆蛇转录组序列的分析和系统发育定位(英文)
祝静静
黎万顺
高虹
徐通
鲍秋颖
郑永祥
周德敏
夏钢
《华东师范大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014
0
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职称材料
4
呼叫建立成功率简析
贾海蓉
武奕峰
张立毅
《科技情报开发与经济》
2007
2
下载PDF
职称材料
5
基于HMM的私有协议自主学习方法
付光远
刘津霖
李海龙
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2017
1
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职称材料
6
从小麦EST序列中开发新的SSR引物
陈军方
任正隆
高丽锋
贾继增
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005
66
下载PDF
职称材料
7
哺乳动物肽聚糖识别蛋白抗菌作用及其机制的研究进展
郭睿
王银
《吉林农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
2
下载PDF
职称材料
8
扫描GMTI系统运动目标精确定位方法
胡瑞贤
王彤
保铮
《系统工程与电子技术》
EI
CSCD
北大核心
2013
2
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职称材料
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