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河南省人源和食源多重耐药致泻大肠埃希氏菌耐药特征与基因组分析
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作者 戚浩彧 李艳芬 +5 位作者 王钰 邱正勇 崔莹 吴玲玲 张濛 李永利 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期723-731,共9页
目的了解河南省临床和食品来源中多重耐药的致泻大肠埃希氏菌的耐药性和基因组特征.方法对2017-2022年河南省分离的101株多重耐药致泻大肠埃希氏菌,通过微量肉汤稀释法进行抗生素敏感性实验.基于全基因组测序结果分析其耐药基因、多位... 目的了解河南省临床和食品来源中多重耐药的致泻大肠埃希氏菌的耐药性和基因组特征.方法对2017-2022年河南省分离的101株多重耐药致泻大肠埃希氏菌,通过微量肉汤稀释法进行抗生素敏感性实验.基于全基因组测序结果分析其耐药基因、多位点序列分型、质粒类型并基于核心基因组单核苷酸多态性位点(cgSNPs)构建系统发育树.结果101株多重耐药的致泻大肠埃希氏菌对氨苄西林、四环素、萘啶酸的耐药率最高,分别为87.1%、79.2%、64.4%;对头孢噻肟的耐药率为38.6%.全基因组测序数据表明:101株分离株可被分为60种ST型,其中ST10、ST1491、ST38是优势型别;101株分离株共预测出23种质粒类型,其中携带率最高的类型为IncFIB.分离株携带喹诺酮类、氨基糖苷类、βG内酰胺酶类、四环素类等多种耐药基因,其中超广谱βG内酰胺酶基因bla_(CTX-M-14)和bla_(CTX-M-55)上下游遗传环境中均存在插入序列(IS26、IS903B、ISECP1).结论河南省人源和食源多重耐药的致泻大肠埃希氏菌具有较高的遗传多样性,整体耐药水平较高,其bla_(CTX-M)基因的传播可能与插入序列(IS)有关. 展开更多
关键词 多重耐药致泻大肠埃希氏菌 全基因组测序 耐药性 bla_(ctx-M)
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移动元件ISEcp1介导bla_(CTX-M)转座机制的分析研究 被引量:3
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作者 刘东 张倩 +2 位作者 王倩薇 毛英格 王丽 《重庆医学》 CAS 2018年第26期3436-3439,共4页
目的探索ISEcp1转座单元的类型及其转座机制。方法采用BLAST比对分析GenBank库中ISEcp1及其下游blaCTX-M所处的基因环境。通过ResFinder预测耐药基因,BLASTN/BLASTP等对ORF和假基因进行核实与信息完善,并利用ISfinder对移动元件进行精... 目的探索ISEcp1转座单元的类型及其转座机制。方法采用BLAST比对分析GenBank库中ISEcp1及其下游blaCTX-M所处的基因环境。通过ResFinder预测耐药基因,BLASTN/BLASTP等对ORF和假基因进行核实与信息完善,并利用ISfinder对移动元件进行精细注释,最后运用Inkscape 0.48.1绘图。结果blaCTX-M常位于移动元件ISEcp1下游,二者可形成完整的转座单元,该转座单元主要可分为6类,即:ISEcp1-blaCTX-M-Δorf477转座单元、ISEcp1-blaCTX-M-IS903-ΔiroN转座单元、ISEcp1-blaCTX-M转座单元、ISEcp1-blaCTX-M-orf3转座单元、ISEcp1-blaCTX-M-orfX转座单元和ISEcp1-blaCTX-M-ΔIS26-orf222转座单元。ISEcp1中的P1为强启动子,调控下游blaCTX-M的表达。结论 ISEcp1可通过捕获不同的基因形成相应的转座单元,这些转座单元在blaCTX-M的传播和表达的过程中起重要作用。 展开更多
关键词 IS Ecp1 bla ctx-M 转座单元 P1 表达
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广东省腹泻仔猪大肠杆菌blaCTX-M-65与mcr-1基因共传播特征
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作者 张岩 曹孟涛 +3 位作者 卢跃溦 蒋红霞 王令 李斌 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期1286-1297,共12页
【目的】调查分析广东省某生猪养殖场腹泻仔猪的大肠杆菌耐药情况以及同时携带blaCTX-M-65与mcr-1两种耐药基因的阳性大肠杆菌的分子特征与其共同传播特征,为耐药性监测及风险防控提供科学依据。【方法】从广东省肇庆市某生猪养殖场采... 【目的】调查分析广东省某生猪养殖场腹泻仔猪的大肠杆菌耐药情况以及同时携带blaCTX-M-65与mcr-1两种耐药基因的阳性大肠杆菌的分子特征与其共同传播特征,为耐药性监测及风险防控提供科学依据。【方法】从广东省肇庆市某生猪养殖场采集腹泻仔猪直肠棉拭子样品90份,并进行大肠杆菌分离鉴定;采用PCR方法检测产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)与mcr-1基因,通过测序确定CTX-M亚型;采用琼脂二倍稀释法和微量肉汤稀释法测定分离菌对12种抗菌药物的最小抑菌浓度(MIC);使用脉冲场凝胶电泳(PFGE)及多位点序列分型(MLST)分析菌株间的遗传背景;通过接合转移方法确定质粒水平转移的能力;使用复制子分型、S1-PFGE、Southern blotting方法检测质粒类型、耐药基因的定位及定位质粒的大小;通过三代测序及序列分析确定质粒的重组过程。【结果】共分离鉴定86株大肠杆菌,检测到44株携带CTX-M型ESBLs基因,其中blaCTX-M-55基因最流行(n=16,36.4%),其次是blaCTX-M-65(n=10,22.7%)、blaCTX-M-27(n=8,18.2%)、blaCTX-M-15(n=5,11.4%),还检测出blaCTX-M-79(n=2,4.5%)、blaCTX-M-14(n=2,4.5%)和blaCTX-M-24(n=1,2.3%)。10株blaCTX-M-65基因阳性菌有8株同时携带mcr-1基因。这8株大肠杆菌均表现为多药耐药,包括氨苄西林、阿莫西林、头孢噻呋、头孢喹肟、黏菌素等多种抗生素。8株菌共分为6种ST型、7个PFGE谱型。接合转移试验发现,有6株菌的blaCTX-M-65和mcr-1基因发生了共转移,且blaCTX-M-65与mcr-1基因均位于IncHI2型(253 kb)质粒上。其中1株菌在接合转移的过程中,其所携带的一个253 kb IncHI2质粒与一个69 kb IncFⅡ质粒发生融合,形成一个大小323 kb的融合质粒。对融合质粒进行三代测序解析,结果表明,在接合转移的过程中IS26介导了两个不同大小质粒的重组。【结论】IncHI2质粒是介导blaCTX-M-65和mcr-1基因共同传播的主要媒介,IS26通过与靶位点GTTTCACT的 展开更多
关键词 大肠杆菌 blactx-M-65 mcr-1 IS26 质粒融合
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新疆动物源携带blaCTX-M且对多黏菌素耐药大肠杆菌的耐药性及传播特性
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作者 王芋丹 王昊蕊 +5 位作者 王磊 队森·木拉力别克 苏战强 谢金鑫 米晓云 佟盼盼 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期312-318,共7页
为探究新疆动物源携带blaCTX-M且对多黏菌素耐药大肠杆菌的流行特征,采用K-B纸片法对40株猪、羊、骆驼、马、鸡、鹅、鸽、犬和猫源携带blaCTX-M且对多黏菌素耐药的大肠杆菌进行了药物敏感试验,利用PCR方法进行耐药基因、整合子检测以及... 为探究新疆动物源携带blaCTX-M且对多黏菌素耐药大肠杆菌的流行特征,采用K-B纸片法对40株猪、羊、骆驼、马、鸡、鹅、鸽、犬和猫源携带blaCTX-M且对多黏菌素耐药的大肠杆菌进行了药物敏感试验,利用PCR方法进行耐药基因、整合子检测以及质粒复制子分型,通过接合试验对多黏菌素耐药表型的水平转移进行了研究。结果显示,这些大肠杆菌对氨苄西林、阿莫西林、复方新诺明、头孢曲松、四环素、链霉素、头孢噻肟和庆大霉素的耐药率为82.5%~100%;对氟苯尼考、磷霉素、环丙沙星、左氧氟沙星、头孢他啶、阿奇霉素、阿米卡星和头孢吡肟耐药率为20.0%~67.5%;对哌拉西林/他唑巴坦、氨苄西林/舒巴坦、头孢西丁和亚胺培南的耐药率为2.5%~10.0%,均为多重耐药。40株受试株中,各耐药基因的检出情况,mcr-1,12.5%;blaCTX-M-1,85%;blaCTX-M-9,15%;blaTEM,60%;floR,70%;tetA,55%;tetG,17.5%;sul2,37.5%;sul1,17.5%;aadA1,35%;strA,32.5%;aac,17.5%;未检出mcr2~10、blaCTX-M-2、blaSHV、strB和tetE。共检出4种质粒复制子型,IncFIB,52.5%;IncHI2,20%;IncN,20%;IncFIA,7.5%。9株携带Ⅰ类整合子,未检出Ⅱ类整合子。40株受试菌均可水平转移多黏菌素耐药表型,但在接合子中未检测出耐药基因、质粒和整合子。结果表明,新疆动物源携带blaCTX-M且对多黏菌素耐药大肠杆菌多重耐药情况严重,耐药基因携带种类多样,均可水平转移多黏菌素耐药表型,应当谨慎使用多黏菌素,以期减缓耐药细菌的发展。 展开更多
关键词 携带blactx-M大肠杆菌 多黏菌素耐药 流行特征 动物 新疆
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养殖场中动物源大肠杆菌blaCTX-M-27基因的传播特征探究 被引量:2
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作者 张岩 龙薇 +3 位作者 林晓玲 孙银焕 蔡润茂 蒋红霞 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1934-1941,共8页
从2014年和2016年保存的来自河南、广东、山东和湖北4个省1 100株食品动物肠道大肠杆菌中筛选出58株blaCTX-M-27阳性菌株,采用药敏试验测定产blaCTX-M-27的大肠杆菌对20种抗生素的敏感性,并用PCR的方法检测其所携带的其他耐药基因;通过... 从2014年和2016年保存的来自河南、广东、山东和湖北4个省1 100株食品动物肠道大肠杆菌中筛选出58株blaCTX-M-27阳性菌株,采用药敏试验测定产blaCTX-M-27的大肠杆菌对20种抗生素的敏感性,并用PCR的方法检测其所携带的其他耐药基因;通过脉冲场凝胶电泳分析各菌株之间的亲缘关系,通过接合或转化试验、复制子分型和Southern blot对携带blaCTX-M-27的质粒特征进行分析。结果显示,58株blaCTX-M-27阳性大肠杆菌对除了β-内酰胺类外的其他抗生素,尤其氟喹诺酮类呈现高水平耐药;大多数菌株还同时携带2~3种编码其他抗生素的耐药基因。PFGE分型结果表明,来源于同一采样地及不同省的菌株存在克隆现象,但不同省或来自于同一省份的不同采样地之间的菌株亲缘关系较远;菌株携带的blaCTX-M-27基因全部定位在质粒上,其中38株位于可接合的IncFIB质粒,另外20株位于不可分型的质粒。 展开更多
关键词 大肠杆菌 食品动物 blactx-M-27基因 接合转移
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产超广谱β-内酰胺酶大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌blaCTX-M基因的检测 被引量:12
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作者 张阮章 王沙燕 +2 位作者 卢月梅 何林 陈升汶 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2004年第6期342-344,共3页
目的了解产CTXM型超广谱β内酰胺酶(ESBLs)大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌在深圳市人民医院的分布情况。方法应用美国国家临床实验室标准化委员会(NCCLS)推荐的表型确证试验,从2000年6月~2003年8月该院临床标本分离株中筛选出不重复的产ESBL... 目的了解产CTXM型超广谱β内酰胺酶(ESBLs)大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌在深圳市人民医院的分布情况。方法应用美国国家临床实验室标准化委员会(NCCLS)推荐的表型确证试验,从2000年6月~2003年8月该院临床标本分离株中筛选出不重复的产ESBLs菌株215株,其中大肠埃希菌151株,肺炎克雷伯菌64株,应用聚合酶链反应(PCR)检测所有产ESBLs株的bla(CTXM)基因。结果PCR结果显示,大肠埃希菌bla(CTXM)基因阳性率为92.1%(139/151),肺炎克雷伯菌的阳性率为65.6%(42/64)。bla(CTXM)基因阳性菌株主要来源于临床送检尿和痰标本,并广泛分布于20多个临床科室。结论该院临床分离的大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌产生的ESBL大多数为CTXM型,该类酶广泛分布于各临床科室,需引起重视。 展开更多
关键词 超广谱Β-内酰胺酶 聚合酶链反应 大肠埃希菌 肺炎克雷伯菌 blactx-M基因 PCR 抗生素
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江苏部分地区牛源大肠埃希菌耐药性分析与bla;流行情况调查 被引量:4
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作者 沈鹏程 周艳阳 +7 位作者 王燕 马振报 吴晗 崔超越 黄金林 陈祥 王晶 焦新安 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS 北大核心 2021年第5期7-12,共6页
为了解江苏部分地区牛源大肠埃希菌对常用抗生素的耐药状况及超广谱β-内酰胺酶基因bla_(CTX-M)的流行情况,2019年对江苏部分地区奶牛场和肉牛场分别采集159份肛拭样品、121份肛拭与粪便样品。采用麦康凯琼脂、PCR等方法对大肠埃希菌进... 为了解江苏部分地区牛源大肠埃希菌对常用抗生素的耐药状况及超广谱β-内酰胺酶基因bla_(CTX-M)的流行情况,2019年对江苏部分地区奶牛场和肉牛场分别采集159份肛拭样品、121份肛拭与粪便样品。采用麦康凯琼脂、PCR等方法对大肠埃希菌进行分离和鉴定,采用琼脂扩散法测定大肠埃希菌对15种抗菌药物的最小抑菌浓度,利用耐药基因测序检测bla_(CTX-M)。结果表明:280份样品中共分离到231株大肠埃希菌,分离率为82.5%,其中肉牛源94株,奶牛源137株。231株大肠埃希菌对四环素耐药率最高,为45.0%;其次为复方新诺明(44.1%)和氨苄西林(38.5%),对头孢唑啉、链霉素、氯霉素、氟苯尼考和萘啶酸的耐药率在10%~20%之间,对头孢噻肟、庆大霉素、环丙沙星和磷霉素耐药率均小于10%,对美罗培南、多黏菌素和阿米卡星全部敏感。除头孢噻肟外,肉牛场分离的大肠埃希菌耐药率均高于奶牛源大肠埃希菌耐药率,尤其是萘啶酸和复方新诺明(P<0.01)。18株头孢噻肟耐药菌株(7.8%)携带bla_(CTX-M)基因,主要为bla_(CTX-M-55)(n=9)和bla_(CTX-M-15)(n=5),此外还检测到bla_(CTX-M-64)、bla_(CTX-M-14)、bla_(CTX-M-27)和bla_(CTX-M-65)。10株大肠埃希菌可成功将bla_(CTX-M)基因转移至大肠埃希菌C600中。综上所述,江苏部分地区牛源大肠埃希菌对多种抗生素产生不同程度的耐药,肉牛源大肠埃希菌耐药率较奶牛源严重;牛源大肠埃希菌携带bla_(CTX-M)基因,以bla_(CTX-M-55)为主。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 bla_(ctx-M) 耐药性
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bla_(CTX-M)型鸡大肠杆菌中mcr-1的分子流行病学分析 被引量:1
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作者 李文娅 贾雅婷 +4 位作者 李垠树 丁海峰 孙华润 胡功政 苑丽 《江西农业学报》 CAS 2021年第7期99-103,共5页
检测了不同时期从河南省分离的162株bla_(CTX-M)型鸡大肠杆菌对黏菌素的耐药性,进行了耐药基因bla_(CTX-M)和mcr-1的质粒接合试验,并比较了各亚型的水平传播规律。结果表明:随着时间的推移,bla_(CTX-M)型鸡大肠杆菌对黏菌素的耐药率由0... 检测了不同时期从河南省分离的162株bla_(CTX-M)型鸡大肠杆菌对黏菌素的耐药性,进行了耐药基因bla_(CTX-M)和mcr-1的质粒接合试验,并比较了各亚型的水平传播规律。结果表明:随着时间的推移,bla_(CTX-M)型鸡大肠杆菌对黏菌素的耐药率由0%显著增加到42.2%;在头孢噻肟单药筛选下获得的21株接合子有5株同时携带mcr-1,在黏菌素单药筛选下获得的18株接合子有11株同时携带bla_(CTX-M),且bla_(CTX-M)和mcr-1基因的接合频率无明显差异;原菌及对应接合子的bla_(CTX-M)亚型均属于bla_(CTX-M-1)和bla_(CTX-M-9)亚群,部分原菌同时携带两种亚型,但接合子均仅携带一种亚型(bla_(CTX-M-9)亚群)。说明在单一药物(黏菌素或头孢噻肟)的选择性压力下,bla_(CTX-M)和mcr-1基因均易水平传播,且携带bla_(CTX-M)和mcr-1的质粒既可单独转移也可同时转移。 展开更多
关键词 mcr-1 bla_(ctx-M-1) bla_(ctx-M-9) 质粒接合 大肠杆菌 耐药性
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扬州某社区健康人源大肠杆菌bla_(CTX-M)的流行特征 被引量:1
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作者 邵逸乔 梅彩月 +5 位作者 蒋悦 卢恒帆 王振宇 刘梦月 焦新安 王晶 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期603-609,共7页
目的为调查扬州某社区健康人源大肠杆菌的耐药状况以及超广谱β-内酰胺酶基因bla_(CTX-M)的流行特征。方法2021年从扬州某社区健康人群中采集鼻拭子样品58份和粪便样品37份,通过麦康凯琼脂、PCR等方法进行大肠杆菌的分离和鉴定,采用琼... 目的为调查扬州某社区健康人源大肠杆菌的耐药状况以及超广谱β-内酰胺酶基因bla_(CTX-M)的流行特征。方法2021年从扬州某社区健康人群中采集鼻拭子样品58份和粪便样品37份,通过麦康凯琼脂、PCR等方法进行大肠杆菌的分离和鉴定,采用琼脂稀释法或微量稀释法测定药物敏感性,通过PCR扩增和测序检测bla_(CTX-M)基因,同时对bla_(CTX-M)阳性大肠杆菌进行全基因组测序。结果从95份样品中分离获得35株大肠杆菌。大肠杆菌对四环素耐药率最高为35.3%,其次为氨苄西林(30.6%)和萘啶酸(27.8%),对头孢他啶、头孢噻肟、庆大霉素、链霉素、复方新诺明的耐药率在10%~20%,对氯霉素、氟苯尼考、环丙沙星、磷霉素耐药率均在10%以下。4株(11.4%)对头孢噻肟耐药的菌株携带bla_(CTX-M)-1G基因,包括bla_(CTX-M)-55(n=3)和bla_(CTX-M)-15(n=1),其中1株可将bla_(CTX-M)接合转移至大肠杆菌C600。在bla_(CTX-M)基因的上游均存在1个拷贝的插入序列ISEcp 1或被IS 26截断的ISEcp 1。结论bla_(CTX-M)基因在扬州某社区健康人源大肠杆菌携带率低,其传播可能与ISEcp 1有关。 展开更多
关键词 大肠杆菌 bla_(ctx-M) 耐药性
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bla_(CTX-M),bla_(TEM),and bla_(SHV) in Enterobacteriaceae from North-Indian tertiary hospital:high occurrence of combination genes 被引量:2
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作者 Mohammed Shahid Anuradha Singh +4 位作者 Farrukh Sobia Mohammad Rashid Abida Malik Indu Shukla Haris Manzoor Khan 《Asian Pacific Journal of Tropical Medicine》 SCIE CAS 2011年第2期101-105,共5页
Objective:To delineate the frequency of occurrence of bla_(CTX-M),bla_(TEM),and bla_(SHV) in Enterobacteriaceae from North-Indian tertiary hospital.Methods:A random collection of a subset of 45 Escherichia coli(E.coli... Objective:To delineate the frequency of occurrence of bla_(CTX-M),bla_(TEM),and bla_(SHV) in Enterobacteriaceae from North-Indian tertiary hospital.Methods:A random collection of a subset of 45 Escherichia coli(E.coli) and 28 Klebsiella pneumoniae(K.pneumoniae) that was resistant to a third generation cephalosporin and obtained during 2007-2008 was selected for detailed screening for bla_(CTX-M),bla_(TEM),and bla_(SHV) by monoplex PCRs.The isolates demonstrating the presence of bla_(CTX-M) alleles were characterized for the specific CTX-M-genogroup by using a multiplex PCR.Results:Resistance to cefoperazone,ceftazidime,ceftriaxone,cefotaxime, cefoxitin and piperacillin was 100%each in K.pneumoniae isolates,whereas these resistancerates for E.coli isolates were 93.1%,83.8%,91.9%,93.6%,97.3%and 97.1%,respectively. Concomitant resistance to aminoglycosides,quinolones and aztreonam was also noticed.Presence of any of the bla genes(bla_(CTX-M),bla_(TEM),and bla_(SHV)) was noticed in a total of 28(38.4%) isolates of the 73 isolates studied.Many isolates demonstrated occurrence of these genes in various combinations.bla_(CTX-M),bla_(TEM),and bla_(SHV) were noticed in 28.8%,10.9%and 13.7%isolates, respectively.Multiplex PCR in bla_(CTX-M) harboring isolates demonstrated the presence of CTX-MGenogroup -1 and sequencing for the specific CTX-M-type revealed presence of CTX-M-15 type. RAPD typing showed wide diversity in isolates.Conclusions:This is amongst the premier report describing the simultaneous occurrence of blo_(TEM),bla_(SHV),and bla_(ampC) in Indian Enterobacteriaceae and that wider dissemination of these genes,as demonstrated by diversity of isolates,raises concern and emphasizes a need for extensive search for the presence of these gene pools in Indian subcontinent. 展开更多
关键词 Resistance genes bla_(ctx-M-15) bla_(TEM) bla_(SHV) Concomitant-occurrence ENTEROBACTERIACEAE
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Characterization of a bla_(CTX-M-3),bla_(KPC-2)and bla_(TEM-1B)co-producing IncN plasmid in Escherichia coli of chicken origin
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作者 WANG Wen-jing WANG Yi-fu +7 位作者 JIN Ya-jie SONG Wu-qiang LIN Jia-meng ZHANG Yan TONG Xin-ru TU Jian LI Rui-chao LI Tao 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2023年第1期320-324,共5页
An extensively drug-resistant(XDR)Escherichia coli strain 258E was isolated from an anal swab sample of a chicken farm of Anhui province in China.Genomic analyses indicated that the strain 258E harbors an incompatibil... An extensively drug-resistant(XDR)Escherichia coli strain 258E was isolated from an anal swab sample of a chicken farm of Anhui province in China.Genomic analyses indicated that the strain 258E harbors an incompatibility group N(IncN)plasmid pEC258-3,which co-produces bla_(CTX-M-3),bla_(KPC-2),bla_(TEM-1B),qnrS1,aac(6')-Ib-cr,dfrA14,arr-3,and aac(6')-Ib3.Multiple genome arrangement analyses indicated that pEC258-3 is highly homologous with pCRKP-1-KPC discovered in Klebsiella pneumoniae from a patient.Furthermore,conjugation experiments proved that plasmid pEC258-3 can be transferred horizontally and may pose a significant potential threat in animals,community and hospital settings. 展开更多
关键词 bla_(ctx-M-3) bla_(KPC-2) bla_(TEM-1B) IncN PLASMID Escherichia coli
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