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叶面喷水影响芒果叶片“午休”的转录组分析
1
作者
丁雨格
侯琪
+3 位作者
周玲
计珠琳
吕鹏悦
彭磊
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期1094-1104,共11页
【目的】通过组学技术研究持续喷水处理对芒果叶片产生的影响,揭示喷水处理影响“午休”的分子机制,进一步优化喷水处理条件,为达到最佳效果提供科学依据,并对提高芒果产量和品质以及响应国家减肥增效政策具有理论意义。【方法】以元江...
【目的】通过组学技术研究持续喷水处理对芒果叶片产生的影响,揭示喷水处理影响“午休”的分子机制,进一步优化喷水处理条件,为达到最佳效果提供科学依据,并对提高芒果产量和品质以及响应国家减肥增效政策具有理论意义。【方法】以元江“台农一号”芒果为材料,对坐果期芒果在“午休”时段(12:30—14:10)喷水3次,每次喷水20 min,间隔20 min,以不喷水为对照,并以2组3个不同时期叶片进行Illumina Hi SeqTM 6000高通量转录组测序分析,用GO和KEGG数据库分析“午休”时段喷水和不喷水处理的差异表达基因(DEGs)。用差异表达基因分析工具(DESeq)对基因表达进行差异分析,以|log_(2)α_(FC)|>1,P<0.05为筛选差异表达基因的条件。【结果】3个时期分别获得3789,2885,1667个差异表达基因。GO分析表明差异基因与细胞组分分类中的膜、膜的固有成分、膜的组成成分等密切相关,KEGG分析差异表达基因主要富集在植物激素信号转导、植物MAPK信号通路、植物昼夜节律、氨基糖和核苷酸糖的代谢、类黄酮生物合成、光合生物碳固定、角质和亚硫酸盐及蜡的生物合成、卟啉和叶绿素的代谢、淀粉和蔗糖代谢以及甘油酯质代谢等途径。根据富集结果筛选8个差异表达基因,经实时荧光定量验证,基因表达趋势与转录组测序结果相符。【结论】CAO和POR基因表达延后,表明喷水处理可延长叶绿素的合成时间;FBP和SBP的基因表达略微降低,表明叶面喷水调控基因的表达量降至缓解芒果“午休”的最适范围内,有利于树体积累碳同化物,从而提高光合效率。
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关键词
芒果
光合午休
转录组
叶绿素生物合成
光合生物碳固定
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职称材料
蓝细菌ORF469的分子克隆和缺失突变工程株的构建
被引量:
4
2
作者
吴庆余
Wim.F.J.Vermaas
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
1996年第3期311-317,共7页
PCR扩增了蓝细菌Synechocystis sp.PCC 6803的ORF469(编码469个氨基酸的开放阅读框),进一步以pUC118为载体将其克隆到E.coli中,构建了pOQ2质粒。通过DNA体外重组,以红霉素抗性基因取代部分克隆化ORF469片段,又构建了缺失ORF469片段(保...
PCR扩增了蓝细菌Synechocystis sp.PCC 6803的ORF469(编码469个氨基酸的开放阅读框),进一步以pUC118为载体将其克隆到E.coli中,构建了pOQ2质粒。通过DNA体外重组,以红霉素抗性基因取代部分克隆化ORF469片段,又构建了缺失ORF469片段(保留部分上游和下游序列)的pOQ22质粒。用pOQ22质粒转化Synechocystis sp.PCC 6803野生株细胞,获ORF469缺失突变工程株,它在红霉素抗性培养基上生长正常。对缺失突变工程株DNA的PCR和Southern blot分析证明,Synechocystis sp.PCC 6803的ORF469已被删除。色素测定结果揭示Synechocystis sp.PCC 6803中ORF469表达产物控制细胞内不依赖光的叶绿素生物合成。
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关键词
蓝细菌
基因工程
ORF469分子克隆
缺失突变
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职称材料
题名
叶面喷水影响芒果叶片“午休”的转录组分析
1
作者
丁雨格
侯琪
周玲
计珠琳
吕鹏悦
彭磊
机构
云南农业大学园林园艺学院
云南农业大学茶学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期1094-1104,共11页
基金
云南省重大科技专项——绿色食品国际合作研究中心课题(2019ZG00907)
云南省基础研究专项重大项目(202101BC070002)。
文摘
【目的】通过组学技术研究持续喷水处理对芒果叶片产生的影响,揭示喷水处理影响“午休”的分子机制,进一步优化喷水处理条件,为达到最佳效果提供科学依据,并对提高芒果产量和品质以及响应国家减肥增效政策具有理论意义。【方法】以元江“台农一号”芒果为材料,对坐果期芒果在“午休”时段(12:30—14:10)喷水3次,每次喷水20 min,间隔20 min,以不喷水为对照,并以2组3个不同时期叶片进行Illumina Hi SeqTM 6000高通量转录组测序分析,用GO和KEGG数据库分析“午休”时段喷水和不喷水处理的差异表达基因(DEGs)。用差异表达基因分析工具(DESeq)对基因表达进行差异分析,以|log_(2)α_(FC)|>1,P<0.05为筛选差异表达基因的条件。【结果】3个时期分别获得3789,2885,1667个差异表达基因。GO分析表明差异基因与细胞组分分类中的膜、膜的固有成分、膜的组成成分等密切相关,KEGG分析差异表达基因主要富集在植物激素信号转导、植物MAPK信号通路、植物昼夜节律、氨基糖和核苷酸糖的代谢、类黄酮生物合成、光合生物碳固定、角质和亚硫酸盐及蜡的生物合成、卟啉和叶绿素的代谢、淀粉和蔗糖代谢以及甘油酯质代谢等途径。根据富集结果筛选8个差异表达基因,经实时荧光定量验证,基因表达趋势与转录组测序结果相符。【结论】CAO和POR基因表达延后,表明喷水处理可延长叶绿素的合成时间;FBP和SBP的基因表达略微降低,表明叶面喷水调控基因的表达量降至缓解芒果“午休”的最适范围内,有利于树体积累碳同化物,从而提高光合效率。
关键词
芒果
光合午休
转录组
叶绿素生物合成
光合生物碳固定
Keywords
mango
photosynthetic
midday-depression
transcriptome
biosynthesis
of
chlorophyll
carbon
fixation
in
photosynthetic
organisms
分类号
S667.7 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
蓝细菌ORF469的分子克隆和缺失突变工程株的构建
被引量:
4
2
作者
吴庆余
Wim.F.J.Vermaas
机构
清华大学生物科学与技术系
Department of Botany
出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
1996年第3期311-317,共7页
基金
美国能源部基金(DE-FG02-89ER 14031)
中国国家杰出青年科学基金课题
文摘
PCR扩增了蓝细菌Synechocystis sp.PCC 6803的ORF469(编码469个氨基酸的开放阅读框),进一步以pUC118为载体将其克隆到E.coli中,构建了pOQ2质粒。通过DNA体外重组,以红霉素抗性基因取代部分克隆化ORF469片段,又构建了缺失ORF469片段(保留部分上游和下游序列)的pOQ22质粒。用pOQ22质粒转化Synechocystis sp.PCC 6803野生株细胞,获ORF469缺失突变工程株,它在红霉素抗性培养基上生长正常。对缺失突变工程株DNA的PCR和Southern blot分析证明,Synechocystis sp.PCC 6803的ORF469已被删除。色素测定结果揭示Synechocystis sp.PCC 6803中ORF469表达产物控制细胞内不依赖光的叶绿素生物合成。
关键词
蓝细菌
基因工程
ORF469分子克隆
缺失突变
Keywords
ORF469
cloning,
deletion
mutant,
light-indepentent
biosynthesis
of
chlorophyll
分类号
Q949.220.3 [生物学—植物学]
Q789
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
叶面喷水影响芒果叶片“午休”的转录组分析
丁雨格
侯琪
周玲
计珠琳
吕鹏悦
彭磊
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
蓝细菌ORF469的分子克隆和缺失突变工程株的构建
吴庆余
Wim.F.J.Vermaas
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
1996
4
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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