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Bacterial flora concurrent with Helicobacter pylori in the stomach of patients with upper gastrointestinal diseases 被引量:20
1
作者 Yuan Hu Li-Hua He Di Xiao Guo-Dong Liu Yi-Xin Gu Xiao-Xia Tao Jian-Zhong Zhang 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2012年第11期1257-1261,共5页
AIM: To investigate the non-He/icobacterpy/ori (H. pylori) bacterial flora concurrent with H. pylori infection.METHODS: A total of 103 gastric biopsy specimens from H. pylori positive patients were selected for ba... AIM: To investigate the non-He/icobacterpy/ori (H. pylori) bacterial flora concurrent with H. pylori infection.METHODS: A total of 103 gastric biopsy specimens from H. pylori positive patients were selected for bacterial culture. All the non-H, pylori bacterial isolates were identified by matrix assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS).RESULTS: A total of 201 non-H, pyiori bacterial isolates were cultivated from 67 (65.0%) of the 103 gastric samples, including 153 isolates identified successfully at species level and 48 at genus level by MALDI-TOF MS. The dominant species were Streptococcus, Neisseria, Rothla and Staphylococcus, which differed fromthe predominantly acid resistant species reported previously in healthy volunteers. The prevalence of non-H. pylori bacteria was higher in non-ulcer dyspepsia group than in gastric ulcer group (100% vs 42.9%, P 〈 0.001). Six bacterial species with urease activity (Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus warneri, Staphylococcus capitis, Staphylococcus aureus, Brevibacteriurn spp. and Klebsiella pneumoniae) were also isolated.CONCLUSION: There is a high prevalence of the non-H, pylori bacteria concurrent with H. pylori infection, and the non-H, pylori bacteria may also play important as-yet-undiscovered roles in the pathogenesis of stomach disorders. 展开更多
关键词 Non-Helicobacter pylori' bacterial flora Gastrointestinal diseases Matrix-assisted laser desorp-tion ionization time-of-flight mass spectrometry
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关于子宫内膜异位症发病机制与肠道菌群关系的思考 被引量:9
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作者 胡小松 孙宇峰 +2 位作者 李婷 刘敬阁 刘春生 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期196-203,共8页
子宫内膜异位症(简称内异症)作为困扰育龄期女性健康的多发性疾病,近几年来发病率逐年上升,且趋于年轻化。目前,内异症的发病机制尚不完全清楚,治愈率不高且极易复发。近年来研究表明人体是由大量微生物组成的共生体,尤其是肠道内微生... 子宫内膜异位症(简称内异症)作为困扰育龄期女性健康的多发性疾病,近几年来发病率逐年上升,且趋于年轻化。目前,内异症的发病机制尚不完全清楚,治愈率不高且极易复发。近年来研究表明人体是由大量微生物组成的共生体,尤其是肠道内微生物与机体健康密切相关。该文以内异症前期研究为基础,提出其发病机制可能与患者肠道微生物紊乱有关,为寻找内异症的治疗方法提供新思路与参考。 展开更多
关键词 子宫内膜异位症 肠道菌群失调 细菌内毒素 上皮-间质转化 免疫耐受 脂多糖 癥瘕
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贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)JJYY防控土传病害效果评价及其全基因组测序分析和抗菌成分鉴定 被引量:3
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作者 王麒 许婧霞 +7 位作者 张亚妮 孙婧 张升潮 王腊 冯作山 易菊平 杨亚珍 胡洪涛 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期155-171,共17页
【背景】土传病害是世界农业可持续发展的关键限制因子,在我国蔬菜和中药材上发生日趋严重,引起严重的连作障碍。生物防治对环境和农产品安全,是目前研究的热点和重点。【目的】明确对土传病原菌具有广谱抗菌活性菌株JJYY的种类及其防... 【背景】土传病害是世界农业可持续发展的关键限制因子,在我国蔬菜和中药材上发生日趋严重,引起严重的连作障碍。生物防治对环境和农产品安全,是目前研究的热点和重点。【目的】明确对土传病原菌具有广谱抗菌活性菌株JJYY的种类及其防控效果和主要抗菌产物,为新型生物农药开发奠定基础。【方法】结合扫描电镜观察、生理生化分析和16S rRNA基因扩增测序技术鉴定菌株JJYY。分别利用比浊法和菌丝生长抑制法测定该菌提取物对4种土传病原细菌和5种土传病原真菌的EC50,利用盆栽试验评价对番茄青枯病等病害的防控效果。利用二代Illumina NovaSeq与三代PacBioSequel相结合测序技术对菌株JJYY进行全基因组测序,使用PGAP等软件进行基因注释等分析,利用反相制备液相色谱和质谱初步分离鉴定抗菌物质。【结果】菌株JJYY是一株贝莱斯芽孢杆菌(Bacillusvelezensis),该菌提取物对4种土传细菌和5种土传真菌的EC50分别为0.940-1.092 mg/mL和2.733-3.678 mg/mL。对番茄青枯病、菊花根腐病和辣椒枯萎病的最高防效在80.00%-87.74%之间,与化学药剂链霉素或噁霉灵无显著差异(P>0.05)。该菌基因组大小为3929792 bp,编码3895个基因,与B.velezensis JS25R和B.subtilis 168具有3445个和2997个同源编码基因。预测该基因组共有12个次级代谢产物合成功能基因簇。从该菌株提取物中共分离出9种抗菌组分,其中2个初步判定为已知大环内酯类抗生素macrolactin D和7-O-malonyl-macrolactin A。【结论】菌株JJYY是一株对土传病原细菌和真菌病害均有较高防效的贝莱斯芽孢杆菌,该菌基因组与已知贝莱斯芽孢杆菌不同,并产生多种已知和未知的抗菌物质,继续深入分析鉴定其抗菌物质和抗菌机制将为开发新型高效的生物农药奠定良好基础。 展开更多
关键词 贝莱斯芽孢杆菌 土传病害 青枯病 抗菌活性 反相制备液相色谱 质谱
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MALDI-TOF MS用于碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌同源性分析的初步研究 被引量:8
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作者 张仁峰 张炳昌 +3 位作者 邵春红 范会 王丽萍 金炎 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期589-595,共7页
目的 评价基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术对碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CRKPN)同源性分析的能力.方法 收集山东大学附属省立医院儿科病房及心外科病房2011年4月至2013年10月分离的21株CRKPN菌株,分别采用脉冲... 目的 评价基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术对碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CRKPN)同源性分析的能力.方法 收集山东大学附属省立医院儿科病房及心外科病房2011年4月至2013年10月分离的21株CRKPN菌株,分别采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)、多位点序列分型(MLST)及MALDI-TOF MS技术进行回顾性同源性分析.结果 MALDI-TOF MS将21株CRKPN菌株根据亲缘关系远近分为三群,其中17例菌株为II群,同源性高于75%,从获得的17株菌的蛋白质谱图结果分析,其蛋白峰大致一致,由此推断其亲缘关系比较接近,与PFGE和MLST结果基本一致.而同源性较低(〈60%)的H13与上述菌株存在差异,尤其在分子量4365、5381及6289处蛋白峰有显著差异,PFGE分析显示H13与其他菌株的同源性为61.0%,MLST分型为ST54.结论 MALDI-TOF MS技术能够准确对碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌进行同源性分析,较之其他同源性分析方法,快速方便,可满足医院感染工作的需求,及时防止耐药菌株在医院感染的爆发与流行. 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 碳青霉烯类 抗药性 细菌 序列同源性 光谱法 质量 基质辅助激光解吸电离
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MALDI-TOF MS技术快速区分携带rmpA2毒力基因的高毒力肺炎克雷伯菌 被引量:6
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作者 孙巧玲 舒玲斌 +2 位作者 胡洁 胡燕燕 张嵘 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期571-576,共6页
目的 评价基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术快速区分携带rmpA2毒力基因的高毒力肺炎克雷伯菌的能力.方法 对浙江大学医学院附属第二医院和河南省人民医院的57株肺炎克雷伯菌,PCR扩增rmpA2毒力基因和荚膜血清型基... 目的 评价基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术快速区分携带rmpA2毒力基因的高毒力肺炎克雷伯菌的能力.方法 对浙江大学医学院附属第二医院和河南省人民医院的57株肺炎克雷伯菌,PCR扩增rmpA2毒力基因和荚膜血清型基因,多位点序列分型方法(MLST)进行分型,拉丝试验进行高黏液表型测定.MALDI-TOF MS对肺炎克雷伯菌进行鉴定并对峰图进行二维分析和算法统计,包括采用支持向量机算法(SVM),遗传算法(GA),监督使神经网络算法(SNN)和快速分类算法(QC)进行数据分析并建立相应模型,得到分型区分的特征峰.结果 57株肺炎克雷伯菌中有28株携带rmpA2毒力基因,MLST均为ST11型,其中拉丝试验阳性有5株;29株不携带rmpA2毒力基因,主要ST型为ST11(n=23),还包括ST15(n=3),ST1、ST76和ST473各一株.质谱将肺炎克雷伯菌较清晰地划分成两个区域,ClinProTools软件可准确区分84.2%(48/57)的菌株.ClinProTools软件四种算法结果基本相似,SVM特异性和灵敏度最高,分别为93.23%和100%.采用ClinProTools对质谱峰进行统计显示,得到区分rmpA2基因阳性组和阴性组的2个特征峰分别为7168.9和7280.76,在峰强度上存在一定的差异.结论 MALDI-TOF MS快速区分携带rmpA2毒力基因的高毒力肺炎克雷伯菌方法灵敏度和特异性都在90%以上,得到两个特征峰在峰强度上存在一定差异,需进一步验证. 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 细菌蛋白质类 转录因子 光谱法 质量 基质辅助激光解吸电离
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MALDI-TOF MS用于碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌同源分析的应用评价 被引量:6
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作者 李鑫 赵强 +1 位作者 叶丽艳 杨继勇 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期435-439,共5页
目的评价基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOFMS)技术在碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CRKp)同源性分析中应用的可行性。方法回顾性分析。收集2017年1月至12月全军细菌耐药监测网上海长海医院临床标本分离的肺炎克雷伯菌非重复菌株5... 目的评价基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOFMS)技术在碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CRKp)同源性分析中应用的可行性。方法回顾性分析。收集2017年1月至12月全军细菌耐药监测网上海长海医院临床标本分离的肺炎克雷伯菌非重复菌株57株,新疆乌鲁木齐市第一医院临床标本分离的肺炎克雷伯菌非重复菌株36株;纳入标准:对亚胺培南、美罗培南或厄他培南当中任一药物耐药菌株并鉴定质谱蛋白峰数大于100的菌株,共计39株;以脉冲场凝胶电泳(PFGE)结果为依据,将待测菌株分为以下三组:高度同源组(包括产OXA-48型CRKp菌株17株)、中度同源组(产KPC型CRKp菌株16株)和非同源性组(包括携带其他耐药机制的CRKp菌株8株)。所有待测菌株经MALDI-TOFMS分析后,所获结果分别采用BioNumeric软件和质谱仪自带的同源性分析软件(SARAMIS数据库软件)的两种分析方法进行同源性分析。以PFGE分析结果为参考标准,评价其他三种分析方法所获结果的可靠性。结果对高度同源组菌株,采用SARAMIS两种分析方法分析KA-A型质谱数据Identicalmass值高于80%,相似度高于85%,能够获得与PFGE分析结果较一致的结果;对非同源组的菌株,SARAMIS两种分析方法分析质谱数据Identicalmass值低于80%,相似度不足85%,所获分型结果与PFGE结果有较好的一致性,能够反映菌株间的差异性;对中度同源组菌株,BioNumeric软件和SARAMIS数据库软件分析质谱数据KC-A型的identitymass值不足70%;相似度不足90%,所获得的结果与PFGE结果之间均存在着较大的差异,无法获得与PFGE结果相一致的分析结果。结论MALDI-TOFMS结果采用BioNumeric软件和SARAMIS数据库软件进行同源性分析可作为具有高度同源性和非同源菌株间同源关系的初筛方法,但仍需要其他方法加以验证;对同源关系多样的菌株,上述方法仍缺乏稳定性,不适于进行菌株间同源关系分析。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 碳青霉烯类 抗药性 细菌 光谱法 质量 基质辅助激光解吸电离 电泳 凝胶 脉冲场
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1521株多重耐药菌的耐药情况及院内感染分析 被引量:6
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作者 田晓波 潘书娟 +2 位作者 张桂 刘宇 董宝坤 《中国医师杂志》 CAS 2017年第3期403-406,共4页
目的分析多重耐药菌(MDR)的耐药情况及院内感染情况,指导临床合理使用抗生素。方法北京同仁医院2015年1月至12月分离1 521株MDR,采用基质辅助激光解吸-电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF MS)细菌鉴定,VITEK-2 Compact和KB法进行药敏... 目的分析多重耐药菌(MDR)的耐药情况及院内感染情况,指导临床合理使用抗生素。方法北京同仁医院2015年1月至12月分离1 521株MDR,采用基质辅助激光解吸-电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF MS)细菌鉴定,VITEK-2 Compact和KB法进行药敏试验。结果1 521株MDR中,鲍曼不动杆菌589株(38.7%),院内感染率16.6%;大肠埃希菌350株(23.0%),院内感染率9.0%;金黄色葡萄球菌249株(16.4%),院内感染率2.7%;肺炎克雷伯菌171株(11.2%),院内感染率14.3%;铜绿假单胞菌150株(9.9%),院内感染率64.7%;屎肠球菌12株(0.8%),院内感染率16.7%。多重耐药鲍曼不动杆菌(MDR-AB)、多重耐药铜绿假单胞菌(MDR-PAE)、超广谱β-内酰胺酶(ESBL)+大肠埃希菌和ESBL+肺炎克雷伯菌对亚胺培南耐药率分别为100%、91.5%、0.6%和55.6%。结论MDR-PAE、MDR-AB和ESBL+肺炎克雷伯菌耐药严重,院内感染率高。 展开更多
关键词 抗药性 细菌 细菌/药物作用 交叉感染 微生物敏感性试验 光谱法 质量 基质 辅助激光解吸电离
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地衣芽胞杆菌ACCC 01957产芽胞碳源组合研究
8
作者 马聪聪 马锐 +2 位作者 王云山 宋国彪 顾金刚 《微生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期40-47,共8页
地衣芽胞杆菌(Bacillus licheniformis)是微生物发酵饲料常用菌。本研究旨在通过优化发酵过程中最重要的碳源因子来提高地衣芽胞杆菌菌株ACCC 01957的菌体量和芽胞产量。首先基于ACCC 01957对Biolog GenⅢ 板的71种碳源进行利用效率筛选... 地衣芽胞杆菌(Bacillus licheniformis)是微生物发酵饲料常用菌。本研究旨在通过优化发酵过程中最重要的碳源因子来提高地衣芽胞杆菌菌株ACCC 01957的菌体量和芽胞产量。首先基于ACCC 01957对Biolog GenⅢ 板的71种碳源进行利用效率筛选,再采用全自动细胞生长曲线仪分析优势碳源对生物量、生长周期及产孢率的影响,并在摇瓶水平上确定最佳发酵碳源。结果表明,菌株ACCC 01957可以较好地利用25种碳源,其中N-乙酰-β-D-甘露糖胺、D-半乳糖、L-鼠李糖、肌苷、甘油、果胶、L-乳酸、吐温-40、L-天冬氨酸、L-谷氨酸和L-焦谷氨酸可以促进其生长和产孢,而D-山梨醇促生长抑产孢;在摇瓶水平上以葡萄糖和L-鼠李糖为复合碳源(添加比例为16)时,培养24 h的菌体总量为8.3×10^(8) cfu/mL,培养48 h的产孢产率高达91.19%。通过产芽胞碳源组合构建提高了地衣芽胞杆菌ACCC 01957的生长、产芽胞率和产芽胞量。 展开更多
关键词 地衣芽胞杆菌 菌体量 产芽胞率 碳源优化
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砂岩注水储层细菌堵塞时空演化定量模拟技术 被引量:3
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作者 蒋官澄 孙喆 +4 位作者 盛科鸣 董腾飞 朱鸿昊 贺垠博 张耀元 《中国石油大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第6期110-118,共9页
注水开发是油气田最主要的开发方式,但注入水中的硫酸盐还原菌、腐生菌等在适宜条件下会在地层中大量增殖,堵塞储层孔喉,造成储层渗透率和注水量大幅下降等。在综合分析影响细菌堵塞因素条件下,采用多孔介质传热、传质理论,进行矿场尺... 注水开发是油气田最主要的开发方式,但注入水中的硫酸盐还原菌、腐生菌等在适宜条件下会在地层中大量增殖,堵塞储层孔喉,造成储层渗透率和注水量大幅下降等。在综合分析影响细菌堵塞因素条件下,采用多孔介质传热、传质理论,进行矿场尺度下砂岩注水储层细菌堵塞数值模拟研究,并利用正交网格差分、五点隐式法进行数值求解,得到不同时期细菌量、营养物质量、储层损害程度的空间分布状况,实现细菌对储层损害的时空演化定量模拟。结果表明:细菌损害注水储层多发生于近井壁2~3 m区域,在适宜细菌生长条件下将导致注水储层渗透率降低超过90%;储层温度和注水速率是影响细菌损害储层的主要因素,降低温度有利于细菌繁殖而增加损害程度,降低注水速度将增加细菌对井眼周围储层的损害程度,增加注水速度则有利于减轻损害。 展开更多
关键词 注水储层 细菌堵塞 传质 传热 数值模拟
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Mass spectrometry-based proteomic approaches to study pathogenic bacteria-host interactions 被引量:1
10
作者 Yufei Yang Mo Hu Kaiwen Yu Xiangmei Zeng Xiaoyun Liu 《Protein & Cell》 SCIE CAS CSCD 2015年第4期265-274,共10页
Elucidation of molecular mechanisms underlying host- pathogen interactions is important for control and treatment of infectious diseases worldwide. Within the last decade, mass spectrometry (MS)-based proteomics has... Elucidation of molecular mechanisms underlying host- pathogen interactions is important for control and treatment of infectious diseases worldwide. Within the last decade, mass spectrometry (MS)-based proteomics has become a powerful and effective approach to better understand complex and dynamic host-pathogen inter- actions at the protein level. Herein we will review the recent progress in proteomic analyses towards bacterial infection of their mammalian host with a particular focus on enteric pathogens. Large-scale studies of dynamic proteomic alterations during infection will be discussed from the perspective of both pathogenic bacteria and host cells. 展开更多
关键词 mass spectrometry PROTEOMICS bacterial infection host-pathogen interactions
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Extended activated sludge model no. 1 (ASM1) for simulating biodegradation process using bacterial technology 被引量:1
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作者 Ya-jing SONG Yue-bo XIE Doddi YUDIANTO 《Water Science and Engineering》 EI CAS 2012年第3期278-290,共13页
Phosphorus is one of the most important nutrients required to support various kinds of biodegradation processes. As this particular nutrient is not included in the activated sludge model no. 1 (ASM1), this study ext... Phosphorus is one of the most important nutrients required to support various kinds of biodegradation processes. As this particular nutrient is not included in the activated sludge model no. 1 (ASM1), this study extended this model in order to determine the fate of phosphorus during the biodegradation processes. When some of the kinetics parameters are modified using observed data from the restoration project of the Xuxi River in Wuxi City, China, from August 25 to 31 in 2009, the extended model shows excellent results. In order to obtain optimum values of coefficients of nitrogen and phosphorus, the mass fraction method was used to ensure that the final results were reasonable and practically relevant. The temporal distribution of the data calculated with the extended ASM1 approximates that of the observed data. 展开更多
关键词 stream restoration bacterial technology extended activated sludge model no. 1(ASM1) mass fraction Xuxi River
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δ溶血素G10S突变与β溶血素联合检测对金黄色葡萄球菌ST59型的鉴定作用 被引量:1
12
作者 王妍乐 罗振 +3 位作者 邱怡瑄 佘鹏飞 陈丽华 伍勇 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期464-468,共5页
目的探讨δ溶血素G10S突变(HldG10S)与β溶血素(β-toxin)联合检测对金黄色葡萄球菌ST59型的鉴定作用。方法收集中南大学湘雅三医院检验科2017年11月至2018年4月非重复分离的82株金黄色葡萄球菌临床菌株,通过基质辅助激光解吸电离飞行... 目的探讨δ溶血素G10S突变(HldG10S)与β溶血素(β-toxin)联合检测对金黄色葡萄球菌ST59型的鉴定作用。方法收集中南大学湘雅三医院检验科2017年11月至2018年4月非重复分离的82株金黄色葡萄球菌临床菌株,通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOFMS)对菌株进行常规鉴定并获取菌株的质谱图,根据δ溶血素(Hld)的m/z表达强度,将所有菌株分为HldG10S(3036±2.0)m/z、Hld(3006±2.0)m/z及ND(无δ溶血素质谱峰)3个组,利用多位点序列分型(MLST)方法检测各组ST59型分布情况,并采用反向协同溶血试验进行β-toxin表型测定,比较HldG10S、β-toxin单项和联合检测鉴定ST59的敏感度、特异度和准确度。结果82株菌中21株表达HldG10S毒素,占25.6%;39株表达Hld毒素,占47.6%;22株不表达HldG10S与Hld毒素,占26.8%。HldG10S组中16株为ST59,占76.19%(16/21);Hld与ND两组中均无ST59。HldG10S组中16株ST59菌株均产β-toxin,而5株非ST59菌株均未检测到β-toxin产生。HldG10S与β-toxin联合检测鉴定ST59的特异度(100%)与准确度(100%)显著高于HldG10S、β-toxin单项检测的特异度(92.4%,77.3%)和准确度(80.5%,81.7%)(χ2=19.472,P<0.001;χ2=17.792,P<0.001)。结论HldG10S与β-toxin联合检测能初步快速鉴定ST59,可辅助常规监测金黄色葡萄球菌流行变化趋势。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 细菌蛋白质类 溶血素蛋白质类 突变 光谱法 质量 基质辅助激光解吸电离
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金黄色葡萄球菌agr和sigB调控系统的MALDI-TOF质谱m/z特征分析 被引量:1
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作者 刘晔华 王猛 +2 位作者 江雁 张坚磊 穆红 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期438-441,共4页
目的通过分析金黄色葡萄球菌的质谱图m/z特征,评估菌体的agr和sigB调节系统的表达情况以及菌体在宿主体内的感染状态。方法回顾性分析,选取天津市第一中心医院2013年6月至2014年2月保藏的基因分型特征明确的金黄色葡萄球菌50株,通过... 目的通过分析金黄色葡萄球菌的质谱图m/z特征,评估菌体的agr和sigB调节系统的表达情况以及菌体在宿主体内的感染状态。方法回顾性分析,选取天津市第一中心医院2013年6月至2014年2月保藏的基因分型特征明确的金黄色葡萄球菌50株,通过VitekMS质谱的科研(RUO)模式获取菌株的质谱图,分析代表agr和sigB系统的m/z表达强度,应用SARAMIS软件构建基于质谱峰特征的系统发育树。结果50株金黄色葡萄球菌分为急性感染和慢性持续、复发感染两种类型,前者的delta毒素表达强度99.2±4.1,后者为60.5±10.1,t=16.83,P〈0.05;慢性持续、复发感染的sigB系统的调控增强,SAS030、SAS049和SA0772蛋白的表达强度分别为27.1±14.7、54.8±21.5和51.6±19.2,急性感染阶段相对应3种蛋白的表达强度分别是4.9±1.9、12.4±2.8和15.7±6.9,二者相比£值分别为-6.88、-8.98和-1.87,P值均小于0.05。生物膜形成相关的酚溶调制肽(PSMs)表达强度不一,金黄色葡萄球菌小菌落变异型菌株的PSMα3相对强度为100%。结论通过agr和sigB调控系统的表达情况,可以评估金黄色葡萄球菌感染宿主的不同状态,MALDI—TOF质谱技术获取的m/z特征能够直观快捷地判断这一状态,该技术的深度应用有待进一步开发。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 细菌蛋白质类 反式激活因子类 光谱法 质量 基质辅助 激光解吸电离
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应用VitekMS质谱检测PSM—mec对医院感染MRSA快速分型
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作者 刘晔华 王猛 +4 位作者 刘萍 陈锦艳 邢迎红 张坚磊 穆红 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期843-847,共5页
目的评估VitekMS质谱快速检测PSM—mee在医院感染耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)分型的应用价值。方法前瞻性研究。收集天津市第一中心医院2012年6月至2013年12月非重复分离的MRSA167株和耐甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(MSSA)100株... 目的评估VitekMS质谱快速检测PSM—mee在医院感染耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)分型的应用价值。方法前瞻性研究。收集天津市第一中心医院2012年6月至2013年12月非重复分离的MRSA167株和耐甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(MSSA)100株,通过2种SCCmec分型技术检测MRSA的型别,以VitekMS质谱对所有菌株进行常规鉴定并对菌株获取图谱和Myla结果图谱进行分析,探明不同SCCmec型别MRSA的特征峰谱。结果167株MRSA的SCCmec型别占比为SCCmecI型6株,占3.6%;Ⅱ型10株,占6.0%;SCCmecHI型和DIa型共141株,占84.4%;Ⅳ型和Ⅳa型共8株,占4.8%;V型2株,占1.2%。SCCmecⅡ、Ⅲ型菌株中分泌delta毒素者(m/z3005~3009或m/z3037—3056)可检测到PSM—mec峰谱,位于紧邻m/z2500坐标左侧,不分泌delta毒素者和其余型别以及MSSA在该位置无峰谱。结论VitekMS质谱对医院感染MRSA能够初步快速分型并预测耐药表型,该技术可辅助常规监测MRSA流行情况,指导临床医生经验用药。 展开更多
关键词 交叉感染 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 基因型 细菌毒素类 质谱分析法
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应用PCR-DGGE技术分析黄海冷水团海域的细菌群落组成 被引量:29
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作者 刘敏 朱开玲 +2 位作者 李洪波 张涛 肖天 《环境科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期1082-1091,共10页
利用PCR-DGGE技术对2个季节(2006-04和2006-10)的黄海冷水团海域的细菌群落组成和优势菌群进行了分析.通过软件Glyko Bandscan分析DGGE图谱,4月份所有站位的条带数相近(约17条),多样性丰富;10月份,在冷水团范围以内站位的条带约16条... 利用PCR-DGGE技术对2个季节(2006-04和2006-10)的黄海冷水团海域的细菌群落组成和优势菌群进行了分析.通过软件Glyko Bandscan分析DGGE图谱,4月份所有站位的条带数相近(约17条),多样性丰富;10月份,在冷水团范围以内站位的条带约16条,其多样性也较丰富;而在冷水团范围以外站位的条带少(约12条),其多样性较低.细菌16S rDNA V3区特征片段经DGGE分离、条带切割,共得到24条条带,克隆、测序后,进行系统进化分析,结果显示这24条带分别归属于2个细菌类群:变形细菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroides).在24条序列中有16条分别与变形细菌亚群的γ-和δ-Proteobacteria相似,有5条与拟杆菌门相似.时空分析发现,4月份所有站位水体(海水温度为7-12℃)的细菌群落组成和10月份(冷水团存在期)冷水团内部水体(海水温度低于10℃)的细菌群落组成相同(都包括γ-Proteobacteria、δ-Proteobacteria和Bacteroides),与10月份冷水团外部水体(海水温度大于19℃)的(包括γ-Proteobacteria和Bacteroides)不同.优势菌群也存在同样的分布特点,4月份所有站位水体的优势菌群与10月份冷水团内部水体的优势菌群也相同(都是γ-Proteobacteria),而10月份冷水团外部水体不同的站位优势菌群不同.该海域细菌群落组成和优势菌群的分布特点,可能与冷水团的形成有一定的相关性. 展开更多
关键词 细菌群落组成 16SrDNA序列分析 PCR-DGGE 黄海冷水团
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黄山药总皂苷肠内菌代谢及代谢产物吸收的研究 被引量:20
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作者 马海英 周秋丽 王本祥 《中国药房》 CAS CSCD 2002年第4期204-205,共2页
目的 :本文离体和整体观察人和大鼠肠内菌对黄山药总皂苷(DX)的代谢作用及整体给予DX后吸收入血的有效成分。方法 :用薄层色谱(TLC)及电喷雾质谱(ESI -MS)法检测粪中DX及其代谢产物。整体给予大鼠灌服DX900mg/kg ,于给药后不同时间采集... 目的 :本文离体和整体观察人和大鼠肠内菌对黄山药总皂苷(DX)的代谢作用及整体给予DX后吸收入血的有效成分。方法 :用薄层色谱(TLC)及电喷雾质谱(ESI -MS)法检测粪中DX及其代谢产物。整体给予大鼠灌服DX900mg/kg ,于给药后不同时间采集尿及血清样品 ,用ESI -MS检测吸收入血成分。结果 :DX容易被人和大鼠消化道菌群代谢 ,随着代谢时间的延长 ,出现了各种甾体皂苷的降解产物及终产物薯蓣皂苷元 (Dio)。整体实验表明 ,在大鼠血及尿中均发现分子量为415 3的代谢产物 ,经ESI -MS二级质谱分析 ,上述分子量的化合物为Dio。结论 :DX可被人和大鼠肠内菌代谢 ,DX经口服后Dio被吸收入血。 展开更多
关键词 黄山药总皂苷 肠内菌代谢 电喷雾质谱 薄层色谱 薯蓣皂苷元 薯蓣皂苷 中药
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职业人群幽门螺杆菌感染情况调查 被引量:15
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作者 冉亮 邓学洁 +3 位作者 屈小英 尤洁茹 王永红 罗蓉 《中国全科医学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期589-591,共3页
目的了解重庆市职业人群幽门螺杆菌(helicobacter pylori,H.pylori)感染现状,探讨H.pylori感染在不同性别、年龄、职业、体质指数(BM I)的职业人群中的差异。方法抽样调查重庆市6个区的机关、学校、企事业单位的职业人群,采用免疫... 目的了解重庆市职业人群幽门螺杆菌(helicobacter pylori,H.pylori)感染现状,探讨H.pylori感染在不同性别、年龄、职业、体质指数(BM I)的职业人群中的差异。方法抽样调查重庆市6个区的机关、学校、企事业单位的职业人群,采用免疫胶体金法检测H.pylori感染情况,体格检查测定身高、体质量等指标。采用Excel表格、2χ检验及SPSS 16.0统计软件进行统计分析。结果共调查重庆市职业人群2188人,其中H.pylori感染651人,感染率为29.8%。男性H.pylori感染率为31.0%,女性为28.0%,二者比较差异无统计学意义(P〉0.05)。不同年龄的职业人群H.pylori感染率比较,差异有统计学意义(P〈0.01);其中50~59岁的人群H.pylori感染率最高。不同行业的职业人群H.pylori感染率(教师26.5%、公务员28.4%、公司职员33.3%、银行职员29.5%)比较,差异无统计学意义(P〉0.05)。不同BM I的职业人群H.pylori感染率(BM I〈18.5 kg/m2者31.1%,18.5 kg/m2≤BM I〈24.0kg/m2者28.6%,24.0 kg/m2≤BM I〈28.0 kg/m2者30.3%,BM I≥28.0 kg/m2者35.0%)比较,差异亦无统计学意义(P〉0.05)。结论重庆市职业人群H.pylori感染率低于国内平均水平;不同年龄的职业人群H.pylori感染率间有显著差异,以50~59岁年龄段H.pylori感染率高;不同性别、职业、BM I的职业人群,H.pylori感染率无显著差异。 展开更多
关键词 螺杆菌 幽门 细菌感染 体质指数 职业群体 重庆
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厌气混合培养中产甲烷菌和硫酸盐还原菌的动力学竞争 Ⅱ.动力学推定的结果及讨论 被引量:10
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作者 贾晓珊 李顺义 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期92-97,共6页
根据前文建立的动力学模型及批量实验结果,进行了包括乙酸及氢气利用在内的MPB和SRB的动力学常数的推定。结果显示,以Methanothrix及Methanobacter为种属的乙酸和氢气利用MPB;以Desulfobacter postageix和Desulfovibrior为种属的乙酸和... 根据前文建立的动力学模型及批量实验结果,进行了包括乙酸及氢气利用在内的MPB和SRB的动力学常数的推定。结果显示,以Methanothrix及Methanobacter为种属的乙酸和氢气利用MPB;以Desulfobacter postageix和Desulfovibrior为种属的乙酸和氢气利用SRB分别存在于葡萄糖消化过程中。在反映现实情况的低浓度硫酸根离子条件下,热力学及动力学均占优势的乙酸利用SRB相反完全竞争不过乙酸利用MPB。这是由于对硫酸根离子乙酸利用SRB竞争不过氢气利用SRB的缘故,因为后者(Kg=10.7-13.3 mg/L)具有比前者(Ks=19.5-21.4mg/L)更高的硫酸根离子亲合性。这一结果进一步显示有必要重新评价长久以来一直承担负面角色的SRB的作用。因为如果从有利于厌气过程中甲烷主要产生者-乙酸利用MPB的生长这一角度来看,适量生长的氢气利用SRB能够完全抑止作为对手的乙酸利用SRB的生长以至发挥重大的正面作用。另外,该研究提供的动力学推定方法能简便、快速、准确的推定出微生物菌体浓度和诸动力学常数,对于生物处理的近乎所有过程都具有参考价值。 展开更多
关键词 产甲烷菌(MPS) 硫酸盐还原菌(SRB) 微生物菌体浓度 厌气混合培养 动力学模型 动力学常数
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基质辅助激光解析电离飞行时间质谱在细菌分型中的应用进展 被引量:11
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作者 李茹鑫 杨靖 赵建宏 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期890-893,共4页
基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)作为一种快速、准确、高通量的细菌鉴定技术,已经开始逐步应用于临床微生物实验室.然而,MALDI-TOF MS的应用远不止细菌鉴定,其在细菌分型方面同样具有广阔的前景.基于MALDI-TOF MS的... 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)作为一种快速、准确、高通量的细菌鉴定技术,已经开始逐步应用于临床微生物实验室.然而,MALDI-TOF MS的应用远不止细菌鉴定,其在细菌分型方面同样具有广阔的前景.基于MALDI-TOF MS的分型方法具有简单、快速、成本低廉、高通量等特点,可以在医院感染控制和暴发流行时发挥快速筛选的作用. 展开更多
关键词 细菌分型技术 光谱法 质量 基质辅助激光解吸电离
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2种嫁接番茄根系分泌活性物质对番茄青枯病及根际微生物的影响 被引量:9
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作者 刘斯晗 郑旭阳 +3 位作者 钟川 王鹏 阳燕娟 于文进 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期3382-3391,共10页
【目的】鉴定分析嫁接番茄根系分泌物,研究其活性成分对番茄抗青枯病、番茄体内青枯菌及根际微生物数量的影响,为番茄青枯病的防治提供新思路。【方法】以高感青枯病番茄品种粉贝贝(Fb)、高抗青枯病番茄砧木番砧1号(No.1)和茄砧21号(No.... 【目的】鉴定分析嫁接番茄根系分泌物,研究其活性成分对番茄抗青枯病、番茄体内青枯菌及根际微生物数量的影响,为番茄青枯病的防治提供新思路。【方法】以高感青枯病番茄品种粉贝贝(Fb)、高抗青枯病番茄砧木番砧1号(No.1)和茄砧21号(No.21)为试验材料,设自根嫁接(Fb/Fb)、砧穗嫁接(Fb/No.1、Fb/No.21)和砧木自嫁接(No.1/No.1、No.21/No.21)5个嫁接组合。利用气相色谱—质谱联用仪(GC-MS)对嫁接番茄接种青枯菌前后的根系分泌物进行鉴定分析,用筛选出的活性物质对高感病番茄进行灌根处理后接种青枯菌,采用稀释平板法分离测定番茄体内和根际青枯菌及根际微生物数量。【结果】从嫁接番茄根系分泌物中鉴定筛选出邻苯二甲酸二甲酯(DP)和2,6-二叔丁基对甲苯酚(BHT)2种活性物质,其中1.0 mmol/L DP与1.0 mmol/L BHT混合灌根处理的抗青枯病效果最好,使高感病番茄的青枯病发病率和病情指数显著降至46.7%、42.5(P<0.05,下同)。2种活性物质灌根处理均能使根际微生物总量和细菌数量明显下降;均可降低根际真菌数量,其中BHT的抑制效果更强;均可在发病初期显著抑制放线菌的增殖,且DP的抑制效果强于BHT。【结论】筛选出DP和BHT 2种活性物质,其可通过改善根际微环境、降低植株体内和根际的青枯菌数量而提高番茄对青枯病的抗性。 展开更多
关键词 番茄 嫁接 青枯病 根系分泌物 气相色谱—质谱联用 根际微生物
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