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芽孢杆菌蛋白酶基因的比较基因组学分析
被引量：
2
1
作者
贾仲昕
赵佳男
+4 位作者
季芳
王雪
李刚
王承民
秦建华
《广东农业科学》
CAS
2022年第5期110-117,共8页
【目的】研究芽孢杆菌产蛋白酶能力与携带的蛋白酶基因的关系,探寻影响芽孢杆菌产蛋白酶能力的重要基因。【方法】通过筛选培养基筛选能够产生蛋白酶的菌株,采用福林酚法检测菌株产生的蛋白酶的活性,对15株芽孢杆菌分离株进行全基因组测...
【目的】研究芽孢杆菌产蛋白酶能力与携带的蛋白酶基因的关系,探寻影响芽孢杆菌产蛋白酶能力的重要基因。【方法】通过筛选培养基筛选能够产生蛋白酶的菌株,采用福林酚法检测菌株产生的蛋白酶的活性,对15株芽孢杆菌分离株进行全基因组测序,获得菌株染色体上携带的蛋白酶基因情况并将其分类;采用实时荧光定量PCR方法检测蛋白酶基因mRNA的转录水平;通过比较基因组学和细菌全基因组关联分析(BGWAS),探讨影响细菌产蛋白酶能力高低的原因。【结果】根据菌株染色体上携带的蛋白酶基因情况,可分为7种基因型(G1~G7)。比较基因组学和BGWAS分析发现,细菌染色体上携带的蛋白酶基因种类的多寡与其产蛋白酶能力的高低有直接关系,且缺少aprX和aprE基因菌株的产蛋白酶能力明显下降。进一步研究基因mRNA水平发现,芽孢杆菌产蛋白酶能力的差异与aprX的表达水平有关。【结论】菌株染色体上携带的蛋白酶基因情况与菌株产蛋白酶能力之间存在关联。aprX是影响芽孢杆菌属细菌产胞外蛋白酶能力的重要基因。
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关键词
蛋白酶
芽孢杆菌
比较
基因
组学
荧光定量PCR
aprx
基因
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职称材料
原料乳中产蛋白酶假单胞菌双重PCR检测体系建立和评价
被引量：
2
2
作者
吴天赐
李楠
+2 位作者
张娟
余意
刘振民
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第14期251-256,共6页
具有产蛋白酶能力的假单胞菌是原料乳中的主要危害菌群之一,针对假单胞菌的sucD基因和aprX基因分别设计了2对特异性引物,建立了一种能够快速检测产蛋白酶假单胞菌的双重PCR方法,并对引物的特异性、灵敏度和人工污染检测限等进行了评价...
具有产蛋白酶能力的假单胞菌是原料乳中的主要危害菌群之一,针对假单胞菌的sucD基因和aprX基因分别设计了2对特异性引物,建立了一种能够快速检测产蛋白酶假单胞菌的双重PCR方法,并对引物的特异性、灵敏度和人工污染检测限等进行了评价。结果表明,该双重PCR方法的特异性良好,对纯细菌DNA检测限可达到0.167 pg/μL。人工污染试验结果表明,经增菌培养12、24 h后,原料乳样品中产蛋白酶假单胞菌检测限分别为3.5×10^(3)、3.5 CFU/mL。因此该研究建立的双重PCR检测方法对原料乳中产蛋白酶假单胞菌的快速检测具有一定的应用前景。
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关键词
假单胞菌
蛋白酶
双重PCR
aprx
基因
快速检测
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职称材料
题名
芽孢杆菌蛋白酶基因的比较基因组学分析
被引量：
2
1
作者
贾仲昕
赵佳男
季芳
王雪
李刚
王承民
秦建华
机构
河北农业大学动物医学院
广东省科学院动物研究所/广东省动物保护与资源利用重点实验室/广东省野生动物保护与利用公共实验室
出处
《广东农业科学》
CAS
2022年第5期110-117,共8页
基金
河北省现代农业产业技术体系奶牛创新团队建设项目(HBCT2018120205)
河北省重点研发项目(20326603D)
+1 种基金
广东省科学院人才专项(2016GDASRC-0205)
北京动物园圈养野生动物技术北京市重点实验室开放课题(ZDK202105)。
文摘
【目的】研究芽孢杆菌产蛋白酶能力与携带的蛋白酶基因的关系,探寻影响芽孢杆菌产蛋白酶能力的重要基因。【方法】通过筛选培养基筛选能够产生蛋白酶的菌株,采用福林酚法检测菌株产生的蛋白酶的活性,对15株芽孢杆菌分离株进行全基因组测序,获得菌株染色体上携带的蛋白酶基因情况并将其分类;采用实时荧光定量PCR方法检测蛋白酶基因mRNA的转录水平;通过比较基因组学和细菌全基因组关联分析(BGWAS),探讨影响细菌产蛋白酶能力高低的原因。【结果】根据菌株染色体上携带的蛋白酶基因情况,可分为7种基因型(G1~G7)。比较基因组学和BGWAS分析发现,细菌染色体上携带的蛋白酶基因种类的多寡与其产蛋白酶能力的高低有直接关系,且缺少aprX和aprE基因菌株的产蛋白酶能力明显下降。进一步研究基因mRNA水平发现,芽孢杆菌产蛋白酶能力的差异与aprX的表达水平有关。【结论】菌株染色体上携带的蛋白酶基因情况与菌株产蛋白酶能力之间存在关联。aprX是影响芽孢杆菌属细菌产胞外蛋白酶能力的重要基因。
关键词
蛋白酶
芽孢杆菌
比较
基因
组学
荧光定量PCR
aprx
基因
Keywords
protease
Bacillus
comparative genomics
fluorescence quantitative PCR
aprx
gene
分类号
S816 [农业科学—饲料科学]
Q753 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
原料乳中产蛋白酶假单胞菌双重PCR检测体系建立和评价
被引量：
2
2
作者
吴天赐
李楠
张娟
余意
刘振民
机构
光明乳业股份有限公司乳业生物技术国家重点实验室
上海大学生命科学学院
出处
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第14期251-256,共6页
基金
国家重点研发计划课题(2018YFC1604201)。
文摘
具有产蛋白酶能力的假单胞菌是原料乳中的主要危害菌群之一,针对假单胞菌的sucD基因和aprX基因分别设计了2对特异性引物,建立了一种能够快速检测产蛋白酶假单胞菌的双重PCR方法,并对引物的特异性、灵敏度和人工污染检测限等进行了评价。结果表明,该双重PCR方法的特异性良好,对纯细菌DNA检测限可达到0.167 pg/μL。人工污染试验结果表明,经增菌培养12、24 h后,原料乳样品中产蛋白酶假单胞菌检测限分别为3.5×10^(3)、3.5 CFU/mL。因此该研究建立的双重PCR检测方法对原料乳中产蛋白酶假单胞菌的快速检测具有一定的应用前景。
关键词
假单胞菌
蛋白酶
双重PCR
aprx
基因
快速检测
Keywords
Pseudomonas
protease
duplex PCR
aprx
gene
rapid detection
分类号
TS252.7 [轻工技术与工程—农产品加工及贮藏工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
芽孢杆菌蛋白酶基因的比较基因组学分析
贾仲昕
赵佳男
季芳
王雪
李刚
王承民
秦建华
《广东农业科学》
CAS
2022
2
下载PDF
职称材料
2
原料乳中产蛋白酶假单胞菌双重PCR检测体系建立和评价
吴天赐
李楠
张娟
余意
刘振民
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
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职称材料
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