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基于拓扑指数的QSAR法探讨脑泰方中抗脑血栓关键活性成分簇
被引量:
4
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作者
张玉超
钟鹏英
+5 位作者
夏凡
李世雄
李璎峪
葛金文
刘文龙
张喜利
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期877-885,共9页
目的基于定量构效关系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)法探讨脑泰方中抗脑血栓的关键活性成分簇。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及检索国内外相关文献,整理脑泰方单味中药和抗血栓化学药的化学...
目的基于定量构效关系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)法探讨脑泰方中抗脑血栓的关键活性成分簇。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及检索国内外相关文献,整理脑泰方单味中药和抗血栓化学药的化学成分信息集,计算各类化学成分的0~8阶/8种子图类型的分子连接性指数(molecular connectivity index,MCI)并构建相应矩阵,运用夹角余弦法分别对脑泰方中成分与抗血栓化学药之间的MCI相似度进行评价,并利用Sybyl-X2.1软件将相似度排名前5的成分与核心靶点对接验证。结果脑泰方中所含成分与抗血栓化学药的MCI相似度在0.3006~0.9978,其中毛蕊异黄酮(0.9961)、洋川芎内酯M(0.9978)、白僵菌素(0.9969)、肌苷(0.9927)为脑泰方中相似度最大的成分簇,且与脑血栓相关蛋白的total score≥5,显示出较强的结合能力。推断出黄芪中的黄酮类化合物毛蕊异黄酮、川芎中的苯酞类化合物洋川芎内酯M、僵蚕中的氨基酸类化合物白僵菌素、地龙中的核苷类化合物肌苷为脑泰方中发挥抗血栓作用的主要活性分子簇。结论所建立的基于MCI相似度评价法能科学地高通量筛选中药及复方功效活性成分簇,与现有的网络药理学等研究方法相得益彰,也为中西药结合研究提供新的思路。
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关键词
定量构效关系法
分子连接性指数
相似度评价
脑泰方
抗脑血栓
分子对接
毛蕊异黄酮
洋川芎内酯
白僵菌素
肌苷
原文传递
题名
基于拓扑指数的QSAR法探讨脑泰方中抗脑血栓关键活性成分簇
被引量:
4
1
作者
张玉超
钟鹏英
夏凡
李世雄
李璎峪
葛金文
刘文龙
张喜利
机构
湖南中医药大学药学院
中药成药性与制剂制备湖南省重点实验室
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期877-885,共9页
基金
国家自然科学基金项目(81874344)
湖南省自然科学基金项目(2021JJ30514)
+1 种基金
湖南省中医药管理局项目(2021073),湖南省中医药管理局项目(2021204)
长沙市自然科学基金项目(kq2208191)。
文摘
目的基于定量构效关系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)法探讨脑泰方中抗脑血栓的关键活性成分簇。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及检索国内外相关文献,整理脑泰方单味中药和抗血栓化学药的化学成分信息集,计算各类化学成分的0~8阶/8种子图类型的分子连接性指数(molecular connectivity index,MCI)并构建相应矩阵,运用夹角余弦法分别对脑泰方中成分与抗血栓化学药之间的MCI相似度进行评价,并利用Sybyl-X2.1软件将相似度排名前5的成分与核心靶点对接验证。结果脑泰方中所含成分与抗血栓化学药的MCI相似度在0.3006~0.9978,其中毛蕊异黄酮(0.9961)、洋川芎内酯M(0.9978)、白僵菌素(0.9969)、肌苷(0.9927)为脑泰方中相似度最大的成分簇,且与脑血栓相关蛋白的total score≥5,显示出较强的结合能力。推断出黄芪中的黄酮类化合物毛蕊异黄酮、川芎中的苯酞类化合物洋川芎内酯M、僵蚕中的氨基酸类化合物白僵菌素、地龙中的核苷类化合物肌苷为脑泰方中发挥抗血栓作用的主要活性分子簇。结论所建立的基于MCI相似度评价法能科学地高通量筛选中药及复方功效活性成分簇,与现有的网络药理学等研究方法相得益彰,也为中西药结合研究提供新的思路。
关键词
定量构效关系法
分子连接性指数
相似度评价
脑泰方
抗脑血栓
分子对接
毛蕊异黄酮
洋川芎内酯
白僵菌素
肌苷
Keywords
QSAR
molecular
connectivity
index
similarity
evaluation
Naotaifang
anticerebral
thrombosis
molecular
docking
calycosin
senkyunolide
M
beauvericin
inosine
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于拓扑指数的QSAR法探讨脑泰方中抗脑血栓关键活性成分簇
张玉超
钟鹏英
夏凡
李世雄
李璎峪
葛金文
刘文龙
张喜利
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2023
4
原文传递
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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