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两种聚丙烯酰胺凝胶银染方法的比较 被引量:26
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作者 关海涛 徐世昌 郭玉华 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期86-87,共2页
比较了两种聚丙烯酰胺凝胶的DNA染色方法。对小麦SSR扩增产物的染色结果显示,改进的Bassam银染法颜色背景浅,灵敏度较高,能够看到副带染色。改进的Sanguinetti方法对条带的鉴别力稍差,但因省时省力,成本较低可用于大规模引物筛选时的染色。
关键词 银染法 聚丙烯酰胺电泳 SSR 扩增产物 小麦
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桃SSR-PCR主要因子对扩增产物的影响 被引量:13
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作者 沈志军 马瑞娟 +1 位作者 俞明亮 许建兰 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2006年第1期76-80,共5页
以寿星桃为试材,通过Mg^2+和DNA聚合酶、模板DNA和引物用量的两个双因素试验,以及dNTP用量的单因素试验,研究了5个主要因子对SSR扩增结果的影响,并对桃SSR反应体系进行了优化。结果表明,Mg^2+和DNA聚合酶的用量对SSR扩增结果起... 以寿星桃为试材,通过Mg^2+和DNA聚合酶、模板DNA和引物用量的两个双因素试验,以及dNTP用量的单因素试验,研究了5个主要因子对SSR扩增结果的影响,并对桃SSR反应体系进行了优化。结果表明,Mg^2+和DNA聚合酶的用量对SSR扩增结果起着关键作用,且两者之间存在明显的可作效应;dNTP用量也对SSR的扩增结果起着重要作用,当浓度在200~300μmol/L时效果较好;模板DNA与引物用量之阃没有很明显的互作效应,适当增加引物用量可以提高SSR的正确扩增;优化的桃SSR反应体系为:25μl的总反应体积中含1×PCR Buffe、Mg^2+ 3mmol/L、DNA聚合酶1.5U、SSR引物各0.4μmol/L、模板DNA 50ng、dNTP 200 μmol/L。 展开更多
关键词 简单序列重复 PCR扩增 扩增产物
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洛阳市汉族群体ADH2和ALDH2的基因多态性研究 被引量:22
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作者 张竹梅 刘茶珍 +6 位作者 边建超 江峰 沈福民 汤伯明 王其军 王启敏 朱鑫 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期532-536,共5页
为研究洛阳市汉族群体ADH2和ALDH2基因的多态性分布,应用聚合酶链反应-扩增片段长度多态性(PCR-APLP)分析法,对ADH2基因外显子3和ALDH2基因外显子12的特定片段同时进行特异性扩增,用非变性的聚丙烯酰胺垂直凝胶电泳和DNA银染方法判定... 为研究洛阳市汉族群体ADH2和ALDH2基因的多态性分布,应用聚合酶链反应-扩增片段长度多态性(PCR-APLP)分析法,对ADH2基因外显子3和ALDH2基因外显子12的特定片段同时进行特异性扩增,用非变性的聚丙烯酰胺垂直凝胶电泳和DNA银染方法判定基因型。ADH2*1和ADH2*2等位基因频率分别为42.86%和57.14%,ADH2*1/*1、*1/*2和*2/*2的基因型频率分别为22.86%、40.00%和37.14%;AL-DH2*1和ALDH2*2的等位基因频率分别为85.24%和14.76%,ALDH2*1/*1、*1/*2和*2/*2的基因型频率分别为71.43%、27.62%和0.95%。洛阳市汉族群体ADH2和ALDH2的等位基因频率和基因型频率不同于台湾人和上海人,ALDH2*1/*1基因型频率明显高于上海人和台湾人的。因而,洛阳市居民对酒精的耐受性比上海人和台湾人强。 展开更多
关键词 洛阳市 汉族群体 ADH2 ALDH2 基因多态性 乙醇脱氢酶2 乙醛脱氢酶
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一种新的近交系实验动物遗传监测方法及小鼠性别相关RAPD标记的发现 被引量:23
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作者 张文艳 龚春梅 +6 位作者 魏云林 吴春花 王文 兰宏 李善如 宿兵 张亚平 《实验生物学报》 CSCD 1996年第1期59-69,共11页
我们用21个10 bp的随机短引物对来自昆明、成都、上海、北京四个地方的BALB/c小鼠以及C57BL小鼠、昆明种小白鼠进行了随机扩增多态DNA(RAPD)分析,发现13个引物的扩增产物在BALB/c小鼠和C 57 BL小鼠中有差异,8个引物的扩增产物在BALB/c... 我们用21个10 bp的随机短引物对来自昆明、成都、上海、北京四个地方的BALB/c小鼠以及C57BL小鼠、昆明种小白鼠进行了随机扩增多态DNA(RAPD)分析,发现13个引物的扩增产物在BALB/c小鼠和C 57 BL小鼠中有差异,8个引物的扩增产物在BALB/c小鼠和昆明种小白鼠之间不同.在四个地方的BALB/c小鼠中,成都、上海、北京的BALB/c小鼠其遗传背景均一,而来自昆明的BALB/c小鼠中,有2只的4个引物的扩增产物不同于其它的BALB/c小鼠,表明这两只BALB/c小鼠可能曾发生过某种程度的遗传改变或污染。实验结果显示RAPD方法是一种有效的近交系实验动物遗传监测手段。实验中一个有趣的结果是,在OPG 2、OPE 4、OPE 9的扩增产物中,发现了严格的性别依赖的PAPD标记。OPE 9扩增产物中,凡雄性个体都有一条0.88 kb的标记.OPG 2、OPE 4则在所有的雄性个体中多扩增出一条约1.2 kb的带。通过交叉PCR扩增和斑点杂交证明OPG 2、OPE 4 得到的雄性特异性RAPD标记虽分子大小一致,但不具同源性。这些性别相关RAPD标记的染色体定位和性质分析正在进一步进行中. 展开更多
关键词 医用实验动物 近交系小鼠 遗传监测 RAPD标记
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用PCR扩增及Southern印迹杂交对新疆克拉玛依地区皮肤利什曼病病原体kDNA同源性研究 被引量:1
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作者 陈建平 胡孝素 杨文天 《实用寄生虫病杂志》 1995年第1期1-4,共4页
本研究自新疆克拉玛依地区皮肤利什曼病(CL)患者的皮肤病变组织内抽取微量的利什曼原虫kDNA,采用引物13A、13B进行PCR扩增,获120hP扩增产物(CL-PCR-AP),并转移到尼龙膜上,分别与地高辛(Digo... 本研究自新疆克拉玛依地区皮肤利什曼病(CL)患者的皮肤病变组织内抽取微量的利什曼原虫kDNA,采用引物13A、13B进行PCR扩增,获120hP扩增产物(CL-PCR-AP),并转移到尼龙膜上,分别与地高辛(Digoxigenin-11-dUTP)标记的L.tropica、L.infantum、L.gerbilli、L.majorkDNA探针进行Southern印迹杂交,结果可见病变组织内kDNAPCR-AP仅与L.tropicakDNA探针有明显的杂交信号带,提示该地区皮肤利什曼病病原体kDNA与L.tropica有较强的同源性。为进一步分析该病原体与L.infantum和L.donovani新疆各分离株的同源关系,我们采用杜氏利什曼原虫(L.d)种特异引物Ⅰ和Ⅱ对患者病变组织进行PCR扩增,未见扩增产物。用地高辛标记的CL-PCR-AP探针对L.donovani新疆各分离株进行打点杂交,结果显示该地区CL病原体与L.donovani新疆分离株以及其它利什曼原虫呈阴性反应。以上结果证实L.tropicakDNA与克拉玛依地区CL患者的CL-PCR-AP之间的同源关系。 展开更多
关键词 同源性 皮肤利什曼病 印迹杂交 聚合酶链反应
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Development of a universal immunoenzyme quantitative assay for detecting amplified products of nucleic acid and its preliminary application in hepatitis C virus
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作者 仝文斌 高巍 +2 位作者 费然 冯百芳 陶其敏 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 1999年第5期8-11,共4页
Objective To develop a universal quantitative immunoenzyme assay (EIA) for detecting amplified products of nucleic acid and its application in hepatit is C virus (HCV). Methods The appropriate cycle number of am... Objective To develop a universal quantitative immunoenzyme assay (EIA) for detecting amplified products of nucleic acid and its application in hepatit is C virus (HCV). Methods The appropriate cycle number of amplification was selected to s top polymerase chain reaction (PCR) before the “plateau stage”. At the same ti me, primers HCV(3) of the second PCR were modified with biotin so that the ampli fied products were labeled. The products were diluted and subsequently added t o the streptavidin coated wells, and the biotinylated products were captured, f ollowed by denaturation of NaOH, and non biotinylated strands were removed. Hy bridization was performed by adding the specific probe labeled with fluorescein. Finally anti fluorescein horse radish peroxidase (HRP) conjugates were added, after washing, 3,3',5,5', tetramethylbenzidine (TMB) was added to the well s and then measured on a microplate reader. Results EIA detection of amplified products of HCV showed that this ass ay was rapid, sensitive, specific and accurate. Correlation between the initial number of viral template and the EIA of amplified products was good. We also pro spectively investigated the response to interferon in five patients with HCV coi nfection. Results showed that this assay could be used as a guidance to the clin ical therapy in directing the use of antiviral drugs. Conclusions This assay could be widely used as a universal technique fo r the quantitative detection of amplified products of all nucleic acid (such as virus, bacterium) and other human genes (such as HLA B 27 ), it has vast vistas. 展开更多
关键词 quantitative · universal · amplified products · hepati tis C virus
原文传递
牛免疫缺陷病毒(BIV)在中美两国流行情况的比较(英文)
7
作者 王金忠 刘淑红 +1 位作者 陈启民 耿运琪 《河北大学学报(自然科学版)》 CAS 1999年第2期170-175,共6页
牛免疫缺陷病毒是反转录病毒科慢病毒属的重要成员,已在一些国家相继发现BIV的感染和蔓延。本文以重组BIV衣壳蛋白和包膜蛋白为抗原,通过免疫印迹技术发现,不仅我国进口奶牛及其后代存在一定比例的BIV感染(血清阳性率为2... 牛免疫缺陷病毒是反转录病毒科慢病毒属的重要成员,已在一些国家相继发现BIV的感染和蔓延。本文以重组BIV衣壳蛋白和包膜蛋白为抗原,通过免疫印迹技术发现,不仅我国进口奶牛及其后代存在一定比例的BIV感染(血清阳性率为2.32%),而且BIV已开始在我国北方牛群中传播(阳性率约3.8%)。上述结果已被聚合酶链式反应及其产物的狭缝杂交所证实,并与美国中部及南部地区BIV流行情况进行了比较。 展开更多
关键词 免疫缺陷病毒 融合蛋白 感染 BIV 牛病毒
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鹰嘴豆SSR-PCR反应体系优化
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作者 李辉玲 李利民 张金波 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2014年第3期10-13,共4页
为了进行鹰嘴豆(Cicer arietinum L.)遗传多样性分析,以鹰嘴豆叶片基因组DNA为模版,通过Mg2+、DNA聚合酶、模版DNA、dNTPs以及引物的用量,设计5因素4水平的正交试验对SSR-PCR反应体系进行优化,并利用梯度PCR对退火温度进行选择。结果表... 为了进行鹰嘴豆(Cicer arietinum L.)遗传多样性分析,以鹰嘴豆叶片基因组DNA为模版,通过Mg2+、DNA聚合酶、模版DNA、dNTPs以及引物的用量,设计5因素4水平的正交试验对SSR-PCR反应体系进行优化,并利用梯度PCR对退火温度进行选择。结果表明:优化的SSR-PCR扩增10μL体系为1.5μL 1×PCR Buffer、1.5mmol/L Mg2+、1.5U TaqDNA聚合酶、0.75μmol/L SSR引物、15ng模版DNA、250μmol/L dNTPs。扩增程序:95℃预变性5min;94℃变性30s,52.3℃退火30s,72℃延伸90s,共35个循环;最后72℃延伸5min。所有SSR引物在优化的反应体系中基本能有效扩增,得到特异性。 展开更多
关键词 鹰嘴豆 PCR 扩增 扩增产物
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羟乙基纤维素及蔗糖无胶筛分毛细管电泳分离DNA片段 被引量:9
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作者 陈洪 宋立国 +1 位作者 熊少祥 程介克 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 1997年第11期1769-1773,共5页
提出以羟乙基纤维素、蔗和硼酸形成"互穿网络"无胶筛分介质,显著地提高了分离效率.分离了ΦX174/HaeⅢDNA的所有11个DNA片段.探讨了"互穿网络"无胶筛分机理.将该方法应用于决定鳝鱼性别基因PCR扩增产物的分离... 提出以羟乙基纤维素、蔗和硼酸形成"互穿网络"无胶筛分介质,显著地提高了分离效率.分离了ΦX174/HaeⅢDNA的所有11个DNA片段.探讨了"互穿网络"无胶筛分机理.将该方法应用于决定鳝鱼性别基因PCR扩增产物的分离与鉴定,结果较好. 展开更多
关键词 无胶筛分 毛细管电泳 DNA片段 性别决定 分离
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建立高效的转基因动物鉴定技术体系 被引量:1
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作者 李文蓉 武坚 +3 位作者 刘明军 黄俊成 杨冬梅 郭志勤 《草食家畜》 2001年第S2期45-50,共6页
转基因动物的鉴定是转基因动物研究领域的重要内容。本文简要回顾了相关鉴定技术的研究进展 ,建立和完善了特异性PCR扩增及其产物酶切的转基因动物鉴定体系 ,在引物设计、PCR参数优化、设立内源性标记等方面作了进一步的改进 ,提高了PC... 转基因动物的鉴定是转基因动物研究领域的重要内容。本文简要回顾了相关鉴定技术的研究进展 ,建立和完善了特异性PCR扩增及其产物酶切的转基因动物鉴定体系 ,在引物设计、PCR参数优化、设立内源性标记等方面作了进一步的改进 ,提高了PCR的特异性和可靠性。实验表明 ,PCR扩增及其产物酶切是一种准确、灵敏、简便。 展开更多
关键词 转基因动物鉴定 PCR 酶切
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