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Pre-mRNA选择性剪接的调控及选择性剪接数据库
被引量：
10
1
作者
邢永强
刘国庆
蔡禄
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期17-28,共12页
Pre-m RNA选择性剪接是真核生物转录组和蛋白质组多样性的主要来源,也是细胞分化、发育等过程中重要的基因表达调控方式。约95%的人类多外显子基因存在RNA选择性剪接;很多人类基因疾病的发生与RNA剪接错误相关。随着共转录现象的发现,RN...
Pre-m RNA选择性剪接是真核生物转录组和蛋白质组多样性的主要来源,也是细胞分化、发育等过程中重要的基因表达调控方式。约95%的人类多外显子基因存在RNA选择性剪接;很多人类基因疾病的发生与RNA剪接错误相关。随着共转录现象的发现,RNA选择性剪接调控机制研究也取得了很大进展。本文分别从序列层面和核小体定位、组蛋白修饰、DNA甲基化及非编码RNA等表观遗传层面,系统地阐述了RNA选择性剪接的调控机制。为便于搜索,本文介绍了近10年来RNA选择性剪接相关的数据库。
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关键词
rna
选择性剪接
核小体定位
组蛋白修饰
DNA甲基化
非编码
rna
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职称材料
MNS血型相关基因GYPA、GYPB、GYPE mRNA全长序列多态性分析
2
作者
梁延连
吴凡
+2 位作者
梁爽
徐筠娉
苏宇清
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期1537-1542,共6页
目的:分析MNS血型相关基因GYPA、GYPB、GYPE mRNA全长序列的特征,了解MNS血型基因的多态性。方法:随机选取无偿献血者500人份离体24 h内的抗凝血各8 ml,以血型血清学方法鉴定MN、Ss、Mia血型。从500例样本中随机选取MNS与Mia血型不同组...
目的:分析MNS血型相关基因GYPA、GYPB、GYPE mRNA全长序列的特征,了解MNS血型基因的多态性。方法:随机选取无偿献血者500人份离体24 h内的抗凝血各8 ml,以血型血清学方法鉴定MN、Ss、Mia血型。从500例样本中随机选取MNS与Mia血型不同组合的5例样本,使用密度梯度离心法分离外周血中的单个核细胞(PBMC)并提取总mRNA,使用逆转录试剂盒制备cDNA,采用巢式PCR(nested PCR)方法扩增目标片段,切胶回收后分别对GYPA、GYPB、GYPE mRNA全长序列进行测序,通过Oligo 6.0软件分析碱基序列。结果:血清学检测得到MN、Ss和Mia表现型,不同个体间的红细胞与抗-Mia血清反应存在凝集强度差异。检测了5例不同表现型组合样本的GYPA、GYPB、GYPE基因mRNA全长序列,1例样本的GYPA mRNA中exon-6完整缺失,其他4例样本的GYPA mRNA全长完整;2例样本的GYPB mRNA中exon-2完整缺失,Mia血型阴性;2例样本的GYPB mRNA全长完整,Mia血型阳性;1例样本的GYPB mRNA中exon-5存在碱基替换;5例样本的GYPE mRNA全长完整。结论:MNS血型相关基因具有明显的多态性,mRNA全长序列的检测为GYPA、GYPB、GYPE基因结构的分析与MNS血型抗原表达的深入研究奠定了基础。
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关键词
MNS血型
m
rna
全长序列
GYPA、GYPB、GYPE基因
选择性
rna
剪接
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职称材料
大鼠磷脂酶C-γ1前体mRNA剪接的初步鉴定
3
作者
刘忠英
罗深秋
赵永忠
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期191-194,共4页
目的探讨在大鼠中是否存在磷脂酶C-γ1(PLC-γ1)选择性剪接变异体的表达及其可能意义。方法针对在人中已发现的选择性剪接位点(即第30内含子的3'末端与第31外显子交界处)自行设计引物,将大鼠RNA逆转录为cDNA后,再用该对引物进行PCR...
目的探讨在大鼠中是否存在磷脂酶C-γ1(PLC-γ1)选择性剪接变异体的表达及其可能意义。方法针对在人中已发现的选择性剪接位点(即第30内含子的3'末端与第31外显子交界处)自行设计引物,将大鼠RNA逆转录为cDNA后,再用该对引物进行PCR扩增及序列测定。用此方法初步筛查了大鼠包括胚胎时期、出生早期、成年时期6种脏器组织心、肝、肺、肾、脑和眼球样品共21份。结果在大鼠中未发现与人相似的第一种剪接方式PLC-γ1a(NM_002660)。结论(1)由于不同物种之间的差异,在大鼠中可能不存在与在人类中已发现的PLC-γ1前体mRNA相似的选择性剪接方式,在大鼠中PLC-γ1转录后的剪接主要以与人类相似的第二种剪接方式(PLC-γ1b)为主。(2)在大鼠中PLC-γ1的选择性剪接位点可能与人不同而位于其他位点。
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关键词
磷脂酶C-Γ1
选择性剪接
M
rna
大鼠
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职称材料
题名
Pre-mRNA选择性剪接的调控及选择性剪接数据库
被引量：
10
1
作者
邢永强
刘国庆
蔡禄
机构
内蒙古科技大学数理与生物工程学院大学物理实验教学示范中心
内蒙古科技大学数理与生物工程学院生物技术系
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期17-28,共12页
基金
国家自然科学基金面上项目(No.61271448
31260274
+3 种基金
11547150)
内蒙古自然科学基金面上项目(No.2014MS0311
2014MS0312)
内蒙古科技大学创新基金面上项目(No.2014QDL012)~~
文摘
Pre-m RNA选择性剪接是真核生物转录组和蛋白质组多样性的主要来源,也是细胞分化、发育等过程中重要的基因表达调控方式。约95%的人类多外显子基因存在RNA选择性剪接;很多人类基因疾病的发生与RNA剪接错误相关。随着共转录现象的发现,RNA选择性剪接调控机制研究也取得了很大进展。本文分别从序列层面和核小体定位、组蛋白修饰、DNA甲基化及非编码RNA等表观遗传层面,系统地阐述了RNA选择性剪接的调控机制。为便于搜索,本文介绍了近10年来RNA选择性剪接相关的数据库。
关键词
rna
选择性剪接
核小体定位
组蛋白修饰
DNA甲基化
非编码
rna
Keywords
alternative
rna
splicing
nucleosome
positioning
histone
modification
DNA
methylation
non-coding
rna
分类号
Q6 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
MNS血型相关基因GYPA、GYPB、GYPE mRNA全长序列多态性分析
2
作者
梁延连
吴凡
梁爽
徐筠娉
苏宇清
机构
深圳市血液中心输血医学研究所
出处
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期1537-1542,共6页
基金
广东省医学科研基金(B2020179)
广东省自然科学基金(2020A1515010387)
+1 种基金
深圳市医疗卫生三名工程(SZSM2O1811092)
深圳市输血医学重点学科(SZXK070)。
文摘
目的:分析MNS血型相关基因GYPA、GYPB、GYPE mRNA全长序列的特征,了解MNS血型基因的多态性。方法:随机选取无偿献血者500人份离体24 h内的抗凝血各8 ml,以血型血清学方法鉴定MN、Ss、Mia血型。从500例样本中随机选取MNS与Mia血型不同组合的5例样本,使用密度梯度离心法分离外周血中的单个核细胞(PBMC)并提取总mRNA,使用逆转录试剂盒制备cDNA,采用巢式PCR(nested PCR)方法扩增目标片段,切胶回收后分别对GYPA、GYPB、GYPE mRNA全长序列进行测序,通过Oligo 6.0软件分析碱基序列。结果:血清学检测得到MN、Ss和Mia表现型,不同个体间的红细胞与抗-Mia血清反应存在凝集强度差异。检测了5例不同表现型组合样本的GYPA、GYPB、GYPE基因mRNA全长序列,1例样本的GYPA mRNA中exon-6完整缺失,其他4例样本的GYPA mRNA全长完整;2例样本的GYPB mRNA中exon-2完整缺失,Mia血型阴性;2例样本的GYPB mRNA全长完整,Mia血型阳性;1例样本的GYPB mRNA中exon-5存在碱基替换;5例样本的GYPE mRNA全长完整。结论:MNS血型相关基因具有明显的多态性,mRNA全长序列的检测为GYPA、GYPB、GYPE基因结构的分析与MNS血型抗原表达的深入研究奠定了基础。
关键词
MNS血型
m
rna
全长序列
GYPA、GYPB、GYPE基因
选择性
rna
剪接
Keywords
MNS
blood
group
full-length
m
rna
sequence
GYPA,GYPB
and
GYPE
genes
alternative
rna
splicing
分类号
R446.6 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
大鼠磷脂酶C-γ1前体mRNA剪接的初步鉴定
3
作者
刘忠英
罗深秋
赵永忠
机构
南方医科大学基础医学院组胚教研室
南方医科大学基础医学院细胞生物教研室
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期191-194,共4页
基金
广东省自然科学基金重点项目(05102580)~~
文摘
目的探讨在大鼠中是否存在磷脂酶C-γ1(PLC-γ1)选择性剪接变异体的表达及其可能意义。方法针对在人中已发现的选择性剪接位点(即第30内含子的3'末端与第31外显子交界处)自行设计引物,将大鼠RNA逆转录为cDNA后,再用该对引物进行PCR扩增及序列测定。用此方法初步筛查了大鼠包括胚胎时期、出生早期、成年时期6种脏器组织心、肝、肺、肾、脑和眼球样品共21份。结果在大鼠中未发现与人相似的第一种剪接方式PLC-γ1a(NM_002660)。结论(1)由于不同物种之间的差异,在大鼠中可能不存在与在人类中已发现的PLC-γ1前体mRNA相似的选择性剪接方式,在大鼠中PLC-γ1转录后的剪接主要以与人类相似的第二种剪接方式(PLC-γ1b)为主。(2)在大鼠中PLC-γ1的选择性剪接位点可能与人不同而位于其他位点。
关键词
磷脂酶C-Γ1
选择性剪接
M
rna
大鼠
Keywords
phospholipase
C-gamma
1
alternative
rna
splicing
m
rna
rat
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Pre-mRNA选择性剪接的调控及选择性剪接数据库
邢永强
刘国庆
蔡禄
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
10
下载PDF
职称材料
2
MNS血型相关基因GYPA、GYPB、GYPE mRNA全长序列多态性分析
梁延连
吴凡
梁爽
徐筠娉
苏宇清
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
3
大鼠磷脂酶C-γ1前体mRNA剪接的初步鉴定
刘忠英
罗深秋
赵永忠
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
0
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职称材料
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