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等位基因特异PCR技术的研究与应用 被引量：19
1
作者 陈吉宝 景蕊莲 +1 位作者 员海燕 卫波 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 2005年第4期469-473,共5页
生物的单核苷酸多态性(Single-nucleotide polymorphism,SNP)具有数量多、分布广、易于分型、稳定性强等优点,很适合于用做分子标记。等位基因特异PCR(Allele-specific PCR,AS-PCR)是根据SNP位点设计3′末端与SNP位点碱基互补或错配的特... 生物的单核苷酸多态性(Single-nucleotide polymorphism,SNP)具有数量多、分布广、易于分型、稳定性强等优点,很适合于用做分子标记。等位基因特异PCR(Allele-specific PCR,AS-PCR)是根据SNP位点设计3′末端与SNP位点碱基互补或错配的特异PCR引物,通过凝胶电泳等方法检测PCR扩增产物的有或无,从而检测基因型中SNP的一种技术。经过不断地改进与完善,基于SNP的等位基因特异PCR标记已逐渐成为一种快速、简便、低成本、可靠、高通量的检测基因型SNP的方法。本文应用等位基因特异PCR技术,根据小麦TaDREB1基因在旱选10和鲁麦14的120(C→A)SNP成功地开发了一个SNP分子标记,证明了该方法的有效性和可行性。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 等位基因特异PCR技术 SNP标记
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抗稻瘟病Pid3/Pid3-A4基因特异InDel分子标记开发与应用
2
作者 黄卫衡 黄志远 +4 位作者 唐丽 彭志荣 朱立煌 辛业芸 吕启明 《杂交水稻》 CSCD 北大核心 2020年第2期68-74,共7页
为更加高效利用抗稻瘟病基因Pid3/Pid3-A4,通过分析3K水稻测序数据中Pid3基因等位变异,设计了Pid3和Pid3-A4基因特异InDel分子标记Pdg-C与PA4-C,利用这2个标记对中国杂交水稻常用亲本材料或品种以及美国水稻微核心种质资源进行检测.结果... 为更加高效利用抗稻瘟病基因Pid3/Pid3-A4,通过分析3K水稻测序数据中Pid3基因等位变异,设计了Pid3和Pid3-A4基因特异InDel分子标记Pdg-C与PA4-C,利用这2个标记对中国杂交水稻常用亲本材料或品种以及美国水稻微核心种质资源进行检测.结果 显示,Pdg-C和PA4-C能够分别快速、准确、经济地区分Pid3和Pid3-A4基因;通过克隆测序、表达分析及接菌鉴定,明确了水稻品种华占携带Pid3基因,栽培稻311100携带Pid3-A4基因,它们作为抗病基因供体更便于在水稻育种中利用. 展开更多
关键词 水稻 抗稻瘟病基因 Pid3/Pid3-A4 等位基因特异分子标记
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水稻抗褐飞虱基因Bph3特异性分子标记开发及应用 被引量：5
3
作者 邓钊 石媛媛 +4 位作者 赵新辉 秦鹏 刘开雨 王凯 杨远柱 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期3563-3568,共6页
Bph3是一个对褐飞虱具有广谱、持久抗性的主效基因,对水稻抗褐飞虱育种具有重要利用价值,但其至今仍缺乏基因特异性标记,限制了分子辅助育种中对它的高效利用。本研究通过对Bph3不同等位基因编码区进行测序比对,获得两个Bph3特异性SNP位... Bph3是一个对褐飞虱具有广谱、持久抗性的主效基因,对水稻抗褐飞虱育种具有重要利用价值,但其至今仍缺乏基因特异性标记,限制了分子辅助育种中对它的高效利用。本研究通过对Bph3不同等位基因编码区进行测序比对,获得两个Bph3特异性SNP位点SNP1(Bph3为T,其余为C)和SNP2(Bph3为C,其余为T)。在等位基因特异性PCR(allele-specific polymerase chain reaction,AS-PCR)方法的基础上,开发两对显性标记特异扩增两个SNP位点来分别鉴定Bph3和其余等位基因型,组合使用两对显性标记即可获得一套鉴定Bph3基因型的共显性标记。使用该套标记对水稻品种基因组DNA进行PCR扩增,鉴定PCR产物条带大小即可区分Bph3不同基因型。利用该方法对Bph3基因进行分子标记辅助选择育种,可快速有效的将其导入目标水稻品种,加快水稻抗褐飞虱品种选育进程。 展开更多
关键词 抗褐飞虱 Bph3 AS-PCR 分子标记辅助选择
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水稻耐盐基因SKC1特异性分子标记开发及应用 被引量：1
4
作者 蒋医蔚 韩晓丽 +5 位作者 闸雯俊 刘凯 李培德 徐华山 游艾青 周雷 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期3609-3614,共6页
SKC1是世界上第一个被克隆的水稻耐盐性QTL,为了使SKC1在水稻分子标记辅助选择(MAS)育种中得到高效和快速利用,本研究通过将SKC1不同等位基因测序及序列比对鉴定到一个SKC1基因内特异SNP位点,使用AS-PCR(allele-specific PCR)的方法加... SKC1是世界上第一个被克隆的水稻耐盐性QTL,为了使SKC1在水稻分子标记辅助选择(MAS)育种中得到高效和快速利用,本研究通过将SKC1不同等位基因测序及序列比对鉴定到一个SKC1基因内特异SNP位点,使用AS-PCR(allele-specific PCR)的方法加以改进开发了一套鉴定该SNP的功能性分子标记,利用该标记及待检测水稻品种基因组DNA进行PCR扩增,通过不同PCR产物条带大小将SKC1与其它等位基因区分开,可快速判断待测水稻SKC1的等位基因类型。本方法成本费用低廉、简单高效,可应用于大规模水稻种质资源SKC1等位基因筛选和MAS育种。本研究对创制耐盐水稻新种质、培育耐盐水稻新品种、推动盐碱地水稻种植推广具有一定的意义。 展开更多
关键词 耐盐性 SKC1 等位基因特异性PCR MAS 水稻
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抗稻瘟病基因Pi2的基因特异性KASP标记开发与应用 被引量：10
5
作者 杨义强 朱林峰 +5 位作者 李晓芳 付杰、 黄道强 邱先进 周少川 王重荣 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期1314-1321,共8页
水稻稻瘟病抗性基因Pi2是一个对稻瘟病生理小种具有广谱抗性的基因,对于水稻的稻瘟病抗性育种具有非常重要的应用价值。为提高Pi2的选择效率,本研究根据高抗稻瘟病品种黄广油占与高感稻瘟病品种广陆矮4号在Pi2基因的第787位、第788位密... 水稻稻瘟病抗性基因Pi2是一个对稻瘟病生理小种具有广谱抗性的基因,对于水稻的稻瘟病抗性育种具有非常重要的应用价值。为提高Pi2的选择效率,本研究根据高抗稻瘟病品种黄广油占与高感稻瘟病品种广陆矮4号在Pi2基因的第787位、第788位密码子上的变异GCA GGA/GTG TTA,基于竞争性等位基因PCR(KASP,kompetitive allele specific PCR)标记技术原理,开发Pi2的基因特异性KASP标记。对40个水稻品种的检测结果表明,所开发的基因特异性KASP标记可准确区分Pi2基因的抗性等位基因型、感病等位基因型和杂合基因型,并且与抗病表型高度关联,是一种鉴定Pi2基因的抗性等位基因的有效方法。F2分离群体的应用结果表明,该标记可在苗期检测育种材料的稻瘟病抗性基因Pi2的等位基因型,不需要将育种材料种到病圃鉴定,可用于预测育种材料的稻瘟病抗性,提高育种效率。本研究鉴定出了28个携带Pi2抗稻瘟病基因的广东水稻品种,并提供了可快速鉴定的分子标记,对提高品种培育效率,促进抗稻瘟病水稻品种的遗传改良,具有重要应用价值。 展开更多
关键词 水稻 抗稻瘟病基因 基因特异性标记 KASP标记 标记辅助选择
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75份贵州小麦品种(系)抗病基因的KASP标记检测 被引量：2
6
作者 隋建枢 陈天青 +4 位作者 罗永露 吴文强 程斌 王伟 何庆才 《山地农业生物学报》 2023年第3期80-85,共6页
贵州气候温暖湿润,容易发生小麦病害。因此选育推广抗病小麦品种,对贵州小麦安全生产至关重要。为明确75份贵州小麦品种(系)中所含抗病基因,本研究运用KASP标记技术对供试材料中所含叶锈病抗病基因(Lr14a、Lr46、Lr68、Lr34)、白粉病抗... 贵州气候温暖湿润,容易发生小麦病害。因此选育推广抗病小麦品种,对贵州小麦安全生产至关重要。为明确75份贵州小麦品种(系)中所含抗病基因,本研究运用KASP标记技术对供试材料中所含叶锈病抗病基因(Lr14a、Lr46、Lr68、Lr34)、白粉病抗病基因(Pm21)、赤霉病抗病基因(Fhb1)进行检测。结果表明:含有Lr14a的品种(系)共24份,占32.0%;含有Lr46的品种(系)共14份,占18.7%;含有Lr68的品种(系)共3份,占4.0%;含有Lr34的品种(系)共5份,占6.7%;含有Pm21的品种(系)共65份,占86.7%;未检测到含有Fhb1的品种(系);同时含有叶锈病、白粉病抗病基因的小麦品种(系)共计26份材料,占34.7%。本研究结果可为贵州小麦抗病育种亲本材料的应用提供参考。 展开更多
关键词 小麦 抗病基因 KASP 标记检测
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KASP分子标记辅助选育甜椒核雄性不育两用系 被引量：4
7
作者 范妍芹 严立斌 +1 位作者 孟雅宁 张红肖 《中国蔬菜》 北大核心 2022年第12期38-44,共7页
为了进一步提高甜椒核雄性不育两用系育种效率,利用AB91核雄性不育候选基因Capana05g000747的突变位点设计KASP分子标记,以转育甜椒核雄性不育两用系的F_(2)群体及育成的两用系为试验材料,对植株的育性进行基因型检测,并检验该标记的准... 为了进一步提高甜椒核雄性不育两用系育种效率,利用AB91核雄性不育候选基因Capana05g000747的突变位点设计KASP分子标记,以转育甜椒核雄性不育两用系的F_(2)群体及育成的两用系为试验材料,对植株的育性进行基因型检测,并检验该标记的准确性。结果表明,该分子标记与甜椒核雄性不育的育性呈现共分离,在苗期对F_(2)植株的基因型进行早期鉴别,分型准确率分别为98.91%和99.04%,可有效淘汰基因型为MSMS的可育株,筛选出基因型为MSms的可育株直接用于不育系的转育,转育出了黄色和红色甜椒核雄性不育两用系AB91-HTJ412和AB91-HLD163。在苗期对两用系群体的育性基因型进行早期鉴别,可有效淘汰基因型为MSms的可育株,选留基因型为msms的不育株直接用于杂交组合选配及杂交制种。 展开更多
关键词 甜椒 核雄性不育 杂交育种 竞争性等位基因特异性PCR 分子标记辅助选择
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利用SDS-PAGE和AS-PCR标记鉴定簇毛麦HMW-GS基因 被引量：3
8
作者 刘守斌 梁荣奇 +2 位作者 尤明山 李保云 刘广田 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2010年第15期38-43,共6页
通过SDS-PAGE和AS-PCR标记对簇毛麦HMW-GS进行鉴定,对于快速鉴别导入到普通小麦中的簇毛麦HMW-GS和改良普通小麦品质具有重要意义。利用SDS-PAGE对中国春、钱尼、簇毛麦、6个中国春-簇毛麦二体附加系、普通小麦-簇毛麦3V异代换系进行HMW... 通过SDS-PAGE和AS-PCR标记对簇毛麦HMW-GS进行鉴定,对于快速鉴别导入到普通小麦中的簇毛麦HMW-GS和改良普通小麦品质具有重要意义。利用SDS-PAGE对中国春、钱尼、簇毛麦、6个中国春-簇毛麦二体附加系、普通小麦-簇毛麦3V异代换系进行HMW-GS组成分析,进一步确定簇毛麦HMW-GS基因位于1V染色体。根据已发表的普通小麦HMW-GS基因序列同源性比较结果,设计了3对分别扩增普通小麦x-型亚基基因、y-型亚基基因以及所有HMW-GS基因的特异引物。经过对簇毛麦HMW-GS基因进行扩增发现,这3个AS-PCR标记都能很好地鉴别簇毛麦HMW-GS编码基因,并从分子水平上把簇毛麦HMW-GS基因定位于簇毛麦1V染色体上。 展开更多
关键词 簇毛麦 高分子量谷蛋白亚基 AS-PCR标记 多态性
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