琼胶寡糖体外清除自由基活性的研究 被引量：34

1

作者 赵雪 薛长湖 +3 位作者 徐强 许加超 李兆杰 林洪 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期280-282,共3页

在不同条件下对琼胶进行酸水解,得琼胶寡糖A1(以二、四糖为主)和A2(以己糖、辛糖为主)采用化学发光法和DPPH体系分别研究A1、A2对O2·-、·OH和DPPH3种自由基的清除作用。结果表明,A1、A2对3种自由基都有较好的清除作用,而且清... 在不同条件下对琼胶进行酸水解,得琼胶寡糖A1(以二、四糖为主)和A2(以己糖、辛糖为主)采用化学发光法和DPPH体系分别研究A1、A2对O2·-、·OH和DPPH3种自由基的清除作用。结果表明,A1、A2对3种自由基都有较好的清除作用,而且清除活性随糖浓度的增加而加强。在O2·-体系中,A2的IC50为0.54mg/mL,效果要好于A1(IC50为0.8mg/mL)。在·OH体系中,A2对·OH的清除作用比A1效果好,IC50分别为1.2和2.3mg/mL。2个体系比较发现A1、A2对O2·-的清除作用高于对·OH的清除作用。在DPPH体系中,A1、A2对DPPH有一定的清除,但A1较A2效果好,IC50分别为4和6 4mg/mL。由此可见,琼胶寡糖在不同体系中清除自由基的活性不同。琼胶寡糖在抗氧化方面具有很好的应用价值。 展开更多

关键词 琼胶寡糖 超氧阴离子自由基 羟基自由基 DPPH自由基 清除作用 清除活性

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酸解法制备琼胶低聚糖及其抗氧化性评价 被引量：25

2

作者 徐强 薛长湖 +4 位作者 赵雪 李兆杰 林洪 许加超 蔡跃飘 《中国海洋药物》 CAS CSCD 2002年第1期19-22,共4页

通过正交实验确定了水解琼胶的最佳方案为盐酸浓度 0 .0 5 mol· L-1、水解 90 min、底物浓度 4 % ,此条件下二糖得率为 4 0 %。水解产物经乙醇沉淀、超滤除去大分子后 ,经凝胶柱层析可得到琼胶低聚糖各寡糖组份。用化学发光分析法... 通过正交实验确定了水解琼胶的最佳方案为盐酸浓度 0 .0 5 mol· L-1、水解 90 min、底物浓度 4 % ,此条件下二糖得率为 4 0 %。水解产物经乙醇沉淀、超滤除去大分子后 ,经凝胶柱层析可得到琼胶低聚糖各寡糖组份。用化学发光分析法比较了琼胶、琼脂糖水解液在抗坏血酸 - Cu2 + -酵母悬浮液 -鲁米诺 - H2 O2 体系中清除羟基自由基 (· OH)的能力 ,两者清除· OH的 IC50 分别为 0 .0 5 g· L-1和 0 .313g· L-1。 展开更多

关键词 琼胶 正交实验 低聚糖 抗氧化性 酸解法 制备 评价

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琼胶寡糖对冻虾仁和罗非鱼片品质的影响 被引量：18

3

作者 戚勃 杨贤庆 +4 位作者 李来好 陈胜军 杨少玲 郝志明 刘刚 《南方水产科学》 CAS 北大核心 2012年第6期72-79,共8页

以干耗率、解冻流失率、蒸煮流失率、质构特性、盐溶性蛋白质量分数和钙激活三磷酸腺苷(Ca2+-ATP)酶活力为指标,研究了琼胶寡糖对虾仁和罗非鱼片在冻藏过程中品质的影响,同时对以海藻糖、水溶液浸泡处理的样品进行了比较。结果显示,经... 以干耗率、解冻流失率、蒸煮流失率、质构特性、盐溶性蛋白质量分数和钙激活三磷酸腺苷(Ca2+-ATP)酶活力为指标,研究了琼胶寡糖对虾仁和罗非鱼片在冻藏过程中品质的影响,同时对以海藻糖、水溶液浸泡处理的样品进行了比较。结果显示,经琼胶寡糖和海藻糖处理后的虾仁和罗非鱼片在冻藏过程中的干耗率、解冻流失率和蒸煮流失率均显著低于蒸馏水组和空白对照组(P<0.05);质构特性(硬度、胶黏性、凝聚性、弹性、咀嚼性和破断力)均优于蒸馏水和空白对照组;盐溶性蛋白质量分数和Ca2+-ATP酶活力均高于蒸馏水和空白对照组;经琼胶寡糖处理后的样品指标略优于海藻糖组。这表明琼胶寡糖能显著提高冷冻虾仁和罗非鱼片的品质,在冷冻水产品的保水、抗冻等方面具有一定的应用前景。 展开更多

关键词 琼胶寡糖 罗非鱼片 虾仁 冷冻

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琼胶酶水解工艺条件的优化及产物分析 被引量：10

4

作者 肖琼 肖安风 +3 位作者 姚德恒 朱艳冰 倪辉 蔡慧农 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第12期99-106,共8页

为探讨琼胶酶水解琼胶的动态过程变化,采用DNS法测定还原糖,结合苯酚-硫酸法测定体系总糖,根据二者比例,得出体系总糖随时间变化的平均聚合度,从而得出各因素对琼胶水解过程的影响。结果表明,来源于厦门红树林的海洋弧菌JMUAZ6菌株产生... 为探讨琼胶酶水解琼胶的动态过程变化,采用DNS法测定还原糖,结合苯酚-硫酸法测定体系总糖,根据二者比例,得出体系总糖随时间变化的平均聚合度,从而得出各因素对琼胶水解过程的影响。结果表明,来源于厦门红树林的海洋弧菌JMUAZ6菌株产生的琼胶酶,其水解琼胶的适宜工艺条件为:水解温度40℃,p H 7.0,初始底物质量浓度12 g/L,加酶量25%,在120 r/min振荡条件下酶解反应90 min。此工艺条件下产生还原糖的质量浓度2.179 g/L,平均聚合度最低值(DP)3。通过20 L罐放大试验验证小试优化工艺条件具有良好的重现性。采用薄层色谱分析酶解产物的降解情况,结果显示:反应48 h后,终产物为二糖及少量的四糖。 展开更多

关键词 琼胶 酶水解 工艺优化 聚合度 琼胶寡糖

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琼胶寡糖的抗氧化活性研究 被引量：7

5

作者 李海新 梁家铭 +3 位作者 李蓉 邱洁瑜 林文雄 柯德森 《广州化工》 CAS 2018年第20期66-68,共3页

以琼胶寡糖为研究对象,测定琼胶寡糖中还原糖的含量、FRAP值、对DPPH自由基、羟基自由基(·OH)和超氧阴离子自由基(O_2^-·)的清除率,探究琼胶寡糖的总还原力和对三种自由基的清除活力。研究表明,浓度为20 mg/m L的琼胶寡糖样液... 以琼胶寡糖为研究对象,测定琼胶寡糖中还原糖的含量、FRAP值、对DPPH自由基、羟基自由基(·OH)和超氧阴离子自由基(O_2^-·)的清除率,探究琼胶寡糖的总还原力和对三种自由基的清除活力。研究表明,浓度为20 mg/m L的琼胶寡糖样液对DPPH自由基清除率高达94. 43%;浓度为20 mg/m L的琼胶寡糖对羟基自由基清除率为25. 35%; 1 m L的10 mg/m L样液对NBT的超氧阴离子自由基的抗氧化活力为4. 49 u。此外还进一步研究其抗氧化能力和还原糖之间的关系,为琼胶寡糖的产业化提供理论基础。 展开更多

关键词 琼胶寡糖 抗氧化性 还原糖 自由基

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琼胶寡糖对脂多糖诱导的巨噬细胞RAW264.7炎症反应的抑制作用 被引量：5

6

作者 郑雅君 李美秀 +3 位作者 姜泽东 朱艳冰 倪辉 郑明静 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第6期72-82,共11页

目的:研究琼胶寡糖对脂多糖(LPS)诱导巨噬细胞RAW264.7炎症反应的抑制作用。方法:采用傅里叶红外光谱法、核磁共振和高效液相色谱法解析琼胶寡糖的分子结构;采用LPS诱导巨噬细胞RAW264.7建立炎症反应模型,测定琼胶寡糖对RAW264.7细胞活... 目的:研究琼胶寡糖对脂多糖(LPS)诱导巨噬细胞RAW264.7炎症反应的抑制作用。方法:采用傅里叶红外光谱法、核磁共振和高效液相色谱法解析琼胶寡糖的分子结构;采用LPS诱导巨噬细胞RAW264.7建立炎症反应模型,测定琼胶寡糖对RAW264.7细胞活力、细胞内一氧化氮(NO)、肿瘤坏死因子(TNF-α)和活性氧簇(ROS)水平的影响;采用Western blot分析丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路中c-Jun氨基末端激酶(JNK)、细胞外信号调节激酶(ERK)和蛋白激酶p38的表达和磷酸化水平。结果:分子结构鉴定结果显示琼胶寡糖具有β构型半乳糖糖环结构,分子质量范围为1065.5~1308.2 u。琼胶寡糖可以提高LPS诱导巨噬细胞系RAW264.7炎症反应后的细胞活力,在0~250μg/mL剂量下呈浓度依赖性地降低细胞内NO、TNF-α和ROS水平,对LPS诱导MAPK家族激酶JNK、ERK、p38磷酸化水平的升高具有抑制作用。结论:琼胶寡糖能够抑制LPS诱导的巨噬细胞RAW264.7炎症反应,可能与阻碍MAPK信号转导有关。 展开更多

关键词 琼胶寡糖 巨噬细胞RAW264.7 脂多糖 抗炎作用 丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路

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酶解琼胶制备活性寡糖的工艺条件研究 被引量：6

7

作者 梅建凤 应国清 +3 位作者 刘美英 易喻 陈建澍 王鸿 《浙江工业大学学报》 CAS 北大核心 2011年第2期119-122,共4页

考察了温度、振荡转速、体系pH、NaCl和底物浓度对酶解琼胶产生还原糖浓度的影响,以选择最佳的酶解条件,提高制备寡糖的得率.结果表明,来源于海洋细菌玫瑰杆菌(Roseobacter sp.)HS519-211菌株的琼胶酶,其水解琼胶制备寡糖的最佳条件是:... 考察了温度、振荡转速、体系pH、NaCl和底物浓度对酶解琼胶产生还原糖浓度的影响,以选择最佳的酶解条件,提高制备寡糖的得率.结果表明,来源于海洋细菌玫瑰杆菌(Roseobacter sp.)HS519-211菌株的琼胶酶,其水解琼胶制备寡糖的最佳条件是:以pH 7.0的磷酸缓冲液为酶解反应体系,3 g/L的溶解态琼胶为底物,在45℃2,00 r/min振荡条件下酶解反应120 min,可产生还原糖的质量浓度达476.9 mg/L,较优化前的299.2 mg/L提高了59.4%. 展开更多

关键词 琼胶 寡糖 酶解 工艺优化

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响应面法优化石花菜酸奶发酵工艺研究 被引量：6

8

作者 朱丰 刘施琳 +5 位作者 李天骄 林圣楠 黄金城 王红丽 赵艺凡 林向阳 《中国酿造》 CAS 北大核心 2017年第4期103-108,共6页

采用响应面法优化石花菜酸奶发酵工艺。采用中心组合试验设计,考察不同双歧杆菌接种量、石花菜添加量、蔗糖添加量、发酵时间对感官评价(R_1)、活菌数(R_2)两个指标的影响。结果表明,石花菜琼胶寡糖能增加酸奶的持水力,改变酸奶的组织... 采用响应面法优化石花菜酸奶发酵工艺。采用中心组合试验设计,考察不同双歧杆菌接种量、石花菜添加量、蔗糖添加量、发酵时间对感官评价(R_1)、活菌数(R_2)两个指标的影响。结果表明,石花菜琼胶寡糖能增加酸奶的持水力,改变酸奶的组织状态。石花菜酸奶发酵的最佳工艺条件为蔗糖添加量11%、石花菜添加量20%,双歧杆菌接种量1.5%,发酵时间为6 h,感官评分为80分,活菌数为2.65×109 CFU/mL。 展开更多

关键词 石花菜 琼胶寡糖 酸奶 响应面分析

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天然生物质材料的制备、性质与应用(Ⅳ)——胶凝稳定的多用途海藻胶:琼脂 被引量：4

9

作者 亓玺 樊建茹 +2 位作者 冯云 徐桂云 范金石 《日用化学工业》 CAS 北大核心 2022年第4期355-362,共8页

琼脂是从红藻中提取的一种海藻多糖,是世界上应用最广泛的海藻胶之一。因具有胶凝、无毒、稳定、增稠、透明、助悬、赋型等优良特性,且利用其分子结构中的羟基、糖苷键等活性基团进行降解、氧化、羧烷基化、羟烷基化及疏水化等改性方法... 琼脂是从红藻中提取的一种海藻多糖,是世界上应用最广泛的海藻胶之一。因具有胶凝、无毒、稳定、增稠、透明、助悬、赋型等优良特性,且利用其分子结构中的羟基、糖苷键等活性基团进行降解、氧化、羧烷基化、羟烷基化及疏水化等改性方法可赋予其更多更强的功能性质,琼脂及其改性产物在食品、生物、医药、化妆品、农业等多个领域得到广泛应用。本文阐述了琼脂的名称、来源和结构,以及物理性质、生产方法、改性技术和近期的应用进展情况,并指出了琼脂及其改性产物当前存在的问题和发展方向。 展开更多

关键词 琼脂 琼脂糖 琼胶寡糖 提取 改性 性质 应用

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腐烂龙须菜自水解生产琼胶寡糖的可行性研究 被引量：5

10

作者 朱思颖 陈丹琦 +3 位作者 梁家铭 李海新 李蓉 柯德森 《广州化工》 CAS 2016年第18期52-54,92,共4页

在不同温度、供氧量、盐度及处理时间条件下,对腐烂龙须菜的还原糖含量、琼胶酶活力及分子量进行分析,以探究龙须菜腐烂过程中自水解生产琼胶寡糖的可行性,并分析影响其水解程度因素。实验表明,腐烂龙须菜中有一种活性物质能降解琼胶生... 在不同温度、供氧量、盐度及处理时间条件下,对腐烂龙须菜的还原糖含量、琼胶酶活力及分子量进行分析,以探究龙须菜腐烂过程中自水解生产琼胶寡糖的可行性,并分析影响其水解程度因素。实验表明,腐烂龙须菜中有一种活性物质能降解琼胶生产琼胶寡糖。35℃、淡水半厌氧、腐烂处理96 h时的龙须菜产琼胶寡糖含量为"完好"样品近6倍,酶活力是0 h酶活力的约8.2倍。该条件下处理48 h的腐烂龙须菜的小分子琼胶寡糖的相对含量达98.71%。 展开更多

关键词 龙须菜 腐烂 琼胶酶 琼胶寡糖 分子量

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一种新型琼胶寡糖面膜精华液的研制 被引量：4

11

作者 林志魁 赵守辉 许紫芬 《广东化工》 CAS 2022年第8期77-80,共4页

以琼胶寡糖为原料,研制具有保湿、美白、抗氧化多功效的活性舒缓嫩肤面膜精华液。采用单因素试验筛选出琼胶寡糖精华液的最佳配方为:甘油8%,烟酰胺0.7%,琼胶寡糖1.4%。该配方制备的精华液粘稠适度,乳白半透明胶质,清爽细腻,无刺激性,能... 以琼胶寡糖为原料,研制具有保湿、美白、抗氧化多功效的活性舒缓嫩肤面膜精华液。采用单因素试验筛选出琼胶寡糖精华液的最佳配方为:甘油8%,烟酰胺0.7%,琼胶寡糖1.4%。该配方制备的精华液粘稠适度,乳白半透明胶质,清爽细腻,无刺激性,能被面膜基本均匀吸收,易涂展吸收,耐热性、耐寒性及性质稳定性良好。此琼胶寡糖面膜精华液具有一定保湿、美白、抗氧化的功效,其中使表皮含水率提升稳定至39.5%的优质状态,对酪氨酸的抑制率和DPPH自由基的清除率分别为84%和25%。该研究为琼胶寡糖在化妆品中的应用开发提供了可靠的依据。 展开更多

关键词 琼胶寡糖 保湿 美白 抗氧化 精华液 面膜

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琼胶寡糖对冻藏南美白对虾蛋白质功能特性的影响

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作者 宋佳 刘思雅 +6 位作者 李露静 田思雨 水珊珊 武天昕 郑文雄 杨榕琳 张宾 《食品安全质量检测学报》 CAS 北大核心 2023年第19期199-206,共8页

目的探究琼胶寡糖对冻藏南美白对虾蛋白质功能特性的影响。方法采用蒸馏水、1.5%和3.0%三聚磷酸钠、1.5%和3.0%琼胶寡糖浸泡南美白对虾,分别在冻藏第0、20、40、60、80和100 d时进行取样,测定其肌原纤维蛋白溶解性、浊度、乳化性(emulsi... 目的探究琼胶寡糖对冻藏南美白对虾蛋白质功能特性的影响。方法采用蒸馏水、1.5%和3.0%三聚磷酸钠、1.5%和3.0%琼胶寡糖浸泡南美白对虾,分别在冻藏第0、20、40、60、80和100 d时进行取样,测定其肌原纤维蛋白溶解性、浊度、乳化性(emulsifying activity index,EAI)、起泡性(foaming capacity,FC)和热稳定性。同时,利用苏木精-伊红(hematoxylin and eosin,HE)染色观察肌肉组织微观结构。结果在冻藏过程中,琼胶寡糖与三聚磷酸钠的作用效果相当,且1.5%、3.0%琼胶寡糖显著改善了虾仁肌原纤维蛋白溶解性、EAI和FC的降低以及浊度的增加情况,增加了其热稳定性。HE染色结果显示,新鲜虾仁内部肌肉组织排列紧密有序,而冻藏100 d后,各处理组虾仁肌肉纤维均有不同程度的扭曲断裂,其中3.0%琼胶寡糖组虾仁肌纤维间的连接仍十分紧密,组织结构最为完整。结论琼胶寡糖能有效保持冻藏南美白对虾蛋白质功能特性,维持肌肉组织结构,提高虾类品质。本研究为水产品抗冻剂的开发提供了借鉴和参考。 展开更多

关键词 南美白对虾 琼胶寡糖 三聚磷酸钠 肌原纤维蛋白 功能特性

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琼胶寡糖的保湿和吸湿性能研究 被引量：3

13

作者 林志魁 赵守辉 许紫芬 《广东化工》 CAS 2022年第2期59-61,共3页

近年来小分子类产品逐渐被广泛应用于皮肤保湿,琼胶寡糖是聚合度2~20的小分子,已有报道琼胶寡糖可作为美白成分添加于化妆品中,但琼胶寡糖作为化妆品保湿剂的应用及研究尚未见报道。本研究以常用的化妆品保湿剂甘油和海藻酸钠为参照物,... 近年来小分子类产品逐渐被广泛应用于皮肤保湿,琼胶寡糖是聚合度2~20的小分子,已有报道琼胶寡糖可作为美白成分添加于化妆品中,但琼胶寡糖作为化妆品保湿剂的应用及研究尚未见报道。本研究以常用的化妆品保湿剂甘油和海藻酸钠为参照物,对比其保湿性和吸湿性,及制备的保湿面霜的保湿率。结果表明,琼胶寡糖的吸湿性低于甘油和海藻酸钠,且保湿性高于甘油和海藻酸钠。琼胶寡糖自制成的面霜,涂抹2小时后皮肤水分值变化率为20.8%高于甘油的19.2%,且显著优于海藻酸钠自制的面霜的皮肤水分值变化率的12.5%。因此,琼胶寡糖作为保湿剂有较好的发展趋势。 展开更多

关键词 琼胶寡糖 保湿剂 面霜 皮肤保湿 化妆品

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琼脂低聚糖性质及在乳酸菌饮料中的应用研究 被引量：2

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作者 李文强 胡佳麒 +7 位作者 赵越 蓝周昀 阮叶萍 罗洁 周运华 吴伟都 李言郡 薛玉清 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2022年第22期235-240,共6页

该文研究了琼脂低聚糖QZ-C50的基础性能以及在乳酸菌饮料中琼脂低聚糖QZ-C50对其稳定性的影响。以凝胶强度、黏度变化来评估琼脂低聚糖作为稳定剂的基本特性;以Lumisizer稳定性扫描结果、粒径分布为指标,结合产品离心沉淀率和货架期静... 该文研究了琼脂低聚糖QZ-C50的基础性能以及在乳酸菌饮料中琼脂低聚糖QZ-C50对其稳定性的影响。以凝胶强度、黏度变化来评估琼脂低聚糖作为稳定剂的基本特性;以Lumisizer稳定性扫描结果、粒径分布为指标,结合产品离心沉淀率和货架期静态放置状态来确定琼脂低聚糖对乳酸菌饮料稳定性的作用。结果表明,琼脂低聚糖QZ-C50凝胶强度低、耐热性能、耐酸性能较好,低用量就具有较好的悬浮力;在乳酸菌饮料中添加0.04%(质量分数)琼脂低聚糖QZ-C50,可以有效降低乳酸菌饮料的粒径、减少沉淀量,大幅度提高产品稳定性。由此可知琼脂低聚糖QZ-C50较低凝胶强度的特性很适合饮料体系使用,且琼脂低聚糖QZ-C50的性能对增加乳酸菌饮料悬浮性、提升乳酸菌饮料整体稳定性有非常重要的价值。 展开更多

关键词 琼脂低聚糖 乳酸菌饮料 凝胶强度 离心沉淀率 黏度

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ZQM2017菌株琼胶酶水解琼胶的工艺研究 被引量：3

15

作者 陈丹琦 梁家铭 +3 位作者 李蓉 李海新 朱思颖 柯德森 《广州化工》 CAS 2017年第16期41-43,共3页

利用产自广东省南澳岛的腐烂龙须菜中新发现的一种弧菌科弧菌属(Vibrio sp.)的细菌ZQM2017提取得到高活力琼胶酶对该菌株所产琼胶酶水解琼胶的工艺进行了优化,从反应体系的振荡速率,底物浓度,振荡时间,体系pH和温度条件等因素的变化探... 利用产自广东省南澳岛的腐烂龙须菜中新发现的一种弧菌科弧菌属(Vibrio sp.)的细菌ZQM2017提取得到高活力琼胶酶对该菌株所产琼胶酶水解琼胶的工艺进行了优化,从反应体系的振荡速率,底物浓度,振荡时间,体系pH和温度条件等因素的变化探讨酶解琼胶产生还原糖的工艺条件,以选择最优的酶解条件。ZQM2017细菌产生的琼胶酶实验结果为制造功能性琼胶寡糖的工艺产业化提供了基础。 展开更多

关键词 新菌株ZQM2017 琼胶酶 琼胶寡糖 酶解 工艺优化

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琼胶寡糖为乳稳定剂在冰淇淋的应用

16

作者 林志魁 许紫芬 赵守辉 《广东化工》 CAS 2022年第24期63-65,55,共4页

在冰淇淋的传统基础配方上,研究以琼胶寡糖为乳稳定剂的冰淇淋工艺。结果表明:在感官方面,添加有琼胶寡糖的乳稳定剂制作的冰淇淋口感丝滑、组织细腻、清爽、形态完整。将琼胶寡糖、刺槐豆胶、单硬脂酸甘油酯以不同比例组成复配乳稳定剂... 在冰淇淋的传统基础配方上,研究以琼胶寡糖为乳稳定剂的冰淇淋工艺。结果表明:在感官方面,添加有琼胶寡糖的乳稳定剂制作的冰淇淋口感丝滑、组织细腻、清爽、形态完整。将琼胶寡糖、刺槐豆胶、单硬脂酸甘油酯以不同比例组成复配乳稳定剂,研究对冰淇淋粘度、抗融性和膨胀率的影响,并确定乳稳定剂的最佳配方:35%琼胶寡糖+35%刺槐豆胶+30%单硬脂酸甘油酯。 展开更多

关键词 琼胶寡糖 乳稳定剂 冰淇淋 抗融性 膨胀率 粘度

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海洋琼胶降解菌FG15基因组从头测序分析

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作者 曾鸿俏 张力雄 +1 位作者 刘明明 方再光 《海南大学学报（自然科学版）》 CAS 2017年第3期260-267,共8页

为充分了解琼胶降解菌FG15的基因功能和代谢途径,本研究使用SOAP de novo 2.04对Illumina Hiseq2000平台测序产生的基因片段进行了拼接和组装,同时利用Glimmer 3.02来预测基因的开放性阅读框,并采用蛋白质直系同源基因簇(COG)、基因本... 为充分了解琼胶降解菌FG15的基因功能和代谢途径,本研究使用SOAP de novo 2.04对Illumina Hiseq2000平台测序产生的基因片段进行了拼接和组装,同时利用Glimmer 3.02来预测基因的开放性阅读框,并采用蛋白质直系同源基因簇(COG)、基因本体数据库(GO)以及京都基因和基因组百科全书(KEGG)的数据来预测其基因功能,获得了代谢途径.结果表明:FG15的基因组大小为5.10 Mb,G+C含量为44.58%,共有38条Scaffolds,4 922个开放性阅读框,82个tRNA,2个rRNA;通过COG分析可将菌株FG15注释到22种COG功能类型,主要包括细胞代谢、细胞信号转导等;利用GO注释可将FG15注释到3大类39个GO功能亚类上;KEGG分析能将其定位到154个代谢通路中,包括物质代谢、次生代谢产物的生物合成等.次生代谢产物的合成代谢途径精确显示,FG15能合成青霉素和头孢菌素,且其与抗生素抗性实验的结果一致.研究结果为FG15功能基因组学的研究和相关次级代谢产物的生物合成途径以及异源表达的研究提供了理论基础. 展开更多

关键词 琼胶降解菌 琼胶寡糖 基因组从头测序 基因功能 代谢途径

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