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玉米开花促进基因ZmGI及其同源蛋白结构特征分析和功能预测
1
作者
陆雪峰
高媛
+7 位作者
奉杰
涂亮
刘鹏飞
郭向阳
王安贵
祝云芳
吴迅
陈泽辉
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024年第5期1410-1420,共11页
光周期是调控植物开花的重要因子之一,对植物的生长发育具有重要影响。为更好地揭示开花促进基因Zm GI在玉米中的功能,本研究以12个GI蛋白作为靶标,利用生物信息学分析方法,对GI各编码蛋白的理化性质、保守基序、蛋白质二级结构、基因...
光周期是调控植物开花的重要因子之一,对植物的生长发育具有重要影响。为更好地揭示开花促进基因Zm GI在玉米中的功能,本研究以12个GI蛋白作为靶标,利用生物信息学分析方法,对GI各编码蛋白的理化性质、保守基序、蛋白质二级结构、基因结构、上游启动子顺式调控元件等信息进行分析,旨在揭示Zm GI的表达模式。结果表明,同一亚群的基因结构相似度更高。12个同源蛋白表现出:(1)具有10个不同的保守模体;(2)不具有跨膜结构域的特征。亚细胞定位结果预测表明,GI蛋白可能定位于细胞核和叶绿体中。互作蛋白分析表明,具有CCT结构域的基因可能与Zm GI共表达于细胞中。组织表达模式分析发现,Zm GI在成熟叶片中显著表达。启动子分析结果显示,GI上游启动子中存在大量的逆境响应元件和光响应元件。这些结果将为深度解析Zm GI基因的功能提供更丰富的理论支撑。
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关键词
玉米
zmgi
基因
同源蛋白
基因
功能
原文传递
题名
玉米开花促进基因ZmGI及其同源蛋白结构特征分析和功能预测
1
作者
陆雪峰
高媛
奉杰
涂亮
刘鹏飞
郭向阳
王安贵
祝云芳
吴迅
陈泽辉
机构
贵州省农业科学院旱粮研究所
贵州大学农学院
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024年第5期1410-1420,共11页
基金
黔农科院青年基金项目([2022]13号)
国家自然科学基金项目(32171981,32060460,32160451)
贵州省科技基金项目(黔科合基础[2020]1Z09)共同资助。
文摘
光周期是调控植物开花的重要因子之一,对植物的生长发育具有重要影响。为更好地揭示开花促进基因Zm GI在玉米中的功能,本研究以12个GI蛋白作为靶标,利用生物信息学分析方法,对GI各编码蛋白的理化性质、保守基序、蛋白质二级结构、基因结构、上游启动子顺式调控元件等信息进行分析,旨在揭示Zm GI的表达模式。结果表明,同一亚群的基因结构相似度更高。12个同源蛋白表现出:(1)具有10个不同的保守模体;(2)不具有跨膜结构域的特征。亚细胞定位结果预测表明,GI蛋白可能定位于细胞核和叶绿体中。互作蛋白分析表明,具有CCT结构域的基因可能与Zm GI共表达于细胞中。组织表达模式分析发现,Zm GI在成熟叶片中显著表达。启动子分析结果显示,GI上游启动子中存在大量的逆境响应元件和光响应元件。这些结果将为深度解析Zm GI基因的功能提供更丰富的理论支撑。
关键词
玉米
zmgi
基因
同源蛋白
基因
功能
Keywords
Maize
zmgi
gene
Homologous protein
Gene function
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
玉米开花促进基因ZmGI及其同源蛋白结构特征分析和功能预测
陆雪峰
高媛
奉杰
涂亮
刘鹏飞
郭向阳
王安贵
祝云芳
吴迅
陈泽辉
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024
0
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