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云南高峰牛MHC-DQB基因外显子2遗传多态性分析
被引量:
3
1
作者
禹文海
鲁绍雄
+3 位作者
和占龙
刘红文
陆润峰
金建斌
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2011年第10期117-121,共5页
本研究采用PCR直接测序和PCR-RFLP法研究了云南高峰牛MHC-DQB基因外显子2(DQB.2)的遗传多态性,并利用DNAMAN软件分析了云南高峰牛与部分物种DQB.2相应核苷酸序列的同源性。结果发现,共检测到了17个等位基因,其中HaeⅢ酶切位点存在10种...
本研究采用PCR直接测序和PCR-RFLP法研究了云南高峰牛MHC-DQB基因外显子2(DQB.2)的遗传多态性,并利用DNAMAN软件分析了云南高峰牛与部分物种DQB.2相应核苷酸序列的同源性。结果发现,共检测到了17个等位基因,其中HaeⅢ酶切位点存在10种基因型,由A、B、C、D和E 5个复等位基因控制;RsaⅠ酶切位点存在22种基因型,由A、B、C、D、E、F、G、H、I、J和K共11个复等位基因控制;TaqⅠ酶切位点只出现了1种基因型。分析发现,云南高峰牛DQB.2基因的12、25、63、96、106、126、152、156、165、204位的碱基表现出了多态性。所分析的物种该基因片段大小相同均为270bp,云南高峰牛第224位碱基缺失及236位碱基插入现象。云南高峰牛与人、猪、马、绵羊、黄牛×瘤牛的核苷酸序列的同源性分别为81.4%、83.3%、78.1%、87.7%、86.6%。经χ2检验结果表明,HaeⅢ和TaqⅠ酶切位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而RsaⅠ酶切位点则未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。
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关键词
云南高峰牛
主要组织相容性复合体(MHC)
DQB基因
外显子2
遗传多态性
下载PDF
职称材料
云南高峰黄牛BoLA-DRB3基因外显子2的PCR-RFLP多态性分析
被引量:
2
2
作者
禹文海
刘红文
+2 位作者
鲁绍雄
连林生
陆润峰
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
2007年第5期694-698,共5页
通过PCR扩增获得云南高峰黄牛BoLA-DRB3基因第2外显子284bp的特异性条带,用核酸限制内切酶HaeⅢ,RsaⅠ,BstYⅠ和TaqⅠ对其进行消化分析。其中HaeⅢ酶切位点存在9种基因型,由A,B,D,E和F 5种复等位基因控制;RsaⅠ酶切位点存在46种基因型,...
通过PCR扩增获得云南高峰黄牛BoLA-DRB3基因第2外显子284bp的特异性条带,用核酸限制内切酶HaeⅢ,RsaⅠ,BstYⅠ和TaqⅠ对其进行消化分析。其中HaeⅢ酶切位点存在9种基因型,由A,B,D,E和F 5种复等位基因控制;RsaⅠ酶切位点存在46种基因型,由A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,P,L,M,N,U,V,W和Y 18种复等位基因控制;BstYⅠ酶切位点存在10种基因型,由A,B、C,D和E 5种复等位基因控制;TaqⅠ酶切位点只出现了一种基因型。分析发现云南高峰黄牛DRB3基因第2外显子的61,70,94,104,124,150,154,163,173,182,202和217位的碱基表现出了多态性。经x2检验表明,BstYⅠ和TaqⅠ酶切位点已经达到了Hardy-Weinberg平衡状态,而HaeⅢ和RsaⅠ两个酶切位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态。
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关键词
云南高峰黄牛
BOLA-DRB3
外显子2
PCR-RFLP
多态性
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职称材料
题名
云南高峰牛MHC-DQB基因外显子2遗传多态性分析
被引量:
3
1
作者
禹文海
鲁绍雄
和占龙
刘红文
陆润峰
金建斌
机构
中国医学科学院
云南农业大学动物科学技术学院
云南省家畜改良站
云南省广南县畜牧局
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2011年第10期117-121,共5页
基金
云南省应用基础研究面上项目(2009ZC184M)
文摘
本研究采用PCR直接测序和PCR-RFLP法研究了云南高峰牛MHC-DQB基因外显子2(DQB.2)的遗传多态性,并利用DNAMAN软件分析了云南高峰牛与部分物种DQB.2相应核苷酸序列的同源性。结果发现,共检测到了17个等位基因,其中HaeⅢ酶切位点存在10种基因型,由A、B、C、D和E 5个复等位基因控制;RsaⅠ酶切位点存在22种基因型,由A、B、C、D、E、F、G、H、I、J和K共11个复等位基因控制;TaqⅠ酶切位点只出现了1种基因型。分析发现,云南高峰牛DQB.2基因的12、25、63、96、106、126、152、156、165、204位的碱基表现出了多态性。所分析的物种该基因片段大小相同均为270bp,云南高峰牛第224位碱基缺失及236位碱基插入现象。云南高峰牛与人、猪、马、绵羊、黄牛×瘤牛的核苷酸序列的同源性分别为81.4%、83.3%、78.1%、87.7%、86.6%。经χ2检验结果表明,HaeⅢ和TaqⅠ酶切位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而RsaⅠ酶切位点则未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。
关键词
云南高峰牛
主要组织相容性复合体(MHC)
DQB基因
外显子2
遗传多态性
Keywords
yunnan
humped
cattle
MHC
DQB
gene
exon
2
genetic
polymorphism
分类号
S813.8 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
云南高峰黄牛BoLA-DRB3基因外显子2的PCR-RFLP多态性分析
被引量:
2
2
作者
禹文海
刘红文
鲁绍雄
连林生
陆润峰
机构
云南农业大学动物科学技术学院
云南省家畜改良站
云南省广南县畜牧局
出处
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
2007年第5期694-698,共5页
基金
云南省中青年学术技术带头人后备人才培养项目(2005PY01-11)
文摘
通过PCR扩增获得云南高峰黄牛BoLA-DRB3基因第2外显子284bp的特异性条带,用核酸限制内切酶HaeⅢ,RsaⅠ,BstYⅠ和TaqⅠ对其进行消化分析。其中HaeⅢ酶切位点存在9种基因型,由A,B,D,E和F 5种复等位基因控制;RsaⅠ酶切位点存在46种基因型,由A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,P,L,M,N,U,V,W和Y 18种复等位基因控制;BstYⅠ酶切位点存在10种基因型,由A,B、C,D和E 5种复等位基因控制;TaqⅠ酶切位点只出现了一种基因型。分析发现云南高峰黄牛DRB3基因第2外显子的61,70,94,104,124,150,154,163,173,182,202和217位的碱基表现出了多态性。经x2检验表明,BstYⅠ和TaqⅠ酶切位点已经达到了Hardy-Weinberg平衡状态,而HaeⅢ和RsaⅠ两个酶切位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态。
关键词
云南高峰黄牛
BOLA-DRB3
外显子2
PCR-RFLP
多态性
Keywords
yunnan
humped
cattle
BoLA-
DRB3
Exon2
Polymorphism
PCR-
RFLP
分类号
S823.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
云南高峰牛MHC-DQB基因外显子2遗传多态性分析
禹文海
鲁绍雄
和占龙
刘红文
陆润峰
金建斌
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2011
3
下载PDF
职称材料
2
云南高峰黄牛BoLA-DRB3基因外显子2的PCR-RFLP多态性分析
禹文海
刘红文
鲁绍雄
连林生
陆润峰
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
2007
2
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职称材料
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