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题名沼泽型水牛Y染微卫星标记的筛选与多态性检测
被引量:2
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作者
张晓明
乐祥鹏
张春梅
蓝贤勇
陈宏
雷初朝
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机构
西北农林科技大学动物科技学院陕西省农业分子生物学重点实验室
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出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第3期242-247,共6页
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基金
教育部新世纪优秀人才支持计划项目(编号:NCET-07-0699)资助
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文摘
为了研究水牛Y染色体的遗传多样性,文章以滇东南水牛3个地方群体——红河(HH)、西双版纳(BN)和普洱(PR)共31头公牛为研究对象,选取14个家牛Y染色体特异性微卫星标记,以检测这些标记在水牛Y染色体遗传多样性研究中的可行性。结果表明,3个标记(INRA008、UMN0103和UMN0504)只有1个等位基因,表现为单态;3个标记(UMN1113、UMN0304和BC1.2)均为3个等位基因,但呈单态;3个标记(UMN0920、UMN0307和UMN3008)呈现无规律的梯状条带,所以这9个标记都不适用于水牛的Y染色体遗传多样性研究;只有5个标记(INRA124、INRA189、BM861、PBR1F1和UMN2001)具有多态性,表明适用于水牛的Y染色体遗传多样性研究。这5个多态性Y染色体特异微卫星标记在滇东南水牛群体中的平均等位基因数(NA)为2.8000,平均期望杂合度(He)为0.3998,基因多样性(GD)为0.4144,多态信息含量(PIC)为0.3245,Shannon信息熵(SI)为0.5849,表明滇东南水牛群体的Y染色体具有中等遗传多态性。
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关键词
水牛
y染色体微卫星标记
遗传多样性
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Keywords
swamp buffalo
y chromosome microsatellite
genetic diversity
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分类号
S823
[农业科学—畜牧学]
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