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兴义矮脚鸡肠道微生物与其体质量的关联性
1
作者 龙小霞 杨永鲜 +6 位作者 吕玉新 吴古荣 张欢 杨金春 汪潘 杨胜宏 王忠 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期311-322,共12页
【目的】探究不同体质量分组兴义矮脚鸡肠道菌群及其网络结构特征,鉴定出与鸡体质量相关的潜在生物标志物,为养鸡业促生长益生菌的发掘提供理论依据。【方法】从同批次的110羽兴义矮脚母鸡群体(16周龄)中选取体质量最高的20羽组成HWC组(... 【目的】探究不同体质量分组兴义矮脚鸡肠道菌群及其网络结构特征,鉴定出与鸡体质量相关的潜在生物标志物,为养鸡业促生长益生菌的发掘提供理论依据。【方法】从同批次的110羽兴义矮脚母鸡群体(16周龄)中选取体质量最高的20羽组成HWC组(1.12±0.05 kg),体质量最低的20羽组成LWC组(0.74±0.05 kg),采集肛门粪便样品检测16SrRNA序列V3~V4可变区,利用Mothur进行肠道菌群Alpha多样性,采用基于未加权UniFrac距离的主坐标分析(PCoA)评估肠道菌群Beta多样性,通过SparCC算法构建肠道菌群互作网络,并应用LEfSe分析鉴定与兴义矮脚鸡体质量相关的肠道微生物。【结果】从40份兴义矮脚鸡粪便样品中共获得3145511条Clean reads,经DADA2聚类分析得到22297个扩增子序列变异体(ASVs)。在门分类水平上,兴义矮脚鸡肠道菌群中相对丰度排名前5的菌门包括厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门、放线菌门和热脱硫杆菌门,对应的相对丰度分别为67.54%、12.24%、11.28%、2.39%和1.26%;在属分类水平上,相对丰度排名前5的菌属分别为乳酸杆菌属、罗斯氏菌属、利吉拉杆菌属、拟杆菌属和志贺杆菌属,对应的相对丰度分别为23.35%、14.86%、5.44%、4.63%和2.77%。LWC组兴义矮脚鸡肠道菌群稳定性指数为3.95%,HWC组的为12.22%,且LWC组的网络复杂性(5.57%)也低于HWC组(7.70%),推测低体质量兴义矮脚鸡肠道菌群复杂性和稳定性的下降与其体质量较低有关。兴义矮脚鸡肠道菌群互作网络中重要性评分排名前5的枢纽菌群分别是植物乳杆菌、乳球菌、瘤胃球菌属扭链群、粪杆菌属和理研菌科_RC9_菌群。LEfSe分析发现,有18个ASVs的相对丰度在HWC组和LWC组间呈显著差异(LDA>2,P<0.05),其中,12个ASVs表现为在LWC组的相对丰度高于HWC组,6个ASVs表现为在HWC组的相对丰度高于LWC组。【结论】肠杆菌科、支原体属等有害菌相对丰度的上升会降低鸡肠道� 展开更多
关键词 兴义矮脚鸡 肠道菌群 体质量 互作网络 16S rRNA
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两种贵州地方鸡线粒体DNA控制区全序列分析 被引量：2
2
作者 王文涛 陈彬 傅筑荫 《湖北农业科学》 北大核心 2011年第15期3114-3115,3119,共3页
采用PCR和直接测序的方法测定兴义矮脚鸡和长顺绿壳蛋鸡线粒体DNA控制区全序列,分析比较两者mtDNA D-loop序列3个区的变异。结果表明,兴义矮脚鸡和长顺绿壳蛋鸡线粒体DNA控制区全序列长分别为1 231和1 230 bp,其中兴义矮脚鸡mtDNA控制... 采用PCR和直接测序的方法测定兴义矮脚鸡和长顺绿壳蛋鸡线粒体DNA控制区全序列,分析比较两者mtDNA D-loop序列3个区的变异。结果表明,兴义矮脚鸡和长顺绿壳蛋鸡线粒体DNA控制区全序列长分别为1 231和1 230 bp,其中兴义矮脚鸡mtDNA控制区的碱基摩尔分数分别为A 26.92%、T33.41%、G 13.39%、C 26.29%,长顺绿壳蛋鸡的分别是A 27.13%、T 33.58%、G 13.20%、C 26.09%。t检验显示两种贵州地方鸡种间线粒体DNA控制区碱基A与C的含量差异显著,说明A与C之间的颠换较多。兴义矮脚鸡和长顺绿壳蛋鸡的遗传距离是0.038 6,根据分子钟计算,二者大约在193万年前分歧进化。 展开更多
关键词 线粒体DNA控制区 兴义矮脚鸡 长顺绿壳蛋鸡 遗传变异
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兴义矮脚鸡生长激素受体基因内含子2的多态性 被引量：2
3
作者 张福平 裴勤贤 +3 位作者 傅筑荫 陈彬 华时尚 王希军 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2011年第6期138-140,共3页
为合理利用兴义矮脚鸡的遗传资源,利用PCR-RFLP技术对兴义矮脚鸡生长激素受体(GHR)基因内含子2的多态性进行了研究。结果表明,兴义矮脚鸡GHR基因内含子2 Hind-Ⅲ位点表现出多态性,具有B、C 2个等位基因。公鸡中检测到BB、CC和BC 3种基因... 为合理利用兴义矮脚鸡的遗传资源,利用PCR-RFLP技术对兴义矮脚鸡生长激素受体(GHR)基因内含子2的多态性进行了研究。结果表明,兴义矮脚鸡GHR基因内含子2 Hind-Ⅲ位点表现出多态性,具有B、C 2个等位基因。公鸡中检测到BB、CC和BC 3种基因型,在母鸡群中仅检测到BB、CC 2种基因型,未检测到杂合型BC。 展开更多
关键词 兴义矮脚鸡 GHR基因 PCR-RFLP
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兴义矮脚鸡群体内遗传变异分析 被引量：1
4
作者 张福平 傅筑荫 +1 位作者 陈彬 吴志国 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第14期7356-7358,共3页
[目的]从分子水平上分析兴义矮脚鸡的选育效果,为矮小型鸡的品种资源保护和开发利用提供理论依据。[方法]采用10个微卫星座位对3个品系贵州兴义矮脚鸡(100日龄),即黄羽(xy)、麻羽(xs)和黑羽(xb)(各50只)的遗传多样性进行研究。[结果]3... [目的]从分子水平上分析兴义矮脚鸡的选育效果,为矮小型鸡的品种资源保护和开发利用提供理论依据。[方法]采用10个微卫星座位对3个品系贵州兴义矮脚鸡(100日龄),即黄羽(xy)、麻羽(xs)和黑羽(xb)(各50只)的遗传多样性进行研究。[结果]3品系矮脚鸡在10个微卫星座位上共检测到68个等位基因,各座位上等位基因数为5～10个,平均为6.800个,平均有效等位基因数4.3002。10个微卫星座位的期望杂合度在0.5238～0.8816,平均为0.7326。多态信息含量(PIC)的范围在0.4981～0.8656,平均为0.6973。3品系间的遗传分化系数(Fst)为0.0129～0.0664,平均值为0.0289。各座位的基因流都大于1,平均Nm值为8.4109。3品系矮脚鸡两两之间的遗传距离在0.0464～0.1474之间,xy和xs品系间的遗传距离最小,但两者与xb品系之间的遗传距离均较远。[结论]兴义矮脚鸡各品系间遗传分化较小,均有丰富的遗传多样性,仍有较大的选育空间。 展开更多
关键词 兴义矮脚鸡 微卫星标记 遗传变异 F-统计量
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蛋氨酸水平对兴义矮脚鸡生长性能及养分表观代谢率的影响 被引量：1
5
作者 蔡惠芬 施晓丽 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2021年第10期2295-2300,共6页
【目的】探讨蛋氨酸水平对龄兴义矮脚鸡生长及养分消化代谢的影响,为兴义矮脚鸡可消化蛋氨酸需要量的研究和生产提供科学依据。【方法】选取0日龄健康兴义矮脚进行0~28和29~49 d两个阶段不同蛋氨酸水平的饲养和代谢试验,0~28 d蛋氨酸水... 【目的】探讨蛋氨酸水平对龄兴义矮脚鸡生长及养分消化代谢的影响,为兴义矮脚鸡可消化蛋氨酸需要量的研究和生产提供科学依据。【方法】选取0日龄健康兴义矮脚进行0~28和29~49 d两个阶段不同蛋氨酸水平的饲养和代谢试验,0~28 d蛋氨酸水平分别为0.24%、0.32%、0.40%、0.48%,第29~49天分别为0.20%、0.30%、0.40%、0.50%,测定试验鸡的日均增重、日均采食量、料重比和养分表观代谢率。【结果】随着蛋氨酸水平的提高,矮脚鸡0~28和29~49 d的采食量和日增重均极显著增加(P<0.01),蛋氨酸水平分别增至0.40%和0.50%时,日增重和采食量均极显著降低(P<0.01);饲料转化效率则以0.30%水平(0~28 d)和0.32%水平(29~49 d)最低;蛋氨酸水平对养分消化代谢呈无规律变化。【结论】以日增重和日均采食量为指标,0~28和29~49 d兴义矮脚鸡适宜蛋氨酸水平均为0.40%。 展开更多
关键词 兴义矮脚鸡 蛋氨酸 生长性能 表观代谢率
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