-
题名黑果枸杞XTH转录因子家族鉴定与生物信息学分析
被引量：2
- 1
-
-
作者
贾西贝
李效雄
杜雨
胡晓桐
刘筠
马彦军
-
机构
甘肃农业大学林学院
兰州资源环境职业技术大学
-
出处
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第10期2916-2924,共9页
-
基金
甘肃省高校产业支撑计划(2023CYZC-46)
兰州资源环境职业技术大学重点研究项目(X2022ZD-05)
兰州市科技计划项目(2022-2-22)资助。
-
文摘
为探究木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(Xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,XTHs)基因家族在黑果枸杞(Lycium ruthenicum)生长发育中的作用,以及对盐胁迫的响应,本文通过生物信息学方法对XTHs基因的理化性质、保守结构域、进化关系和表达模式进行分析。从黑果枸杞转录组数据中共筛选出19个LrXTHs成员,其编码氨基酸的数目为258~330 aa,分子量为29.77~37.98 kDa,等电点为4.98~8.92,基因长度为954~1814 bp。LrXTHs成员都含DE(I/L/F/V)D(F/I/M)EFLG保守结构域。系统发育树显示XTH基因家族可分为4个亚族。基因表达谱显示不同组织中的LrXTHs在盐胁迫下具有不同的表达趋势,LrXTH3,LrXTH18和LrXTH19在根部组织中高表达,LrXTH9在根部和叶部组织中高表达,表明LrXTHs可能在黑果枸杞的盐胁迫响应中发挥重要作用。该结果为黑果枸杞及XTH家族的进一步研究提供了参考。
-
关键词
黑果枸杞
NACL胁迫
xth转录因子
生物信息学
系统发育树
-
Keywords
Lycium ruthenicum
NaCl stress
xth transcription factor
Bioinformatics
Evolutionary tree
-
分类号
S722.36
[农业科学—林木遗传育种]
-
