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中国数字病理发展展望 被引量:14
1
作者 包骥 步宏 《实用医院临床杂志》 2017年第5期1-2,共2页
全载玻片成像扫描(Whole Slide imaging,WSI)技术及其衍生的一系列数字病理技术和方法为改变传统临床病理诊断方法,探索计算机辅助临床病理诊断和提高远程病理会诊的学术培训交流创造了新的机会。随着人工智能技术的兴起,相信在今后病... 全载玻片成像扫描(Whole Slide imaging,WSI)技术及其衍生的一系列数字病理技术和方法为改变传统临床病理诊断方法,探索计算机辅助临床病理诊断和提高远程病理会诊的学术培训交流创造了新的机会。随着人工智能技术的兴起,相信在今后病理日常工作中WSI技术将逐步替代传统切片的诊断地位。本文从临床诊断病理的角度出发,阐述数字病理的发展阶段、特点和面临的挑战,讨论今后数字病理在中国的发展方向。 展开更多
关键词 全载玻片成像扫描 数字病理 远程病理
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数字病理中计算机辅助诊断研究展望 被引量:10
2
作者 邓杨 包骥 《实用医院临床杂志》 2017年第5期10-12,共3页
随着数字病理切片扫描仪的出现,病理切片图像信息能够通过全玻片数字扫描(Whole slide imaging,WSI)技术实现全数字化。WSI首先可以通过计算机网络开展病理远程会诊,但更重要的是可以和计算机强大的计算能力结合开展计算机辅助诊断(comp... 随着数字病理切片扫描仪的出现,病理切片图像信息能够通过全玻片数字扫描(Whole slide imaging,WSI)技术实现全数字化。WSI首先可以通过计算机网络开展病理远程会诊,但更重要的是可以和计算机强大的计算能力结合开展计算机辅助诊断(computer-aided diagnosis,CAD)。病理图像的全数字化起步较晚,数字病理图像CAD目前在全球范围内还只处于实验室研究阶段,但已是数字病理发展的方向和目标。随着与人工智能、大数据与云技术的结合,数字病理CAD研发将迎来快速发展期。本文将着重讨论CAD在未来数字病理临床应用中的发展阶段和研究方向。 展开更多
关键词 全玻片数字扫描 计算机辅助诊断 数字病理
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基于深度学习的人工智能在数字病理学中的进展 被引量:9
3
作者 杨鑫(综述) 章真(审校) 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期151-155,共5页
全切片数字化图像扫描技术的进步促成了数字病理学的诞生。随着存储技术的提高和互联网技术与计算机技术的迅速发展,深度学习的方法被广泛应用于病理学图像的分析中,其目标是化解病理学图像冗余复杂的信息导致病理学医师诊断和分析困难... 全切片数字化图像扫描技术的进步促成了数字病理学的诞生。随着存储技术的提高和互联网技术与计算机技术的迅速发展,深度学习的方法被广泛应用于病理学图像的分析中,其目标是化解病理学图像冗余复杂的信息导致病理学医师诊断和分析困难的问题,减轻病理学医师日常繁琐的分析工作,并提高分析结果的准确度。回顾分析常用于病理学分析的深度学习方法,介绍深度学习在病理学分析中各领域的应用,并讨论深度学习在病理学分析中的挑战和机遇。 展开更多
关键词 深度学习 人工智能 数字病理学 全切片数字化图像扫描技术
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面向下一代数字病理成像分析仪的高通量全彩色傅里叶叠层显微成像术(特邀) 被引量:4
4
作者 潘安 高宇婷 +3 位作者 王爱业 高慧琴 马彩文 姚保利 《光子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第7期191-215,共25页
傅里叶叠层显微成像术是近年来提出的新型计算成像技术,它有效解决了传统显微成像中分辨率与视场制约的问题,无需对样本进行机械扫描便能获得十亿像素级的高通量图像,有效解决传统数字病理扫描仪器的拼接伪影、重影、拼接成功率低、景... 傅里叶叠层显微成像术是近年来提出的新型计算成像技术,它有效解决了传统显微成像中分辨率与视场制约的问题,无需对样本进行机械扫描便能获得十亿像素级的高通量图像,有效解决传统数字病理扫描仪器的拼接伪影、重影、拼接成功率低、景深狭小、效率偏低等问题。近年来更是发现其不单是解决视场与分辨率制约的工具,更是解决一系列权衡问题的范式,从而迸发出源源不绝的生命力与应用潜力。本文全方位概述了傅里叶叠层显微成像术技术9个方面的发展趋势,简介了其起源与基本原理,着重综述了其在面向下一代数字病理成像分析仪的多个阶段与最新进展。指出其在这一应用方向上已进入“10-100”的产业化阶段。讨论了其产生大规模社会经济效益的可能性,其极有可能给数字病理行业及其上下游相关行业带来突破进展。尽管如此,作为典型交叉领域仍有不尽人意之处,包括科学问题、技术问题、工程问题及行业问题,需要多方共同努力推进,展望了未来技术与工程发展方向。 展开更多
关键词 数字病理学 全划片成像 计算成像 高通量 高内涵 傅里叶叠层显微成像术
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浆膜腔积液细胞块全切片扫描图像作为初始诊断的可行性研究 被引量:4
5
作者 李媛媛 钟琴 胡佐鸿 《实用医院临床杂志》 2016年第4期89-92,共4页
目的 探讨全切片扫描图像技术在浆膜腔积液细胞块初始诊断中的可行性。方法 回顾成都市第一人民医院病理科2015年1~12月318例浆膜腔积液细胞块病理资料,采用优纳第四代全自动数字切片扫描系统扫描玻片,存入电脑。所有玻片均由同一位病... 目的 探讨全切片扫描图像技术在浆膜腔积液细胞块初始诊断中的可行性。方法 回顾成都市第一人民医院病理科2015年1~12月318例浆膜腔积液细胞块病理资料,采用优纳第四代全自动数字切片扫描系统扫描玻片,存入电脑。所有玻片均由同一位病理主治医生独立重新阅片分析。观察者先进行原始玻片传统光学显微镜判读,5周后再于电脑上判读数字切片。阅片结束后,计算分析光学显微镜上判读与电脑数字切片判读的的可重复性。结果 全切片扫描图像诊断与传统光学显微镜诊断的,Kappa值0.91。所有的诊断差异性出现在可疑肿瘤病例,在良性与恶性病例之间没有诊断差异性。结论数字切片扫描图像技术可用于细胞块初始诊断。 展开更多
关键词 全切片扫描图像 传统光学显微镜 数字切片 浆膜腔积液 细胞块
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基于人工智能的H-E染色全切片病理学图像分析在肺癌研究中的进展
6
作者 姜梦琦(综述) 韩昱晨(审校) 傅小龙(审校) 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期306-315,共10页
病理学是疾病诊断的金标准。利用全切片扫描技术将病理切片转化为数字图像后,人工智能特别是深度学习模型在病理学图像分析领域展现出了巨大潜力。人工智能在肺癌全切片扫描中的应用涉及组织病理学分型、肿瘤微环境分析、疗效及生存预... 病理学是疾病诊断的金标准。利用全切片扫描技术将病理切片转化为数字图像后,人工智能特别是深度学习模型在病理学图像分析领域展现出了巨大潜力。人工智能在肺癌全切片扫描中的应用涉及组织病理学分型、肿瘤微环境分析、疗效及生存预测等多个方面,有望辅助临床进行精准治疗决策。然而标注数据不足、切片质量差异等因素也限制了病理学图像分析的发展。本文总结了肺癌领域利用人工智能手段进行病理学图像分析的应用进展,并对未来发展方向进行展望。 展开更多
关键词 全切片扫描 肺癌 人工智能 卷积神经网络
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全视野数字病理图像智能分析
7
作者 王景川 胡喜风 +1 位作者 许宏吉 刘治 《生物医学工程研究》 2024年第3期175-180,222,共7页
随着数字组织病理学的快速发展,全视野数字病理切片(whole slide imaging, WSI)在医疗领域得到了广泛应用。近年来,深度学习算法的飞速发展为WSI的研究提供了新契机。为更好地分析WSI,充分利用其中丰富的细节信息,通过深度学习算法提取... 随着数字组织病理学的快速发展,全视野数字病理切片(whole slide imaging, WSI)在医疗领域得到了广泛应用。近年来,深度学习算法的飞速发展为WSI的研究提供了新契机。为更好地分析WSI,充分利用其中丰富的细节信息,通过深度学习算法提取WSI图像特征,进而完成各种下游任务已成为当前的研究热点。本文对WSI图像的智能分析作了综述,首先介绍了利用深度学习进行颜色归一化的方法,随后回顾了不同研究在输入数据筛选方面采用的不同策略。最后,本文总结了深度学习在WSI的分割、分类、预测三大任务中的应用,并探讨了其在WSI应用中面临的挑战和未来的发展方向。 展开更多
关键词 深度学习 全视野数字病理切片 数字病理学图像分析 卷积神经网络 组织病理学图像
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肝癌影像-数字化大体病理标本制作流程规范
8
作者 禹鸿鸣 王康 +4 位作者 董辉 蔡权宇 贾宁阳 丛文铭 程树群 《中华肝脏外科手术学电子杂志》 CAS 2020年第4期321-323,共3页
原发性肝癌(肝癌)是常见的恶性肿瘤之一,其发病率及病死率分别居全球恶性肿瘤疾病的第6位和第2位[1]。尽管诊断技术与治疗手段不断进步,但整体疗效仍不能令人满意。导致肝癌预后不良的主要原因之一就是缺乏有效的辅助检查,对早期复发、... 原发性肝癌(肝癌)是常见的恶性肿瘤之一,其发病率及病死率分别居全球恶性肿瘤疾病的第6位和第2位[1]。尽管诊断技术与治疗手段不断进步,但整体疗效仍不能令人满意。导致肝癌预后不良的主要原因之一就是缺乏有效的辅助检查,对早期复发、转移判断不准确,导致治疗选择不当,影响整体疗效。如肝癌的微血管侵犯(microvascular invasion,MVI)和微小转移灶,是影响复发、转移的重要因素,通过影像学检查很难分辨,同时缺乏有效的预测方法,仅能通过术后病理检出[2-3]。 展开更多
关键词 肝肿瘤 影像 病理学 全切片扫描
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全切片图像扫描技术在临床病理诊断工作中的应用 被引量:8
9
作者 唐仲平 崔权哲 +2 位作者 杨李波 包骥 赵春 《河北医科大学学报》 CAS 2018年第10期1205-1209,共5页
目的探讨全切片图像扫描技术(whole slide images,WSI)在日常病理诊断工作中的应用价值与效果。方法选取300例连续的组织学病例作为研究对象,将所有样本的病理切片运用WSI技术进行数字化扫描,在电脑屏幕上阅读数字化切片后作出病理诊断... 目的探讨全切片图像扫描技术(whole slide images,WSI)在日常病理诊断工作中的应用价值与效果。方法选取300例连续的组织学病例作为研究对象,将所有样本的病理切片运用WSI技术进行数字化扫描,在电脑屏幕上阅读数字化切片后作出病理诊断。再将在显微镜下常规病理切片的病理诊断与在电脑屏幕上数字化切片的病理诊断进行对比,分析WSI技术在日常病理诊断工作中的应用效果。结果 300例HE染色的常规病理切片与数字化病理切片诊断病变性质的总体符合率为98.67%(296/300)。300例HE染色的常规病理切片与数字化病理切片诊断病变种类完全符合272例(90.67%),部分符合9例(3.00%),不符合19例(6.33%)。与经验丰富的上级医师制定的标准答案比较,常规病理切片与数字化病理切片诊断HE染色、亚甲基蓝染色、免疫组织化学染色的符合率差异均无统计学意义(P>0.05)。结论在日常病理诊断工作中,同一医师在显微镜下常规病理切片的病理诊断与在电脑屏幕上数字化病理切片的病理诊断有较高的符合率。随着医学信息数字化的不断发展,数字病理在教学、诊断、科学研究和数据保存上的优势会越来越明显,数字病理在将来的病理日常工作中也会变得越来越重要。 展开更多
关键词 病理学 临床 诊断 全切片图像扫描技术
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低倍率病理全切片图像伪影检测
10
作者 丁维龙 廖婉茵 +3 位作者 朱伟 汪春年 祝行琴 朱红波 《中国图象图形学报》 CSCD 北大核心 2024年第10期3157-3170,共14页
目的高质量的病理切片对人工诊断和计算机辅助诊断至关重要。当前基于图像块的伪影检测方法存在着计算资源消耗巨大以及伪影检测过程的完整性缺失问题。为此,本文提出了一种适用于低倍率病理全切片图像的伪影检测算法WRC_Net(window-row... 目的高质量的病理切片对人工诊断和计算机辅助诊断至关重要。当前基于图像块的伪影检测方法存在着计算资源消耗巨大以及伪影检测过程的完整性缺失问题。为此,本文提出了一种适用于低倍率病理全切片图像的伪影检测算法WRC_Net(window-row-col_net)。方法首先,将低倍率的全切片图像输入到ResNet50(residual neural network)网络中,以提取图像的低级特征。随后,这些低级特征被传入特征融合模块,用于聚合来自不同深度和方向的特征。此外,在特征提取模块中,引入了WRC模块,包括WRC注意力和多尺度扩张模块,其能够同时捕捉全局和局部信息,提取多尺度特征,从而增强了特征的表达能力。最后,将融合后的特征传入单一检测头,以获取最终的检测结果。结果在SPDPSD(Shanghai Pudong department of pathology slide dataset)和NCPDCSD(Ningbo clinical pathology diagnosis center slide dataset)两个数据集上,所提方法的平均精度(mean average precision,mAP)分别达到了63.1%和55.0%,与目前主流的目标检测算法相比具有一定竞争力。结论本文提出的病理切片伪影检测算法能够准确识别数字病理切片中的不同种类伪影,为病理图像质量评估提供了一种有效的技术解决方案。 展开更多
关键词 数字病理学 数字病理切片 伪影检测 多尺度 特征融合
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毒性病理学及人工智能数字组织图像分析质量控制概述
11
作者 滕伊洋 张亚群 +3 位作者 李一昊 钱庄 汪溪洁 吕建军 《中国新药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期441-448,共8页
随着人工智能和机器学习的快速发展,人工智能对全切片图像的诊断几乎可以媲美病理学家,建立人工智能算法需要大量的数字组织图像训练集数据。数字组织图像分析是通过各种算法分析全切片图像,并从其中提取大量复杂的定量数据集。数字组... 随着人工智能和机器学习的快速发展,人工智能对全切片图像的诊断几乎可以媲美病理学家,建立人工智能算法需要大量的数字组织图像训练集数据。数字组织图像分析是通过各种算法分析全切片图像,并从其中提取大量复杂的定量数据集。数字组织图像分析的质量控制不仅非常重要,而且是确保建立高质量数据集和AI算法的基础和前提。本文简要概述了全切片图像的质量控制策略、数字组织图像分析的影响因素和质量控制方法、数字组织图像分析结果的质量控制方法、毒性病理学家在数字组织图像分析中的作用、数据解释和报告以及数字组织图像用于毒性病理学诊断及AI的挑战,以期为我国药物非临床安全性评价毒性试验中使用全切片图像进行毒性病理学诊断及建立AI各种算法提供一定参考。 展开更多
关键词 毒性病理学 人工智能 数字组织图像分析 质量控制 全切片图像
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全切片图像扫描技术在病理切片质控中的作用 被引量:3
12
作者 唐仲平 崔权哲 +2 位作者 包骥 蔡玮 赵春 《中国医药科学》 2020年第12期33-38,共6页
目的探讨WSI技术在日常病理切片的数字化扫描和质量控制中的作用。方法选取成都市第一人民医院2015年9月由作者诊断的300例连续的组织学病例作为研究对象,将所有病理切片运用WSI技术进行数字化扫描,在电脑屏幕上阅读数字化切片后评估扫... 目的探讨WSI技术在日常病理切片的数字化扫描和质量控制中的作用。方法选取成都市第一人民医院2015年9月由作者诊断的300例连续的组织学病例作为研究对象,将所有病理切片运用WSI技术进行数字化扫描,在电脑屏幕上阅读数字化切片后评估扫描效果,分析WSI技术在日常病理切片的数字化扫描中的应用效果及我科HE切片的主要质量缺陷。结果WSI技术的总体扫描优良率为89.86%,而因扫描机原因造成的扫描不良率仅为1.83%。我科HE切片质量优良率较高(99.74%),宫内膜和皮肤组织是我科制片难点。我科HE切片的主要质量缺陷包括裂隙、折叠、刀痕、裱贴位置不当和切片厚薄不均。结论WSI技术对日常病理切片的数字化扫描及质量控制有较高的可行性及独特的优势。 展开更多
关键词 全切片图像扫描技术(WSI) 日常病理切片扫描 病理科质量控制 质量缺陷
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基于深度学习的黑色素细胞病变全流程智能化精准诊断 被引量:2
13
作者 石田蕾 张家意 +1 位作者 鲍泳扬 高欣 《生物医学工程学杂志》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第5期919-927,共9页
黑色素细胞病变发生于皮肤表层,恶性病变即为致死率极高的黑色素瘤,严重危害人类健康,病理组织学分析是其诊断的金标准。本文对黑色素细胞病变病理全切片图像(WSI)进行分类研究,提出一种基于深度学习的黑色素细胞病变全流程智能化诊断... 黑色素细胞病变发生于皮肤表层,恶性病变即为致死率极高的黑色素瘤,严重危害人类健康,病理组织学分析是其诊断的金标准。本文对黑色素细胞病变病理全切片图像(WSI)进行分类研究,提出一种基于深度学习的黑色素细胞病变全流程智能化诊断方法。首先,基于CycleGAN神经网络对多中心病理WSI进行颜色校正;其次,通过745张WSI构建以ResNet-152神经网络为架构的深度卷积网络预测模块;然后,级联以预测概率平均值计算为核心的决策融合模块;最终,分别采用包含182张和54张WSI的内外部测试集验证所提方法的诊断性能。实验结果显示,所提方法的整体准确率在内部测试集上达到94.12%,在外部测试集上超越90%;采用的颜色校正方式在组织结构保持、伪影抑制方面均优于传统基于颜色统计或染色分离的方式。研究证实了本文所提方法可实现高精度、强鲁棒的黑色素细胞病变病理WSI分类,对推动临床病理人工智能辅助诊断具有重要的指导意义。 展开更多
关键词 黑色素细胞病变 全切片图像 智能精准诊断 深度学习 颜色校正
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数字化阅片在病理诊断中的可重复性和正确率研究 被引量:2
14
作者 唐仲平 崔权哲 +2 位作者 包骥 蔡玮 赵春 《中国当代医药》 2020年第3期28-31,共4页
目的探讨数字化阅片在临床病理诊断中的可重复性和正确率。方法选取成都市第一人民医院病理科于2015年9月诊断的300例连续组织学病例作为研究对象,将所有病理切片运用全切片图像扫描技术(WSI)进行数字化扫描;再分别于2015年11月、2016年... 目的探讨数字化阅片在临床病理诊断中的可重复性和正确率。方法选取成都市第一人民医院病理科于2015年9月诊断的300例连续组织学病例作为研究对象,将所有病理切片运用全切片图像扫描技术(WSI)进行数字化扫描;再分别于2015年11月、2016年1月、2016年3月再次阅片后做出第一次数字化诊断、第二次显微镜诊断及第二次数字化诊断;最后对不同时间用不同方式诊断的四次结果进行比较,分析数字化阅片在临床病理诊断中的可重复性和正确率。结果同显微镜诊断一样,数字化诊断在病变性质及种类上均有很高的可重复性和正确率;同第一次数字化诊断与显微镜诊断的符合率比较,第二次数字化诊断与显微镜诊断的符合率明显升高;无论是显微镜阅片还是数字化阅片,对疑难病例复诊的正确率均高于初诊。结论数字化阅片在临床病理诊断中有很高的可重复性和正确率。随着病理医师对数字化阅片的逐渐适应,数字化诊断会越来越贴近、甚至超越显微镜诊断的可重复性和正确率。 展开更多
关键词 全切片图像扫描技术 数字化阅片 临床病理诊断 可重复性 正确率
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基于无监督学习的数字病理切片自动分割方法 被引量:2
15
作者 秦航宇 邓杨 +6 位作者 周燕燕 刘洪红 李丽 周琪琪 梅娟 步宏 包骥 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期813-818,共6页
目的使用无监督的方式进行图像分割,作为人工标记的一种替代。方法选取了共100张HE染色和巴氏染色切片的全片数字化图像(whole slide image,WSI)数据作为研究和测试的对象,其中乳腺切片70张,肺切片20张,甲状腺切片10张。为了保证数据的... 目的使用无监督的方式进行图像分割,作为人工标记的一种替代。方法选取了共100张HE染色和巴氏染色切片的全片数字化图像(whole slide image,WSI)数据作为研究和测试的对象,其中乳腺切片70张,肺切片20张,甲状腺切片10张。为了保证数据的多样性,乳腺的切片包含了正常组织、炎症、肿瘤,肺切片取材主要为下叶新生物(包含了炎症和肿瘤),甲状腺为细针穿刺的细胞(均为良性)。每张图像的最大总倍率(原始倍率)均为400倍,文件格式为ndpi。对每张WSI进行人工的标注,每张WSI的标注区域都大于10个视野,标注后的信息将用于有效性的验证。使用基于超像素与全卷积神经网络的算法构建无监督图像分割技术,对没有标记的WSI的任意感兴趣区域(regions of interest,ROI)进行图像分割。与区域邻接图合并的方法进行比较,以欠分割错误差率、边缘召回率和平均交并结果比判定两种方法的分割效果,并比较两种方法的效率。在执行效率的比较中,测试过程包含了超像素的预处理的时间,去掉了加载深度学习引擎的时间。结果对WSI任意ROI区域按纹理和颜色对图像实现了无监督的自动分割,乳腺切片、肺切片和甲状腺切片测试的结果差异小,多次测试的结果稳定,但该方法在对炎症和肿瘤的区分中表现一般。其欠分割错误差率、边缘召回率和平均交并结果分别为19.10%、82.06%和45.06%。区域邻接图合并的方法的欠分割错误差率、边缘召回率和平均交并的结果分别为21.52%、78.39%和44.81%。在GPU模式下整个过程平均耗时为0.27 s,在CPU模式下平均耗时为1.30 s,由于区域邻接图合并的方法没有实现GPU模式,在CPU模式下平均耗时为10.5 s。结论本方法通过简单的人机交互操作得到理想的像素级标注结果,可以有效降低数字病理切片数据标注的成本,比区域邻接图合并的方法在处理图像纹理的方面表现得� 展开更多
关键词 超像素 全片数字化图像 卷积神经网络
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基于Lab色彩空间K均值聚类的全切片图像分割在肿瘤生物学效应空间分析中应用 被引量:1
16
作者 金文东 阴慧娟 李迎新 《生物医学工程与临床》 CAS 2022年第1期1-8,共8页
目的探讨全切片图像分割在肿瘤生物学效应空间分布分析中的准确性和可行性。方法采用Lab色彩空间K均值聚类分别获取苏木精-伊红(HE)、TdT介导的dUTP缺口末端标记(TUNEL)和血小板内皮细胞黏附因子(PECAM-1/CD31)染色图像分割的颜色阈值... 目的探讨全切片图像分割在肿瘤生物学效应空间分布分析中的准确性和可行性。方法采用Lab色彩空间K均值聚类分别获取苏木精-伊红(HE)、TdT介导的dUTP缺口末端标记(TUNEL)和血小板内皮细胞黏附因子(PECAM-1/CD31)染色图像分割的颜色阈值关系式和亮度阈值,与基于颜色反卷积等分割方法比较,验证其分割性能[性能参数包括归一化互信息(NMI)、Kappa系数、平均交互比(mIoU)、平均精准率(mPr)、平均召回率(mRe)和平均准确度(mA)]。以光动力治疗小鼠乳腺癌为例,对来自科学数据银行(ScienceDB)的数据集,运用核密度估计热力图和分布密度的空间分析方法分别可视化和量化肿瘤生物学效应,并对坏死、凋亡和血管密度与光通量进行相关性分析。结果图像分割速率约为54.5 s/G;以基于颜色反卷积和Otsu的分割结果为金标准,HE、TUNEL和CD31染色图像分割的NMI为0.45~0.58,Kappa系数为0.60~0.80,mIoU为0.70~0.83,mPr为0.73~0.91,mRe为0.81~0.97,mA为0.94~0.96。光通量与坏死密度线性相关,其Pearson相关系数为0.88;进行线性回归分析,可得到关系式为Y=0.101 4X+22.470 0(其中:Y为坏死密度;X为光通量)。结论基于Lab色彩空间K均值聚类的方法实现了图像的精准分割,结合空间分析和统计学方法实现了肿瘤生物标记物的空间数据分析及可视化,在肿瘤图谱生物效应分析中具有巨大的潜力。 展开更多
关键词 全切片图像 图像分割 肿瘤生物学效应 空间分布分析 K均值聚类
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融合空间相关性特征的乳腺组织病理全切片分类 被引量:4
17
作者 赵樱莉 丁维龙 +4 位作者 游庆华 朱峰龙 朱筱婕 郑魁 刘丹丹 《中国图象图形学报》 CSCD 北大核心 2023年第4期1134-1145,共12页
目的病理学检查是明确乳腺癌诊断及肿瘤类型的金标准。深度神经网络广泛应用于乳腺病理全切片的诊断工作并取得了明显进展,但是现有大多数工作只是将全切片切割成小图像块,对每个图像块进行单独处理,没有考虑它们之间的空间信息。为此,... 目的病理学检查是明确乳腺癌诊断及肿瘤类型的金标准。深度神经网络广泛应用于乳腺病理全切片的诊断工作并取得了明显进展,但是现有大多数工作只是将全切片切割成小图像块,对每个图像块进行单独处理,没有考虑它们之间的空间信息。为此,提出了一种融合空间相关性特征的乳腺组织病理全切片分类方法。方法首先基于卷积神经网络对病理图像块进行预测,并提取每个图像块有代表性的深层特征,然后利用特征融合将图像块及其周围图像的特征进行聚合,以形成具有空间相关性的块描述符,最后将全切片图像中最可疑的块描述符传递给循环神经网络,以预测最终的全切片级别的分类。结果本文构建了一个经过详细标注的乳腺病理全切片数据集,并在此数据集上进行良性/恶性二分类实验。在自建的数据集中与3种全切片分类方法进行了比较。结果表明,本文方法的分类精度达到96.3%,比未考虑空间相关性的方法高出了1.9%,与基于热力图特征和基于空间性和随机森林的方法相比,分类精度分别高出8.8%和1.3%。结论本文提出的乳腺组织病理全切片识别方法将空间相关性特征融合和RNN分类集成到一个统一模型,有助于提高图像识别准确率,为病理图像诊断工作提供了高效的辅助诊断工具。 展开更多
关键词 乳腺癌 病理组织全切片 分类 卷积神经网络(CNN) 特征融合 循环神经网络(RNN)
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基于多字典学习框架的肾透明细胞癌预后分析模型 被引量:2
18
作者 涂超 宁振源 张煜 《中国生物医学工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期385-393,共9页
肾透明细胞癌是一种高度异质的肿瘤,具有复杂多变的临床表现。基于病理全切片图像的肾透明细胞癌自动预后分析,可辅助医生做出临床决策,从而达到更好的治疗目的。肾透明细胞癌的组织异构性使得针对预后分析任务的特征提取存在很大的挑... 肾透明细胞癌是一种高度异质的肿瘤,具有复杂多变的临床表现。基于病理全切片图像的肾透明细胞癌自动预后分析,可辅助医生做出临床决策,从而达到更好的治疗目的。肾透明细胞癌的组织异构性使得针对预后分析任务的特征提取存在很大的挑战性。提出针对肾透明细胞癌病理全切片图像的多字典学习框架,自适应获取病理全切片图像的有效信息,进行肾透明细胞癌预后分析。该框架主要包括基于图像块水平的多字典学习和基于患者水平的生存模型构建两个阶段。利用癌症基因组图谱数据库的肾透明细胞癌数据集(TCGA-KIRC)中378例苏木素-伊红染色的全切片图像上进行评估,实验结果(C-index=0.681,AUC=0.751,P<0.05)优于现流行的各种生存模型,其中较传统的Boosted模型和随机生存森林模型,C-index指标分别提高0.138和0.155,AUC指标分别提高0.149和0.191;较Deep Surv和WSISA两个深度学习模型,C-index指标分别提高0.046和0.035,AUC指标分别提高0.096和0.090。所提出的方法可以更准确地对肾透明细胞癌进行预后分析。 展开更多
关键词 肾透明细胞癌 病理全切片图像(WSIs) 预后分析 多字典学习
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全景病理切片神经母细胞瘤分化类型的交叉伪监督识别方法
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作者 万真真 刘雨薇 +2 位作者 施宁 李昊成 刘芳 《中国激光》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第15期68-77,共10页
评估神经母细胞瘤的分化类型对肿瘤预后至关重要。虽然计算机辅助诊断能有效减轻医生的负担,但细胞级结构的精细标注较为耗时。为优化细胞级数据标注问题,采用一种基于交叉伪监督的深度学习方法,充分利用无标签数据的分布特性,结合少量... 评估神经母细胞瘤的分化类型对肿瘤预后至关重要。虽然计算机辅助诊断能有效减轻医生的负担,但细胞级结构的精细标注较为耗时。为优化细胞级数据标注问题,采用一种基于交叉伪监督的深度学习方法,充分利用无标签数据的分布特性,结合少量标注数据,通过两个分支相互监督,提升模型的泛化能力。针对神经母细胞瘤复杂的细胞环境和异质性,提出一种新型网络CSA-U-Net,用于全景病理图像中细胞的分割和分类。该网络在U-Net网络的瓶颈层加入通道和空间注意力模块。将CSA-U-Net作为交叉伪监督模型的基础网络,通过结合不同比例的有标签和无标签数据进行训练,当有标签数据和无标签数据比例为1∶4时,模型在分化差和分化细胞上的F1分数和准确度分别达到81.02%、65.48%、98.02%,优于其他分割算法,从而验证半监督学习的有效性。最后,使用K-means算法对不同类型细胞进行计数,并与医生的诊断金标准进行对比,结果显示分化差和分化的神经母细胞计数结果的准确率分别为94.00%和89.89%。通过计数结果中分化的神经母细胞占比,可以判断出神经母细胞瘤的分化类型,辅助病理医生进行诊断。 展开更多
关键词 全景病理切片 神经母细胞瘤 交叉伪监督 注意力机制 图像分割 细胞计数
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