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题名河田鸡与白绒乌骨鸡MC1R基因序列分析
被引量:4
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作者
胡卓成
孟庆铎
张梦文
林瑞意
肖天放
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机构
福建农林大学动物科学学院
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出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2019年第17期29-33,183-184,共6页
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基金
福建省自然科学基金项目(2017J01596)
福建农林大学科技创新专项基金项目(CXZX2016015)
福建农林大学大学生创新创业训练计划项目(201810389161)
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文摘
为了比较白绒乌骨鸡和河田鸡的黑素皮质素受体1(melanocortin 1 receptor,MC1R)基因序列的差异,试验以NCBI上的红原鸡MC1R基因序列(AB201630)为参照,进行PCR扩增和基因序列比对,并分析了氨基酸序列与蛋白质结构。结果表明:白绒乌骨鸡和河田鸡MC1R基因的序列长度均为945 bp,河田鸡与红原鸡序列同源性为99. 70%,白绒乌骨鸡与红原鸡序列同源性为99. 20%,而河田鸡与白绒乌骨鸡序列同源性为99. 0%;河田鸡相对于红原鸡有2处突变(T143A和C213R),白绒乌骨鸡相对于红原鸡有6处突变(M71T、E92K、L133P、A137T、C213R和H215P),河田鸡相对于白绒乌骨鸡有6处突变(M71T、E92K、L133P、A137T、A143T和H215P);河田鸡和白绒乌骨鸡MCIR基因的二级结构区中α-螺旋、β-折叠、无规则卷曲所占比例分别为55. 73%、8. 92%、35. 35%和52. 55%、12. 42%、35. 03%,均有7个跨膜区,白绒乌骨鸡和河田鸡的三维结构差异主要发生在跨膜区;在鸡形目动物中,MC1R基因具有较高的保守性。说明白绒乌骨鸡MC1R基因突变导致其编码的氨基酸序列H215P异常,推测鸡体内抑制黑色素在羽毛沉积的表征可能由该突变导致。
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关键词
河田鸡
白绒乌骨鸡
MC1R基因
序列分析
蛋白质分析
相关性
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Keywords
Hetian chicken
white-velvet silky chicken
MC1R gene
sequence analysis
protein analysis
correlation
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分类号
S831.2
[农业科学—畜牧学]
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