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RUNX1-RUNX1T1融合转录本及WT1转录本水平检测的室间比对研究 被引量:1
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作者 秦亚溱 朱立文 +26 位作者 林樉 耿素霞 刘生伟 程辉 邬成业 肖敏 李小青 胡瑞萍 王丽丽 刘海燕 马道新 关涛 叶远馨 牛挺 岑建农 卢利莎 孙黎 杨同华 王云贵 李涛 王玥 李庆华 赵晓甦 李玲娣 陈文敏 龙玲玉 黄晓军 《中华血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期889-894,共6页
目的通过室间比对了解国内RUNX1-RUNX1T1融合转录本及WT1转录本检测现状和真实表现。方法北京大学人民医院(简称PKUPH)制备比对样品,即用RUNX1-RUNX1T1(-)患者与RUNX1-RUNX1T1(+)患者新鲜骨髓/外周血有核细胞进行不同比例的稀释,制备出1... 目的通过室间比对了解国内RUNX1-RUNX1T1融合转录本及WT1转录本检测现状和真实表现。方法北京大学人民医院(简称PKUPH)制备比对样品,即用RUNX1-RUNX1T1(-)患者与RUNX1-RUNX1T1(+)患者新鲜骨髓/外周血有核细胞进行不同比例的稀释,制备出14种比对样本,每种样本各制备23份平行样本,加入TRIzol均质化后-70℃保存。各家中心采用RT-PCR技术同时检测各样本的RUNX1-RUNX1T1融合转录本及WT1转录本水平,统一以目的基因拷贝数/ABL拷贝数×100%的形式报告结果。通过Spearman相关分析计算各家中心与PKUPH检测结果之间的相关系数。结果①RUNX1-RUNX1T1比对:9份为阳性、5份为阴性样本,参与的20家实验室的假阳性率为5%(5/100),假阴性率为0(0/180)。每份阳性样本各家检测值均不相同,9份阳性样本各家报告的结果中位值为0.060%~176.7%,共覆盖3.5个log的范围,各份样本最高与最低报告结果的比值为5.5~12.3(去除1份明显偏离的结果)。85%(17/20)的实验室与PKUPH结果之间的相关系数≥0.98。②WT1比对:14份样本各家报告结果均不相同,中位值为0.16%~67.6%,覆盖2.6个log的范围,各样本检测最高值与最低值的比值为5.3~13.7.62%(13/21)的实验室与PKUPH结果的相关系数≥0.98。③两个转录本每家与PKUPH报告结果的相对关系不一致,2家均低于、7家均高于PKUPH,另11家为1个高于另一个低于PKUPH。结论同一样本各家中心报告的RUNX1-RUNX1T1及WT1转录本水平不同,大多数实验室与PKUPH报告的结果具有很高的一致性,实验室间不同转录本水平的相对关系不一定相同。 展开更多
关键词 融合蛋白质类 RUNX1-RUNX1T1 wt1 实时聚合酶链反应 室间比对
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WT1异构体比例转变对人白血病细胞株HL-60增殖和凋亡的影响 被引量:1
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作者 徐菁 覃艳红 +3 位作者 张翠明 乔爱秀 李灵敏 王宏伟 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期923-927,共5页
目的:探讨WT1异构体比例改变对人白血病细胞株HL-60增殖和凋亡的影响。方法:逆转录获得人WT1(17AA-/KTS-)异构体全长cDNA序列,连接到PCDH1-MCS1-EF1-copGFP慢病毒质粒载体上,酶切和测序证实正确构建重组质粒,建立WT1异构体表达比例改变... 目的:探讨WT1异构体比例改变对人白血病细胞株HL-60增殖和凋亡的影响。方法:逆转录获得人WT1(17AA-/KTS-)异构体全长cDNA序列,连接到PCDH1-MCS1-EF1-copGFP慢病毒质粒载体上,酶切和测序证实正确构建重组质粒,建立WT1异构体表达比例改变的单克隆细胞株。MTT法检测细胞增殖活性,形态学观察及Annexin V检测细胞凋亡。结果:成功构建了真核表达载体PCDH1-MCS1-EF1-copGFP-WT1(17AA-/KTS-),转染HL-60细胞后,实时荧光定量RT-PCR和Western blotting显示重组质粒转染细胞中WT1(17AA-/KTS-)mR-NA和蛋白水平明显高于空质粒转染组和正常对照组。重组质粒转染细胞的生长抑制率高于空质粒转染组和正常对照组,差异显著(P<0.05)。加2μmol/L三氧化二砷(As2O3)培养48 h后,形态学观察发现3组细胞都出现了凋亡形态,但重组质粒转染细胞更为明显。流式细胞术结果显示,As2O3作用24 h后,重组质粒转染细胞凋亡率较空质粒转染组和正常对照组细胞升高,差异显著(P<0.05)。结论:增加外源性WT1(17AA-/KTS-)异构体的表达能抑制HL-60细胞增殖,促进As2O3诱导的细胞凋亡。 展开更多
关键词 wt1蛋白 蛋白异构体 白血病 细胞凋亡
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H-2K^b限制性WT1蛋白CTL表位肽基因疫苗的构建与鉴定 被引量:1
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作者 范艳 杨蓉 +2 位作者 樊卫平 陈武娟 申晓贺 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期404-407,共4页
目的构建H-2Kb限制性WT1蛋白CTL表位肽的真核表达载体并检测其在293T细胞中的表达,并鉴定疫苗抗肿瘤效应。方法筛选鉴定H-2Kb限制性WT1蛋白CTL表位9肽,设计并合成肽疫苗核酸序列,插入p UC57载体,经酶切和测序鉴定,亚克隆至真核表达载体p... 目的构建H-2Kb限制性WT1蛋白CTL表位肽的真核表达载体并检测其在293T细胞中的表达,并鉴定疫苗抗肿瘤效应。方法筛选鉴定H-2Kb限制性WT1蛋白CTL表位9肽,设计并合成肽疫苗核酸序列,插入p UC57载体,经酶切和测序鉴定,亚克隆至真核表达载体pc DNA3.1(+)及p EGFP-N1载体,转染293T细胞,RT-PCR鉴定目的基因的转录,共聚焦显微镜鉴定目的基因的表达。构建pc DNA3.1(+)-WT1免疫小鼠,取小鼠脾细胞进行体外特异CTL杀伤FBL3细胞试验。结果构建的基因疫苗经测序、双酶切及PCR鉴定确认无误;其携带的目的基因可在293T细胞中表达。免疫小鼠后特异CTL对FBL3杀伤结果高于对照组(P<0.05)。结论成功构建了H-2Kb限制性WT1蛋白CTL表位肽基因疫苗,载体疫苗能在真核细胞中成功表达,疫苗特异CTL具有体外杀伤肿瘤细胞功能,为提高WT1肽疫苗的抗肿瘤效应提供了新思路。 展开更多
关键词 H-2Kb限制性 wt1蛋白 CTL 肽表位 基因疫苗
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白血病细胞检测WT1mRNA及其蛋白产物的价值与意义
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作者 胡永军 滕熔 《中国血液流变学杂志》 CAS 2004年第4期448-451,454,共5页
目的 研究WT1同白血病预后的关系及其作为白血病微小残留病检测指标的可行性及实用性。方法 采用逆转录聚合酶联反应及间接免疫荧光方法检测白血病患者及正常人骨髓或外周血单个核细胞WT1mRNA及其蛋白产物。结果 WT1mRNA及其蛋白产... 目的 研究WT1同白血病预后的关系及其作为白血病微小残留病检测指标的可行性及实用性。方法 采用逆转录聚合酶联反应及间接免疫荧光方法检测白血病患者及正常人骨髓或外周血单个核细胞WT1mRNA及其蛋白产物。结果 WT1mRNA及其蛋白产物在急性白血病细胞中高表达 ,初诊急性白血病患者WT1mRNA阳性表达 (39例 )较阴性表达 (12例 )治疗完全缓解率 (38.5 % ,83.3% )低 ,急性白血病化疗完全缓解后WT1mRNA阳性表达与阴性表达无病存活率 (15 .4 % ,5 0 .0 % )经Log rank检验有统计学意义。WT1蛋白在急性白血病中的表达率为 5 1.0 % ,表达部位为细胞核 ,在白血病阴性对照组及正常对照组中的表达率为 0。结论 WT1表达同急性白血病预后呈负相关 ,其逆转录聚合酶联反应可作为监测白血病微小残留病一项实用而有价值的方法。 展开更多
关键词 wt1 急性白血病 蛋白产物 RNA 阳性表达 完全缓解 阴性 细胞核 表达率 逆转录
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WT1蛋白CTL表位肽基因载体的构建与鉴定
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作者 彭霞 樊卫平 +3 位作者 张凯 苑晓娟 刘玲玲 王亮 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2013年第4期448-451,共4页
目的构建WT1(Wilms’tumor gene 1)蛋白CTL表位肽基因载体,并检测其在293T细胞中的转录。方法设计分别含WT1-126肽、WT1-235肽以及这两种肽的基因载体,并加入Th通用表位Pan-DR-Th(PADRE),应用蛋白酶体切割软件PAProC和NetChop优化各表... 目的构建WT1(Wilms’tumor gene 1)蛋白CTL表位肽基因载体,并检测其在293T细胞中的转录。方法设计分别含WT1-126肽、WT1-235肽以及这两种肽的基因载体,并加入Th通用表位Pan-DR-Th(PADRE),应用蛋白酶体切割软件PAProC和NetChop优化各表位和间隔序列,DNA疫苗在线预测工具DyNAVacS优化真核密码子后,人工合成核苷酸序列,分别插入pUC57载体,构建pUC57-WT1质粒,测序鉴定后,酶切回收各目的片段,亚克隆至真核表达载体pcDNA3.1(+)中,构建重组真核表达质粒,转染293T细胞,RT-PCR检测各目的基因在293T细胞中的转录。采用无内毒素质粒大量提取试剂盒提取各重组质粒,采用紫外分光光度计测定质粒的纯度和浓度。结果各重组真核表达质粒经双酶切及测序鉴定证实构建正确;重组质粒携带的目的基因可在293T细胞中成功转录;各重组质粒DNA的纯度均合格,浓度在864.6~883.9μg/ml之间。结论成功构建了WT1蛋白CTL表位肽基因载体,并能在真核细胞中正常转录,为下一步在小鼠体内探讨特异性不同的CTLs群发挥抗肿瘤作用的机制奠定了基础。 展开更多
关键词 wt1蛋白 细胞毒性T淋巴细胞 表位肽 DNA疫苗
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CD2相关蛋白在足细胞分化中的作用 被引量:7
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作者 姜华军 常莹 +3 位作者 朱忠华 刘建社 邓安国 张春 《生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期135-142,共8页
本文旨在研究肾脏足细胞的分化特点及CD2相关蛋白(CD2-associated protein,CD2AP)在足细胞分化过程中的作用。用RPMI1640培养基在33oC许可条件下培养永生化小鼠足细胞系(未分化组),转染针对CD2AP的小分子干扰RNA(small interfering RNA,... 本文旨在研究肾脏足细胞的分化特点及CD2相关蛋白(CD2-associated protein,CD2AP)在足细胞分化过程中的作用。用RPMI1640培养基在33oC许可条件下培养永生化小鼠足细胞系(未分化组),转染针对CD2AP的小分子干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)后置于37oC非许可条件下培养(转染组),并将非许可条件下未转染组作为对照组。用MTT法检测足细胞的生长速度;用RT-PCR方法检测CD2AP、WT1、synaptopodin和nephrin mRNA表达;用Westernblot检测CD2AP、WT1和nephrin蛋白表达;用免疫荧光结合激光共聚焦方法检测CD2AP、nephrin、F-actin和tubulin在分化及未分化足细胞中的分布及其共定位情况。结果显示,CD2AP、WT1和nephrin在分化及未分化足细胞中均可稳定表达,而synaptopodin仅表达于已分化足细胞,在未分化足细胞无表达。在足细胞分化过程中,CD2AP和nephrin的表达上调(P<0.05);CD2AP、tubulin和F-actin在细胞内的分布发生改变,CD2AP与nephrin及F-actin在未分化足细胞中存在共定位关系。转染特异性siRNA下调CD2AP表达,细胞生长速度明显减慢,synaptopodin mRNA表达下调(P<0.05),细胞分化迟滞。结果表明,足细胞分化过程中伴随细胞骨架的重新分布和细胞形态的改变;CD2AP可能作为足细胞裂孔隔膜分子与细胞骨架的连接蛋白,在足细胞分化过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 CD2相关蛋白 足细胞 NEPHRIN SYNAPTOPODIN wt1
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卵巢浆液性肿瘤中WT-1异常活化对ki-67和P53蛋白表达的调控作用 被引量:7
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作者 廖寿雁 郭苑莉 《解剖学研究》 CAS 2017年第2期119-122,共4页
目的探讨卵巢浆液性肿瘤WT-1异常活化情况,并分析对ki-67和P53蛋白表达的调控作用及临床意义。方法随机选取我院卵巢肿瘤患者100例,其中卵巢浆液性囊腺瘤26例、交界性浆液性肿瘤15例、卵巢浆液性癌34例和卵巢黏液性癌25例,采用免疫组化... 目的探讨卵巢浆液性肿瘤WT-1异常活化情况,并分析对ki-67和P53蛋白表达的调控作用及临床意义。方法随机选取我院卵巢肿瘤患者100例,其中卵巢浆液性囊腺瘤26例、交界性浆液性肿瘤15例、卵巢浆液性癌34例和卵巢黏液性癌25例,采用免疫组化检测WT-1、ki-67、P53蛋白的表达,并分析其与关系。结果在卵巢浆液性癌中WT-1阳性率为32.35%,显著高于交界性浆液性肿瘤,其中高级别浆液性癌中的阳性率为36.84%,又明显高于低级别浆液性癌(26.87%),组间比较差异具有统计学意义(P<0.05),而在卵巢浆液性囊腺瘤中未见WT-1蛋白异常表达。在卵巢浆液性癌和交界性浆液性肿瘤中ki-67、P53蛋白的表达明显高于浆液性囊腺瘤(P<0.05),ki-67和P53在不同级别卵巢癌中亦存在差异性表达(P<0.05);在卵巢黏液性癌和浆液性癌组织中WT-1和ki-67、P53蛋白差异均未见统计学意义(P>0.05)。Spearman等级相关分析显示,WT-1蛋白与ki-67、P53蛋白的表达均呈正相关(r=0.998和0.745,P=0.001)。结论卵巢浆液性癌中存在WT-1异常活化,且主要发生于高级别浆液性癌中,其可能通过调控ki-67、P53蛋白的表达而发挥癌基因的作用,检测WT-1蛋白对判断肿瘤性质和级别具有重要的指导价值。 展开更多
关键词 卵巢肿瘤 wilms肿瘤基因-1 KI-67 P53蛋白
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