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大豆基因组WRKY31同源基因的生物信息学分析
被引量：
5
1
作者
孙晶
盛碧涵
+5 位作者
韩英鹏
赵雪
王强
孟宪新
魏淑红
李文滨
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第5期642-647,共6页
WRKY转录因子是一类参与多种生物和非生物胁迫的诱导性转录调控因子,在植物进化上高度保守。通过克隆大豆WRKY31基因全长和生物信息学分析,发现WRKY31在大豆基因组中存在3个同源基因,分别位于第6、12和13号染色体上;WRKY31蛋白含有1个W...
WRKY转录因子是一类参与多种生物和非生物胁迫的诱导性转录调控因子,在植物进化上高度保守。通过克隆大豆WRKY31基因全长和生物信息学分析,发现WRKY31在大豆基因组中存在3个同源基因,分别位于第6、12和13号染色体上;WRKY31蛋白含有1个WRKY结构域（343-419 aa）和C2H2型锌指结构,属于第二类WRKY基因。RT-PCR分析表明,GmWRKY31在大豆的叶、花、豆荚、根、根瘤中的组织内均有表达,且在花中表达量最高,豆荚中最低。通过MEGA 5.0软件分析,大豆和芸豆WRKY蛋白亲缘关系更近,位于同一分支上,而它的2个拷贝Glyma06g46420.2和Glyma12g10350.1位于另一个分支上,亲缘关系较近。蛋白结构及功能预测表明WRKY31是一类转录因子,参与胁迫反应;系统进化分析表明其基因在进化过程中功能上发生了重大分化。
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关键词
大豆
wrky
31
胁迫
wrky
结构域
系统进化
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职称材料
拟南芥中WRKY31转录因子的转录活性与互作蛋白分析
被引量：
5
2
作者
王艺桥
赵新杰
+3 位作者
牛芳芳
郭小华
杨博
江元清
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期101-109,共9页
为深化对AtWRKY基因家族中功能尚未被报道成员的认识,探究拟南芥中WRKY转录因子基因在非生物逆境响应中的作用与可能的机制,通过对AtWRKY31进行亚细胞定位以及转录活性分析,并利用qRT-PCR检测AtWRKY31在不同逆境处理1、3和12 h后的表达...
为深化对AtWRKY基因家族中功能尚未被报道成员的认识,探究拟南芥中WRKY转录因子基因在非生物逆境响应中的作用与可能的机制,通过对AtWRKY31进行亚细胞定位以及转录活性分析,并利用qRT-PCR检测AtWRKY31在不同逆境处理1、3和12 h后的表达变化,通过酵母双杂交(Y2H)和双分子荧光互补(BiFC)对其互作蛋白进行了筛选与验证。发现AtWRKY31定位于细胞核,具有转录抑制作用,且表达受热害、低钾、低氮等处理显著的抑制。此外,发现WRKY31可以与WRKY31、WRKY6和WRKY42在体内发生互作。拟南芥WRKY31作为一个转录抑制子,可能通过与WRKY6和WRKY42转录因子互作来参与调控对一些非生物逆境的应答。
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关键词
拟南芥
wrky
31
亚细胞定位
酵母双杂交
双分子荧光互补
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职称材料
题名
大豆基因组WRKY31同源基因的生物信息学分析
被引量：
5
1
作者
孙晶
盛碧涵
韩英鹏
赵雪
王强
孟宪新
魏淑红
李文滨
机构
东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室
出处
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第5期642-647,共6页
基金
国家"十二五"科技支撑计划(2011BAD35B06-1)
现代农业产业技术体系(CARS-04-PS04)
+11 种基金
国家重点基础研究发展计划"973计划"前期项目(2012CB126311)
国家自然基金(31201227
31301339)
中国博士后项目(20110491024)
黑龙江省博士后项目(LBH11220
LBH-TZ1210)
黑龙江省教育厅科学技术研究项目(12541049)
黑龙江省教育厅骨干教师项目(1252G014)
黑龙江省教育厅新世纪项目优秀人才资助项目(1253-NCET-005)
教育部博士点项目(20122325120012)
东北农业大学博士后启动金项目(2012RCB11)
大豆生物学教育部重点实验室开放基金项目(SB12A05)
文摘
WRKY转录因子是一类参与多种生物和非生物胁迫的诱导性转录调控因子,在植物进化上高度保守。通过克隆大豆WRKY31基因全长和生物信息学分析,发现WRKY31在大豆基因组中存在3个同源基因,分别位于第6、12和13号染色体上;WRKY31蛋白含有1个WRKY结构域（343-419 aa）和C2H2型锌指结构,属于第二类WRKY基因。RT-PCR分析表明,GmWRKY31在大豆的叶、花、豆荚、根、根瘤中的组织内均有表达,且在花中表达量最高,豆荚中最低。通过MEGA 5.0软件分析,大豆和芸豆WRKY蛋白亲缘关系更近,位于同一分支上,而它的2个拷贝Glyma06g46420.2和Glyma12g10350.1位于另一个分支上,亲缘关系较近。蛋白结构及功能预测表明WRKY31是一类转录因子,参与胁迫反应;系统进化分析表明其基因在进化过程中功能上发生了重大分化。
关键词
大豆
wrky
31
胁迫
wrky
结构域
系统进化
Keywords
Soybean
wrky
31
Stress
wrky
domain
Phylogenetic
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
拟南芥中WRKY31转录因子的转录活性与互作蛋白分析
被引量：
5
2
作者
王艺桥
赵新杰
牛芳芳
郭小华
杨博
江元清
机构
西北农林科技大学生命科学学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期101-109,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31270293)
文摘
为深化对AtWRKY基因家族中功能尚未被报道成员的认识,探究拟南芥中WRKY转录因子基因在非生物逆境响应中的作用与可能的机制,通过对AtWRKY31进行亚细胞定位以及转录活性分析,并利用qRT-PCR检测AtWRKY31在不同逆境处理1、3和12 h后的表达变化,通过酵母双杂交(Y2H)和双分子荧光互补(BiFC)对其互作蛋白进行了筛选与验证。发现AtWRKY31定位于细胞核,具有转录抑制作用,且表达受热害、低钾、低氮等处理显著的抑制。此外,发现WRKY31可以与WRKY31、WRKY6和WRKY42在体内发生互作。拟南芥WRKY31作为一个转录抑制子,可能通过与WRKY6和WRKY42转录因子互作来参与调控对一些非生物逆境的应答。
关键词
拟南芥
wrky
31
亚细胞定位
酵母双杂交
双分子荧光互补
Keywords
Arabidopsis thaliana
wrky
31
subcellular localization
yeast two-hybrid
bimolecular fluorescence complementation
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大豆基因组WRKY31同源基因的生物信息学分析
孙晶
盛碧涵
韩英鹏
赵雪
王强
孟宪新
魏淑红
李文滨
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014
5
下载PDF
职称材料
2
拟南芥中WRKY31转录因子的转录活性与互作蛋白分析
王艺桥
赵新杰
牛芳芳
郭小华
杨博
江元清
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
5
下载PDF
职称材料
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