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利用杨树原生质体瞬时表达系统筛选杨生褐盘二孢菌效应因子蛋白
被引量：
6
1
作者
曹友志
谭碧玥
+1 位作者
王明庥
黄敏仁
《南京林业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期31-36,共6页
效应因子蛋白在病原真菌侵染宿主植物过程中发挥着重要作用,效应因子的筛选和鉴定是目前研究的难点。笔者以杨生褐盘二孢菌全基因组测序结果为基础,根据真菌效应因子蛋白结构特征,预测出106个候选效应因子,并成功克隆其中25个。利用杨...
效应因子蛋白在病原真菌侵染宿主植物过程中发挥着重要作用,效应因子的筛选和鉴定是目前研究的难点。笔者以杨生褐盘二孢菌全基因组测序结果为基础,根据真菌效应因子蛋白结构特征,预测出106个候选效应因子,并成功克隆其中25个。利用杨树原生质体瞬时表达系统对这25个候选效应因子蛋白进行细胞内功能筛选,鉴定出4个效应因子蛋白可以抑制杨树转录因子WRKY29启动子的活性,表明这4个效应因子蛋白在干扰植物免疫系统的信号传导途径中发挥重要作用。
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关键词
杨树原生质体瞬时表达系统
wrky
29
杨生褐盘二孢菌
效应因子
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职称材料
陆地棉转录因子 WRKY29 的鉴定及表达分析
2
作者
刘文豪
余渝
+5 位作者
王旭文
田琴
吴珂
马麒
赵福相
孔宪辉
《安徽农业科学》
CAS
2023年第23期85-89,共5页
[目的]揭示WRKY29基因表达机理,为分子辅助育种创新种质提供基因资源。[方法]以WRKY家族成员中的WRKY29为目标,通过生物信息学方法分析陆地棉WRKY29转录因子的理化性质、系统进化关系、亚细胞定位建模和染色体分布定位、基因的组织特异...
[目的]揭示WRKY29基因表达机理,为分子辅助育种创新种质提供基因资源。[方法]以WRKY家族成员中的WRKY29为目标,通过生物信息学方法分析陆地棉WRKY29转录因子的理化性质、系统进化关系、亚细胞定位建模和染色体分布定位、基因的组织特异性表达。[结果]生物信息学分析表明,陆地棉WRKY29转录因子含有279个氨基酸残基,理论等电点为6.08,具有典型的WRKY保守结构域,属于不稳定蛋白。蛋白质二级结构以α螺旋和无规卷曲为主。系统进化关系分析得知WRKY29与同为锦葵目的物种聚类在同一进化分支,亚细胞定位预测WRKY29转录因子分布在细胞核,而染色体定位发现WRKY29转录因子分布在A02染色体40~48 Mb区域内。WRKY29转录因子具有正调控功能,组织表达模式发现在根部具有显著性表达。[结论]陆地棉转录因子WRKY29的鉴定及表达分析为棉花生长发育过程中的抗逆研究提供了重要线索。
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关键词
wrky
29
转录因子
生物信息学
育种
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职称材料
题名
利用杨树原生质体瞬时表达系统筛选杨生褐盘二孢菌效应因子蛋白
被引量：
6
1
作者
曹友志
谭碧玥
王明庥
黄敏仁
机构
南京林业大学森林资源与环境学院
出处
《南京林业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期31-36,共6页
基金
国家重点基础研究发展计划(2009CB119100)
文摘
效应因子蛋白在病原真菌侵染宿主植物过程中发挥着重要作用,效应因子的筛选和鉴定是目前研究的难点。笔者以杨生褐盘二孢菌全基因组测序结果为基础,根据真菌效应因子蛋白结构特征,预测出106个候选效应因子,并成功克隆其中25个。利用杨树原生质体瞬时表达系统对这25个候选效应因子蛋白进行细胞内功能筛选,鉴定出4个效应因子蛋白可以抑制杨树转录因子WRKY29启动子的活性,表明这4个效应因子蛋白在干扰植物免疫系统的信号传导途径中发挥重要作用。
关键词
杨树原生质体瞬时表达系统
wrky
29
杨生褐盘二孢菌
效应因子
Keywords
poplar protoplast transient expression system
wrky
29
Marssonina brunnea f.sp.multigermtubi
effector
分类号
S763.15 [农业科学—森林保护学]
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职称材料
题名
陆地棉转录因子 WRKY29 的鉴定及表达分析
2
作者
刘文豪
余渝
王旭文
田琴
吴珂
马麒
赵福相
孔宪辉
机构
新疆农垦科学院棉花研究所/农业农村部西北内陆区棉花生物学与遗传育种重点实验室/棉花生物学国家重点实验室
出处
《安徽农业科学》
CAS
2023年第23期85-89,共5页
基金
国家重点研发计划项目“西北内陆优质机采棉新品种培育-机采优异育种资源的创制”(2017YFD0101601)
兵团重点领域创新团队建设计划项目“机采棉遗传育种与高效栽培创新团队”(2017CB011)
棉花生物学国家重点实验室开放课题“缩节胺拌种对棉花生长发育转录组分析”(CB2022A27)。
文摘
[目的]揭示WRKY29基因表达机理,为分子辅助育种创新种质提供基因资源。[方法]以WRKY家族成员中的WRKY29为目标,通过生物信息学方法分析陆地棉WRKY29转录因子的理化性质、系统进化关系、亚细胞定位建模和染色体分布定位、基因的组织特异性表达。[结果]生物信息学分析表明,陆地棉WRKY29转录因子含有279个氨基酸残基,理论等电点为6.08,具有典型的WRKY保守结构域,属于不稳定蛋白。蛋白质二级结构以α螺旋和无规卷曲为主。系统进化关系分析得知WRKY29与同为锦葵目的物种聚类在同一进化分支,亚细胞定位预测WRKY29转录因子分布在细胞核,而染色体定位发现WRKY29转录因子分布在A02染色体40~48 Mb区域内。WRKY29转录因子具有正调控功能,组织表达模式发现在根部具有显著性表达。[结论]陆地棉转录因子WRKY29的鉴定及表达分析为棉花生长发育过程中的抗逆研究提供了重要线索。
关键词
wrky
29
转录因子
生物信息学
育种
Keywords
wrky
29
Transcription factor
Bioinformatics
Breeding
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用杨树原生质体瞬时表达系统筛选杨生褐盘二孢菌效应因子蛋白
曹友志
谭碧玥
王明庥
黄敏仁
《南京林业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2012
6
下载PDF
职称材料
2
陆地棉转录因子 WRKY29 的鉴定及表达分析
刘文豪
余渝
王旭文
田琴
吴珂
马麒
赵福相
孔宪辉
《安徽农业科学》
CAS
2023
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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