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题名欧洲葡萄VvCAX基因家族的鉴定与表达分析
被引量：3
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作者
崔小月
尚泓泉
吕中伟
娄玉穗
张柯
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机构
河南省农业科学院园艺研究所
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出处
《河南农业科学》
北大核心
2023年第11期113-123,共11页
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基金
国家葡萄产业技术体系豫东综合试验站项目(CARS-29-19)
河南省科技攻关项目(222102110472)
河南省农业科学院优秀青年科技基金项目(2022YQ08)。
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文摘
CAX(Ca^(2+)/H^(+)exchanger antiporter)是一类重要的阳离子转运蛋白,在植物生长发育和抵抗非生物胁迫中至关重要。通过生物信息学分析的方法,从欧洲葡萄中共鉴定出5个VvCAX基因,根据其在染色体上的位置依次命名为VvCAX1—VvCAX5,进行了包括理化性质、二级结构、三级结构、跨膜结构域、基因结构、保守基序、系统进化树等分析。结果表明,VvCAX基因家族成员均为疏水蛋白,主要定位于质膜和液泡,包含10~11个跨膜结构域和4个典型的功能域,α-螺旋和无规则卷曲在二级结构中占据主要位置,所有成员三级结构非常相似且均为单体。系统发育分析将VvCAX分为2个亚家族,同一亚家族的VvCAX结构相似,不同亚家族VvCAX的保守基序有差异,且7对VvCAX基因在进化过程中发生了基因的片段复制事件。VvCAX的互作蛋白主要与钙离子转运、钙离子通道和离子转运相关。上游调控因子和启动子顺式作用元件分析结果表明,VvCAX基因可能通过MYB、ERF等转录因子的调控参与激素和胁迫响应,这一推论经表达模式分析得到了验证。通过不同胁迫下的表达分析发现,所有VvCAX基因的表达水平均受ABA的影响,ⅠA亚家族的成员响应创伤、霜霉菌、干旱和低温,而ⅠB亚家族的成员主要与高温有关,ⅠA亚家族的VvCAX基因更有研究价值。
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关键词
欧洲葡萄
vvcax基因家族
基因结构
胁迫响应
表达分析
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Keywords
Vitis vinifera
vvcax gene family
gene structure
Stress response
Expression analysis
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分类号
S663.1
[农业科学—果树学]
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