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HCV genotypes in hepatitis C patients and their clinical significances 被引量:23
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作者 Huang F Zhao GZ Li Y 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 1999年第6期547-549,共3页
关键词 HEPATITIS C HEPATITIS C virus genotyping
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陕西省麻疹病毒基因分型及疫苗免疫因素分析 被引量:14
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作者 李平 司源 关蓉晖 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2007年第9期1122-1124,共3页
目的确定引起陕西省麻疹流行的病原毒株,探讨相关的疫苗免疫因素。方法采集麻疹病人咽拭子标本分离病毒,用酚-氯仿抽提法提取病毒悬液中的RNA,逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增N基因碳末端的核苷酸450个(bp)片段,对扩增产物进行序列测... 目的确定引起陕西省麻疹流行的病原毒株,探讨相关的疫苗免疫因素。方法采集麻疹病人咽拭子标本分离病毒,用酚-氯仿抽提法提取病毒悬液中的RNA,逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增N基因碳末端的核苷酸450个(bp)片段,对扩增产物进行序列测定和基因分型。用微量中和试验测定健康人群麻疹病人急性期血清中和麻疹疫苗株和野毒株的中和抗体水平。结果从82份咽拭子中分离出19株H1基因型麻疹病毒。麻疹疫苗免疫血清和有免疫史麻疹急性期病人血清对麻疹野毒株的中和抗体几何平均滴度(GMT)分别为26.36和26.90,明显低于疫苗株,GMT分别为49.30和56.18。结论陕西省近年麻疹流行是由H1基因型麻疹野病毒引起,不排除疫苗对目前流行株保护性不足的因素。 展开更多
关键词 麻疹病毒 基因分型 中和抗体
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新城疫病毒分子生物学研究进展 被引量:10
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作者 王学理 武迎红 +1 位作者 鲁金波 原奎林 《内蒙古民族大学学报(自然科学版)》 2009年第3期318-322,共5页
新城疫是由新城疫病毒引起的极易传染的毁灭性疾病.由于该病发病急、致死率高,对养禽业的发展构成了严重威胁,所以被世界动物卫生组织(OIE)定为A类烈性传染病.本文概述了新城疫病毒的基因结构与功能及基因分型等问题.
关键词 新城疫病毒 结构基因 基因分型
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不同临床类型慢性乙肝患者乙肝病毒基因型检测 被引量:9
4
作者 牟一坤 顾琳 曾淑珍 《分子诊断与治疗杂志》 2010年第1期46-49,共4页
目的探讨本院慢性乙型肝炎患者乙肝病毒基因型分布特征及与临床类型的关系。方法利用线性探针分析法进行乙肝病毒基因分型。结果52例慢性乙肝患者检出乙肝病毒基因型B型24例(46.2%),C型26例(50%),A、B混合型2例(3.8%),B、C两型均以男性... 目的探讨本院慢性乙型肝炎患者乙肝病毒基因型分布特征及与临床类型的关系。方法利用线性探针分析法进行乙肝病毒基因分型。结果52例慢性乙肝患者检出乙肝病毒基因型B型24例(46.2%),C型26例(50%),A、B混合型2例(3.8%),B、C两型均以男性多见,两型间性别比例差异无统计学意义(χ2=0.65,P>0.05);在慢性肝炎轻度、中度、重度、肝硬化及肝癌中,B和C基因型的分布差异无统计学意义(P>0.05);A、B混合型2例分别为慢性乙型肝炎轻度和慢性乙型肝炎中度。C型HBeAg阳性率高于B型,差异有统计学意义(P<0.05),HBVDNA载量两组间差异无统计学意义(P>0.05)。结论本组慢性乙肝患者的乙肝病毒基因型以B、C为主要亚型,且C型稍多,C型HBeAg阳性率高于B型。 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 基因分型 临床类型
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河南省唐河县分离到基因1型乙型脑炎病毒 被引量:8
5
作者 王环宇 郝宗宇 +8 位作者 付士红 张爱梅 曹玉玺 宋付党 李林红 何英 王焕琴 唐青 梁国栋 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期83-86,共4页
目的从河南省唐河县采集的蚊虫标本中分离乙型脑炎病毒(JEV)并确定其基因分型及E基因区段氨基酸序列特征。方法对2004年采集蚊虫标本进行病毒分离,对新分离的乙脑病毒进行生物学、血清学及分子生物学鉴定。逆转录聚合酶链反应(RT-PC... 目的从河南省唐河县采集的蚊虫标本中分离乙型脑炎病毒(JEV)并确定其基因分型及E基因区段氨基酸序列特征。方法对2004年采集蚊虫标本进行病毒分离,对新分离的乙脑病毒进行生物学、血清学及分子生物学鉴定。逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增新分离JEV的PrM、E区段核苷酸序列,测序后应用Clustal X软件做碱基配对分析,MEGA3.1完成病毒进化分析,GENEDOS(3.2)软件完成氨基酸位点分析。结果共采集3722只蚊虫标本,包括:库蚊、骚扰阿蚊、伊蚊及按蚊。从库蚊标本中分离到3株属于基因1型的乙脑病毒,E区段核苷酸和氨基酸与减毒活疫苗株SA14-14-2株的同源性分别为86.9%-87.7%,氨基酸同源性为95.2%-97.0%,存在12处共同的氨基酸位点差异。结论从河南省唐河县首次分离到基因1型的乙脑病毒。E基因与疫苗株相比有部分氨基酸差异,但现行疫苗株理论上可以保护新分离乙脑病毒。 展开更多
关键词 脑炎病毒 日本 基因分型 种系发生
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深圳市HIV阳性人群HPV病毒载量分析 被引量:5
6
作者 温贵华 刘晋洪 +5 位作者 黄玲 申杰 刘婷 郭夏娜 翁琼琳 邓文国 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期795-796,共2页
目的了解深圳市人类免疫缺陷病毒(HIV)阳性及阴性人群中人乳头瘤病毒(HPV)感染情况。方法荧光定量PCR法检测HPV感染情况以及病毒载量。结果40例HIV阳性组中HPV阳性20例,感染率为50.0%,在HIV阴性组中HPV阳性7例,感染率为17.5%,差异有统... 目的了解深圳市人类免疫缺陷病毒(HIV)阳性及阴性人群中人乳头瘤病毒(HPV)感染情况。方法荧光定量PCR法检测HPV感染情况以及病毒载量。结果40例HIV阳性组中HPV阳性20例,感染率为50.0%,在HIV阴性组中HPV阳性7例,感染率为17.5%,差异有统计学意义(P<0.05);HIV阳性组HPV病毒载量比HIV阴性组至少高1个数量级(P<0.05);检出16种HPV亚型,其中包括11种高危型,5种低危型,感染率最高的为16型(5例),其次为52型(4例)、58型(3例)。结论HIV感染人群中HPV感染率、病毒载量较高,且多型感染情况较严重。 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒(HIV) 人乳头瘤病毒(HPV) 病毒分型 病毒载量
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河南省2013—2015年病毒性腹泻哨点医院监测结果与分析 被引量:7
7
作者 赵嘉咏 申晓靖 +4 位作者 张白帆 王泽乾 夏胜利 黄学勇 许汴利 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1392-1396,共5页
目的 分析2013-2015年河南省监测哨点5岁以下腹泻儿童轮状病毒(HRV)、人感染杯状病毒(HuCV)、人感染星状病毒(HAtV)及肠道腺病毒(EAdV)的感染状况。方法 采集4个哨点医院腹泻儿童住院病例粪便样本880份,ELISA法检测A组HRV并进... 目的 分析2013-2015年河南省监测哨点5岁以下腹泻儿童轮状病毒(HRV)、人感染杯状病毒(HuCV)、人感染星状病毒(HAtV)及肠道腺病毒(EAdV)的感染状况。方法 采集4个哨点医院腹泻儿童住院病例粪便样本880份,ELISA法检测A组HRV并进行G/P基因分型;二步法多重RT-PCR检测B/C组HRV、HuCV和HAtV,单重PCR检测EAdV;对阳性病例进行流行病学统计分析。结果 共检出阳性样本594份(含混合感染样本24份):HRV 370份,阳性率42.0%,男性感染率高于女性,农村高于城市,小年龄组高于大年龄组;HuCV 162份,阳性率18.4%;HAtV 69份,阳性率7.8%;EAdV 17份,阳性率1.9%,3种病毒的城市总阳性率高于农村。A组HRV存在以G9P[8]为主的多种型别,秋季和春季有两个显著高峰;HuCV以诺如Ⅱ型为主,存在春季感染高峰。阳性病例以0-12月龄(HRV)和3-5岁(HuCV)为主;临床存在不同程度的发热、腹泻、呕吐等症状,性别及地区分布存在病原学差异。结论 河南省监测哨点5岁以下患儿中存在较高的腹泻病毒感染率,不同感染类别呈现不同的流行病学及临床特点。 展开更多
关键词 腹泻病毒 婴幼儿 基因分型 流行病学特征
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人乳头瘤病毒多基因型检测对传统部分基因型宫颈癌筛查策略价值优化的敏感性分析 被引量:2
8
作者 戎春宇 揭俊钦 +6 位作者 王贤吉 周萍 蒋虹丽 杜莉 祖恩晴 李欣 李真 《中国卫生资源》 CSCD 北大核心 2023年第4期330-338,共9页
目的评估薄层液基细胞学检查(thinprep cytologic test,TCT)筛查技术的有效性、部分宫颈癌诊断费用和初始人群中人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)低度风险基因型感染者占比对HPV多基因型和HPV部分(16/18)基因型检测初筛策略的... 目的评估薄层液基细胞学检查(thinprep cytologic test,TCT)筛查技术的有效性、部分宫颈癌诊断费用和初始人群中人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)低度风险基因型感染者占比对HPV多基因型和HPV部分(16/18)基因型检测初筛策略的成本效果影响,为公共卫生决策部门选择宫颈癌筛查策略提供参考。方法基于构建的Markov队列模型,以预防宫颈癌发病例数为效果指标,模型运行50年,对HPV多基因型和HPV部分(16/18)基因型筛查方案进行敏感性分析,分析TCT筛查技术的有效性、部分宫颈癌诊断费用,以及初始人群中HPV低度风险基因型感染者占比的变化对成本效果的影响。结果在设定的模型及各参数阈值下,敏感性分析发现:HPV低度风险基因型(HPV 51/35/39/68/56/59/66型)感染者(HPV感染状况或进展为CIN1/2/3状况)中TCT分流检测的灵敏度与特异度[以TCT结果为不典型鳞状上皮细胞病变(atypical squamous cells of undetermined significance,ASCUS)以上为判别标准]变化对两种筛查策略差距影响较大;TCT检测费用、阴道镜检测费用及组织病理学检测费用对两种筛查策略差距影响相对较小。上述各指标在设定阈值范围内变化时,HPV多基因型与部分基因型策略相比,效果差异甚微,成本差异有所变化,具有成本优势。此外,随着初始人群中HPV低度风险基因型感染者的比例增大,HPV多基因型策略的优势亦逐渐增强。结论进一步明确HPV不同基因型的致病风险对优化多基因型HPV筛查的后续管理路径具有重要意义,而进一步细分TCT检测的TBS(The Bethesda System)分级报告结果,提升TCT检测精度则是保障多基因型HPV筛查防治策略价值优化的关键。 展开更多
关键词 宫颈癌筛查cervical cancer screening 人乳头瘤病毒human papilloma virus HPV 多基因型检测extended genotyping testing 部分基因型检测partial genotyping testing 价值value 成本效果costeffectiveness 敏感性分析sensitivity analysis 薄层液基细胞学检查thinprep cytologic test TCT 不典型鳞状上皮细胞病变atypical squamous cells of undetermined significance ASCUS
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甘肃口岸出入境人员乙肝病毒和丁肝病毒混合感染调查及乙肝病毒基因型分析
9
作者 王莉 王姣乐 +7 位作者 宋晓芸 赵志亮 巩伟兵 高云新 张妙婷 张红霞 刘芳 高晓强 《中国国境卫生检疫杂志》 CAS 2024年第2期116-120,共5页
目的了解甘肃口岸出入境人员乙肝病毒(HBV)和丁肝病毒(HDV)混合感染情况及乙肝病毒基因分型,为甘肃口岸乙肝和丁肝的预防控制提供科学依据。方法收集2017—2022年在甘肃国际旅行卫生保健中心进行健康体检的出入境人员HBsAg阳性血清样本... 目的了解甘肃口岸出入境人员乙肝病毒(HBV)和丁肝病毒(HDV)混合感染情况及乙肝病毒基因分型,为甘肃口岸乙肝和丁肝的预防控制提供科学依据。方法收集2017—2022年在甘肃国际旅行卫生保健中心进行健康体检的出入境人员HBsAg阳性血清样本,用酶联免疫法和PCR法分别检测HDV抗体和HBV S基因片段。用NCBI在线病毒分型工具进行HBV基因分型,用Mega 11软件构建进化树确定基因亚型。结果共收集出入境人员HBsAg阳性血清样本672人份,检出HDV抗体阳性1例,HBV DNA阳性322例。HBV基因分型成功118例,其中B基因型11例、C基因型51例、D基因型55例、E基因型1例,B基因型分为B1、B2、B4和B6亚型,B2亚型7例,B4亚型2例,B1亚型和B6亚型各1例;C基因型分为C1、C2和C5亚型,C2亚型42例,C1亚型6例,C5亚型3例;D基因型分为D1、D3亚型和C/D重组基因型,C/D重组基因型44例,D1亚型7例,D3亚型4例。结论甘肃口岸出入境人群HBV和HDV混合感染率低,HBV优势基因型为C型和D型,亚型以C2亚型和C/D重组基因型为主。 展开更多
关键词 乙肝病毒 丁肝病毒 基因分型 出入境人员
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Tools for the diagnosis of hepatitis C virus infection and hepatic fibrosis staging 被引量:4
10
作者 Verónica Saludes Victoria González +3 位作者 Ramon Planas Lurdes Matas Vicente Ausina Elisa Martró 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2014年第13期3431-3442,共12页
Hepatitis C virus(HCV)infection represents a major public health issue.Hepatitis C can be cured bytherapy,but many infected individuals are unaware of their status.Effective HCV screening,fast diagnosis and characteri... Hepatitis C virus(HCV)infection represents a major public health issue.Hepatitis C can be cured bytherapy,but many infected individuals are unaware of their status.Effective HCV screening,fast diagnosis and characterization,and hepatic fibrosis staging are highly relevant for controlling transmission,treating infected patients and,consequently,avoiding end-stage liver disease.Exposure to HCV can be determined with high sensitivity and specificity with currently available third generation serology assays.Additionally,the use of point-of-care tests can increase HCV screening opportunities.However,active HCV infection must be confirmed by direct diagnosis methods.Additionally,HCV genotyping is required prior to starting any treatment.Increasingly,high-volume clinical laboratories use different types of automated platforms,which have simplified sample processing,reduced hands-on-time,minimized contamination risks and human error and ensured full traceability of results.Significant advances have also been made in the field of fibrosis stage assessment with the development of non-invasive methods,such as imaging techniques and serum-based tests.However,no single test is currently available that is able to completely replace liver biopsy.This review focuses on approved commercial tools used to diagnose HCV infection and the recommended hepatic fibrosis staging tests. 展开更多
关键词 Hepatitis C virus DIAGNOSIS Real-time polymerase chain reaction SEROLOGY Hepatitis C virus-RNA quantification Hepatitis C virus genotyping Hepatic fibrosis staging
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分子杂交技术在人乳头瘤病毒分型检测中的应用 被引量:6
11
作者 黄涛 何进才 《江西医学检验》 2006年第3期195-196,286,共3页
目的了解人乳头瘤病毒(HPV)型别(低危型:HPV6/11/42/43/44,高危型:HPV16/18/31/33/35/39/45/51/52/53/56/58/59/66/68/73/83/MM4)的感染和分布情况,为HPV感染的诊断和相关疾病的防治提供依据。方法利用核酸扩增和分子杂交技术检测606例... 目的了解人乳头瘤病毒(HPV)型别(低危型:HPV6/11/42/43/44,高危型:HPV16/18/31/33/35/39/45/51/52/53/56/58/59/66/68/73/83/MM4)的感染和分布情况,为HPV感染的诊断和相关疾病的防治提供依据。方法利用核酸扩增和分子杂交技术检测606例临床送检样本23种HPV型别,对检测结果进行统计分析。结果HPV阳性检出率为21.8%,其中单一型别感染率为17.5%,两型混合感染者2.8%,三型混合感染者1.5%。HPV型别分布情况为:HPV16型21.2%、HPV11型18.8%、HPV33型12.1%、HPV58型11.5%、HPV18型9.7%、HPV6型7.9%,其余型别为18.8%。结论本法对HPV进行基因分型,可同时检测23种HPV型别,并检出具体的感染型别,为HPV感染诊断和宫颈癌防治提供重要依据。 展开更多
关键词 乳头瘤病毒 基因分型 核酸扩增 分子杂交
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人乳头瘤病毒基因分型检测在绝经后妇女HPV感染中的应用价值
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作者 杨玉萍 《实用妇科内分泌电子杂志》 2024年第6期88-90,共3页
目的探究人乳头瘤病毒(HPV)基因分型检测在绝经后妇女HPV感染中的应用价值。方法选择80名接受HPV筛查的绝经后妇女为研究对象,采集其宫颈脱落细胞标本,采用聚合酶链式反应(PCR)-反向杂交法进行检测。以柱提法提取样本DNA,将提取液及阴... 目的探究人乳头瘤病毒(HPV)基因分型检测在绝经后妇女HPV感染中的应用价值。方法选择80名接受HPV筛查的绝经后妇女为研究对象,采集其宫颈脱落细胞标本,采用聚合酶链式反应(PCR)-反向杂交法进行检测。以柱提法提取样本DNA,将提取液及阴、阳性对照品同时在天隆PCR扩增仪上进行扩增,在安必平杂交仪上进行杂交。分析阳性率、危险分型情况、阳性样本与感染样本分型情况及不同年龄段妇女HPV感染阳性率。结果在80名绝经后妇女中,HPV阳性检出率为15.00%(12/80)。其中,HPV-16型2例,占比16.67%;HPV-52型2例,占比16.67%;HPV-58型1例,占比8.33%;HPV-53型1例,占比8.33%;HPV-68型1例,占比8.33%;HPV-33型1例,占比8.33%;HPV-11型1例,占比8.33%;HPV-18型1例,占比8.33%;HPV-cp8304型1例,占比8.33%;HPV-66型1例,占比8.33%。在12例HPV阳性样本中,多重感染样本3例,占比25.00%;单一感染样本9例,占比75.00%。不同年龄组HPV感染阳性例数分布数据差异不明显(P>0.05)。结论绝经后不同年龄段妇女HPV阳性率无明显分布,感染以单一感染为主,HPV基因分型检测有着较高的检验诊断价值,值得推广。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 病毒基因分型检测 感染 绝经后妇女
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淋巴瘤患者外周血EB病毒检测及分型的临床意义
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作者 霍佳佳 《工业微生物》 CAS 2024年第1期140-142,共3页
本研究旨在探讨淋巴瘤患者外周血EB病毒(EBV)检测及分型的临床意义。首先选择了100例淋巴瘤患者,使用荧光定量PCR技术对这100例患者的外周血样本进行了EB病毒含量检测,并对EB病毒阳性患者进行了EB病毒分型检测。在100例淋巴瘤患者中检... 本研究旨在探讨淋巴瘤患者外周血EB病毒(EBV)检测及分型的临床意义。首先选择了100例淋巴瘤患者,使用荧光定量PCR技术对这100例患者的外周血样本进行了EB病毒含量检测,并对EB病毒阳性患者进行了EB病毒分型检测。在100例淋巴瘤患者中检测到了69个EBV-DNA阳性样本。在接受4个疗程治疗后的46例B细胞类型非霍奇金淋巴瘤患者中,EB病毒阳性组的总缓解率为60.7%,而EB病毒阴性组的总缓解率为88.9%。两组之间的差异具有统计学意义(P<0.05),对淋巴瘤患者进行外周血EB病毒检测与分型具有一定的临床意义。EB病毒阳性淋巴瘤患者以EBV-2型感染为主。在外周血的EB病毒检测中核酸结果为阳性的淋巴瘤患者的治疗效果比阴性患者的治疗效果差,因此,对于EB病毒阳性的淋巴瘤患者,我们可能需要调整他们的治疗方案,以提高治疗效果。 展开更多
关键词 淋巴瘤 EB病毒 基因分型
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人乳头瘤病毒多基因型检测对传统部分基因型宫颈癌筛查策略的价值优化:基于Markov模型的分析 被引量:1
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作者 揭俊钦 戎春宇 +6 位作者 王贤吉 蒋虹丽 杜莉 周萍 李欣 祖恩晴 李真 《中国卫生资源》 CSCD 北大核心 2023年第4期323-329,338,共8页
目的比较人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)多基因型(extended genotyping)与HPV部分(16/18)基因型检测技术对宫颈癌筛查策略及其后续管理的影响,分析可能带来的价值变化。方法基于Markov队列模型,以预防宫颈癌发病例数为效果指... 目的比较人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)多基因型(extended genotyping)与HPV部分(16/18)基因型检测技术对宫颈癌筛查策略及其后续管理的影响,分析可能带来的价值变化。方法基于Markov队列模型,以预防宫颈癌发病例数为效果指标,模拟100万名初始年龄为15岁的健康妇女在10、20、30、40、50年内从健康状态到宫颈癌发病的疾病进程,基于2种检测技术的宫颈癌筛查-诊断-癌前病变诊疗路径构建模型,分析2种筛查技术不同累计年份下的效果指标、阴道镜检查次数、宫颈上皮内瘤样病变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)1/2/3状态的筛查率,并比较成本与成本效果,以此判定对价值的影响。结果模型模拟10、20、30、40、50年,HPV多基因型相对于HPV部分(16/18)基因型在成本上分别减少29.73万、75.55万、98.53万、111.23万、119.39万元,效果始终保持一致,阴道镜检测次数可分别减少1002、2726、3865、4605、5086人次,CIN1-3筛查率上,模型运行第10、20、30、40、50年时,HPV多基因型策略分别减少约4%的CIN1-3的筛查率。结论相比于HPV部分(16/18)基因型,HPV多基因型检测技术在保障预防效果的情况下,能降低筛查假阳性带来的阴道镜“过诊”率,提升阴道镜检查精度,优化卫生资源利用效能,一定程度上避免假阳性带来的心理负担,从而优化传统HPV部分(16/18)基因型的筛查价值。 展开更多
关键词 宫颈癌筛查cervical cancer screening 人乳头瘤病毒human papilloma virus HPV 多基因型检测extended genotyping testing 部分基因型检测partial genotyping testing 价值value 成本效果costeffectiveness 薄层液基细胞学检查thinprep cytologic test TCT 不典型鳞状上皮细胞病变atypical squamous cells of undetermined significance ASCUS
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陕西延安地区肾综合征出血热流行情况研究报告 被引量:5
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作者 李光玉 陈延平 +4 位作者 潘蕾 黄长形 陈伟红 徐光华 白雪帆 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2004年第6期495-499,共5页
目的 明确陕西延安地区为肾综合征出血热疫源地及病毒基因型别。方法 择有疫情报告地,进行人群疫情调查及健康人群特异性抗体检测;用夹夜法捕鼠,调查鼠种及鼠密度,采集鼠肺、血标本。人血、鼠血分别用IFA和ELISA法检测IgG抗体;鼠肺采用R... 目的 明确陕西延安地区为肾综合征出血热疫源地及病毒基因型别。方法 择有疫情报告地,进行人群疫情调查及健康人群特异性抗体检测;用夹夜法捕鼠,调查鼠种及鼠密度,采集鼠肺、血标本。人血、鼠血分别用IFA和ELISA法检测IgG抗体;鼠肺采用RT-PCR检测汉坦病毒(HV)RNA,测定PCR产物并与HV代表株76-118和Seoul序列进行比较。结果 对延安市防疫站2001年统计的7例HFRS患者进行流行病学调查,均属在当地感染;检测延安市洛川县交口河镇245例人血标本HV特异性IgG抗体,阳性50例,人群隐性感染率为20.41%。22份鼠肺及鼠血标本,IFA抗HV IgG阳性3例,ELISA阳性5例。从一只鼠血抗体阳性的鼠肺中检测到HV RNA,序列测定符合Seoul S片段序列(94%)。结论 延安市洛川县交口河镇为HFRS疫源地及新疫区,洛川交口河镇健康人群、褐家鼠、小家鼠中有HV感染,病毒型别为SEO型。 展开更多
关键词 肾综合征出血热 自然疫源地 病毒基因型别 特异性抗体 检测
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高通量基因芯片技术在登革病毒检测和分型中的应用 被引量:5
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作者 李深伟 张子龙 +3 位作者 李帅 张晓航 田桢干 李平 《中国国境卫生检疫杂志》 CAS 2019年第3期163-165,共3页
目的建立能同时检测登革病毒4个亚型的基因芯片方法,并进行验证。方法使用建立的高通量快速基因芯片检测28份疑似登革热病例血清样本,与商品化荧光RT-PCR试剂盒检测结果进行比较,分析方法的结果一致性;将4个已知型别的登革病毒阳性样本... 目的建立能同时检测登革病毒4个亚型的基因芯片方法,并进行验证。方法使用建立的高通量快速基因芯片检测28份疑似登革热病例血清样本,与商品化荧光RT-PCR试剂盒检测结果进行比较,分析方法的结果一致性;将4个已知型别的登革病毒阳性样本混合,使用建立的芯片平台进行检测,评价该芯片在登革病毒分型中的应用价值。结果 28份疑似登革热病例的样本经高通量基因芯片检测,18份为登革病毒阳性,与商品化实时荧光RT-PCR试剂盒结果一致,符合率100%;混合样本中登革病毒4个型别均可检出。结论建立的芯片检测技术平台在登革热诊断方面具有较高的应用价值,值得在疾病预防、卫生检疫领域推广。 展开更多
关键词 基因芯片 登革病毒 快速检测 基因分型
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Laboratory-based Surveillance and Clinical Profile of Sporadic HEV Infection in Shanghai,China 被引量:5
17
作者 Jie Lu Qing Li +10 位作者 Jiayuan Jiang Ziqiang Li Peiyun Wang Zike Sheng Rongtao Lai Huijuan Zhou Wei Cai Hui Wang Qing Guo Honglian Gui Qing Xie 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2021年第4期644-654,共11页
The study aimed to describe the epidemiological,virological and clinical features of sporadic HEV infection in eastern China.A total of 6112 patient sera were tested for anti-HEV IgG or anti-HEV IgM during one consecu... The study aimed to describe the epidemiological,virological and clinical features of sporadic HEV infection in eastern China.A total of 6112 patient sera were tested for anti-HEV IgG or anti-HEV IgM during one consecutive year(between August 2018 and July 2019).HEV RNA presence was evaluated by RT-PCR and HEV sequences were phylogenetically analyzed.Clinical features of confirmed HEV-infected patients were delineated.The sero-positivity rate of anti-HEV IgG maintained stable around 40%,while an obvious winter spike of anti-HEV IgM prevalence was observed.A total of 111 patients were confirmed of HEV viremia by molecular diagnosis.Subtype 4d was predominant.Phylogenetic analyses suggest that certain strains circulate across species and around the country.Subjects with confirmed current HEV infection had a high median age(58 years)and males were predominant(62.2%).Most patients presented with jaundice(75.7%)and anorexia(68.0%).Significantly elevated levels of liver enzymes and bilirubin were observed.Remarkably,the baseline bilirubin level was positively correlated with illness severity.Pre-existing HBV carriage may deteriorate illness.The clinical burden caused by locally acquired HEV infection is increasing.Surveillance should be enforced especially during the transition period from winter to spring.Patients with higher level of bilirubin at disease onset had slower recovery from HEV infection. 展开更多
关键词 Hepatitis E virus(HEV) SEROPREVALENCE genotyping EPIDEMIOLOGY SURVEILLANCE
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肾综合征出血热汉坦病毒分型及序列特征的研究 被引量:4
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作者 盛欣 陈淑红 +4 位作者 兰英华 陈国林 郭伟 王开利 李用国 《医学研究杂志》 2014年第6期41-44,共4页
目的 分析黑龙江省肾综合征出血热(HFRS)患者携带汉坦病毒的基因型别及序列特征.方法 采集临床诊断为肾综合征出血热病人的全血60例,其中通过金标法检测出血热特异性抗体阳性40例、阴性20例,血凝块提取汉坦病毒RNA,应用RT-Nest-PCR及... 目的 分析黑龙江省肾综合征出血热(HFRS)患者携带汉坦病毒的基因型别及序列特征.方法 采集临床诊断为肾综合征出血热病人的全血60例,其中通过金标法检测出血热特异性抗体阳性40例、阴性20例,血凝块提取汉坦病毒RNA,应用RT-Nest-PCR及核苷酸序列测定分型技术对黑龙江地区的汉坦病毒进行分型研究,设计汉坦病毒M片段通用引物(MOF,MOR)及HTNV和SEOV的M片段特异性引物(HTNMF、HTNMR,SEOMF、SEOMR),应用Nest-PCR进行扩增,回收阳性扩增产物进行基因序列测定,将所测基因序列与国内外HV病毒株序列进行核苷酸同源性分析,构建M基因种系进化树.结果 出血热特异性抗体阳性的病例中扩增出HTN型19份,抗体阴性的病例中扩增出HTN型1份、SEO型l份.总体来看黑龙江省流行的汉坦病毒毒株主要为HTN型和SEO型,以HTN型为主.经核苷酸及氨基酸同源性和种系进化分析表明其黑龙江地区的病毒株同源性较高,其中HTN型与76 ~ 118株同源性较高,SEO型与Z37株的同源性较高.结论 黑龙江省的HV感染病例多为HTN型,与其他GenBank中的各地标准株的核苷酸及推导的氨基酸序列均有一定差异,在系统进化树中分析HTN型与76-118株较为接近.SEO型与国内Z37较为接近.结合临床症状发现其临床症状较为相似的在系统进化发生树中较为接近. 展开更多
关键词 肾综合征出血热 汉坦病毒 M基因 分型 种系进化
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广州与佛山地区2014年登革病毒基因型特征研究 被引量:4
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作者 罗招凡 张凤宜 +3 位作者 潘昆贻 方伟祯 赵文忠 任瑞文 《中国卫生检验杂志》 CAS 2016年第9期1219-1222,共4页
目的对2014年广州与佛山地区登革病毒C-prM区进行基因测序,从分子水平与相关国际流行株进行同源性比较,构建系统发育树,追踪其可能输入来源。方法收集本院2014年9月-11月447例登革热疑似患者急性期血清,随机选取其中广州与佛山地区不同... 目的对2014年广州与佛山地区登革病毒C-prM区进行基因测序,从分子水平与相关国际流行株进行同源性比较,构建系统发育树,追踪其可能输入来源。方法收集本院2014年9月-11月447例登革热疑似患者急性期血清,随机选取其中广州与佛山地区不同区域的24例标本,提取病毒RNA,RT-PCR法扩增C-prM基因,并将其克隆到p MD19T载体,测序并利用生物信息学软件进行分析。结果成功测序登革病毒11株,BLAST分析表明均为登革1型病毒(DENV-1)。系统发育树结果显示GZ2014-01等序列与2010年印度德里流行株同源性高(相似度为99.21%),GZ2014-02等序列与2013年广州流行株相近(相似度为97.64%~98.82%)。广州株GZ2014-01等和佛山株GZ2014-23属于基因型Ⅴ,而广州株GZ2014-02等和佛山株GZ2014-20属于基因型Ⅰ。结论 GZ2014-01等株可能来源于印度德里,而GZ2014-02等株可能来源于中国广州。登革病毒多基因型流行可能是造成2014年登革热大暴发的原因之一。 展开更多
关键词 登革病毒 C-prM基因 系统发育树 基因分型
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2009年至2013年萍乡市流感病例样本real-time RT-PCR结果分析 被引量:3
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作者 邓兰 李晶鑫 +3 位作者 钟知情 张春芝 谢荣福 朱金华 《实验与检验医学》 CAS 2014年第5期511-513,共3页
目的通过对萍乡市历年流感样病例的病毒核酸检测结果分析,了解当地流感疫情状况,分析当地流感发病趋势,为预防和控制流感流行提供科学论证凭据。方法萍乡市人民医院为国家流感样病例监测哨点医院,对符合流感样病例定义的病例收集相关信... 目的通过对萍乡市历年流感样病例的病毒核酸检测结果分析,了解当地流感疫情状况,分析当地流感发病趋势,为预防和控制流感流行提供科学论证凭据。方法萍乡市人民医院为国家流感样病例监测哨点医院,对符合流感样病例定义的病例收集相关信息,采集咽拭子标本,采用实时荧光逆转录聚合酶链反应法(real-time RT-PCR)对标本进行流感病毒核酸检测,并进行统计分析。结果萍乡市流感病毒核酸阳性率22.09%,其中2009年阳性率59.75%最高,之后呈下降趋势。新甲型H1N1流感病毒和乙型流感病毒阳性数接近,构成比分为33.74%和30.89%。新甲型H1N1共检出阳性166例,其中2009年9-12月检出阳性143例,2009年11月为最高峰,阳性率达到(75/143)52.45%,2010年以后有少量病例发现。乙型和季H3流感检出阳性数逐年增加。男、女流感核酸阳性检出率分别为23.19%(291/1255)和20.68%(201/972)。年龄分5个组统计分析,阳性率分别是37.25%、30.59%、19.40%、18.69%和13.00%。结论萍乡市流感病例核酸阳性以新甲型H1N1和乙型为主;季H3流感病例核酸阳性有所增加,且新甲型H1N1在2009年12月后得到有效控制,流感病毒易感染人群以学龄儿童和青少年为主,性别无差异。 展开更多
关键词 流感病毒 实时荧光逆转录聚合酶链反应法 病毒分型
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